logo

Genes within 1Mb (chr12:105491988:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 9.22e-01 0.00968 0.0986 0.237 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 3.49e-02 -0.107 0.0504 0.237 B L1
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 7.58e-01 0.0232 0.0749 0.237 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0509 0.0476 0.237 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 8.63e-02 0.13 0.0756 0.237 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 4.53e-01 -0.069 0.0919 0.237 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0132 0.0612 0.237 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 2.04e-02 0.151 0.0647 0.237 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 3.34e-01 0.07 0.0723 0.237 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 2.72e-01 0.068 0.0617 0.237 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 6.54e-01 -0.032 0.0713 0.237 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0215 0.0703 0.237 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0992 0.097 0.237 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 9.12e-01 0.00696 0.063 0.237 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 7.94e-01 0.0142 0.0544 0.237 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 4.62e-01 0.0633 0.0859 0.237 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 6.35e-01 -0.027 0.0568 0.237 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0834 0.0812 0.237 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 2.05e-01 -0.115 0.0905 0.237 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 5.09e-02 -0.16 0.0815 0.237 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 9.85e-01 0.00092 0.0504 0.237 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 8.69e-01 0.00597 0.0361 0.237 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 4.50e-01 0.0752 0.0993 0.245 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0189 0.0684 0.245 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 6.16e-02 -0.19 0.101 0.245 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0513 0.0823 0.245 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 3.76e-01 0.0618 0.0697 0.245 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0279 0.0625 0.245 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 7.71e-02 0.181 0.102 0.245 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0166 0.0419 0.245 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 3.57e-01 0.0792 0.0858 0.237 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 8.19e-01 0.0141 0.0616 0.237 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0346 0.0974 0.237 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 7.29e-03 -0.128 0.0471 0.237 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0404 0.0841 0.237 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 6.27e-01 0.0348 0.0715 0.237 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0064 0.0933 0.237 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 9.84e-02 0.155 0.0931 0.238 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -648045 sc-eQTL 6.00e-01 0.0484 0.0922 0.238 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 4.53e-01 0.063 0.0838 0.238 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0784 0.0825 0.238 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 7.55e-01 0.027 0.0863 0.238 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 8.17e-02 -0.184 0.105 0.238 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00915 0.0764 0.238 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 8.76e-01 -0.00977 0.0626 0.238 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 5.59e-02 -0.201 0.104 0.237 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0628 0.0658 0.237 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 2.24e-02 -0.195 0.0849 0.237 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 7.78e-01 0.0319 0.113 0.237 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 7.83e-01 0.0219 0.0795 0.237 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 5.57e-01 0.0476 0.0808 0.237 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 3.12e-01 0.0668 0.0659 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 9.20e-01 0.011 0.109 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0771 0.104 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 5.07e-01 0.0777 0.117 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 1.42e-01 -0.163 0.11 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0606 0.083 0.23 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 8.67e-01 0.0193 0.115 0.23 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 3.24e-01 0.114 0.115 0.23 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 9.18e-01 0.0116 0.112 0.23 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0746 0.112 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 1.46e-03 -0.26 0.0807 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 9.47e-01 0.00655 0.0983 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 1.58e-01 -0.12 0.0846 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 2.08e-01 0.117 0.093 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 9.21e-02 0.182 0.107 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 7.76e-02 0.169 0.0953 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 6.60e-02 0.184 0.0997 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 5.99e-01 0.0585 0.111 0.239 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0444 0.0939 0.239 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 1.56e-01 0.144 0.101 0.239 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0143 0.0838 0.239 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00248 0.0983 0.239 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0638 0.113 0.239 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 2.41e-01 -0.11 0.0933 0.239 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 5.53e-01 0.0511 0.086 0.239 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 1.90e-01 0.134 0.102 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 6.02e-01 0.0402 0.077 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 5.95e-01 0.0458 0.0861 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0355 0.0775 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 2.40e-01 0.105 0.0894 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0719 0.111 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0557 0.0755 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 2.94e-02 0.215 0.0981 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 7.86e-01 0.0298 0.11 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 7.89e-01 0.0256 0.0952 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 9.25e-01 0.00856 0.0911 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0218 0.0823 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 9.04e-02 -0.146 0.0858 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 1.22e-02 -0.291 0.115 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 3.63e-01 0.0739 0.081 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 5.77e-01 0.0563 0.101 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 2.53e-02 0.232 0.103 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 1.30e-01 0.13 0.0856 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 2.38e-01 -0.126 0.107 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 6.28e-01 0.0499 0.103 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0887 0.103 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 6.08e-01 0.0558 0.109 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 4.40e-01 0.0481 0.0622 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 9.58e-01 0.00426 0.0809 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 6.22e-01 0.0343 0.0694 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0621 0.0739 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0444 0.0729 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 2.43e-01 -0.124 0.106 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0456 0.0695 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 5.91e-01 0.051 0.0949 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 1.01e-01 0.15 0.0911 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0115 0.0673 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0138 0.0876 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0059 0.0902 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0321 0.111 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 3.90e-01 0.0638 0.074 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 5.10e-01 0.0484 0.0733 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0206 0.113 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0513 0.0889 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0539 0.0973 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 2.99e-01 -0.114 0.11 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 3.92e-01 0.0914 0.106 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 1.82e-01 -0.119 0.0886 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 6.88e-01 0.0287 0.0714 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 9.10e-01 0.0116 0.102 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0323 0.0912 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 3.32e-02 -0.183 0.0853 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 3.78e-02 -0.198 0.0945 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 1.23e-01 -0.173 0.112 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 3.19e-01 0.0976 0.0977 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 2.45e-01 0.0841 0.0721 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0209 0.0958 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0256 0.0854 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 8.36e-01 0.0182 0.0878 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0482 0.0952 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0819 0.102 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0332 0.0763 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0893 0.0814 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 8.63e-01 0.0197 0.114 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0361 0.0992 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 4.85e-01 -0.078 0.111 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0729 0.112 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00705 0.12 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0182 0.0957 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 3.59e-01 -0.097 0.106 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 8.83e-01 0.0164 0.112 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0125 0.103 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 7.02e-01 0.0432 0.113 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 5.88e-01 0.0633 0.117 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 4.07e-02 -0.232 0.113 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 8.00e-01 0.0272 0.107 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 5.58e-01 0.0511 0.087 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 2.32e-02 -0.236 0.103 0.238 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0253 0.0936 0.238 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 1.90e-03 -0.307 0.0977 0.238 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 2.24e-01 -0.143 0.117 0.238 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0665 0.106 0.238 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 9.45e-01 0.00657 0.0953 0.238 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0267 0.0793 0.238 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 7.83e-01 0.0291 0.105 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -648045 sc-eQTL 1.57e-02 0.221 0.0907 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 2.73e-01 0.0946 0.086 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 9.87e-02 0.169 0.102 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 8.34e-01 0.0223 0.106 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 5.54e-01 -0.068 0.115 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 7.30e-01 -0.038 0.11 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0363 0.0994 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 1.52e-01 0.137 0.0955 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -648045 sc-eQTL 4.48e-01 0.0711 0.0936 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0411 0.0962 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 4.14e-02 -0.176 0.0856 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00778 0.0945 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0608 0.114 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 4.72e-01 0.0608 0.0843 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 7.85e-01 0.0187 0.0684 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 4.86e-01 0.0753 0.108 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -648045 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0828 0.105 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0785 0.0971 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 2.25e-01 0.13 0.107 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 2.36e-01 0.131 0.11 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0322 0.112 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0613 0.109 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 8.90e-01 0.0111 0.0802 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0169 0.107 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -648045 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0153 0.0989 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 6.38e-01 0.0461 0.0979 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00276 0.104 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 9.27e-01 0.00924 0.1 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 2.06e-01 -0.14 0.11 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0338 0.0876 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 8.92e-01 0.00996 0.0736 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 4.51e-01 -0.107 0.142 0.237 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00796 0.0797 0.237 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 5.87e-01 0.0783 0.144 0.237 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0717 0.122 0.237 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 3.95e-01 0.111 0.13 0.237 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 3.75e-01 -0.114 0.128 0.237 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 3.74e-01 -0.118 0.133 0.237 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 4.49e-01 0.0684 0.09 0.237 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0119 0.108 0.233 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 8.35e-01 0.0118 0.0566 0.233 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 7.56e-01 -0.032 0.103 0.233 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 2.52e-01 0.131 0.114 0.233 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 9.76e-01 0.00267 0.0873 0.233 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 8.84e-01 0.0128 0.0873 0.233 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0315 0.0729 0.233 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 6.07e-01 0.0558 0.108 0.237 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00557 0.0801 0.237 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0202 0.0956 0.237 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 7.00e-01 0.041 0.106 0.237 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 2.76e-01 -0.117 0.107 0.237 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 4.67e-01 0.0628 0.0863 0.237 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 3.89e-01 0.0596 0.069 0.237 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0641 0.102 0.256 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 3.33e-01 0.0735 0.0757 0.256 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 5.50e-02 -0.206 0.107 0.256 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0745 0.0961 0.256 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 2.42e-01 0.098 0.0836 0.256 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0219 0.0746 0.256 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 3.36e-01 0.109 0.113 0.256 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 3.68e-01 0.0727 0.0806 0.256 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 4.67e-01 0.0753 0.103 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 4.48e-01 0.0538 0.0707 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0594 0.107 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 1.65e-02 -0.131 0.0542 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0925 0.0893 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 6.64e-01 0.0367 0.0845 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 8.98e-01 0.0128 0.0993 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 5.59e-01 0.062 0.106 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 5.03e-01 -0.052 0.0774 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 4.22e-01 0.0923 0.115 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0665 0.0799 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 7.41e-01 0.0316 0.0955 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0806 0.0907 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0259 0.0981 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 9.88e-01 0.00187 0.122 0.248 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 9.47e-02 -0.193 0.115 0.248 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0427 0.115 0.248 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 5.05e-01 0.0904 0.135 0.248 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 3.33e-01 0.131 0.134 0.248 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00733 0.126 0.248 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 6.65e-03 0.287 0.104 0.248 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0272 0.101 0.24 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 2.39e-01 0.121 0.103 0.24 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 2.13e-01 -0.134 0.107 0.24 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0828 0.0909 0.24 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 8.99e-01 -0.014 0.11 0.24 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 8.17e-02 0.2 0.115 0.24 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 2.49e-01 0.11 0.095 0.24 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0306 0.0944 0.238 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0324 0.0977 0.238 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 9.48e-01 0.00656 0.0998 0.238 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 6.29e-02 -0.125 0.0667 0.238 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 8.98e-01 0.0139 0.108 0.238 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 5.88e-01 0.0521 0.0959 0.238 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0507 0.104 0.238 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0144 0.12 0.243 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0689 0.0766 0.243 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 8.56e-01 0.0214 0.118 0.243 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 7.97e-01 0.0289 0.112 0.243 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 5.77e-01 0.0487 0.0871 0.243 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0615 0.0759 0.243 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 7.78e-01 0.0326 0.115 0.243 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0304 0.0732 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0993 0.111 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 1.24e-03 -0.239 0.073 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 6.51e-01 0.0428 0.0943 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 7.63e-02 -0.119 0.067 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 1.27e-01 0.149 0.0974 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 2.38e-01 0.121 0.102 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 9.13e-01 0.00997 0.0906 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 4.47e-02 0.186 0.0919 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 4.98e-01 0.0705 0.104 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 7.39e-01 0.0258 0.0773 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 7.72e-01 0.023 0.0793 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0372 0.0676 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 533244 sc-eQTL 3.69e-01 0.0743 0.0826 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 9.86e-02 -0.186 0.112 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0196 0.0675 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 1.13e-01 0.151 0.0946 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 3.15e-01 0.0978 0.0971 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 8.51e-01 0.0128 0.0677 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 7.20e-01 0.0376 0.105 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 6.76e-02 -0.0934 0.0509 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0494 0.0837 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0183 0.072 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00633 0.0952 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0666 0.0912 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 3.98e-01 0.0763 0.09 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 2.73e-01 -0.111 0.101 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 8.99e-02 -0.102 0.0597 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0517 0.109 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 4.08e-01 0.0773 0.0932 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0579 0.107 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -865760 sc-eQTL 2.14e-01 0.12 0.0963 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -648045 sc-eQTL 7.15e-01 0.034 0.093 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -812291 sc-eQTL 9.15e-01 0.00943 0.0884 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 255785 sc-eQTL 2.00e-01 -0.106 0.0823 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 384664 sc-eQTL 7.34e-01 0.0307 0.0904 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 505672 sc-eQTL 1.28e-01 -0.166 0.108 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -809941 sc-eQTL 8.14e-01 0.0178 0.0756 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 256698 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00064 0.0633 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 255785 eQTL 0.00105 -0.0731 0.0222 0.0 0.0 0.239

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina