logo

Genes within 1Mb (chr12:105397537:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 6.47e-01 0.0614 0.134 0.107 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0559 0.0691 0.107 B L1
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 2.80e-01 -0.11 0.101 0.107 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 9.98e-01 0.0002 0.0648 0.107 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 1.90e-01 0.135 0.103 0.107 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0138 0.125 0.107 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0443 0.083 0.107 B L1
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 5.49e-02 0.185 0.0959 0.107 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0166 0.089 0.107 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0651 0.0975 0.107 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 8.74e-01 0.0133 0.0833 0.107 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 4.76e-02 0.19 0.0951 0.107 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 7.80e-01 0.0265 0.0946 0.107 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0963 0.131 0.107 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 3.82e-01 0.0742 0.0846 0.107 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0754 0.0867 0.107 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 7.15e-01 0.0268 0.0733 0.107 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00229 0.116 0.107 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 1.11e-01 0.122 0.0765 0.107 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 4.33e-01 0.0864 0.11 0.107 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 4.21e-01 0.0991 0.123 0.107 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 2.19e-03 -0.338 0.109 0.107 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 2.27e-01 0.0824 0.068 0.107 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0809 0.0697 0.107 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00111 0.0489 0.107 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 4.53e-01 0.0999 0.133 0.11 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 7.43e-01 0.0301 0.0916 0.11 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 2.21e-01 -0.167 0.136 0.11 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 8.42e-01 -0.022 0.11 0.11 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0385 0.0935 0.11 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 7.44e-01 0.0273 0.0837 0.11 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0265 0.138 0.11 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 8.16e-01 0.0272 0.117 0.11 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 6.69e-01 -0.024 0.0561 0.11 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0722 0.116 0.107 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0254 0.0832 0.107 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0658 0.131 0.107 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 1.03e-01 0.105 0.0643 0.107 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 2.87e-01 -0.121 0.113 0.107 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0864 0.0964 0.107 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 1.05e-01 0.158 0.0971 0.107 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 8.51e-01 0.0238 0.126 0.107 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 1.95e-01 -0.163 0.126 0.107 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -742496 sc-eQTL 1.88e-01 0.164 0.124 0.107 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 8.59e-01 0.0201 0.113 0.107 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 4.03e-01 0.0933 0.111 0.107 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 3.81e-01 -0.102 0.116 0.107 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 4.27e-01 -0.114 0.143 0.107 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 8.87e-01 0.0147 0.103 0.107 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 7.76e-01 -0.031 0.109 0.107 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 8.26e-02 0.146 0.0837 0.107 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 6.80e-01 0.0596 0.144 0.107 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 9.87e-01 0.00146 0.0905 0.107 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 7.93e-01 0.0309 0.118 0.107 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 3.32e-01 -0.15 0.154 0.107 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 5.90e-01 0.0588 0.109 0.107 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 3.12e-02 0.238 0.11 0.107 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 9.48e-01 0.00743 0.115 0.107 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 2.22e-01 0.111 0.0903 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0358 0.15 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0409 0.143 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 2.82e-01 -0.174 0.161 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 2.97e-01 0.16 0.153 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 9.14e-01 0.0123 0.114 0.112 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 5.97e-01 -0.084 0.159 0.112 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 1.20e-01 -0.247 0.158 0.112 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 5.64e-01 0.0893 0.154 0.112 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 1.68e-01 0.212 0.153 0.112 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 1.79e-01 0.203 0.15 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00434 0.112 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0112 0.133 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 5.20e-01 0.0739 0.115 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 5.11e-01 0.083 0.126 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0741 0.146 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 3.69e-01 0.117 0.13 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 9.27e-01 0.011 0.119 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 2.63e-01 0.152 0.135 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 5.30e-01 0.094 0.149 0.108 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0695 0.126 0.108 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0681 0.136 0.108 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0177 0.113 0.108 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 2.34e-01 0.157 0.132 0.108 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 4.55e-01 0.114 0.152 0.108 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 2.80e-01 0.136 0.125 0.108 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 7.71e-01 0.038 0.13 0.108 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 1.25e-01 0.177 0.115 0.108 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 9.60e-01 0.00715 0.142 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0987 0.107 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 1.63e-01 -0.167 0.119 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0766 0.107 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 8.63e-01 0.0214 0.124 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 4.42e-01 0.119 0.154 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 3.76e-01 -0.093 0.105 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 6.37e-02 0.224 0.12 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 1.70e-01 -0.189 0.137 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 1.07e-01 -0.237 0.146 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 8.16e-01 0.0298 0.128 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 9.44e-01 0.00854 0.122 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0396 0.11 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 1.52e-01 0.166 0.115 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 9.39e-01 -0.012 0.157 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 2.79e-01 -0.118 0.109 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 4.78e-02 0.223 0.112 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 6.93e-01 0.0534 0.135 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 1.79e-01 -0.194 0.144 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 3.54e-01 -0.111 0.119 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 4.04e-01 0.124 0.148 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 1.76e-01 0.193 0.142 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0452 0.144 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 2.59e-01 0.17 0.15 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 7.03e-01 0.0489 0.128 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0104 0.0866 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 2.42e-01 -0.127 0.108 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 9.03e-01 0.0114 0.0932 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 1.98e-01 0.128 0.099 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0418 0.0979 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0335 0.143 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 4.05e-01 0.0776 0.0931 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 9.00e-01 0.0114 0.0901 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 6.66e-01 -0.055 0.127 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 4.95e-01 0.0832 0.122 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0646 0.0895 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 1.33e-01 0.175 0.116 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0323 0.12 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 4.13e-01 -0.122 0.148 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 8.94e-01 0.0131 0.0986 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 3.28e-01 -0.107 0.11 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 1.22e-01 0.151 0.0971 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0207 0.152 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 8.21e-01 -0.027 0.12 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 5.03e-01 0.0876 0.131 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 6.20e-01 0.0734 0.148 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 4.04e-02 -0.293 0.142 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 8.21e-01 0.0271 0.12 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 8.90e-02 -0.218 0.128 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 9.87e-01 0.00153 0.096 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00424 0.144 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 9.21e-02 0.216 0.127 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 8.13e-02 0.211 0.12 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 8.25e-01 0.0298 0.134 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 1.91e-01 -0.207 0.158 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0254 0.138 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 1.56e-01 -0.166 0.117 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 2.56e-01 0.115 0.101 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 1.94e-01 -0.165 0.127 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 8.89e-01 0.0158 0.114 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 9.38e-01 0.00907 0.117 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 5.77e-01 0.0707 0.126 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 2.31e-02 -0.307 0.134 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 1.57e-01 0.143 0.101 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0522 0.0902 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0291 0.108 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 1.91e-01 0.191 0.145 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 1.20e-03 0.407 0.124 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 3.05e-02 -0.308 0.141 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0301 0.144 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 1.32e-01 -0.231 0.153 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 2.27e-01 0.148 0.122 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 7.50e-01 -0.032 0.1 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 6.02e-01 0.0709 0.136 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 3.18e-01 0.157 0.157 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 3.14e-01 0.146 0.144 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 3.45e-01 -0.151 0.159 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 7.61e-01 0.0503 0.165 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 1.65e-02 -0.384 0.159 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 2.01e-01 -0.193 0.15 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 9.66e-01 0.00674 0.157 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 1.92e-01 0.16 0.122 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 2.72e-01 0.156 0.142 0.108 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 2.05e-01 0.162 0.127 0.108 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0819 0.136 0.108 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0842 0.16 0.108 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 7.03e-01 0.055 0.144 0.108 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 6.35e-02 0.24 0.129 0.108 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 4.21e-01 -0.103 0.128 0.108 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 7.55e-01 0.0338 0.108 0.108 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 1.71e-01 -0.194 0.141 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -742496 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0153 0.124 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0464 0.116 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 1.77e-01 0.187 0.138 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 3.37e-03 -0.416 0.14 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 3.45e-01 -0.146 0.155 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 6.45e-01 0.0684 0.148 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 4.44e-01 0.0975 0.127 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 4.02e-01 0.112 0.134 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 2.29e-01 -0.154 0.127 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -742496 sc-eQTL 1.31e-01 0.188 0.124 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 4.22e-01 0.103 0.128 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 2.26e-01 0.139 0.115 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 6.62e-01 0.0551 0.126 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 7.13e-02 -0.272 0.15 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0997 0.112 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 5.11e-01 -0.077 0.117 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 1.86e-02 0.213 0.09 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0824 0.147 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -742496 sc-eQTL 1.79e-01 0.192 0.143 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 4.48e-01 -0.101 0.132 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0721 0.146 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 8.91e-01 0.0208 0.151 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 9.08e-02 0.256 0.151 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00191 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 4.37e-01 0.103 0.133 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 2.17e-01 0.135 0.109 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 2.52e-01 -0.165 0.144 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -742496 sc-eQTL 2.88e-01 0.141 0.133 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0842 0.132 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 7.50e-01 0.0444 0.139 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0544 0.135 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0587 0.149 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 5.16e-01 0.0765 0.118 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0109 0.122 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 2.37e-01 0.117 0.0986 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0545 0.182 0.111 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 2.67e-01 0.114 0.102 0.111 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 6.38e-01 0.0871 0.185 0.111 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0397 0.158 0.111 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 7.52e-01 0.0533 0.168 0.111 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 3.57e-01 -0.153 0.165 0.111 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 2.99e-01 0.178 0.17 0.111 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 7.76e-01 0.0425 0.149 0.111 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 2.30e-01 0.139 0.115 0.111 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00123 0.152 0.109 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0893 0.0792 0.109 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 7.42e-01 0.0474 0.144 0.109 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 9.84e-01 0.00326 0.16 0.109 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 2.53e-01 0.14 0.122 0.109 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 7.27e-01 0.0428 0.123 0.109 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 7.28e-01 0.0483 0.139 0.109 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 1.69e-01 0.141 0.102 0.109 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0606 0.144 0.107 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 8.97e-01 0.0138 0.107 0.107 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0495 0.127 0.107 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 4.02e-02 0.289 0.14 0.107 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 7.92e-01 0.0376 0.142 0.107 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0373 0.115 0.107 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 6.03e-02 -0.189 0.1 0.107 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0894 0.0918 0.107 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 1.02e-01 0.222 0.135 0.11 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 7.28e-01 0.0352 0.101 0.11 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 7.56e-01 0.0446 0.143 0.11 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 3.23e-01 0.127 0.128 0.11 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 2.02e-01 0.142 0.111 0.11 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 1.63e-01 0.138 0.0987 0.11 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 1.19e-01 -0.234 0.15 0.11 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0111 0.133 0.11 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0616 0.107 0.11 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0935 0.138 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0624 0.0942 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0301 0.142 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 2.19e-01 0.09 0.073 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 3.01e-02 -0.257 0.118 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0969 0.112 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 4.54e-02 0.216 0.107 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00187 0.132 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 8.32e-01 0.0299 0.141 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0911 0.103 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0609 0.152 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 4.03e-01 0.0888 0.106 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 9.79e-01 0.00337 0.127 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 4.31e-01 0.0949 0.12 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 9.80e-01 0.00284 0.116 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 8.25e-01 0.0288 0.13 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 6.82e-01 0.0685 0.167 0.106 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0929 0.159 0.106 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 3.85e-01 0.137 0.157 0.106 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 2.41e-01 0.218 0.185 0.106 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 4.66e-01 -0.135 0.185 0.106 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 2.66e-01 0.193 0.173 0.106 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 1.72e-01 0.209 0.152 0.106 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 2.76e-01 -0.16 0.146 0.106 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 9.92e-02 -0.231 0.14 0.109 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0473 0.143 0.109 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0215 0.15 0.109 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 1.22e-01 -0.196 0.126 0.109 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 3.81e-01 -0.135 0.153 0.109 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 4.22e-01 -0.129 0.161 0.109 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 7.85e-02 -0.244 0.138 0.109 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 5.49e-01 0.0797 0.133 0.109 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 2.55e-01 -0.15 0.131 0.106 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0473 0.136 0.106 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0433 0.139 0.106 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 4.27e-01 0.0746 0.0938 0.106 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 2.79e-01 0.163 0.15 0.106 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 3.17e-01 -0.134 0.134 0.106 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0454 0.116 0.106 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 1.04e-01 0.237 0.145 0.106 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 8.13e-01 0.039 0.165 0.107 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0221 0.106 0.107 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 4.43e-01 -0.125 0.162 0.107 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 3.33e-01 -0.149 0.154 0.107 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 7.27e-02 -0.215 0.119 0.107 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0192 0.105 0.107 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0372 0.159 0.107 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 4.59e-01 -0.11 0.149 0.107 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0494 0.101 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 2.30e-01 0.18 0.15 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 9.90e-01 0.00126 0.101 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0715 0.128 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 4.75e-01 0.0653 0.0913 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 1.20e-01 0.206 0.132 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 8.75e-01 0.0219 0.139 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 1.34e-01 0.184 0.122 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0367 0.119 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 1.12e-01 0.2 0.125 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 2.37e-01 -0.167 0.14 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 3.59e-01 0.0962 0.105 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 2.62e-01 -0.12 0.107 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00963 0.0917 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 sc-eQTL 2.53e-01 0.128 0.112 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 6.32e-01 0.0731 0.153 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 2.37e-01 -0.108 0.0912 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 4.34e-02 0.218 0.107 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0692 0.129 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0422 0.131 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0499 0.0908 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0442 0.141 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 2.87e-01 0.0731 0.0686 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 1.14e-01 -0.177 0.112 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0757 0.0965 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 8.97e-02 0.17 0.0999 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 9.19e-01 -0.013 0.128 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 4.20e-01 -0.1 0.124 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 7.74e-01 0.0352 0.123 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0661 0.138 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0453 0.0816 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 9.91e-01 0.00173 0.149 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 2.05e-01 -0.161 0.126 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0758 0.12 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 2.37e-01 0.172 0.145 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -960211 sc-eQTL 2.93e-01 -0.137 0.129 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -742496 sc-eQTL 1.41e-01 0.183 0.124 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -906742 sc-eQTL 8.06e-01 0.0292 0.119 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 161334 sc-eQTL 3.57e-01 0.102 0.111 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 290213 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0108 0.121 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 411221 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0509 0.146 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -904392 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00649 0.101 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 942242 sc-eQTL 8.93e-01 -0.015 0.111 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 162247 sc-eQTL 9.81e-02 0.14 0.0844 0.106 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136052 SLC41A2 438793 eQTL 0.000226 0.213 0.0574 0.0 0.0 0.104
ENSG00000171310 CHST11 942242 eQTL 0.00332 0.0693 0.0236 0.0 0.0 0.104

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina