Genes within 1Mb (chr12:105447655:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0416 0.164 0.064 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 1.27e-01 0.129 0.0842 0.064 B L1
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 9.54e-02 0.207 0.124 0.064 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0554 0.0792 0.064 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 9.65e-01 0.00551 0.126 0.064 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 4.07e-01 0.127 0.153 0.064 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 6.79e-01 0.0421 0.102 0.064 B L1
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0288 0.118 0.064 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 8.30e-01 0.0235 0.109 0.064 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 2.81e-01 -0.129 0.12 0.064 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0684 0.102 0.064 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 9.86e-01 0.00204 0.118 0.064 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 5.95e-01 0.0619 0.116 0.064 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 1.60e-01 0.226 0.16 0.064 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 1.19e-01 0.162 0.104 0.064 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 8.56e-01 0.0194 0.107 0.064 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0253 0.09 0.064 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0775 0.145 0.064 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 5.77e-01 0.0534 0.0956 0.064 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 5.67e-02 -0.26 0.136 0.064 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 5.54e-01 0.0906 0.153 0.064 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 3.54e-01 0.128 0.138 0.064 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 4.47e-01 0.0645 0.0848 0.064 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0485 0.0869 0.064 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00881 0.0608 0.064 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 3.15e-01 -0.166 0.165 0.065 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 2.02e-01 -0.145 0.113 0.065 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 2.97e-01 -0.177 0.169 0.065 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 2.71e-02 -0.301 0.135 0.065 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 3.63e-01 -0.106 0.116 0.065 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 9.85e-01 -0.002 0.104 0.065 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 5.71e-01 -0.097 0.171 0.065 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0529 0.145 0.065 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 7.71e-02 -0.123 0.0691 0.065 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 7.45e-01 0.0465 0.143 0.064 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 2.79e-02 -0.224 0.101 0.064 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0677 0.162 0.064 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0384 0.0795 0.064 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 4.15e-01 0.114 0.139 0.064 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 9.78e-01 0.00321 0.119 0.064 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 7.99e-02 -0.21 0.119 0.064 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 6.80e-01 0.0641 0.155 0.064 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 5.94e-01 0.0834 0.156 0.064 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -692378 sc-eQTL 5.09e-01 -0.102 0.154 0.064 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0847 0.14 0.064 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0465 0.138 0.064 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0387 0.144 0.064 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 7.33e-02 0.316 0.176 0.064 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 7.13e-01 0.0469 0.127 0.064 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0101 0.135 0.064 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 9.75e-01 0.00325 0.104 0.064 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 2.62e-01 0.201 0.178 0.064 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0608 0.112 0.064 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 5.93e-02 -0.275 0.145 0.064 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0052 0.192 0.064 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0107 0.135 0.064 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 1.71e-01 0.188 0.137 0.064 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0202 0.142 0.064 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 1.15e-02 -0.282 0.111 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 1.46e-01 0.262 0.179 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 4.59e-02 -0.341 0.17 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 8.47e-01 0.0373 0.194 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 4.90e-01 -0.127 0.184 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 5.93e-01 0.0736 0.137 0.061 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 9.28e-01 0.0173 0.191 0.061 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 2.00e-01 0.245 0.19 0.061 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 5.35e-01 -0.115 0.186 0.061 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 4.00e-01 0.156 0.185 0.061 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 7.85e-02 -0.332 0.188 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 2.88e-01 0.149 0.14 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 4.99e-02 0.325 0.165 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 3.55e-01 0.133 0.144 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 1.26e-01 -0.241 0.157 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0333 0.183 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 4.06e-01 -0.135 0.162 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 3.12e-01 0.151 0.149 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0803 0.17 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 6.05e-02 -0.347 0.184 0.065 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 1.28e-01 0.238 0.156 0.065 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 4.57e-01 -0.126 0.169 0.065 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 1.12e-01 0.222 0.139 0.065 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 2.32e-01 0.196 0.163 0.065 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 4.54e-01 -0.142 0.189 0.065 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 7.84e-01 0.0428 0.156 0.065 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 4.83e-01 0.114 0.162 0.065 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0889 0.143 0.065 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 5.46e-01 -0.103 0.171 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 5.62e-03 0.354 0.126 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 3.00e-02 0.312 0.143 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 1.83e-01 -0.172 0.129 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 8.93e-01 0.0202 0.15 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 7.38e-01 0.0623 0.186 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 4.36e-01 0.0985 0.126 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 3.19e-01 -0.146 0.146 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 3.99e-01 0.14 0.166 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 6.57e-03 0.498 0.181 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 4.35e-02 0.322 0.159 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 5.99e-01 0.0806 0.153 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 5.31e-01 0.0869 0.138 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 8.09e-01 0.0351 0.145 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 4.83e-01 0.138 0.197 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 3.25e-01 0.134 0.136 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 3.17e-01 0.142 0.141 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 5.99e-01 0.0893 0.17 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 9.93e-01 0.00151 0.172 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 3.37e-01 0.137 0.142 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 1.88e-01 0.233 0.176 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 4.76e-01 -0.121 0.169 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0779 0.171 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 8.24e-01 -0.04 0.18 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 4.95e-01 0.104 0.152 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 2.56e-01 0.117 0.103 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 4.50e-01 -0.101 0.134 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0929 0.115 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 9.44e-01 0.00858 0.122 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 4.09e-01 0.0998 0.121 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 3.12e-01 0.178 0.176 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 1.34e-01 0.172 0.114 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 7.87e-01 0.0301 0.111 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 4.37e-01 -0.122 0.157 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 3.99e-02 -0.311 0.15 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 8.40e-01 0.0225 0.112 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 7.70e-01 0.0426 0.145 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 3.15e-01 0.15 0.149 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 6.54e-02 0.34 0.183 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 6.64e-01 0.0535 0.123 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 9.02e-01 0.0168 0.137 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 1.54e-01 -0.173 0.121 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 5.84e-01 0.103 0.188 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 4.83e-01 -0.104 0.148 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 5.50e-03 -0.446 0.159 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 3.00e-02 -0.395 0.181 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 3.82e-01 -0.155 0.177 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 3.72e-01 0.132 0.148 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 9.57e-01 0.00867 0.159 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 4.68e-01 0.0862 0.119 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0687 0.176 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 1.23e-01 -0.242 0.156 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 8.68e-01 0.0247 0.148 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 9.66e-03 0.422 0.162 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00385 0.194 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 3.07e-01 0.172 0.168 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0835 0.143 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0588 0.124 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0685 0.158 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 6.45e-01 0.065 0.141 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 1.23e-01 -0.223 0.144 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 8.00e-01 0.0398 0.157 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 6.16e-01 0.0847 0.169 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 9.01e-01 0.0157 0.126 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 9.03e-01 0.0137 0.112 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 4.25e-01 -0.108 0.134 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0819 0.181 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 4.58e-01 0.117 0.158 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 4.28e-01 -0.141 0.177 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 5.32e-01 -0.112 0.178 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000311 0.19 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 4.37e-01 0.118 0.152 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0891 0.124 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 5.25e-01 -0.107 0.168 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 2.42e-01 0.234 0.199 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 1.80e-01 -0.247 0.183 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 3.67e-01 -0.183 0.202 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0596 0.21 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 8.02e-02 0.357 0.203 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0605 0.192 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 4.53e-01 0.15 0.199 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 4.44e-02 -0.313 0.155 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 5.30e-01 0.11 0.176 0.063 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00806 0.158 0.063 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 2.79e-01 -0.183 0.168 0.063 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 5.15e-01 -0.129 0.198 0.063 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 6.38e-01 0.0839 0.178 0.063 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 2.06e-01 0.203 0.16 0.063 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0299 0.159 0.063 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 1.26e-01 -0.204 0.133 0.063 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 2.04e-01 0.231 0.181 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -692378 sc-eQTL 8.94e-01 0.0212 0.159 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 8.66e-01 0.0251 0.149 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 1.83e-01 0.236 0.177 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0871 0.183 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 3.85e-01 0.173 0.198 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 1.66e-01 0.263 0.189 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 2.27e-01 0.197 0.162 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 6.66e-02 -0.314 0.17 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 4.60e-01 0.117 0.158 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -692378 sc-eQTL 8.93e-01 0.0208 0.154 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0525 0.158 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 3.59e-01 -0.131 0.142 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 2.59e-01 0.176 0.155 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 2.09e-01 0.235 0.186 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 6.10e-01 0.071 0.139 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 6.68e-01 0.0621 0.144 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 7.93e-01 0.0296 0.113 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0913 0.198 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -692378 sc-eQTL 9.63e-01 0.00907 0.193 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 6.37e-02 -0.33 0.177 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 1.99e-01 0.253 0.196 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 9.44e-01 0.0143 0.203 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00663 0.205 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 1.08e-01 0.322 0.2 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 4.90e-01 0.124 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 5.61e-01 0.0858 0.147 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0369 0.176 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -692378 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0929 0.163 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 4.06e-01 -0.134 0.161 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 2.56e-01 -0.193 0.17 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 1.86e-01 -0.218 0.164 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 1.64e-01 0.254 0.181 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0745 0.144 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 2.74e-01 -0.163 0.148 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 1.68e-01 -0.167 0.12 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 9.41e-01 0.0163 0.22 0.059 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0366 0.123 0.059 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 2.03e-01 0.283 0.221 0.059 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 2.45e-01 -0.22 0.189 0.059 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 3.64e-01 0.184 0.201 0.059 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 8.67e-01 0.0335 0.199 0.059 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 5.89e-02 0.387 0.203 0.059 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 1.17e-01 -0.281 0.178 0.059 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0659 0.14 0.059 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 4.05e-02 -0.374 0.181 0.065 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0289 0.0956 0.065 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 8.62e-02 -0.297 0.172 0.065 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 3.29e-01 -0.188 0.193 0.065 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 3.89e-01 -0.127 0.147 0.065 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 9.38e-02 -0.247 0.147 0.065 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 8.17e-01 0.0386 0.167 0.065 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 6.96e-02 -0.223 0.122 0.065 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 5.45e-01 -0.108 0.178 0.064 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0726 0.132 0.064 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 4.69e-01 -0.114 0.157 0.064 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 3.89e-01 -0.151 0.174 0.064 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 3.92e-01 0.151 0.176 0.064 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 6.17e-01 0.0711 0.142 0.064 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0633 0.125 0.064 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0693 0.114 0.064 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0872 0.165 0.066 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 1.30e-01 -0.186 0.122 0.066 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0464 0.175 0.066 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 2.21e-01 -0.191 0.155 0.066 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 1.76e-01 -0.184 0.135 0.066 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0109 0.121 0.066 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 5.65e-01 0.106 0.183 0.066 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0954 0.162 0.066 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 1.87e-01 -0.173 0.13 0.066 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 1.99e-01 0.218 0.169 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 2.07e-01 -0.147 0.116 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 5.18e-01 0.114 0.175 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 2.28e-01 -0.109 0.0901 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 3.25e-02 0.314 0.146 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 8.77e-01 0.0215 0.139 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 3.71e-01 -0.12 0.133 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0541 0.163 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 5.45e-01 -0.105 0.174 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 7.32e-02 -0.228 0.126 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 5.07e-01 -0.125 0.188 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0321 0.131 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 3.29e-01 -0.153 0.157 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 7.33e-01 -0.051 0.149 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 2.17e-02 -0.327 0.142 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 5.70e-01 0.0917 0.161 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0703 0.211 0.07 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 4.25e-01 -0.161 0.201 0.07 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0385 0.2 0.07 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 8.92e-01 0.0321 0.236 0.07 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 4.90e-01 0.162 0.234 0.07 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 2.49e-01 0.253 0.218 0.07 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 7.55e-01 0.0607 0.194 0.07 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 2.72e-01 -0.204 0.185 0.07 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 2.30e-01 -0.201 0.167 0.067 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 2.48e-01 -0.197 0.17 0.067 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 2.07e-01 -0.226 0.178 0.067 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0894 0.151 0.067 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 2.04e-01 0.232 0.183 0.067 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 7.84e-02 -0.337 0.19 0.067 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 5.80e-01 0.0917 0.165 0.067 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 4.30e-01 0.125 0.158 0.067 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 3.84e-01 -0.15 0.171 0.061 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 2.89e-02 -0.387 0.176 0.061 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 3.28e-02 -0.386 0.18 0.061 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 1.12e-01 0.194 0.122 0.061 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0741 0.196 0.061 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 5.59e-01 0.102 0.175 0.061 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 7.49e-01 0.0483 0.151 0.061 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0991 0.19 0.061 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 1.49e-01 -0.303 0.209 0.062 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 7.43e-02 -0.24 0.134 0.062 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0685 0.207 0.062 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 2.96e-03 -0.577 0.191 0.062 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 8.30e-01 -0.033 0.153 0.062 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0204 0.134 0.062 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 5.07e-01 -0.135 0.202 0.062 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 2.53e-01 0.217 0.189 0.062 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 4.42e-02 -0.258 0.127 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 1.24e-01 -0.287 0.186 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 3.38e-01 0.121 0.126 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 3.94e-01 0.136 0.159 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 3.74e-01 0.101 0.114 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0784 0.165 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0376 0.173 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 9.70e-01 0.00569 0.153 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 5.86e-01 0.0809 0.148 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 4.75e-01 -0.112 0.156 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 4.11e-01 0.143 0.173 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 2.45e-02 0.289 0.128 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 1.45e-01 0.193 0.132 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 3.47e-01 -0.106 0.113 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 488911 sc-eQTL 8.85e-01 -0.02 0.138 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 5.47e-01 0.113 0.188 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 5.15e-01 0.0735 0.113 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0308 0.134 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 3.34e-01 0.154 0.159 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 2.48e-01 0.185 0.16 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 1.18e-01 -0.174 0.111 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 7.65e-01 0.0519 0.173 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0467 0.0845 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 2.49e-01 0.159 0.138 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 8.86e-01 0.0171 0.119 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 6.03e-02 -0.232 0.123 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 7.38e-01 0.0526 0.157 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 2.00e-01 -0.197 0.154 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 1.49e-02 -0.368 0.15 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 3.57e-01 -0.158 0.171 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 2.34e-01 0.12 0.101 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 9.00e-01 0.0233 0.184 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 3.32e-01 -0.153 0.157 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00939 0.15 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 9.04e-01 0.0217 0.18 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -910093 sc-eQTL 8.47e-01 0.031 0.16 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -692378 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0861 0.154 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -856624 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0983 0.146 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 211452 sc-eQTL 3.06e-01 -0.14 0.137 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 340331 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00226 0.15 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 461339 sc-eQTL 7.98e-02 0.316 0.179 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 sc-eQTL 8.57e-01 0.0227 0.125 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 992360 sc-eQTL 7.64e-01 -0.041 0.137 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 212365 sc-eQTL 8.56e-01 0.019 0.105 0.065 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000166046 TCP11L2 -854274 eQTL 0.0349 0.0616 0.0292 0.0 0.0 0.0667


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina