logo

Genes within 1Mb (chr12:105456369:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0553 0.0947 0.233 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 3.48e-02 0.103 0.0485 0.233 B L1
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 2.11e-01 0.09 0.0717 0.233 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0239 0.0459 0.233 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0461 0.073 0.233 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 1.71e-01 -0.121 0.088 0.233 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 4.18e-01 0.0477 0.0587 0.233 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 7.46e-01 0.0204 0.063 0.233 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0721 0.0688 0.233 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 7.68e-01 0.0174 0.0589 0.233 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 5.00e-01 0.0458 0.0678 0.233 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0349 0.0669 0.233 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 1.91e-01 -0.121 0.0922 0.233 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00467 0.06 0.233 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 8.30e-01 0.0111 0.0518 0.233 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 5.45e-01 0.0503 0.0828 0.233 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 4.24e-01 0.0438 0.0547 0.233 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 6.30e-02 0.145 0.0778 0.233 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 1.55e-02 -0.211 0.0864 0.233 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0281 0.0792 0.233 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0489 0.0485 0.233 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 4.90e-01 0.024 0.0348 0.233 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 4.32e-03 -0.282 0.0976 0.232 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 7.65e-01 0.0205 0.0685 0.232 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 5.78e-01 0.057 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 3.22e-01 0.0817 0.0824 0.232 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0869 0.0698 0.232 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00269 0.0626 0.232 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 7.71e-01 0.03 0.103 0.232 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 1.23e-01 0.0646 0.0417 0.232 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 1.19e-01 -0.129 0.0826 0.233 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0559 0.0594 0.233 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 3.81e-01 0.0825 0.0939 0.233 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 3.68e-02 0.0963 0.0458 0.233 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 1.44e-01 -0.119 0.0809 0.233 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 9.64e-01 0.00311 0.0691 0.233 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0865 0.09 0.233 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00635 0.0904 0.232 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -683664 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0428 0.0889 0.232 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 1.09e-01 -0.129 0.0804 0.232 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 1.17e-02 0.2 0.0786 0.232 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0375 0.0832 0.232 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 3.53e-01 -0.095 0.102 0.232 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.10e-01 0.0376 0.0736 0.232 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0371 0.0603 0.232 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 5.60e-01 -0.059 0.101 0.233 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0291 0.0634 0.233 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0191 0.0827 0.233 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 7.22e-01 0.0386 0.108 0.233 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00155 0.0764 0.233 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 7.90e-02 -0.136 0.0772 0.233 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 8.54e-01 0.0117 0.0635 0.233 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 8.04e-01 0.0262 0.106 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 1.72e-01 0.137 0.0998 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0213 0.113 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 3.78e-01 0.0949 0.107 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0181 0.0803 0.232 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.232 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 9.12e-01 0.0124 0.112 0.232 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 1.69e-01 -0.149 0.108 0.232 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 3.14e-01 -0.109 0.108 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 2.58e-03 0.238 0.0781 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 7.42e-02 0.169 0.0942 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0262 0.082 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 2.58e-01 -0.102 0.0899 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0822 0.104 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0363 0.0927 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0462 0.0969 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 3.81e-01 0.0946 0.108 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00879 0.0912 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 1.41e-01 -0.145 0.0979 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00646 0.0814 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 4.39e-01 0.0738 0.0953 0.235 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 2.34e-01 -0.131 0.11 0.235 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 2.73e-01 0.0995 0.0906 0.235 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 5.16e-01 0.0543 0.0835 0.235 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0781 0.0997 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 1.93e-01 0.0978 0.0749 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 3.92e-01 0.0721 0.084 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0201 0.0757 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0779 0.0874 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 5.20e-01 0.0701 0.109 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.41e-01 0.0345 0.0738 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 1.75e-01 -0.131 0.0965 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 6.28e-01 0.0511 0.105 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0826 0.0914 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 2.78e-01 0.095 0.0874 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 9.87e-01 0.00131 0.0792 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 2.30e-02 0.188 0.0821 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0444 0.112 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 5.31e-01 -0.049 0.078 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 3.95e-01 0.0825 0.0969 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 8.58e-01 0.0182 0.102 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 4.58e-02 -0.167 0.0831 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0281 0.104 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 3.58e-01 0.092 0.0999 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0091 0.101 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0424 0.106 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00909 0.0608 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0689 0.077 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 4.27e-01 0.0527 0.0662 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000898 0.0707 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00192 0.0697 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0896 0.101 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.44e-01 0.0307 0.0663 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0117 0.0906 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 7.41e-02 -0.156 0.0867 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 3.81e-01 0.0562 0.064 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 2.30e-01 0.1 0.0832 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0463 0.0859 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 2.56e-01 -0.121 0.106 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.63e-02 -0.129 0.0701 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0288 0.0699 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 5.98e-01 0.0572 0.108 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 6.21e-01 -0.042 0.0849 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 5.84e-01 0.051 0.093 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 7.92e-01 0.0278 0.105 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0551 0.102 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 4.49e-01 0.0645 0.0849 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0488 0.0681 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 5.34e-01 0.0623 0.1 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 4.05e-02 -0.182 0.0883 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 1.43e-01 0.123 0.0839 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 1.66e-01 -0.129 0.0929 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 2.66e-01 -0.123 0.11 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 9.30e-03 -0.247 0.0942 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 5.27e-01 0.0447 0.0706 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000507 0.0929 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 6.05e-01 0.0429 0.0828 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 4.00e-01 0.0717 0.085 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 3.54e-02 -0.193 0.0914 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 9.95e-01 0.000675 0.0992 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.27e-01 0.036 0.074 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0303 0.0792 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0828 0.109 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0397 0.0948 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0415 0.107 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0641 0.107 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 6.17e-02 0.213 0.113 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 9.17e-02 -0.154 0.0908 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 3.32e-01 -0.098 0.101 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 6.07e-01 0.055 0.107 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00822 0.0983 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0944 0.108 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0676 0.112 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 1.96e-01 0.141 0.109 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 9.64e-01 0.00469 0.102 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 7.28e-01 0.029 0.0835 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 1.75e-01 -0.138 0.101 0.229 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 1.98e-01 -0.117 0.0908 0.229 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 1.49e-01 0.14 0.0969 0.229 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 4.25e-01 0.0915 0.114 0.229 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0791 0.103 0.229 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 9.25e-02 -0.156 0.0922 0.229 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 8.02e-01 0.0194 0.0772 0.229 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 5.92e-01 0.0536 0.0998 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -683664 sc-eQTL 1.99e-02 -0.202 0.086 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 7.74e-02 -0.144 0.0811 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 1.17e-01 0.152 0.0968 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 1.16e-01 0.158 0.1 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 2.55e-01 0.124 0.109 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 4.96e-01 -0.071 0.104 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 6.80e-01 0.039 0.0942 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0533 0.0921 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -683664 sc-eQTL 6.98e-01 -0.035 0.09 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0492 0.0924 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 8.08e-02 0.145 0.0824 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0598 0.0907 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 1.70e-01 -0.15 0.109 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.19e-01 0.0404 0.081 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 7.69e-02 -0.116 0.0652 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 9.33e-01 0.00865 0.103 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -683664 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00715 0.101 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 1.13e-01 -0.147 0.0926 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 7.38e-02 0.183 0.102 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 7.28e-02 -0.19 0.105 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 5.68e-01 0.061 0.107 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.13e-01 0.0531 0.105 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 8.67e-01 0.0129 0.0768 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 4.86e-01 0.0726 0.104 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -683664 sc-eQTL 1.88e-01 -0.127 0.096 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 2.37e-01 -0.113 0.0951 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 7.02e-01 0.0387 0.101 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0568 0.0976 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00728 0.108 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 5.43e-01 0.0519 0.0853 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 8.45e-01 0.014 0.0717 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 1.71e-01 -0.171 0.124 0.233 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 5.50e-01 -0.042 0.07 0.233 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 2.90e-01 0.134 0.126 0.233 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0695 0.108 0.233 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 1.80e-01 -0.154 0.114 0.233 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 7.14e-01 0.0416 0.113 0.233 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0277 0.117 0.233 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 2.36e-01 0.0939 0.0789 0.233 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 6.44e-01 0.0499 0.108 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 9.74e-01 0.00182 0.0565 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 7.77e-01 0.029 0.102 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 3.54e-01 -0.106 0.114 0.237 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 1.44e-01 -0.127 0.0867 0.237 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00857 0.0871 0.237 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0154 0.0728 0.237 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 1.11e-01 -0.165 0.103 0.233 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 7.58e-01 0.0236 0.0765 0.233 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 3.04e-01 0.0937 0.091 0.233 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 3.11e-02 -0.218 0.1 0.233 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 9.74e-01 0.00334 0.102 0.233 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.42e-01 0.0384 0.0824 0.233 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0493 0.0659 0.233 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 3.15e-02 -0.22 0.102 0.232 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 8.02e-01 0.0192 0.0765 0.232 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 2.57e-01 0.123 0.108 0.232 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 8.33e-02 0.167 0.0961 0.232 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0474 0.0845 0.232 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0132 0.0751 0.232 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.96e-01 0.0446 0.114 0.232 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 6.00e-01 0.0428 0.0813 0.232 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0851 0.0985 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 8.37e-01 0.0139 0.0676 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 3.62e-01 0.0927 0.102 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 9.29e-02 0.088 0.0521 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00302 0.0854 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0263 0.0806 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0138 0.0947 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 2.36e-01 -0.121 0.102 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0618 0.0746 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 6.59e-01 0.0489 0.111 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 4.00e-01 0.065 0.077 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 5.02e-02 -0.18 0.0913 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 3.43e-01 -0.083 0.0874 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 9.52e-02 -0.158 0.094 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0742 0.118 0.23 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 3.33e-02 0.239 0.111 0.23 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 2.23e-01 -0.136 0.111 0.23 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00563 0.132 0.23 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 7.43e-01 0.0431 0.131 0.23 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0344 0.123 0.23 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 9.32e-01 0.00894 0.104 0.23 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 1.56e-01 0.138 0.0972 0.233 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0951 0.0994 0.233 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 4.46e-01 0.0795 0.104 0.233 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 1.08e-01 0.141 0.0876 0.233 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0279 0.107 0.233 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 3.84e-01 0.0973 0.111 0.233 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 1.01e-01 -0.151 0.0916 0.233 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 9.89e-01 0.00125 0.0924 0.235 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 2.85e-01 0.102 0.0953 0.235 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 2.89e-01 -0.104 0.0974 0.235 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 4.73e-01 0.0473 0.0658 0.235 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 8.14e-02 -0.184 0.105 0.235 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 2.59e-01 0.106 0.0937 0.235 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 3.13e-01 -0.103 0.102 0.235 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 6.88e-01 0.0482 0.12 0.229 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 9.65e-02 0.127 0.076 0.229 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 6.05e-01 0.0611 0.118 0.229 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0918 0.112 0.229 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 8.95e-01 0.0115 0.0871 0.229 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 9.41e-01 0.00565 0.0759 0.229 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.85e-02 0.209 0.114 0.229 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 1.90e-01 0.0957 0.0727 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 7.82e-01 0.0294 0.106 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 7.66e-02 0.127 0.0712 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 6.50e-01 0.0411 0.0904 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 9.71e-01 0.00237 0.0647 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0991 0.0936 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 1.01e-02 -0.251 0.0967 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 2.63e-01 0.0971 0.0866 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0266 0.0889 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0212 0.0997 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 2.38e-01 0.0875 0.074 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 1.15e-01 0.12 0.0756 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 7.70e-01 -0.019 0.0649 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 497625 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0469 0.0794 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0233 0.108 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 5.63e-01 0.0375 0.0648 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0742 0.0912 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 1.54e-01 -0.134 0.0933 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0317 0.0652 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 2.74e-01 0.11 0.101 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 8.74e-02 0.0841 0.049 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0924 0.0803 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0416 0.0693 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 2.62e-01 -0.103 0.0913 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 6.47e-01 0.0402 0.0877 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 8.54e-01 -0.016 0.0866 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0096 0.0976 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 2.55e-01 0.0657 0.0575 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0339 0.105 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 1.04e-01 0.145 0.0891 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 1.56e-01 -0.145 0.102 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -901379 sc-eQTL 7.06e-01 0.0352 0.0932 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -683664 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0359 0.0896 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -847910 sc-eQTL 2.39e-01 -0.1 0.085 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 220166 sc-eQTL 3.23e-02 0.17 0.0788 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 349045 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0718 0.0871 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 470053 sc-eQTL 1.44e-01 -0.153 0.105 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -845560 sc-eQTL 6.41e-01 0.034 0.0728 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 221079 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0372 0.0609 0.233 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 220166 eQTL 0.014 0.0534 0.0217 0.0 0.0 0.247

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina