Genes within 1Mb (chr12:105397392:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 9.32e-01 0.00772 0.0905 0.276 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0206 0.0467 0.276 B L1
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 7.81e-01 0.0191 0.0687 0.276 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 4.50e-01 0.0331 0.0438 0.276 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0831 0.0696 0.276 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 2.38e-01 0.0995 0.0841 0.276 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0596 0.056 0.276 B L1
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0523 0.0653 0.276 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 8.90e-02 -0.102 0.0597 0.276 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 8.62e-02 0.116 0.0674 0.276 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 3.19e-01 0.0578 0.0578 0.276 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 2.65e-01 0.0745 0.0666 0.276 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0106 0.0658 0.276 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0058 0.0911 0.276 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 4.11e-01 0.0485 0.0589 0.276 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 8.86e-01 0.00864 0.0604 0.276 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0193 0.051 0.276 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 4.84e-02 0.159 0.0801 0.276 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0431 0.0533 0.276 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 2.18e-01 0.0942 0.0762 0.276 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 1.60e-02 -0.205 0.0842 0.276 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 4.60e-01 0.0572 0.0772 0.276 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0117 0.0474 0.276 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 5.25e-01 0.0309 0.0485 0.276 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 7.88e-01 -0.00912 0.034 0.276 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 7.57e-02 -0.164 0.0919 0.273 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 2.97e-01 0.0664 0.0635 0.273 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 8.18e-01 0.0219 0.0951 0.273 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 4.20e-01 0.0619 0.0766 0.273 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 5.04e-01 0.0435 0.065 0.273 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 4.81e-01 0.041 0.0581 0.273 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 2.64e-01 0.107 0.0954 0.273 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 9.71e-01 0.00297 0.0814 0.273 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 8.68e-01 0.00649 0.039 0.273 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0483 0.0786 0.276 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 2.03e-01 0.0717 0.0561 0.276 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 4.03e-02 0.182 0.0882 0.276 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0388 0.0438 0.276 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 7.74e-01 0.0222 0.077 0.276 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 9.12e-01 0.00726 0.0654 0.276 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 7.09e-01 0.0247 0.0661 0.276 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 6.66e-01 0.0369 0.0854 0.276 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 9.73e-02 -0.146 0.0874 0.275 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -742641 sc-eQTL 7.30e-02 -0.155 0.086 0.275 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0184 0.0787 0.275 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 5.13e-01 0.0508 0.0776 0.275 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 2.58e-01 0.0916 0.0808 0.275 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 2.15e-01 -0.123 0.0992 0.275 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00761 0.0717 0.275 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 3.46e-01 0.0713 0.0755 0.275 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 9.25e-01 0.00555 0.0587 0.275 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 2.22e-02 -0.223 0.0967 0.276 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0514 0.0613 0.276 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 1.19e-01 0.125 0.0796 0.276 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 8.92e-01 0.0142 0.105 0.276 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 1.13e-01 0.117 0.0735 0.276 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0425 0.0752 0.276 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 4.07e-01 0.0645 0.0776 0.276 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0449 0.0614 0.276 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0762 0.0982 0.283 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 3.13e-01 0.0943 0.0932 0.283 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 1.42e-01 0.155 0.105 0.283 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0275 0.1 0.283 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 8.28e-01 0.0163 0.0749 0.283 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0136 0.104 0.283 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0488 0.104 0.283 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 2.75e-01 0.11 0.101 0.283 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0257 0.101 0.283 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0213 0.105 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0434 0.0776 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0793 0.0921 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0666 0.0797 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 6.36e-01 0.0415 0.0876 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 5.77e-01 0.0565 0.101 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 7.39e-01 0.03 0.0901 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0189 0.0829 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0773 0.0942 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00775 0.104 0.272 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0126 0.0878 0.272 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 9.89e-01 0.00134 0.0948 0.272 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00176 0.0783 0.272 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0492 0.0918 0.272 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0731 0.106 0.272 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0903 0.0872 0.272 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0552 0.0906 0.272 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 1.21e-01 -0.124 0.0799 0.272 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00158 0.0936 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0409 0.0704 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 7.68e-01 0.0233 0.0789 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 2.63e-01 0.0793 0.0707 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0463 0.082 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 4.98e-01 0.0691 0.102 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0392 0.0691 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0257 0.08 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0865 0.0906 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 3.71e-01 0.0892 0.0995 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0993 0.0862 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 6.31e-01 0.0398 0.0827 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 2.94e-01 0.0785 0.0746 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0406 0.0785 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 6.19e-01 0.0529 0.106 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 1.30e-01 -0.112 0.0734 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 1.01e-01 -0.126 0.0761 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 2.14e-01 -0.114 0.0913 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0201 0.0962 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 1.98e-01 -0.102 0.0791 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 3.42e-01 0.0941 0.0987 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0419 0.0948 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 2.67e-01 -0.106 0.0952 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0474 0.1 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0424 0.0852 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 9.16e-01 0.00604 0.0575 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 4.15e-02 0.153 0.0747 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 2.98e-01 0.0674 0.0646 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 1.91e-01 0.0903 0.0688 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 6.84e-01 0.0277 0.0681 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 5.25e-01 0.0632 0.0993 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 4.73e-01 0.0466 0.0648 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00441 0.0627 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0213 0.0885 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0217 0.0855 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 3.40e-01 0.06 0.0627 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 8.47e-01 0.0158 0.0817 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0674 0.084 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 1.54e-01 -0.148 0.103 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 8.63e-01 0.012 0.0691 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 4.65e-01 0.0563 0.0769 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 4.21e-01 -0.055 0.0683 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 8.65e-01 0.0186 0.109 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0334 0.0854 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 1.15e-02 0.235 0.0921 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0891 0.106 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 3.50e-01 0.0957 0.102 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0305 0.0854 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 5.67e-01 0.0526 0.0917 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0727 0.0684 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 3.94e-02 0.191 0.0923 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 3.67e-01 0.0749 0.0828 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 7.01e-01 0.0302 0.0784 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 1.75e-01 -0.118 0.0865 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 6.11e-01 0.0522 0.103 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0867 0.0889 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 3.20e-02 0.162 0.075 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0243 0.0658 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 8.77e-01 0.0142 0.0917 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0587 0.0817 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 4.47e-01 0.0639 0.0839 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 1.35e-01 -0.136 0.0906 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 1.79e-01 0.132 0.0975 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 4.35e-01 0.0571 0.0729 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0716 0.0649 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 7.41e-01 0.0258 0.0781 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 4.88e-01 0.0729 0.105 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0935 0.0914 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 5.46e-01 0.0623 0.103 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0541 0.104 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 2.43e-01 0.129 0.11 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0684 0.0882 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 5.94e-01 0.0386 0.0722 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0771 0.0975 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0763 0.102 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 1.80e-01 0.127 0.094 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 1.66e-01 0.144 0.103 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 6.81e-01 0.0443 0.108 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 7.71e-02 0.185 0.104 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0415 0.0983 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 1.11e-01 0.163 0.102 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 4.69e-01 -0.058 0.08 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 4.66e-03 -0.283 0.0988 0.275 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 8.81e-01 0.0136 0.0904 0.275 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 2.47e-01 0.112 0.0963 0.275 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 4.91e-01 0.0784 0.114 0.275 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 3.01e-01 0.106 0.102 0.275 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0787 0.0919 0.275 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 4.36e-01 0.0708 0.0908 0.275 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0833 0.0764 0.275 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0295 0.0953 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -742641 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0694 0.0831 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0155 0.078 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 6.12e-01 0.0472 0.0929 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 1.04e-01 0.156 0.0953 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 1.48e-01 0.15 0.103 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 1.06e-01 -0.16 0.0989 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 6.49e-01 0.0389 0.0853 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 5.30e-01 0.0565 0.0898 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 3.29e-02 -0.188 0.0875 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -742641 sc-eQTL 8.56e-02 -0.148 0.0859 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 1.19e-01 -0.138 0.0883 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0276 0.0797 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 2.38e-01 0.103 0.0869 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0506 0.105 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 8.09e-01 0.0188 0.0778 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 6.06e-01 0.0418 0.0809 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0751 0.0629 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0207 0.0992 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -742641 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0597 0.0966 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 6.42e-01 0.0416 0.0892 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 6.33e-01 0.047 0.0983 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 5.55e-02 -0.194 0.101 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0752 0.102 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 2.66e-01 0.112 0.1 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0349 0.0897 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0952 0.0733 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 6.70e-01 0.0424 0.0996 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -742641 sc-eQTL 1.37e-01 -0.137 0.0915 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 5.55e-01 0.0538 0.091 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 2.32e-01 0.115 0.096 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 9.86e-01 0.00162 0.0932 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0595 0.103 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0637 0.0814 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 1.64e-01 0.117 0.0838 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 3.94e-01 0.0584 0.0683 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 7.80e-01 0.0347 0.124 0.293 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0913 0.0693 0.293 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 3.50e-01 0.118 0.126 0.293 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 5.61e-01 0.0625 0.107 0.293 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 4.20e-02 -0.231 0.112 0.293 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 3.15e-01 0.113 0.112 0.293 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0545 0.116 0.293 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 8.40e-01 0.0206 0.102 0.293 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 1.61e-01 -0.111 0.0783 0.293 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 6.08e-01 -0.051 0.0993 0.274 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0144 0.0519 0.274 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 9.97e-01 0.000326 0.0942 0.274 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0186 0.105 0.274 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00934 0.0801 0.274 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 1.01e-01 0.131 0.0795 0.274 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 3.51e-01 0.0845 0.0904 0.274 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 7.27e-01 0.0234 0.0669 0.274 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00339 0.0997 0.276 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 6.18e-02 -0.137 0.073 0.276 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 6.35e-01 0.0417 0.0877 0.276 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0283 0.0976 0.276 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 5.92e-01 0.0527 0.0982 0.276 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 8.58e-01 0.0142 0.0794 0.276 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 2.97e-01 0.0726 0.0695 0.276 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 6.22e-01 0.0313 0.0635 0.276 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 5.46e-03 -0.266 0.0945 0.271 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 6.13e-02 0.134 0.071 0.271 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 4.04e-02 0.208 0.101 0.271 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0566 0.0908 0.271 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0622 0.0792 0.271 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 2.42e-02 0.158 0.0695 0.271 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 2.90e-01 0.113 0.107 0.271 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 6.50e-01 0.0429 0.0943 0.271 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 3.67e-01 0.0689 0.0762 0.271 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 1.93e-01 -0.123 0.0941 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 1.04e-01 0.105 0.0643 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 4.66e-02 0.193 0.0966 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 2.19e-01 0.0617 0.05 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 2.23e-01 0.0997 0.0815 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0215 0.0772 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0289 0.0742 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0124 0.0907 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 2.03e-01 -0.123 0.0965 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 3.55e-01 0.0655 0.0707 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 1.62e-01 0.147 0.104 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 7.60e-02 -0.129 0.0725 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 4.24e-01 0.0699 0.0872 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 8.51e-01 0.0156 0.083 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 1.20e-01 0.124 0.0793 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 6.87e-01 0.0362 0.0896 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 6.80e-01 0.0469 0.113 0.255 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0352 0.108 0.255 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 9.60e-02 0.178 0.106 0.255 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 3.39e-01 -0.121 0.126 0.255 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0533 0.126 0.255 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 1.89e-01 0.154 0.117 0.255 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 7.05e-01 0.0394 0.104 0.255 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 7.40e-01 0.033 0.0995 0.255 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 2.62e-01 0.106 0.0939 0.269 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 3.93e-02 0.197 0.095 0.269 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 1.78e-01 0.135 0.1 0.269 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 2.83e-02 0.186 0.084 0.269 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00189 0.103 0.269 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0474 0.108 0.269 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 5.77e-01 0.0518 0.0929 0.269 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 3.34e-01 0.0858 0.0887 0.269 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 1.81e-01 0.117 0.0875 0.278 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 1.68e-02 0.216 0.0896 0.278 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 1.14e-01 -0.147 0.0923 0.278 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 3.24e-02 -0.133 0.0619 0.278 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 2.56e-01 -0.114 0.1 0.278 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 8.56e-01 0.0163 0.0894 0.278 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 5.43e-01 -0.047 0.0771 0.278 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.097 0.278 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 7.12e-01 0.0399 0.108 0.274 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 1.23e-02 0.172 0.0679 0.274 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 1.22e-02 -0.265 0.104 0.274 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0195 0.101 0.274 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 5.28e-03 0.217 0.0767 0.274 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 4.58e-01 0.0509 0.0685 0.274 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 9.63e-01 0.00487 0.104 0.274 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0131 0.0976 0.274 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 5.67e-01 0.0379 0.066 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0183 0.102 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0824 0.0687 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 9.38e-01 0.00681 0.087 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0388 0.0621 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00537 0.0902 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 9.85e-01 0.00176 0.0944 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0939 0.0832 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 8.78e-01 0.0124 0.0809 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 4.37e-02 -0.172 0.0846 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 6.08e-01 0.0489 0.0952 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0653 0.0708 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 7.33e-01 0.0248 0.0727 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 1.16e-01 0.0974 0.0617 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 438648 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0404 0.0759 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 4.36e-01 0.0806 0.103 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0302 0.0619 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0825 0.0732 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 4.01e-02 -0.179 0.0864 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 7.49e-02 -0.158 0.0883 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 2.38e-01 0.0729 0.0617 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 1.31e-02 0.236 0.0944 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0192 0.0468 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 2.56e-01 0.0867 0.0762 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00061 0.0658 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 5.93e-01 0.0366 0.0684 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0194 0.0869 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 4.37e-02 0.167 0.0825 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 2.32e-02 0.186 0.0812 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0936 0.0924 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0388 0.0547 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 1.77e-01 -0.135 0.0992 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0557 0.0851 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 7.11e-01 0.03 0.0808 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 4.74e-01 0.0697 0.0972 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -960356 sc-eQTL 6.14e-02 -0.169 0.0899 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -742641 sc-eQTL 9.20e-02 -0.147 0.0866 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -906887 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0401 0.0829 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 161189 sc-eQTL 6.92e-01 0.0307 0.0775 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 290068 sc-eQTL 4.16e-01 0.0691 0.0847 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 411076 sc-eQTL 4.82e-02 -0.201 0.101 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -904537 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00635 0.0709 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 942097 sc-eQTL 5.46e-01 0.0467 0.0772 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 162102 sc-eQTL 9.27e-01 0.00542 0.0593 0.274 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 161189 pQTL 0.0122 0.0274 0.0109 0.0 0.0 0.287
ENSG00000136044 APPL2 161189 eQTL 0.0309 0.0449 0.0208 0.0 0.0 0.287
ENSG00000151131 C12orf45 411076 eQTL 0.0191 0.0423 0.018 0.0 0.0 0.287
ENSG00000235162 C12orf75 162102 eQTL 0.0356 0.041 0.0195 0.0 0.0 0.287


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina