logo

Genes within 1Mb (chr12:105478920:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0407 0.0965 0.239 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 3.10e-02 0.107 0.0493 0.239 B L1
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 1.51e-01 0.105 0.073 0.239 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 9.04e-01 0.00567 0.0468 0.239 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 5.64e-01 -0.043 0.0744 0.239 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0205 0.09 0.239 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 8.95e-01 0.00791 0.0599 0.239 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 8.02e-01 0.0161 0.0642 0.239 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0404 0.0702 0.239 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 9.54e-01 0.00346 0.06 0.239 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 2.34e-01 0.0822 0.0689 0.239 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 4.83e-01 0.0478 0.0681 0.239 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 1.72e-01 -0.128 0.0939 0.239 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0491 0.061 0.239 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0426 0.0527 0.239 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 9.08e-01 0.00979 0.0843 0.239 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 8.06e-01 0.0137 0.0557 0.239 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 3.20e-01 0.0794 0.0796 0.239 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 2.85e-02 -0.194 0.0881 0.239 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 8.42e-01 0.0161 0.0806 0.239 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0308 0.0494 0.239 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00206 0.0354 0.239 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 2.39e-02 -0.223 0.098 0.239 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 5.15e-01 0.0444 0.0682 0.239 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0154 0.102 0.239 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 4.82e-02 0.162 0.0814 0.239 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 7.76e-02 -0.123 0.0692 0.239 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 8.84e-01 0.00908 0.0624 0.239 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 6.53e-01 0.0461 0.103 0.239 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 5.68e-01 0.0239 0.0418 0.239 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 9.94e-02 -0.138 0.0835 0.239 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0256 0.0602 0.239 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0397 0.0952 0.239 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 4.01e-02 0.0958 0.0464 0.239 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 1.51e-01 -0.118 0.0819 0.239 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 7.22e-01 0.0249 0.0699 0.239 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.56e-01 -0.129 0.0908 0.239 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 8.44e-01 0.0181 0.092 0.238 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -661113 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00385 0.0906 0.238 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 6.57e-02 -0.151 0.0816 0.238 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 1.87e-01 0.107 0.0808 0.238 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00263 0.0847 0.238 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 7.55e-01 0.0325 0.104 0.238 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00295 0.0749 0.238 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0628 0.0612 0.238 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 8.11e-01 0.0246 0.102 0.239 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 6.10e-01 0.0327 0.0641 0.239 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 9.69e-01 0.00322 0.0836 0.239 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 1.91e-01 0.143 0.109 0.239 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 8.29e-01 0.0167 0.0773 0.239 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 3.87e-02 -0.162 0.0779 0.239 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0209 0.0643 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 8.57e-01 0.0195 0.108 0.24 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 2.90e-01 0.109 0.103 0.24 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0587 0.116 0.24 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 1.30e-01 0.167 0.109 0.24 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00718 0.0824 0.24 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 1.48e-01 -0.165 0.114 0.24 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 8.34e-01 -0.024 0.115 0.24 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.23e-01 -0.171 0.11 0.24 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0845 0.109 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 1.57e-03 0.252 0.0786 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 2.57e-01 0.109 0.0955 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 9.69e-01 0.00326 0.0828 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0416 0.0909 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0706 0.105 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 1.99e-01 -0.12 0.0932 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 8.27e-01 0.0215 0.0978 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000546 0.108 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 5.14e-01 0.0594 0.0909 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 2.15e-01 -0.122 0.0979 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 6.81e-01 0.0334 0.0812 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 9.19e-01 0.00976 0.0952 0.241 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0461 0.11 0.241 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0592 0.0906 0.241 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.88e-01 0.11 0.083 0.241 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0115 0.101 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 7.52e-01 0.0242 0.0764 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 5.99e-01 0.045 0.0855 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0532 0.0769 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0382 0.089 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 2.41e-01 0.13 0.11 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0594 0.0749 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0838 0.0983 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 5.49e-01 0.0638 0.106 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 7.37e-02 -0.165 0.0916 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 1.83e-01 0.117 0.0879 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0547 0.0797 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 1.18e-02 0.21 0.0825 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 7.66e-01 0.0337 0.113 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0511 0.0786 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 3.24e-01 0.0965 0.0975 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0166 0.103 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 5.82e-02 -0.161 0.0843 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0749 0.106 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 6.36e-01 0.0481 0.101 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 1.86e-01 -0.135 0.102 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0685 0.107 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0201 0.0616 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 1.13e-01 -0.124 0.0783 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 6.98e-01 0.0263 0.0676 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 2.80e-01 0.0779 0.0719 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 3.92e-01 0.0609 0.071 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0929 0.104 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 6.91e-01 0.0269 0.0677 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0136 0.0925 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00995 0.0891 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 9.34e-01 0.00541 0.0655 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 7.72e-02 0.15 0.0846 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 7.92e-01 0.0232 0.0878 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 7.19e-01 -0.039 0.108 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 5.20e-03 -0.2 0.0708 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0781 0.0712 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 9.16e-01 0.0116 0.11 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0141 0.0861 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 6.25e-01 0.0461 0.0942 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 5.67e-01 0.061 0.107 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 1.48e-01 -0.149 0.103 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0692 0.0861 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0994 0.0688 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 6.50e-01 0.046 0.101 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 7.93e-02 -0.158 0.0895 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 8.93e-02 0.144 0.0847 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 2.45e-01 -0.11 0.0941 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0552 0.111 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 1.32e-01 -0.146 0.0963 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 8.52e-01 0.0133 0.0715 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 9.57e-01 0.00505 0.0937 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00849 0.0835 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0296 0.0858 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 5.68e-02 -0.177 0.0923 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 6.07e-01 0.0515 0.1 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0179 0.0746 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 8.83e-02 -0.136 0.0793 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 2.43e-01 -0.127 0.109 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0692 0.095 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0839 0.107 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0272 0.108 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 5.67e-02 0.218 0.114 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 4.33e-02 -0.185 0.0907 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 8.28e-01 0.022 0.101 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 8.23e-01 0.0243 0.109 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0863 0.0996 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 7.20e-02 -0.197 0.109 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0853 0.114 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 3.08e-01 0.113 0.111 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 7.30e-01 -0.036 0.104 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0393 0.0847 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 7.51e-01 -0.033 0.104 0.236 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0801 0.0929 0.236 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 1.45e-01 0.145 0.0989 0.236 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 1.03e-01 0.191 0.116 0.236 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0883 0.105 0.236 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 1.63e-02 -0.226 0.0935 0.236 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00475 0.0788 0.236 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 3.27e-01 0.0992 0.101 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -661113 sc-eQTL 5.27e-02 -0.17 0.0875 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 4.25e-03 -0.235 0.0811 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 3.92e-01 0.0845 0.0984 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 1.45e-01 0.148 0.101 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 6.85e-01 0.0448 0.11 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0646 0.105 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 8.14e-01 0.0224 0.0954 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0326 0.093 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -661113 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00741 0.0909 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0178 0.0933 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 1.88e-01 0.11 0.0834 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0818 0.0915 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0984 0.11 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0147 0.0818 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.29e-01 -0.1 0.0659 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 8.70e-01 0.0171 0.104 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -661113 sc-eQTL 2.60e-01 0.115 0.102 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 1.30e-01 -0.142 0.0935 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 7.65e-01 0.031 0.104 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 2.02e-01 -0.137 0.107 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 3.47e-01 0.101 0.108 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0726 0.106 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0193 0.0775 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 6.03e-01 0.054 0.104 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -661113 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0811 0.0957 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 2.87e-02 -0.207 0.0938 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 9.53e-01 0.00586 0.1 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 6.74e-01 0.0409 0.0971 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 7.42e-02 0.191 0.107 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 3.59e-01 0.0778 0.0847 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 4.16e-01 -0.058 0.0712 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 2.28e-01 -0.151 0.124 0.248 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0056 0.0702 0.248 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 5.67e-01 0.0727 0.127 0.248 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0658 0.108 0.248 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 2.43e-01 -0.134 0.114 0.248 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 4.73e-01 0.0816 0.113 0.248 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 4.11e-01 0.0964 0.117 0.248 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.77e-01 0.107 0.0789 0.248 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 6.84e-01 0.0442 0.108 0.243 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 9.15e-01 0.00604 0.0567 0.243 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 3.80e-01 0.0903 0.103 0.243 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 8.99e-01 0.0145 0.114 0.243 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 2.34e-01 -0.104 0.0872 0.243 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 7.41e-01 0.0289 0.0874 0.243 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0243 0.073 0.243 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 6.12e-01 -0.053 0.104 0.239 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 3.56e-01 0.0712 0.077 0.239 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0825 0.0918 0.239 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 1.71e-01 -0.14 0.102 0.239 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 9.56e-01 0.00573 0.103 0.239 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0125 0.0832 0.239 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0809 0.0663 0.239 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 2.77e-01 -0.112 0.103 0.237 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 9.64e-01 0.00348 0.0765 0.237 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 9.80e-01 0.00273 0.109 0.237 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 3.67e-02 0.202 0.0959 0.237 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 1.83e-01 -0.113 0.0842 0.237 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0444 0.0751 0.237 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 3.25e-01 0.112 0.114 0.237 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0453 0.0814 0.237 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0687 0.0998 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 9.16e-01 0.00723 0.0685 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 6.04e-01 0.0535 0.103 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 1.36e-01 0.0792 0.0529 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0322 0.0866 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 9.78e-01 0.00225 0.0817 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0471 0.0959 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0126 0.103 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0387 0.0755 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 2.07e-01 -0.141 0.112 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 5.98e-01 0.0412 0.0779 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 2.17e-01 -0.115 0.0928 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 9.60e-01 0.0045 0.0886 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.49e-01 -0.138 0.0952 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 9.27e-01 0.011 0.12 0.236 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 3.37e-02 0.241 0.112 0.236 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0887 0.113 0.236 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0716 0.133 0.236 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 7.27e-01 0.0465 0.133 0.236 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0539 0.124 0.236 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.82e-01 -0.14 0.105 0.236 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0307 0.0986 0.24 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0787 0.1 0.24 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 9.60e-01 0.00525 0.105 0.24 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 1.01e-01 0.146 0.0884 0.24 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0319 0.108 0.24 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 8.64e-01 0.0193 0.113 0.24 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.48e-01 -0.135 0.0926 0.24 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0702 0.0931 0.24 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 3.97e-02 0.198 0.0954 0.24 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0191 0.0985 0.24 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 5.14e-01 0.0434 0.0664 0.24 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 5.32e-02 -0.205 0.106 0.24 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00351 0.0948 0.24 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.29e-01 -0.156 0.103 0.24 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00365 0.123 0.232 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 1.54e-01 0.112 0.0783 0.232 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 3.44e-01 0.115 0.121 0.232 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 8.30e-01 0.0247 0.115 0.232 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0134 0.0895 0.232 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 6.19e-01 0.0389 0.078 0.232 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 4.66e-01 0.0864 0.118 0.232 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 9.12e-02 0.127 0.0744 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0455 0.108 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 1.43e-02 0.178 0.0721 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 8.11e-01 0.0221 0.0922 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 4.26e-01 0.0525 0.0658 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0472 0.0956 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 1.35e-02 -0.246 0.0986 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0299 0.0885 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 5.55e-01 0.0536 0.0905 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 6.11e-01 0.0521 0.102 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 7.98e-01 0.0195 0.0761 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 1.33e-01 0.117 0.0776 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0354 0.0665 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 520176 sc-eQTL 8.86e-01 0.0117 0.0814 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 5.09e-01 0.0733 0.111 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0246 0.0664 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0255 0.0936 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 4.12e-01 -0.078 0.0949 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0214 0.0661 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0405 0.102 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 1.52e-01 0.0715 0.0498 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0837 0.0815 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 9.17e-01 0.00733 0.0703 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 1.78e-01 -0.125 0.0924 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 2.36e-01 -0.104 0.088 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 6.37e-01 0.0411 0.0871 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 7.84e-01 0.0269 0.0981 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 2.61e-01 0.0652 0.0579 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0562 0.106 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 3.05e-01 0.0926 0.09 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 5.47e-02 -0.197 0.102 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -878828 sc-eQTL 5.70e-01 0.0539 0.0946 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -661113 sc-eQTL 7.28e-01 0.0317 0.0911 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -825359 sc-eQTL 2.20e-01 -0.106 0.0863 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 242717 sc-eQTL 2.47e-01 0.0938 0.0807 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 371596 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0429 0.0886 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 492604 sc-eQTL 9.37e-01 0.00852 0.107 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -823009 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0034 0.0741 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 243630 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0629 0.0619 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 242717 eQTL 0.0292 0.0466 0.0213 0.0 0.0 0.251

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina