logo

Genes within 1Mb (chr12:105484791:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0627 0.109 0.126 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 2.81e-02 -0.123 0.0558 0.126 B L1
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0331 0.083 0.126 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 5.30e-02 -0.102 0.0525 0.126 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 1.62e-01 0.118 0.0839 0.126 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00195 0.102 0.126 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 3.34e-01 0.0655 0.0677 0.126 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 1.91e-01 0.0948 0.0723 0.126 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 3.85e-01 0.0701 0.0805 0.126 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 5.08e-01 0.0457 0.0688 0.126 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 1.01e-01 -0.13 0.0789 0.126 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0441 0.0782 0.126 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0671 0.108 0.126 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 9.71e-01 0.00252 0.0701 0.126 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 1.50e-01 0.0872 0.0603 0.126 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 8.13e-01 0.0225 0.0952 0.126 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 9.08e-01 0.00726 0.0629 0.126 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 1.22e-01 -0.139 0.0896 0.126 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 3.12e-01 0.102 0.1 0.126 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 2.76e-02 -0.2 0.09 0.126 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0762 0.0556 0.126 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 1.04e-01 0.0649 0.0398 0.126 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 5.93e-01 0.0585 0.109 0.131 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 1.76e-01 -0.102 0.0749 0.131 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0975 0.112 0.131 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0955 0.0903 0.131 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 4.35e-01 0.0599 0.0767 0.131 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 9.96e-01 0.00037 0.0687 0.131 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00808 0.113 0.131 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00407 0.046 0.131 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0732 0.0954 0.126 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0147 0.0685 0.126 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 6.78e-01 0.045 0.108 0.126 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 7.77e-03 -0.141 0.0524 0.126 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0668 0.0935 0.126 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 9.18e-01 0.00824 0.0795 0.126 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 3.74e-01 0.0923 0.104 0.126 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 2.82e-01 0.113 0.104 0.127 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -655242 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00216 0.103 0.127 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.71e-01 0.0273 0.0936 0.127 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 1.20e-01 -0.143 0.0918 0.127 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 2.25e-01 0.117 0.096 0.127 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 3.26e-02 -0.252 0.117 0.127 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 7.26e-01 0.03 0.0853 0.127 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 4.17e-01 0.0567 0.0697 0.127 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 3.46e-01 -0.111 0.118 0.126 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 5.46e-01 0.0447 0.0739 0.126 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 2.96e-01 -0.101 0.0961 0.126 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0239 0.127 0.126 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0588 0.089 0.126 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 6.13e-01 0.0459 0.0906 0.126 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 8.67e-01 0.0125 0.0741 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0333 0.126 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 6.75e-01 0.0502 0.119 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 8.89e-01 0.0189 0.135 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 9.47e-02 -0.213 0.127 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 2.24e-01 -0.116 0.0953 0.122 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 9.37e-01 0.0105 0.133 0.122 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 6.39e-02 0.246 0.132 0.122 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 2.97e-01 0.135 0.129 0.122 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 1.47e-01 -0.182 0.125 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 1.71e-03 -0.289 0.0909 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 8.84e-01 0.0162 0.111 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 2.90e-01 -0.101 0.0954 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 3.41e-02 0.222 0.104 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 1.63e-01 0.169 0.121 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 1.33e-02 0.266 0.107 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 3.30e-01 0.11 0.113 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0636 0.124 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 2.41e-01 -0.123 0.104 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 3.74e-01 0.101 0.113 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0444 0.0934 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 4.47e-01 0.0834 0.109 0.127 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0364 0.126 0.127 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0379 0.104 0.127 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 2.19e-01 -0.118 0.0956 0.127 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 9.76e-01 0.00336 0.114 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.20e-01 0.0308 0.0857 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 2.00e-01 0.123 0.0956 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 6.43e-01 -0.04 0.0862 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 5.48e-01 0.0599 0.0997 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00688 0.124 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 1.53e-01 0.12 0.0837 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 4.19e-01 0.0892 0.11 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 9.95e-01 0.000762 0.124 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 1.51e-01 0.154 0.107 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0868 0.103 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0968 0.0927 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 2.48e-01 -0.113 0.0973 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 3.26e-02 -0.281 0.131 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 8.04e-01 0.0227 0.0917 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 2.91e-01 0.12 0.114 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 6.46e-01 0.0543 0.118 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 2.01e-01 0.124 0.0971 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 8.71e-01 0.0198 0.121 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 3.38e-01 0.112 0.116 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 1.13e-01 0.185 0.116 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 1.22e-01 0.19 0.122 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 1.66e-01 0.0977 0.0702 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 4.16e-01 0.0736 0.0903 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.66e-01 0.0232 0.0777 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 2.75e-02 -0.182 0.0819 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 6.68e-01 -0.035 0.0816 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0573 0.119 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0774 0.0776 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 9.67e-01 0.00436 0.106 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0221 0.103 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 3.29e-01 0.0739 0.0755 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 1.63e-01 -0.137 0.098 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 7.25e-01 0.0358 0.101 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0867 0.125 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 6.76e-01 0.0348 0.0832 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 8.05e-02 0.144 0.0818 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 8.36e-02 0.219 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 8.59e-01 0.0177 0.0995 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0579 0.109 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 1.60e-01 -0.173 0.123 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 4.03e-01 0.0999 0.119 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 4.18e-01 0.0806 0.0994 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 6.05e-01 0.0413 0.0798 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 3.35e-01 -0.111 0.114 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0362 0.102 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 7.52e-02 -0.171 0.0958 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 9.70e-01 0.00397 0.107 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 1.05e-01 -0.204 0.125 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0498 0.11 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 1.20e-01 0.126 0.0805 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0223 0.107 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.41e-01 0.0316 0.0954 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00149 0.0981 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 5.75e-01 0.0596 0.106 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 1.14e-01 -0.18 0.114 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0511 0.0852 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0049 0.0912 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 5.70e-01 0.0719 0.127 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 5.16e-01 0.0717 0.11 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0439 0.124 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 3.74e-01 0.111 0.125 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0574 0.133 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 3.32e-01 -0.103 0.106 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0271 0.118 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 5.85e-01 0.0689 0.126 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 8.35e-01 0.0242 0.116 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 8.03e-01 -0.032 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 3.49e-01 0.124 0.132 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 2.22e-01 -0.157 0.129 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 5.04e-01 0.081 0.121 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 5.81e-03 0.27 0.0967 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 1.82e-01 -0.157 0.117 0.126 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 3.30e-01 0.103 0.106 0.126 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 6.47e-02 -0.208 0.112 0.126 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 1.91e-01 -0.174 0.133 0.126 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0705 0.119 0.126 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 6.59e-01 0.0475 0.108 0.126 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 8.47e-01 0.0173 0.0896 0.126 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0592 0.117 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -655242 sc-eQTL 1.30e-01 0.154 0.101 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 6.01e-01 0.05 0.0954 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 7.36e-01 0.0385 0.114 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 2.79e-01 0.127 0.117 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00318 0.127 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 7.69e-01 0.0358 0.122 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 2.58e-01 -0.124 0.11 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 3.48e-01 0.1 0.106 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -655242 sc-eQTL 7.44e-01 0.0341 0.104 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0882 0.107 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 1.49e-02 -0.232 0.0947 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 3.46e-01 0.0989 0.105 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 1.25e-01 -0.193 0.126 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 3.21e-01 0.0932 0.0936 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 2.42e-01 0.0888 0.0758 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 7.75e-01 0.0355 0.124 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -655242 sc-eQTL 1.50e-02 -0.292 0.119 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.92e-01 0.0294 0.112 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 3.31e-01 0.12 0.123 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 1.67e-01 0.176 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00286 0.128 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0708 0.126 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 1.19e-01 0.143 0.0916 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 6.60e-01 0.0537 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -655242 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0617 0.113 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 3.95e-01 0.0948 0.111 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0382 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0684 0.114 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 2.94e-01 -0.132 0.126 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0448 0.0997 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 5.73e-01 0.0473 0.0837 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 4.14e-01 -0.118 0.143 0.13 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0796 0.0804 0.13 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 2.86e-01 0.156 0.145 0.13 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 7.43e-01 0.0408 0.124 0.13 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00933 0.132 0.13 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 2.10e-01 -0.163 0.13 0.13 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 2.70e-01 -0.149 0.134 0.13 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 8.26e-01 0.0201 0.0914 0.13 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 1.22e-01 0.186 0.12 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 9.39e-01 0.00484 0.0629 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 4.22e-01 0.0916 0.114 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 4.74e-01 0.0909 0.127 0.126 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 7.70e-01 0.0284 0.097 0.126 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 2.72e-01 -0.106 0.0967 0.126 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 5.30e-02 -0.156 0.0803 0.126 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 2.78e-01 -0.132 0.122 0.126 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.08e-01 0.0338 0.0901 0.126 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00134 0.107 0.126 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 2.80e-01 -0.129 0.119 0.126 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0654 0.12 0.126 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0574 0.0971 0.126 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 1.15e-01 0.122 0.0773 0.126 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 3.17e-01 -0.114 0.113 0.132 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0661 0.0842 0.132 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 3.53e-01 -0.111 0.12 0.132 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0126 0.107 0.132 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 1.80e-01 0.125 0.0928 0.132 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0576 0.0827 0.132 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 1.48e-01 -0.181 0.125 0.132 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 1.94e-01 0.116 0.0893 0.132 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0745 0.114 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.66e-01 0.0232 0.078 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0668 0.117 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 9.74e-03 -0.155 0.0596 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0116 0.0986 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 9.20e-01 0.00937 0.0931 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 4.72e-02 0.216 0.108 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 3.75e-01 -0.104 0.117 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0877 0.0852 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 6.22e-02 0.235 0.126 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0327 0.0882 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0558 0.105 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 2.02e-01 -0.128 0.0998 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 7.21e-01 0.0386 0.108 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 7.46e-01 0.0442 0.136 0.127 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 1.01e-01 -0.212 0.129 0.127 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 2.24e-01 -0.156 0.128 0.127 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 3.54e-01 0.14 0.151 0.127 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0193 0.151 0.127 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 3.94e-01 0.12 0.141 0.127 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 1.04e-02 0.303 0.117 0.127 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 8.02e-01 0.0281 0.112 0.127 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 1.27e-01 0.174 0.114 0.127 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 3.02e-01 -0.124 0.119 0.127 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 2.15e-01 -0.125 0.101 0.127 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 2.19e-01 -0.151 0.122 0.127 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 1.38e-01 0.19 0.128 0.127 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 6.11e-01 0.0539 0.106 0.127 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 2.04e-01 -0.135 0.106 0.131 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 3.07e-01 -0.112 0.11 0.131 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 1.86e-01 0.148 0.112 0.131 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 6.58e-02 -0.139 0.075 0.131 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 8.12e-01 0.029 0.121 0.131 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 9.06e-03 0.28 0.106 0.131 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0846 0.117 0.131 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 4.52e-01 0.0992 0.132 0.124 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0333 0.0845 0.124 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 9.20e-01 0.0131 0.13 0.124 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 2.11e-01 -0.154 0.123 0.124 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 5.96e-01 0.051 0.0959 0.124 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 9.41e-01 0.00619 0.0837 0.124 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 6.32e-01 -0.061 0.127 0.124 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0489 0.0805 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 1.16e-01 -0.193 0.122 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 5.91e-03 -0.227 0.0816 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00614 0.105 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 8.40e-02 -0.129 0.0744 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 6.53e-02 0.2 0.108 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 1.39e-01 0.168 0.113 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 6.85e-02 0.183 0.0998 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 7.00e-01 0.0397 0.103 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0174 0.116 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.43e-01 0.0283 0.0863 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 6.94e-01 0.0349 0.0884 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 2.43e-01 -0.088 0.0752 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 526047 sc-eQTL 7.88e-01 0.0248 0.0923 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0709 0.126 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 9.89e-02 0.124 0.0748 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 4.34e-01 0.083 0.106 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0782 0.108 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0203 0.0751 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 4.04e-01 0.0971 0.116 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 7.44e-02 -0.101 0.0564 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0408 0.0929 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0484 0.0799 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 6.59e-02 0.194 0.105 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 3.79e-01 -0.089 0.101 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 7.96e-01 0.0259 0.0999 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 7.56e-01 -0.035 0.113 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 7.89e-03 -0.176 0.0655 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 2.05e-01 -0.153 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 2.09e-02 0.238 0.102 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0666 0.118 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -872957 sc-eQTL 3.14e-01 0.109 0.108 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -655242 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0276 0.104 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0172 0.0986 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 248588 sc-eQTL 7.29e-02 -0.165 0.0915 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 377467 sc-eQTL 2.77e-01 0.11 0.101 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 498475 sc-eQTL 5.04e-02 -0.237 0.12 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -817138 sc-eQTL 5.91e-01 0.0453 0.0842 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 249501 sc-eQTL 3.14e-01 0.071 0.0704 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 -819488 eQTL 0.00562 0.0428 0.0154 0.0026 0.0 0.135
ENSG00000136044 APPL2 248588 eQTL 1.66e-07 -0.148 0.0282 0.0 0.0 0.135

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 248588 1.34e-06 1.25e-06 2.29e-07 1.25e-06 3.67e-07 5.87e-07 1.51e-06 4.04e-07 1.67e-06 5.93e-07 2.06e-06 8.48e-07 2.54e-06 2.95e-07 4.95e-07 9.36e-07 9.31e-07 9.7e-07 7.98e-07 4.83e-07 7.85e-07 1.91e-06 1.12e-06 6.29e-07 2.47e-06 7.53e-07 9.54e-07 8.66e-07 1.57e-06 1.23e-06 8.22e-07 3e-07 2.65e-07 5.71e-07 5.31e-07 5.24e-07 6.97e-07 2.74e-07 4.58e-07 3.32e-07 3.04e-07 1.95e-06 1.22e-07 1.38e-07 2.8e-07 1.98e-07 2.3e-07 4.82e-08 1.56e-07