logo

Genes within 1Mb (chr12:105392470:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 2.70e-01 0.177 0.161 0.053 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 1.92e-01 -0.108 0.0829 0.053 B L1
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 3.12e-01 -0.124 0.122 0.053 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 9.85e-01 0.00144 0.078 0.053 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 1.83e-01 0.165 0.124 0.053 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 7.76e-01 0.0427 0.15 0.053 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 4.10e-01 0.0823 0.0998 0.053 B L1
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0829 0.116 0.053 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 9.63e-01 0.00498 0.107 0.053 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 3.82e-01 -0.104 0.119 0.053 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00933 0.102 0.053 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 1.24e-03 -0.374 0.114 0.053 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 8.59e-02 0.198 0.115 0.053 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 3.50e-01 -0.149 0.159 0.053 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 3.41e-01 0.0986 0.103 0.053 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0137 0.106 0.053 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0534 0.0893 0.053 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 8.60e-01 0.0248 0.141 0.053 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 3.27e-01 0.0912 0.0929 0.053 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 5.98e-03 -0.364 0.131 0.053 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 1.85e-01 0.197 0.148 0.053 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 6.52e-01 0.0608 0.135 0.053 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 7.77e-01 0.0234 0.0826 0.053 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 8.56e-01 0.0153 0.0846 0.053 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 3.87e-01 0.0513 0.0591 0.053 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 9.27e-01 0.0148 0.161 0.056 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0716 0.11 0.056 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0398 0.165 0.056 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 2.65e-01 -0.148 0.133 0.056 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0669 0.113 0.056 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 6.35e-01 -0.048 0.101 0.056 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 3.60e-01 0.152 0.166 0.056 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 1.78e-01 -0.19 0.141 0.056 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 9.78e-01 0.00184 0.0677 0.056 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0347 0.139 0.053 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0214 0.1 0.053 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 3.74e-04 -0.555 0.153 0.053 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0676 0.0776 0.053 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 3.16e-01 -0.137 0.136 0.053 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 9.12e-01 0.0129 0.116 0.053 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 5.53e-01 0.0697 0.117 0.053 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 2.42e-01 0.177 0.151 0.053 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 2.11e-01 0.194 0.154 0.054 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -747563 sc-eQTL 2.53e-01 -0.174 0.152 0.054 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 7.37e-01 0.0467 0.139 0.054 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 1.06e-03 -0.443 0.133 0.054 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 3.23e-01 0.141 0.142 0.054 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 7.25e-03 -0.467 0.172 0.054 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 3.07e-01 0.129 0.126 0.054 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 3.95e-01 0.114 0.133 0.054 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 7.65e-01 0.031 0.103 0.054 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 4.50e-01 -0.131 0.173 0.053 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 5.19e-01 0.0699 0.108 0.053 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 9.41e-02 -0.236 0.14 0.053 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0503 0.185 0.053 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 3.05e-01 -0.134 0.13 0.053 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0114 0.133 0.053 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 6.04e-01 0.0713 0.137 0.053 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 9.93e-01 0.000975 0.108 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 2.94e-01 -0.183 0.174 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 1.61e-01 -0.232 0.165 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 5.16e-01 -0.122 0.187 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 1.72e-01 -0.242 0.177 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 3.93e-01 -0.114 0.133 0.051 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 8.52e-01 0.0344 0.184 0.051 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 3.26e-01 0.181 0.184 0.051 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0336 0.179 0.051 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 3.89e-01 0.154 0.179 0.051 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 2.49e-01 0.211 0.182 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 1.18e-01 -0.211 0.134 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 4.77e-01 -0.114 0.161 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0213 0.139 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 1.22e-01 0.236 0.152 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 6.40e-01 0.0827 0.176 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00603 0.157 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 7.85e-02 -0.253 0.143 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 9.18e-01 0.0169 0.164 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 2.70e-01 0.2 0.181 0.054 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 9.70e-01 0.0058 0.153 0.054 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 4.65e-01 -0.121 0.165 0.054 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 5.37e-01 0.0843 0.136 0.054 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 4.37e-01 -0.125 0.16 0.054 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 8.88e-01 0.0262 0.185 0.054 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 8.39e-01 -0.031 0.152 0.054 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 2.10e-01 -0.198 0.157 0.054 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0241 0.14 0.054 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 5.41e-01 -0.102 0.167 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 2.95e-01 0.132 0.126 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 5.71e-01 0.0801 0.141 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 7.37e-01 0.0426 0.127 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 2.38e-01 0.173 0.146 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 8.74e-01 -0.029 0.182 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 6.54e-01 0.0556 0.124 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0662 0.143 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 5.23e-01 -0.104 0.162 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 1.16e-01 0.286 0.181 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 8.72e-01 0.0255 0.158 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0193 0.151 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 6.43e-01 0.0633 0.136 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 1.43e-01 -0.21 0.143 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 4.51e-01 -0.146 0.194 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 1.80e-01 0.18 0.134 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0239 0.14 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 4.54e-01 0.125 0.167 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 8.54e-01 0.0318 0.173 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 6.47e-02 0.263 0.141 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 4.82e-01 -0.125 0.177 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0149 0.17 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 3.01e-01 -0.177 0.171 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0123 0.18 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 6.85e-02 0.278 0.152 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 2.20e-01 0.126 0.103 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 2.90e-01 -0.139 0.131 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0398 0.113 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 2.35e-03 -0.364 0.118 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 4.84e-01 0.0833 0.119 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 2.40e-01 -0.204 0.173 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 8.77e-01 0.0176 0.113 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 4.82e-01 0.0771 0.109 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 8.35e-03 -0.405 0.152 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0728 0.15 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 2.50e-01 -0.127 0.11 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 1.77e-02 -0.338 0.141 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 3.16e-02 0.316 0.146 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 5.79e-01 0.101 0.182 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 1.86e-01 0.16 0.121 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 3.59e-01 0.124 0.135 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0477 0.12 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 5.22e-01 0.118 0.183 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 3.90e-01 0.124 0.144 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 6.85e-02 -0.286 0.156 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 7.55e-01 0.0556 0.178 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 6.73e-01 -0.073 0.173 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 6.10e-01 0.0737 0.144 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 2.38e-01 -0.182 0.154 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 4.20e-01 0.0932 0.115 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 4.85e-01 -0.116 0.166 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 5.29e-01 0.0935 0.148 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 2.62e-02 -0.31 0.139 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 7.00e-01 0.06 0.155 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0397 0.183 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 7.66e-01 0.0474 0.159 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 7.46e-01 -0.044 0.136 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 3.03e-01 0.121 0.117 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 9.91e-02 0.256 0.154 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 3.65e-01 0.126 0.138 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 2.02e-03 -0.435 0.139 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 1.66e-02 0.368 0.152 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 2.68e-01 0.184 0.166 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 5.04e-01 0.0827 0.124 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 6.40e-01 0.0516 0.11 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 6.62e-02 -0.243 0.131 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0632 0.197 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 6.01e-01 0.0898 0.171 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0629 0.193 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 4.53e-01 0.146 0.194 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 4.47e-01 -0.158 0.207 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 2.59e-01 -0.187 0.165 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0793 0.135 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 1.52e-01 -0.262 0.182 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 7.77e-01 0.0523 0.184 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 5.20e-01 -0.109 0.169 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 5.06e-01 -0.124 0.186 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0949 0.193 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 6.76e-02 -0.342 0.186 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 3.39e-01 0.168 0.176 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0224 0.183 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 2.83e-01 0.154 0.143 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 3.57e-01 -0.159 0.173 0.054 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 9.93e-01 0.0013 0.155 0.054 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 2.49e-01 -0.191 0.165 0.054 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 2.69e-01 -0.216 0.195 0.054 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 7.01e-02 -0.317 0.174 0.054 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 3.35e-01 0.152 0.158 0.054 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 5.03e-01 0.105 0.156 0.054 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0735 0.131 0.054 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0709 0.16 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -747563 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00839 0.156 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 5.05e-01 0.107 0.16 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 6.64e-02 -0.263 0.143 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 1.80e-01 0.211 0.157 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 1.57e-01 -0.268 0.188 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 4.74e-02 0.278 0.139 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 5.51e-01 0.0872 0.146 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 3.16e-01 0.114 0.114 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 6.22e-01 0.0879 0.178 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -747563 sc-eQTL 1.76e-01 -0.235 0.173 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 6.76e-01 0.0672 0.16 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 7.20e-01 0.0635 0.177 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 5.98e-01 0.0966 0.183 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 1.63e-02 -0.44 0.181 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0708 0.181 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 9.80e-02 0.267 0.16 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 3.36e-01 0.128 0.132 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 4.36e-01 0.139 0.178 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -747563 sc-eQTL 2.42e-01 -0.192 0.164 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 9.56e-01 0.00904 0.163 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 4.78e-02 -0.34 0.171 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 4.53e-01 0.125 0.166 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 1.41e-01 -0.271 0.183 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0788 0.146 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 8.69e-01 0.0249 0.15 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0972 0.122 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 5.80e-01 -0.115 0.208 0.056 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 7.86e-01 0.0318 0.117 0.056 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 6.37e-01 0.0998 0.211 0.056 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 2.27e-01 -0.217 0.179 0.056 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 6.00e-01 0.101 0.191 0.056 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 5.23e-01 -0.121 0.189 0.056 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 8.27e-01 0.0426 0.195 0.056 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 4.48e-01 -0.129 0.17 0.056 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 5.46e-01 0.0801 0.132 0.056 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 1.08e-01 -0.289 0.179 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 2.41e-01 0.11 0.0938 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 2.37e-01 -0.202 0.17 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 4.39e-01 -0.147 0.19 0.05 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0227 0.145 0.05 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 7.92e-01 0.0383 0.145 0.05 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 4.74e-01 0.118 0.164 0.05 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00887 0.121 0.05 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 6.30e-01 0.0842 0.175 0.053 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0285 0.129 0.053 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 2.58e-01 -0.174 0.154 0.053 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 4.74e-01 0.123 0.171 0.053 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 1.81e-01 -0.23 0.172 0.053 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 6.73e-01 0.0588 0.139 0.053 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 8.05e-02 -0.213 0.121 0.053 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 9.35e-01 0.00913 0.111 0.053 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 6.44e-01 0.0747 0.162 0.056 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0362 0.12 0.056 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0282 0.171 0.056 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0188 0.152 0.056 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 5.99e-01 0.07 0.133 0.056 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.118 0.056 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 7.77e-01 0.0507 0.179 0.056 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 5.01e-01 -0.106 0.158 0.056 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 4.27e-01 0.102 0.128 0.056 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 9.20e-01 0.0166 0.166 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 9.57e-01 0.00609 0.113 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 3.34e-02 -0.362 0.169 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 1.03e-01 -0.143 0.0875 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 2.47e-01 -0.166 0.143 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 9.75e-01 0.00433 0.135 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 3.06e-01 0.133 0.13 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 7.91e-02 0.279 0.158 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0107 0.171 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00383 0.125 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 1.07e-01 -0.297 0.184 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0188 0.129 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00546 0.154 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0642 0.146 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 4.49e-01 -0.106 0.14 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00044 0.158 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 8.48e-01 0.0401 0.209 0.052 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 3.68e-01 -0.179 0.198 0.052 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 2.26e-01 -0.238 0.196 0.052 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 7.71e-01 0.0677 0.232 0.052 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 4.92e-01 -0.159 0.231 0.052 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 5.20e-01 -0.139 0.216 0.052 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 3.29e-01 -0.187 0.191 0.052 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 7.22e-01 0.0652 0.183 0.052 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 7.93e-01 -0.043 0.164 0.056 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 5.08e-01 -0.111 0.167 0.056 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 1.74e-02 -0.413 0.172 0.056 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 4.01e-01 -0.124 0.147 0.056 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 3.45e-01 -0.169 0.179 0.056 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 4.39e-01 -0.145 0.187 0.056 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0277 0.162 0.056 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0103 0.155 0.056 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 3.27e-02 -0.341 0.159 0.052 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 7.91e-01 0.044 0.166 0.052 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 1.20e-01 -0.263 0.169 0.052 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 5.75e-01 0.0643 0.114 0.052 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 5.01e-01 -0.124 0.183 0.052 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 6.35e-02 0.302 0.162 0.052 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 7.76e-02 -0.248 0.14 0.052 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 6.89e-01 0.0712 0.178 0.052 ncMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 2.27e-01 0.219 0.181 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 1.04e-01 -0.199 0.122 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 2.80e-01 -0.167 0.154 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0336 0.11 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 6.07e-01 0.0826 0.16 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 5.76e-01 0.0938 0.168 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 8.87e-01 -0.021 0.148 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 3.81e-02 -0.297 0.142 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 8.48e-01 0.0292 0.152 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 6.65e-01 0.0743 0.171 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 7.48e-01 0.0411 0.128 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 7.37e-01 0.0439 0.131 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 7.48e-01 0.036 0.112 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 433726 sc-eQTL 7.75e-01 0.0391 0.137 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0841 0.186 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 4.18e-01 0.0903 0.111 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0674 0.132 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 9.97e-01 0.000664 0.157 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 7.45e-01 0.0514 0.157 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0173 0.11 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 1.23e-02 -0.422 0.167 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0719 0.0827 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 4.04e-01 -0.113 0.135 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 9.86e-01 0.00207 0.116 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 4.57e-01 0.0903 0.121 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 1.04e-01 0.25 0.153 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 8.32e-02 -0.255 0.147 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0382 0.146 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 1.71e-03 -0.51 0.16 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 8.53e-01 0.018 0.0971 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 2.64e-01 -0.197 0.176 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 6.67e-01 0.065 0.151 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 1.62e-01 -0.2 0.143 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00842 0.172 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -965278 sc-eQTL 2.36e-01 0.189 0.159 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -747563 sc-eQTL 3.23e-01 -0.151 0.153 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -911809 sc-eQTL 4.26e-01 0.116 0.145 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 156267 sc-eQTL 2.88e-03 -0.402 0.133 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 285146 sc-eQTL 1.28e-01 0.226 0.148 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 406154 sc-eQTL 6.87e-03 -0.482 0.176 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -909459 sc-eQTL 3.51e-01 0.116 0.124 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 937175 sc-eQTL 5.16e-01 0.0882 0.136 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 157180 sc-eQTL 8.87e-01 0.0149 0.104 0.054 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 156267 pQTL 0.000177 -0.0937 0.0249 0.00122 0.0 0.0426
ENSG00000136044 APPL2 156267 eQTL 1.81e-43 -0.636 0.0437 0.0 0.0 0.0407

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 156267 2.18e-06 2.6e-06 2.75e-07 1.42e-06 3.75e-07 7.23e-07 1.31e-06 3.99e-07 1.7e-06 6.69e-07 1.81e-06 1.3e-06 3.23e-06 8.94e-07 3.95e-07 9.36e-07 1.07e-06 1.16e-06 5.54e-07 4.69e-07 8.07e-07 1.9e-06 1.65e-06 5.65e-07 2.57e-06 7.46e-07 1.04e-06 8.14e-07 1.73e-06 1.63e-06 7.67e-07 1.92e-07 2.69e-07 6.44e-07 6.99e-07 4.46e-07 7.15e-07 2.34e-07 5.13e-07 2.1e-07 2.78e-07 2.84e-06 3.32e-07 8.06e-08 2.1e-07 1.2e-07 2.27e-07 8.31e-08 9.59e-08