logo

Genes within 1Mb (chr12:105491467:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 9.66e-01 0.00418 0.0984 0.233 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 1.96e-02 -0.118 0.0502 0.233 B L1
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 8.17e-01 0.0174 0.0748 0.233 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0585 0.0475 0.233 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 8.49e-02 0.131 0.0754 0.233 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0684 0.0917 0.233 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00912 0.0611 0.233 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 3.51e-02 0.137 0.0648 0.233 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 3.38e-01 0.0694 0.0723 0.233 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 2.36e-01 0.0734 0.0617 0.233 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0341 0.0713 0.233 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0339 0.0703 0.233 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 2.57e-01 -0.11 0.097 0.233 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 8.02e-01 0.0158 0.063 0.233 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 5.82e-01 0.03 0.0544 0.233 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 4.30e-01 0.068 0.0861 0.233 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00299 0.0569 0.233 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 1.85e-01 -0.108 0.0812 0.233 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 1.12e-01 -0.145 0.0905 0.233 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 1.99e-02 -0.191 0.0813 0.233 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 7.90e-01 0.0135 0.0505 0.233 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 8.16e-01 0.00842 0.0362 0.233 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 3.64e-01 0.0896 0.0985 0.241 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0217 0.0679 0.241 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 4.64e-02 -0.201 0.1 0.241 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0464 0.0817 0.241 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 4.02e-01 0.0581 0.0693 0.241 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0322 0.062 0.241 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 1.23e-01 0.157 0.101 0.241 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0157 0.0416 0.241 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 7.93e-01 0.0225 0.0854 0.233 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 8.83e-01 0.00904 0.0612 0.233 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0455 0.0968 0.233 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 9.02e-03 -0.124 0.0469 0.233 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0475 0.0836 0.233 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 7.37e-01 0.0239 0.0711 0.233 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0109 0.0928 0.233 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 1.22e-01 0.145 0.0933 0.234 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -648566 sc-eQTL 4.95e-01 0.063 0.0923 0.234 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 2.98e-01 0.0874 0.0837 0.234 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0726 0.0826 0.234 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 9.38e-01 0.00671 0.0864 0.234 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 1.16e-01 -0.167 0.106 0.234 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00261 0.0764 0.234 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0262 0.0626 0.234 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 4.71e-02 -0.21 0.105 0.233 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0453 0.0664 0.233 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 2.02e-02 -0.2 0.0856 0.233 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 6.65e-01 0.0493 0.114 0.233 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 8.46e-01 0.0156 0.0801 0.233 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 5.51e-01 0.0486 0.0815 0.233 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 2.96e-01 0.0697 0.0664 0.233 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 8.53e-01 0.0203 0.109 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0755 0.104 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 5.32e-01 0.0731 0.117 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 7.50e-02 -0.197 0.11 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0588 0.0829 0.224 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0204 0.115 0.224 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 3.44e-01 0.109 0.115 0.224 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 9.77e-01 0.00322 0.112 0.224 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0536 0.112 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 2.55e-03 -0.247 0.0809 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 8.57e-01 0.0177 0.0983 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 1.74e-01 -0.115 0.0846 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 1.76e-01 0.126 0.093 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 5.14e-02 0.21 0.107 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 5.26e-02 0.185 0.0952 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 5.42e-02 0.193 0.0996 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 8.57e-01 0.02 0.111 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0642 0.0936 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 1.65e-01 0.14 0.101 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 9.76e-01 0.00256 0.0836 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00794 0.0981 0.235 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0759 0.113 0.235 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 2.62e-01 -0.105 0.0931 0.235 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 7.54e-01 0.027 0.0859 0.235 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 1.86e-01 0.135 0.102 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 5.93e-01 0.0411 0.0768 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 5.76e-01 0.0481 0.086 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0467 0.0773 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 2.59e-01 0.101 0.0893 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 4.72e-01 -0.08 0.111 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0426 0.0754 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 5.86e-02 0.187 0.0982 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 8.86e-01 0.0157 0.11 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 9.96e-01 0.000532 0.0951 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 9.99e-01 7.94e-05 0.091 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0379 0.0822 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 1.06e-01 -0.139 0.0858 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 9.01e-03 -0.303 0.115 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 3.75e-01 0.0719 0.0809 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 7.28e-01 0.035 0.101 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 3.68e-02 0.216 0.103 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 9.20e-02 0.144 0.0851 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 1.26e-01 -0.163 0.106 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 6.45e-01 0.0472 0.102 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0771 0.103 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 4.97e-01 0.0736 0.108 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 3.39e-01 0.0594 0.0619 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00223 0.081 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 6.35e-01 0.0331 0.0695 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0599 0.0741 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0548 0.073 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 1.84e-01 -0.142 0.106 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0377 0.0696 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 5.49e-01 0.0571 0.095 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 1.09e-01 0.146 0.091 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0111 0.0673 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0157 0.0875 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0252 0.0902 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0202 0.111 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 3.19e-01 0.0738 0.0739 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 3.75e-01 0.065 0.0732 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0137 0.113 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0377 0.089 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0731 0.0973 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 3.47e-01 -0.104 0.11 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 4.53e-01 0.0801 0.107 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 1.66e-01 -0.123 0.0887 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 6.53e-01 0.0322 0.0714 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 8.21e-01 0.0234 0.103 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0467 0.0916 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 1.98e-02 -0.201 0.0855 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 4.74e-02 -0.19 0.095 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 6.47e-02 -0.209 0.112 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 2.33e-01 0.117 0.098 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 3.60e-01 0.0665 0.0725 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 6.69e-01 -0.041 0.0959 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 9.37e-01 0.00677 0.0855 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 9.71e-01 0.0032 0.0879 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 4.07e-01 -0.079 0.0951 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.102 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0266 0.0764 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0803 0.0816 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 6.55e-01 0.0511 0.114 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0129 0.0995 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 2.82e-01 -0.12 0.112 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0568 0.113 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 7.40e-01 -0.04 0.12 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0314 0.0959 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0751 0.106 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 8.83e-01 0.0164 0.112 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0125 0.103 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 7.02e-01 0.0432 0.113 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 5.88e-01 0.0633 0.117 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 4.07e-02 -0.232 0.113 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 8.00e-01 0.0272 0.107 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 5.58e-01 0.0511 0.087 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 1.68e-02 -0.248 0.103 0.234 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0452 0.0934 0.234 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 3.39e-03 -0.29 0.0979 0.234 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 3.33e-01 -0.114 0.117 0.234 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 4.21e-01 -0.085 0.105 0.234 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00903 0.0952 0.234 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0397 0.0792 0.234 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 8.75e-01 0.0166 0.105 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -648566 sc-eQTL 1.05e-02 0.234 0.0905 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 2.14e-01 0.107 0.0859 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 7.05e-02 0.185 0.102 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 9.92e-01 0.00112 0.106 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0922 0.115 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0584 0.11 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0416 0.0994 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 1.58e-01 0.135 0.0953 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -648566 sc-eQTL 3.44e-01 0.0886 0.0934 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 9.01e-01 -0.012 0.0961 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 5.43e-02 -0.166 0.0855 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0163 0.0944 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 5.85e-01 -0.062 0.113 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 3.76e-01 0.0746 0.0841 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 8.01e-01 0.0172 0.0683 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 5.91e-01 0.0582 0.108 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -648566 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0635 0.105 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0655 0.0971 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 2.14e-01 0.133 0.107 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 2.18e-01 0.136 0.11 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00525 0.112 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0433 0.109 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00994 0.0802 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0198 0.107 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -648566 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0244 0.0989 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 5.77e-01 0.0546 0.0979 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0108 0.104 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 9.92e-01 0.000956 0.1 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 2.44e-01 -0.129 0.11 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0387 0.0876 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0182 0.0735 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0897 0.141 0.23 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0335 0.0794 0.23 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 3.75e-01 0.127 0.143 0.23 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0816 0.122 0.23 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 3.11e-01 0.132 0.13 0.23 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 3.01e-01 -0.133 0.128 0.23 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 5.67e-01 -0.076 0.132 0.23 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 6.27e-01 0.0437 0.0899 0.23 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000179 0.108 0.228 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 8.57e-01 0.0102 0.0565 0.228 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0491 0.103 0.228 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 2.82e-01 0.123 0.114 0.228 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00555 0.0872 0.228 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 9.52e-01 0.00527 0.0872 0.228 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 6.12e-01 -0.037 0.0728 0.228 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 4.80e-01 0.0768 0.108 0.233 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00969 0.0801 0.233 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0168 0.0956 0.233 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 6.92e-01 0.0421 0.106 0.233 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 2.70e-01 -0.118 0.107 0.233 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 4.11e-01 0.071 0.0863 0.233 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 3.86e-01 0.0599 0.069 0.233 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0476 0.101 0.251 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 3.90e-01 0.0648 0.0752 0.251 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 4.51e-02 -0.214 0.106 0.251 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0483 0.0955 0.251 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 2.63e-01 0.0932 0.083 0.251 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0292 0.074 0.251 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 3.96e-01 0.0954 0.112 0.251 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 3.64e-01 0.0728 0.08 0.251 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 7.07e-01 0.0386 0.103 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 4.61e-01 0.0518 0.0702 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 5.71e-01 -0.06 0.106 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 1.02e-02 -0.139 0.0537 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 2.90e-01 -0.094 0.0887 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 7.72e-01 0.0243 0.0839 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 8.82e-01 0.0147 0.0986 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 9.02e-01 0.0129 0.105 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0676 0.0767 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 5.65e-01 0.0656 0.114 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0454 0.0793 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 8.33e-01 0.02 0.0948 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0745 0.09 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0248 0.0973 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 9.88e-01 0.00187 0.122 0.248 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 9.47e-02 -0.193 0.115 0.248 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0427 0.115 0.248 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 5.05e-01 0.0904 0.135 0.248 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 3.33e-01 0.131 0.134 0.248 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00733 0.126 0.248 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 6.65e-03 0.287 0.104 0.248 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0676 0.101 0.236 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 2.21e-01 0.126 0.102 0.236 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 2.31e-01 -0.129 0.107 0.236 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0793 0.0907 0.236 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0277 0.11 0.236 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 6.93e-02 0.209 0.114 0.236 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 2.97e-01 0.0992 0.0949 0.236 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0415 0.0939 0.235 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 6.74e-01 -0.041 0.0972 0.235 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 8.77e-01 0.0154 0.0994 0.235 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 6.46e-02 -0.123 0.0664 0.235 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 9.78e-01 0.00292 0.107 0.235 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 5.54e-01 0.0567 0.0955 0.235 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0533 0.104 0.235 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00605 0.12 0.24 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 3.82e-01 -0.067 0.0765 0.24 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0112 0.118 0.24 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 8.76e-01 0.0174 0.112 0.24 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 6.12e-01 0.0442 0.087 0.24 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0444 0.0758 0.24 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 9.76e-01 0.00353 0.115 0.24 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0285 0.073 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 3.32e-01 -0.107 0.11 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 1.82e-03 -0.231 0.073 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 6.23e-01 0.0463 0.0942 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 1.14e-01 -0.106 0.067 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 1.29e-01 0.148 0.0973 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 2.24e-01 0.124 0.102 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 8.40e-01 0.0183 0.0905 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 5.80e-02 0.175 0.0918 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 5.35e-01 0.0645 0.104 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 7.78e-01 0.0218 0.0773 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 8.16e-01 0.0184 0.0792 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0522 0.0675 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 532723 sc-eQTL 3.72e-01 0.0738 0.0825 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 7.77e-02 -0.198 0.112 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0107 0.0675 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 1.86e-01 0.125 0.0947 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 6.26e-01 0.0472 0.0967 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 9.54e-01 0.00388 0.0673 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 8.22e-01 0.0235 0.104 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 8.30e-02 -0.0881 0.0506 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0553 0.0831 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0261 0.0716 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00244 0.0945 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0985 0.0905 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 3.39e-01 0.0856 0.0893 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 2.78e-01 -0.109 0.101 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 8.96e-02 -0.101 0.0593 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0761 0.108 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 3.49e-01 0.087 0.0926 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0716 0.106 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -866281 sc-eQTL 2.52e-01 0.111 0.0964 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -648566 sc-eQTL 5.79e-01 0.0517 0.093 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -812812 sc-eQTL 7.36e-01 0.0299 0.0884 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 255264 sc-eQTL 2.22e-01 -0.101 0.0824 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 384143 sc-eQTL 8.79e-01 0.0137 0.0905 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 505151 sc-eQTL 1.83e-01 -0.145 0.109 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -810462 sc-eQTL 7.05e-01 0.0287 0.0756 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 256177 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0196 0.0633 0.235 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 255264 eQTL 0.00034 -0.0802 0.0223 0.0 0.0 0.235

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina