logo

Genes within 1Mb (chr12:105498916:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0465 0.117 0.12 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 6.62e-02 -0.111 0.0602 0.12 B L1
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0863 0.0891 0.12 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 5.11e-02 -0.111 0.0564 0.12 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 1.47e-01 0.131 0.0902 0.12 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 1.67e-01 -0.151 0.109 0.12 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 3.64e-01 0.0662 0.0728 0.12 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 9.25e-02 0.131 0.0776 0.12 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 7.28e-01 0.0303 0.0869 0.12 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 6.64e-01 0.0323 0.0743 0.12 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0907 0.0854 0.12 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 6.37e-01 0.0399 0.0843 0.12 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 1.81e-01 -0.156 0.116 0.12 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 6.99e-01 0.0293 0.0756 0.12 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 1.04e-01 0.106 0.0649 0.12 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 9.67e-01 0.0042 0.101 0.12 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 5.41e-01 -0.041 0.067 0.12 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 7.79e-02 -0.169 0.0953 0.12 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 6.61e-01 0.0471 0.107 0.12 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 3.09e-02 -0.209 0.096 0.12 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0176 0.0595 0.12 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 4.20e-01 0.0344 0.0426 0.12 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 4.53e-01 0.0887 0.118 0.124 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0927 0.081 0.124 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 2.92e-02 -0.263 0.12 0.124 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0679 0.0978 0.124 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 4.03e-01 0.0695 0.0829 0.124 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00597 0.0743 0.124 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 2.55e-01 0.139 0.122 0.124 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0215 0.0497 0.124 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0556 0.102 0.12 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0172 0.0734 0.12 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0533 0.116 0.12 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 2.16e-02 -0.13 0.0564 0.12 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0898 0.1 0.12 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 6.70e-01 0.0363 0.0851 0.12 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 9.19e-01 0.0114 0.111 0.12 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 7.38e-02 0.2 0.111 0.12 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -641117 sc-eQTL 6.09e-01 0.0566 0.11 0.12 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 7.34e-01 0.0341 0.1 0.12 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 9.34e-02 -0.166 0.0983 0.12 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 4.48e-01 0.0784 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 2.31e-02 -0.287 0.125 0.12 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 4.60e-01 0.0676 0.0913 0.12 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 9.80e-01 0.00185 0.0749 0.12 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 2.32e-01 -0.15 0.125 0.12 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 6.32e-01 0.0378 0.0789 0.12 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 6.13e-02 -0.192 0.102 0.12 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00997 0.135 0.12 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 9.87e-01 0.0015 0.0951 0.12 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 5.93e-01 0.0518 0.0967 0.12 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 9.14e-01 0.00856 0.079 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00702 0.137 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00629 0.131 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 4.31e-01 0.116 0.147 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 7.01e-02 -0.253 0.139 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 7.71e-02 -0.184 0.104 0.112 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 9.37e-01 0.0116 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 5.58e-01 0.0853 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 2.37e-01 0.167 0.14 0.112 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 1.13e-01 -0.212 0.133 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 5.37e-03 -0.274 0.0973 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 9.37e-01 0.00933 0.118 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 1.52e-01 -0.146 0.101 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 8.51e-03 0.292 0.11 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 2.21e-01 0.158 0.129 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 1.00e-02 0.294 0.113 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 1.06e-01 0.194 0.12 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 2.23e-01 -0.16 0.131 0.121 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0665 0.111 0.121 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 7.48e-01 0.0385 0.12 0.121 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0542 0.0991 0.121 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00236 0.116 0.121 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00258 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 6.93e-01 0.0437 0.111 0.121 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0562 0.102 0.121 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 2.51e-01 0.14 0.122 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 4.53e-01 0.0691 0.092 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 8.90e-01 0.0143 0.103 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0408 0.0927 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 2.63e-01 0.12 0.107 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 1.79e-01 -0.179 0.133 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 5.67e-01 0.0518 0.0903 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 4.91e-02 0.233 0.118 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 8.79e-01 0.0201 0.132 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 2.96e-01 0.12 0.114 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0881 0.11 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 1.55e-01 -0.141 0.0987 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 1.56e-01 -0.148 0.104 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 1.27e-02 -0.349 0.139 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 7.14e-01 0.0358 0.0978 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 3.30e-01 0.118 0.121 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 4.15e-01 0.103 0.126 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 1.77e-01 0.141 0.104 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0535 0.13 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 3.89e-01 0.107 0.124 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 9.80e-01 0.00313 0.125 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 1.42e-01 0.193 0.131 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 3.59e-01 0.0694 0.0755 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 9.90e-01 0.00118 0.0975 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0205 0.0837 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0804 0.0891 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 9.96e-01 0.000461 0.088 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 2.53e-01 -0.147 0.128 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0222 0.0838 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 2.42e-01 0.134 0.114 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 8.88e-01 0.0154 0.109 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 6.60e-01 0.0355 0.0804 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 1.02e-01 -0.171 0.104 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 2.48e-01 0.124 0.107 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 4.24e-01 -0.107 0.133 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 4.09e-01 0.0732 0.0884 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 1.51e-01 0.126 0.0872 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 5.71e-01 0.0771 0.136 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 6.53e-01 0.048 0.107 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 2.37e-01 -0.138 0.116 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 3.60e-01 -0.121 0.132 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 9.81e-01 0.00301 0.128 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 9.44e-01 0.00753 0.107 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 9.83e-01 0.0018 0.0857 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 5.63e-01 -0.071 0.122 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 1.95e-01 -0.141 0.109 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 6.14e-02 -0.192 0.102 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0175 0.114 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 4.57e-02 -0.268 0.134 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 5.65e-01 0.0674 0.117 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 7.43e-01 0.0284 0.0864 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0525 0.113 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 7.59e-01 -0.031 0.101 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00484 0.104 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0308 0.113 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 1.09e-01 -0.194 0.12 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0215 0.0903 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0372 0.0966 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00961 0.133 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 6.32e-01 0.0557 0.116 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0737 0.131 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 6.34e-01 0.0628 0.131 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0609 0.14 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0245 0.112 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0599 0.124 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 1.48e-01 0.198 0.136 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0573 0.126 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 4.66e-01 -0.101 0.138 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 1.48e-01 0.207 0.143 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 3.60e-02 -0.292 0.138 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 3.66e-01 0.119 0.131 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 1.60e-01 0.15 0.106 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 4.94e-01 -0.087 0.127 0.119 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 8.96e-01 0.0149 0.114 0.119 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 3.44e-03 -0.353 0.119 0.119 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 2.15e-01 -0.178 0.143 0.119 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0774 0.129 0.119 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0364 0.116 0.119 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00343 0.0966 0.119 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 6.61e-01 0.055 0.125 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -641117 sc-eQTL 3.82e-02 0.226 0.108 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 9.47e-01 0.00687 0.103 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 4.43e-01 0.0937 0.122 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 4.21e-01 0.102 0.126 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0889 0.136 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 7.84e-01 0.0358 0.131 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 1.44e-01 -0.172 0.118 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 2.09e-01 0.143 0.114 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -641117 sc-eQTL 2.48e-01 0.129 0.111 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 7.01e-01 -0.044 0.114 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 5.04e-03 -0.286 0.101 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 7.45e-01 0.0365 0.112 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 4.71e-02 -0.267 0.134 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 7.96e-02 0.175 0.0996 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 2.59e-01 0.0917 0.0811 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 9.54e-01 0.00746 0.13 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -641117 sc-eQTL 5.18e-02 -0.245 0.125 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 6.98e-01 0.0453 0.117 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 5.48e-01 0.0773 0.128 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 2.12e-02 0.305 0.131 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0421 0.134 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 3.31e-01 -0.128 0.131 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 1.76e-01 0.13 0.0958 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 8.20e-01 0.0291 0.127 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -641117 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0244 0.118 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 9.33e-01 0.00984 0.116 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 6.56e-01 -0.055 0.123 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 9.13e-01 0.013 0.119 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0474 0.132 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 9.76e-01 0.00313 0.104 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 5.37e-01 -0.054 0.0874 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 4.68e-01 -0.115 0.158 0.115 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0581 0.0889 0.115 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 4.89e-01 0.112 0.161 0.115 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 7.04e-01 0.0523 0.137 0.115 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 5.89e-01 0.0791 0.146 0.115 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 2.82e-02 -0.313 0.141 0.115 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 4.19e-01 -0.12 0.148 0.115 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 5.30e-01 0.0635 0.101 0.115 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 3.92e-01 0.11 0.129 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 4.85e-01 0.0471 0.0674 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 2.47e-01 0.142 0.122 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 2.13e-01 0.169 0.136 0.12 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 8.75e-01 0.0164 0.104 0.12 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 2.00e-01 -0.133 0.104 0.12 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 5.95e-02 -0.163 0.0862 0.12 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0498 0.131 0.12 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 1.13e-01 0.153 0.0959 0.12 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 3.06e-01 -0.118 0.115 0.12 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0168 0.128 0.12 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 1.46e-01 -0.187 0.128 0.12 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 8.98e-01 0.0134 0.104 0.12 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 1.14e-01 0.131 0.0827 0.12 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0905 0.123 0.127 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0746 0.0915 0.127 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 1.35e-02 -0.319 0.128 0.127 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0581 0.116 0.127 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 2.33e-01 0.121 0.101 0.127 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 1.38e-01 -0.133 0.0895 0.127 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0687 0.136 0.127 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 8.72e-01 0.0157 0.0975 0.127 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0297 0.122 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 8.93e-01 0.0112 0.0836 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 1.56e-01 -0.178 0.125 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 1.37e-02 -0.159 0.064 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 3.07e-01 -0.108 0.105 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 8.59e-01 0.0178 0.0998 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 1.37e-01 0.174 0.117 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 8.64e-01 0.0215 0.125 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 2.09e-01 -0.115 0.0911 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 3.03e-01 0.14 0.135 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0617 0.0943 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 9.87e-01 0.00178 0.113 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 1.85e-01 -0.142 0.107 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 9.38e-01 0.00903 0.116 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0236 0.146 0.121 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 2.94e-02 -0.3 0.136 0.121 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 1.55e-01 -0.195 0.136 0.121 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 2.75e-01 0.177 0.161 0.121 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00894 0.161 0.121 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 5.35e-02 0.29 0.149 0.121 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 1.66e-01 0.177 0.127 0.121 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0529 0.121 0.122 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 5.54e-01 0.073 0.123 0.122 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 3.09e-01 -0.132 0.129 0.122 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0974 0.109 0.122 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 2.86e-01 -0.141 0.132 0.122 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 4.44e-02 0.277 0.137 0.122 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 6.24e-01 0.0561 0.114 0.122 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 2.51e-01 -0.129 0.112 0.124 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0692 0.116 0.124 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 4.61e-01 0.0877 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0938 0.08 0.124 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 8.39e-01 0.0261 0.129 0.124 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 9.69e-03 0.294 0.113 0.124 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 4.18e-01 -0.101 0.124 0.124 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 6.24e-01 0.0716 0.146 0.119 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 2.85e-01 -0.1 0.0933 0.119 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 7.28e-01 0.0502 0.144 0.119 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0727 0.136 0.119 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 7.49e-01 0.0341 0.106 0.119 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 7.12e-01 0.0342 0.0927 0.119 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 9.15e-01 0.0149 0.141 0.119 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 4.64e-01 0.0654 0.0891 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 1.07e-02 -0.335 0.13 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 3.70e-02 -0.185 0.0882 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0247 0.112 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 4.66e-02 -0.159 0.0796 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 5.64e-02 0.222 0.116 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 2.69e-01 0.135 0.122 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 5.21e-02 0.209 0.107 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 1.88e-01 0.145 0.11 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 4.16e-01 0.101 0.124 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 6.05e-01 0.0479 0.0926 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0474 0.0949 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 2.12e-01 -0.101 0.0807 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 540172 sc-eQTL 4.05e-01 0.0825 0.099 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 6.71e-02 -0.246 0.134 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 4.55e-01 0.0604 0.0808 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 7.70e-02 0.201 0.113 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 8.65e-01 0.0196 0.115 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0372 0.0803 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0198 0.124 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 4.94e-02 -0.119 0.0602 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0804 0.0992 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0398 0.0854 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 2.46e-01 0.131 0.112 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 1.26e-01 -0.167 0.109 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0259 0.108 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0634 0.121 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 6.90e-02 -0.13 0.0713 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 2.81e-01 -0.141 0.13 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 4.69e-03 0.313 0.11 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0893 0.128 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -858832 sc-eQTL 1.26e-01 0.176 0.115 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -641117 sc-eQTL 5.88e-01 0.0601 0.111 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0254 0.105 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 262713 sc-eQTL 5.26e-02 -0.19 0.0977 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 391592 sc-eQTL 4.68e-01 0.0783 0.108 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 512600 sc-eQTL 5.27e-02 -0.251 0.129 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -803013 sc-eQTL 1.86e-01 0.119 0.0898 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 263626 sc-eQTL 7.25e-01 0.0266 0.0754 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 -805363 eQTL 0.0251 0.0341 0.0152 0.00133 0.0 0.136
ENSG00000136044 APPL2 262713 eQTL 6.76e-07 -0.139 0.0277 0.0 0.0 0.136

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 262713 1.28e-06 9.25e-07 1.31e-07 3.25e-07 9.45e-08 2.77e-07 8.73e-07 1.73e-07 8.36e-07 3.16e-07 1.13e-06 5.28e-07 1.49e-06 2.06e-07 3.61e-07 3.79e-07 6.44e-07 5.12e-07 3.26e-07 1.87e-07 2.38e-07 6.2e-07 5.87e-07 2.6e-07 1.79e-06 2.49e-07 4.34e-07 3.78e-07 7.07e-07 8.63e-07 4.59e-07 6.42e-08 5.71e-08 1.67e-07 3.26e-07 9.51e-08 8.52e-08 8.33e-08 7.41e-08 2.62e-08 6.31e-08 1.43e-06 4.59e-08 1.95e-08 1.15e-07 1.33e-08 1.32e-07 1.22e-08 5.54e-08
ENSG00000151131 \N 512600 3.53e-07 1.83e-07 5.72e-08 2.15e-07 9.24e-08 9.05e-08 2.24e-07 5.43e-08 1.54e-07 6.75e-08 1.66e-07 1.15e-07 2.24e-07 8.13e-08 5.69e-08 7.98e-08 4.18e-08 1.72e-07 7.18e-08 4.95e-08 1.25e-07 1.47e-07 1.64e-07 2.68e-08 2.17e-07 1.22e-07 1.18e-07 1.06e-07 1.32e-07 1.06e-07 1.09e-07 3.03e-08 3.43e-08 8.7e-08 3.71e-08 3.2e-08 5.8e-08 9.23e-08 6.67e-08 4.55e-08 5e-08 1.68e-07 5.08e-08 1.55e-08 3.42e-08 1.87e-08 1.15e-07 1.89e-09 5.02e-08