logo

Genes within 1Mb (chr12:105456769:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0553 0.0947 0.233 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 3.48e-02 0.103 0.0485 0.233 B L1
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 2.11e-01 0.09 0.0717 0.233 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0239 0.0459 0.233 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0461 0.073 0.233 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 1.71e-01 -0.121 0.088 0.233 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 4.18e-01 0.0477 0.0587 0.233 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 7.46e-01 0.0204 0.063 0.233 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0721 0.0688 0.233 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 7.68e-01 0.0174 0.0589 0.233 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 5.00e-01 0.0458 0.0678 0.233 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0349 0.0669 0.233 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 1.91e-01 -0.121 0.0922 0.233 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00467 0.06 0.233 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 8.30e-01 0.0111 0.0518 0.233 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 5.45e-01 0.0503 0.0828 0.233 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 4.24e-01 0.0438 0.0547 0.233 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 6.30e-02 0.145 0.0778 0.233 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 1.55e-02 -0.211 0.0864 0.233 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0281 0.0792 0.233 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0489 0.0485 0.233 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 4.90e-01 0.024 0.0348 0.233 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 4.32e-03 -0.282 0.0976 0.232 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 7.65e-01 0.0205 0.0685 0.232 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 5.78e-01 0.057 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 3.22e-01 0.0817 0.0824 0.232 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0869 0.0698 0.232 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00269 0.0626 0.232 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 7.71e-01 0.03 0.103 0.232 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 1.23e-01 0.0646 0.0417 0.232 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 1.19e-01 -0.129 0.0826 0.233 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0559 0.0594 0.233 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 3.81e-01 0.0825 0.0939 0.233 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 3.68e-02 0.0963 0.0458 0.233 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 1.44e-01 -0.119 0.0809 0.233 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 9.64e-01 0.00311 0.0691 0.233 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0865 0.09 0.233 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00635 0.0904 0.232 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -683264 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0428 0.0889 0.232 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 1.09e-01 -0.129 0.0804 0.232 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 1.17e-02 0.2 0.0786 0.232 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0375 0.0832 0.232 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 3.53e-01 -0.095 0.102 0.232 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.10e-01 0.0376 0.0736 0.232 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0371 0.0603 0.232 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 5.60e-01 -0.059 0.101 0.233 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0291 0.0634 0.233 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0191 0.0827 0.233 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 7.22e-01 0.0386 0.108 0.233 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00155 0.0764 0.233 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 7.90e-02 -0.136 0.0772 0.233 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 8.54e-01 0.0117 0.0635 0.233 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 8.04e-01 0.0262 0.106 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 1.72e-01 0.137 0.0998 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0213 0.113 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 3.78e-01 0.0949 0.107 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0181 0.0803 0.232 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.232 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 9.12e-01 0.0124 0.112 0.232 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 1.69e-01 -0.149 0.108 0.232 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 3.14e-01 -0.109 0.108 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 2.58e-03 0.238 0.0781 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 7.42e-02 0.169 0.0942 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0262 0.082 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 2.58e-01 -0.102 0.0899 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0822 0.104 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0363 0.0927 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0462 0.0969 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 3.81e-01 0.0946 0.108 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00879 0.0912 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 1.41e-01 -0.145 0.0979 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00646 0.0814 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 4.39e-01 0.0738 0.0953 0.235 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 2.34e-01 -0.131 0.11 0.235 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 2.73e-01 0.0995 0.0906 0.235 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 5.16e-01 0.0543 0.0835 0.235 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0781 0.0997 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 1.93e-01 0.0978 0.0749 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 3.92e-01 0.0721 0.084 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0201 0.0757 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0779 0.0874 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 5.20e-01 0.0701 0.109 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.41e-01 0.0345 0.0738 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 1.75e-01 -0.131 0.0965 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 6.28e-01 0.0511 0.105 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0826 0.0914 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 2.78e-01 0.095 0.0874 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 9.87e-01 0.00131 0.0792 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 2.30e-02 0.188 0.0821 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0444 0.112 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 5.31e-01 -0.049 0.078 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 3.95e-01 0.0825 0.0969 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 8.58e-01 0.0182 0.102 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 4.58e-02 -0.167 0.0831 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0281 0.104 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 3.58e-01 0.092 0.0999 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0091 0.101 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0424 0.106 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00909 0.0608 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0689 0.077 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 4.27e-01 0.0527 0.0662 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000898 0.0707 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00192 0.0697 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0896 0.101 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.44e-01 0.0307 0.0663 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0117 0.0906 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 7.41e-02 -0.156 0.0867 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 3.81e-01 0.0562 0.064 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 2.30e-01 0.1 0.0832 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0463 0.0859 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 2.56e-01 -0.121 0.106 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.63e-02 -0.129 0.0701 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0288 0.0699 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 5.98e-01 0.0572 0.108 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 6.21e-01 -0.042 0.0849 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 5.84e-01 0.051 0.093 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 7.92e-01 0.0278 0.105 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0551 0.102 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 4.49e-01 0.0645 0.0849 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0488 0.0681 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 5.34e-01 0.0623 0.1 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 4.05e-02 -0.182 0.0883 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 1.43e-01 0.123 0.0839 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 1.66e-01 -0.129 0.0929 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 2.66e-01 -0.123 0.11 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 9.30e-03 -0.247 0.0942 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 5.27e-01 0.0447 0.0706 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000507 0.0929 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 6.05e-01 0.0429 0.0828 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 4.00e-01 0.0717 0.085 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 3.54e-02 -0.193 0.0914 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 9.95e-01 0.000675 0.0992 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.27e-01 0.036 0.074 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0303 0.0792 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0828 0.109 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0397 0.0948 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0415 0.107 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0641 0.107 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 6.17e-02 0.213 0.113 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 9.17e-02 -0.154 0.0908 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 3.32e-01 -0.098 0.101 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 6.07e-01 0.055 0.107 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00822 0.0983 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0944 0.108 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0676 0.112 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 1.96e-01 0.141 0.109 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 9.64e-01 0.00469 0.102 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 7.28e-01 0.029 0.0835 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 1.75e-01 -0.138 0.101 0.229 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 1.98e-01 -0.117 0.0908 0.229 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 1.49e-01 0.14 0.0969 0.229 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 4.25e-01 0.0915 0.114 0.229 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0791 0.103 0.229 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 9.25e-02 -0.156 0.0922 0.229 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 8.02e-01 0.0194 0.0772 0.229 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 5.92e-01 0.0536 0.0998 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -683264 sc-eQTL 1.99e-02 -0.202 0.086 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 7.74e-02 -0.144 0.0811 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 1.17e-01 0.152 0.0968 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 1.16e-01 0.158 0.1 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 2.55e-01 0.124 0.109 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 4.96e-01 -0.071 0.104 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 6.80e-01 0.039 0.0942 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0533 0.0921 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -683264 sc-eQTL 6.98e-01 -0.035 0.09 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0492 0.0924 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 8.08e-02 0.145 0.0824 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0598 0.0907 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 1.70e-01 -0.15 0.109 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.19e-01 0.0404 0.081 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 7.69e-02 -0.116 0.0652 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 9.33e-01 0.00865 0.103 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -683264 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00715 0.101 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 1.13e-01 -0.147 0.0926 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 7.38e-02 0.183 0.102 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 7.28e-02 -0.19 0.105 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 5.68e-01 0.061 0.107 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.13e-01 0.0531 0.105 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 8.67e-01 0.0129 0.0768 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 4.86e-01 0.0726 0.104 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -683264 sc-eQTL 1.88e-01 -0.127 0.096 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 2.37e-01 -0.113 0.0951 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 7.02e-01 0.0387 0.101 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0568 0.0976 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00728 0.108 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 5.43e-01 0.0519 0.0853 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 8.45e-01 0.014 0.0717 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 1.71e-01 -0.171 0.124 0.233 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 5.50e-01 -0.042 0.07 0.233 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 2.90e-01 0.134 0.126 0.233 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0695 0.108 0.233 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 1.80e-01 -0.154 0.114 0.233 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 7.14e-01 0.0416 0.113 0.233 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0277 0.117 0.233 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 2.36e-01 0.0939 0.0789 0.233 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 6.44e-01 0.0499 0.108 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 9.74e-01 0.00182 0.0565 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 7.77e-01 0.029 0.102 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 3.54e-01 -0.106 0.114 0.237 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 1.44e-01 -0.127 0.0867 0.237 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00857 0.0871 0.237 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0154 0.0728 0.237 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 1.11e-01 -0.165 0.103 0.233 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 7.58e-01 0.0236 0.0765 0.233 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 3.04e-01 0.0937 0.091 0.233 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 3.11e-02 -0.218 0.1 0.233 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 9.74e-01 0.00334 0.102 0.233 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.42e-01 0.0384 0.0824 0.233 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0493 0.0659 0.233 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 3.15e-02 -0.22 0.102 0.232 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 8.02e-01 0.0192 0.0765 0.232 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 2.57e-01 0.123 0.108 0.232 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 8.33e-02 0.167 0.0961 0.232 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0474 0.0845 0.232 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0132 0.0751 0.232 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.96e-01 0.0446 0.114 0.232 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 6.00e-01 0.0428 0.0813 0.232 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0851 0.0985 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 8.37e-01 0.0139 0.0676 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 3.62e-01 0.0927 0.102 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 9.29e-02 0.088 0.0521 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00302 0.0854 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0263 0.0806 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0138 0.0947 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 2.36e-01 -0.121 0.102 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0618 0.0746 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 6.59e-01 0.0489 0.111 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 4.00e-01 0.065 0.077 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 5.02e-02 -0.18 0.0913 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 3.43e-01 -0.083 0.0874 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 9.52e-02 -0.158 0.094 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0742 0.118 0.23 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 3.33e-02 0.239 0.111 0.23 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 2.23e-01 -0.136 0.111 0.23 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00563 0.132 0.23 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 7.43e-01 0.0431 0.131 0.23 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0344 0.123 0.23 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 9.32e-01 0.00894 0.104 0.23 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 1.56e-01 0.138 0.0972 0.233 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0951 0.0994 0.233 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 4.46e-01 0.0795 0.104 0.233 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 1.08e-01 0.141 0.0876 0.233 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0279 0.107 0.233 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 3.84e-01 0.0973 0.111 0.233 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 1.01e-01 -0.151 0.0916 0.233 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 9.89e-01 0.00125 0.0924 0.235 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 2.85e-01 0.102 0.0953 0.235 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 2.89e-01 -0.104 0.0974 0.235 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 4.73e-01 0.0473 0.0658 0.235 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 8.14e-02 -0.184 0.105 0.235 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 2.59e-01 0.106 0.0937 0.235 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 3.13e-01 -0.103 0.102 0.235 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 6.88e-01 0.0482 0.12 0.229 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 9.65e-02 0.127 0.076 0.229 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 6.05e-01 0.0611 0.118 0.229 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0918 0.112 0.229 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 8.95e-01 0.0115 0.0871 0.229 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 9.41e-01 0.00565 0.0759 0.229 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.85e-02 0.209 0.114 0.229 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 1.90e-01 0.0957 0.0727 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 7.82e-01 0.0294 0.106 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 7.66e-02 0.127 0.0712 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 6.50e-01 0.0411 0.0904 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 9.71e-01 0.00237 0.0647 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0991 0.0936 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 1.01e-02 -0.251 0.0967 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 2.63e-01 0.0971 0.0866 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0266 0.0889 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0212 0.0997 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 2.38e-01 0.0875 0.074 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 1.15e-01 0.12 0.0756 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 7.70e-01 -0.019 0.0649 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 498025 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0469 0.0794 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0233 0.108 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 5.63e-01 0.0375 0.0648 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0742 0.0912 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 1.54e-01 -0.134 0.0933 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0317 0.0652 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 2.74e-01 0.11 0.101 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 8.74e-02 0.0841 0.049 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0924 0.0803 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0416 0.0693 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 2.62e-01 -0.103 0.0913 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 6.47e-01 0.0402 0.0877 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 8.54e-01 -0.016 0.0866 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0096 0.0976 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 2.55e-01 0.0657 0.0575 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0339 0.105 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 1.04e-01 0.145 0.0891 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 1.56e-01 -0.145 0.102 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -900979 sc-eQTL 7.06e-01 0.0352 0.0932 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -683264 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0359 0.0896 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -847510 sc-eQTL 2.39e-01 -0.1 0.085 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 220566 sc-eQTL 3.23e-02 0.17 0.0788 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 349445 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0718 0.0871 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 470453 sc-eQTL 1.44e-01 -0.153 0.105 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -845160 sc-eQTL 6.41e-01 0.034 0.0728 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 221479 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0372 0.0609 0.233 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 220566 eQTL 0.0138 0.0531 0.0215 0.0 0.0 0.247

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina