logo

Genes within 1Mb (chr12:105388064:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0159 0.127 0.122 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0353 0.0655 0.122 B L1
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0754 0.0963 0.122 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0294 0.0614 0.122 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 1.24e-01 0.15 0.0974 0.122 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 8.89e-01 0.0165 0.118 0.122 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0493 0.0787 0.122 B L1
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 2.03e-02 0.212 0.0905 0.122 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 8.78e-01 0.013 0.0843 0.122 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0492 0.0927 0.122 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00992 0.0793 0.122 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 3.24e-02 0.195 0.0903 0.122 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 8.32e-01 0.0191 0.09 0.122 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0299 0.125 0.122 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 8.10e-01 0.0194 0.0806 0.122 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 2.16e-01 -0.102 0.0823 0.122 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 8.11e-01 0.0167 0.0697 0.122 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0615 0.11 0.122 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 4.80e-02 0.143 0.0721 0.122 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 5.73e-01 0.0587 0.104 0.122 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 3.54e-01 0.108 0.116 0.122 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 6.86e-03 -0.282 0.103 0.122 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 5.59e-01 0.0377 0.0645 0.122 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 1.38e-01 -0.098 0.0658 0.122 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000645 0.0463 0.122 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 4.79e-01 0.0886 0.125 0.126 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 7.81e-01 0.0239 0.0861 0.126 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 9.15e-02 -0.216 0.128 0.126 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0344 0.104 0.126 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0102 0.0879 0.126 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 6.72e-01 0.0333 0.0786 0.126 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0627 0.129 0.126 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 6.60e-01 0.0484 0.11 0.126 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0314 0.0527 0.126 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 2.36e-01 -0.13 0.109 0.122 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 8.92e-01 0.0106 0.0785 0.122 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0704 0.124 0.122 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 7.41e-02 0.109 0.0606 0.122 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0804 0.107 0.122 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0887 0.0909 0.122 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 2.77e-01 0.1 0.0919 0.122 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0219 0.119 0.122 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 1.34e-01 -0.181 0.12 0.122 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -751969 sc-eQTL 2.97e-01 0.124 0.119 0.122 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0157 0.108 0.122 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 3.93e-01 0.0913 0.107 0.122 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0848 0.111 0.122 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0493 0.137 0.122 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 6.06e-01 0.0509 0.0986 0.122 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0623 0.104 0.122 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 1.50e-02 0.195 0.0797 0.122 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 4.19e-02 0.277 0.135 0.122 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 6.57e-01 0.0381 0.0856 0.122 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 2.36e-01 0.132 0.111 0.122 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 3.10e-01 -0.149 0.146 0.122 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 7.08e-01 0.0387 0.103 0.122 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 4.78e-01 0.0746 0.105 0.122 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0321 0.108 0.122 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 1.99e-01 0.11 0.0855 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0175 0.141 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0115 0.134 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 4.02e-01 -0.127 0.151 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 3.07e-01 0.147 0.144 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 5.78e-01 0.06 0.108 0.128 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 4.22e-01 -0.12 0.149 0.128 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 1.05e-01 -0.242 0.149 0.128 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 5.28e-01 0.0918 0.145 0.128 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 2.61e-01 0.163 0.145 0.128 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 2.83e-01 0.154 0.143 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 9.11e-01 0.0119 0.106 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 5.59e-01 0.0738 0.126 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 9.34e-01 0.00909 0.109 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 4.45e-01 0.0916 0.12 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0564 0.139 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 7.33e-01 0.0421 0.123 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 9.72e-01 -0.004 0.114 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 1.75e-01 0.175 0.129 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 2.89e-01 0.152 0.143 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0639 0.121 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0303 0.13 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0821 0.108 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 2.32e-01 0.151 0.126 0.123 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 5.94e-01 0.0779 0.146 0.123 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 1.00e-01 0.197 0.12 0.123 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 8.06e-01 0.0306 0.125 0.123 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 1.18e-01 0.173 0.11 0.123 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 2.87e-01 -0.143 0.134 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0565 0.101 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 1.56e-01 -0.161 0.113 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0846 0.102 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0193 0.118 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 4.11e-01 0.121 0.147 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 1.71e-01 -0.136 0.0991 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 1.37e-02 0.282 0.114 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0994 0.131 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 6.45e-02 -0.256 0.138 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 7.64e-01 0.0363 0.121 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 8.14e-01 0.0272 0.116 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0412 0.104 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 5.35e-01 0.068 0.109 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0294 0.148 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0867 0.103 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 1.66e-01 0.148 0.106 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 9.57e-01 0.00697 0.128 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 1.02e-01 -0.225 0.137 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 4.45e-01 -0.087 0.114 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 7.65e-01 0.0424 0.142 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 5.07e-02 0.264 0.134 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0156 0.137 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 3.56e-01 0.133 0.143 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0269 0.122 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 8.92e-01 0.0112 0.0824 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 2.64e-01 -0.115 0.103 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 9.73e-01 0.00302 0.0886 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 8.27e-02 0.164 0.0938 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0649 0.093 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 9.84e-01 0.00272 0.136 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 9.94e-01 0.000633 0.0887 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 8.34e-01 0.018 0.0857 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0257 0.121 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 8.80e-01 0.0176 0.117 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0725 0.0856 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 1.71e-01 0.152 0.111 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 8.37e-01 0.0237 0.115 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0868 0.142 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0247 0.0943 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 1.37e-01 -0.156 0.105 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 1.88e-01 0.123 0.093 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 7.05e-01 0.0547 0.144 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0414 0.113 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 2.70e-01 0.137 0.123 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 5.06e-01 0.093 0.14 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 2.03e-01 -0.172 0.135 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0497 0.113 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 5.71e-02 -0.23 0.12 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 4.00e-01 0.0764 0.0906 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 8.81e-01 0.0203 0.136 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 1.99e-01 0.155 0.12 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 1.06e-01 0.184 0.113 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 6.43e-01 0.0587 0.126 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 4.88e-01 -0.104 0.149 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 2.02e-01 -0.165 0.129 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 1.08e-01 -0.177 0.11 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 9.49e-02 0.159 0.095 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 3.46e-01 -0.114 0.121 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 5.74e-01 0.0607 0.108 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 9.97e-01 0.000416 0.111 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 4.73e-01 0.0864 0.12 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 3.10e-02 -0.278 0.128 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 1.80e-01 0.129 0.096 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 1.93e-01 -0.112 0.0856 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0519 0.103 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 2.43e-01 0.164 0.14 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 8.16e-04 0.404 0.119 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 7.43e-02 -0.245 0.136 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0102 0.138 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 6.51e-02 -0.271 0.146 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 3.90e-01 0.101 0.118 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 2.01e-01 -0.123 0.096 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 3.80e-01 0.114 0.13 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0685 0.15 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 1.10e-01 0.221 0.137 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 3.94e-01 -0.13 0.152 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0198 0.158 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 2.18e-02 -0.351 0.152 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 2.41e-01 -0.169 0.144 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 9.10e-01 0.017 0.15 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 3.96e-01 0.0998 0.117 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 1.44e-02 0.327 0.133 0.123 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 6.08e-01 0.062 0.121 0.123 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00454 0.129 0.123 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 4.81e-01 -0.107 0.152 0.123 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0359 0.136 0.123 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 7.11e-01 0.0455 0.123 0.123 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 7.02e-02 -0.219 0.12 0.123 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 5.86e-01 0.0556 0.102 0.123 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 4.16e-01 -0.11 0.135 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -751969 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0243 0.118 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 9.25e-01 0.0104 0.111 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 1.26e-01 0.202 0.131 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 4.22e-03 -0.387 0.134 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 3.21e-01 -0.147 0.147 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 6.19e-01 0.0704 0.141 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 6.86e-01 0.0492 0.121 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 1.69e-01 0.176 0.127 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 1.10e-01 -0.195 0.121 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -751969 sc-eQTL 2.06e-01 0.151 0.119 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 5.06e-01 0.0815 0.122 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 1.50e-01 0.158 0.109 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 8.17e-01 0.0278 0.12 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 4.42e-01 -0.111 0.144 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 7.38e-01 -0.036 0.107 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0738 0.112 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 5.54e-03 0.24 0.0855 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 3.66e-01 -0.127 0.14 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -751969 sc-eQTL 3.43e-01 0.13 0.136 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0442 0.126 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 3.35e-01 -0.134 0.139 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 3.02e-01 0.148 0.143 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 7.70e-02 0.255 0.144 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0868 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 8.33e-01 0.0267 0.127 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 2.12e-01 0.13 0.104 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 3.86e-01 -0.118 0.136 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -751969 sc-eQTL 3.28e-01 0.123 0.126 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 2.94e-01 -0.131 0.124 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00303 0.132 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0308 0.128 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 3.13e-01 -0.142 0.141 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 7.57e-01 0.0346 0.112 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00889 0.115 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 9.50e-02 0.156 0.0931 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0284 0.168 0.13 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 3.57e-01 0.0872 0.0942 0.13 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00516 0.171 0.13 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0863 0.145 0.13 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 5.93e-01 0.083 0.155 0.13 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 2.48e-01 -0.177 0.152 0.13 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 8.58e-01 0.0283 0.158 0.13 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 7.16e-01 0.0501 0.138 0.13 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 2.06e-01 0.135 0.106 0.13 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 2.66e-01 0.161 0.144 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 1.82e-01 -0.101 0.0752 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 5.71e-01 0.0777 0.137 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 9.13e-01 0.0167 0.152 0.124 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 3.25e-01 0.115 0.116 0.124 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 3.97e-01 0.0988 0.116 0.124 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0199 0.132 0.124 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 1.95e-01 0.126 0.097 0.124 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00872 0.137 0.122 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0138 0.101 0.122 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0579 0.121 0.122 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 9.57e-02 0.223 0.133 0.122 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 6.53e-01 0.0609 0.135 0.122 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 3.11e-01 -0.111 0.109 0.122 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 1.70e-01 -0.131 0.0954 0.122 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0659 0.0872 0.122 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 6.52e-02 0.233 0.126 0.129 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 7.02e-01 0.0362 0.0942 0.129 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0787 0.134 0.129 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 3.47e-01 0.113 0.119 0.129 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 2.66e-01 0.116 0.104 0.129 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 3.30e-02 0.196 0.0915 0.129 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 1.13e-01 -0.222 0.14 0.129 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 9.49e-01 0.00788 0.124 0.129 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0249 0.1 0.129 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0566 0.131 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0106 0.0896 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0306 0.135 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 4.49e-02 0.139 0.0689 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 1.39e-01 -0.167 0.113 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 1.19e-01 -0.166 0.106 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 5.86e-02 0.194 0.102 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 6.16e-01 -0.063 0.126 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 6.06e-01 0.0692 0.134 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0467 0.0979 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 3.89e-01 -0.125 0.145 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 3.80e-01 0.0887 0.101 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 6.32e-01 0.0579 0.121 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 2.64e-01 0.128 0.115 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0609 0.11 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 9.66e-01 0.00522 0.124 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 7.68e-01 0.0483 0.163 0.115 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000551 0.156 0.115 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 6.72e-01 0.0654 0.154 0.115 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 1.89e-01 0.239 0.181 0.115 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 6.46e-01 0.0834 0.181 0.115 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 3.02e-01 0.175 0.169 0.115 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 4.49e-02 0.299 0.148 0.115 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 2.48e-01 -0.165 0.143 0.115 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 2.94e-02 -0.288 0.131 0.122 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0375 0.135 0.122 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 4.27e-01 0.113 0.142 0.122 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 1.88e-01 -0.158 0.119 0.122 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 3.97e-01 -0.123 0.145 0.122 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0316 0.152 0.122 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 4.98e-02 -0.256 0.13 0.122 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 6.34e-01 0.0598 0.125 0.122 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 8.13e-02 -0.214 0.122 0.122 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 9.50e-01 0.00807 0.128 0.122 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 6.64e-01 0.0566 0.13 0.122 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 1.00e+00 -2.5e-05 0.0879 0.122 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 4.48e-01 0.107 0.141 0.122 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 4.44e-01 -0.096 0.125 0.122 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 8.88e-01 0.0153 0.108 0.122 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 5.73e-02 0.259 0.135 0.122 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0461 0.156 0.13 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 7.99e-01 0.0256 0.1 0.13 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 8.57e-02 -0.263 0.152 0.13 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 1.76e-01 -0.197 0.145 0.13 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 1.08e-01 -0.182 0.113 0.13 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000777 0.099 0.13 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0512 0.15 0.13 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0795 0.141 0.13 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0307 0.0953 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 1.67e-01 0.196 0.142 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 8.69e-01 0.0159 0.0961 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 8.55e-01 0.0222 0.121 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 9.95e-01 0.000549 0.0866 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 8.95e-02 0.213 0.125 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 9.02e-01 0.0162 0.132 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 1.10e-01 0.185 0.116 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 8.32e-01 -0.024 0.113 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 7.57e-02 0.211 0.118 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 5.20e-02 -0.259 0.133 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 2.37e-01 0.118 0.0993 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 3.07e-01 -0.104 0.102 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 9.49e-01 0.00559 0.0871 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 sc-eQTL 6.80e-01 0.0441 0.107 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 7.12e-01 0.0536 0.145 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 1.92e-01 -0.113 0.0866 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 2.82e-02 0.225 0.102 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0457 0.123 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0269 0.123 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0103 0.0859 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0864 0.133 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 1.22e-01 0.1 0.0646 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 3.43e-01 -0.101 0.106 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0925 0.0911 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 1.92e-01 0.124 0.0947 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0856 0.121 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 4.63e-02 -0.233 0.116 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 7.10e-01 0.0431 0.116 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 3.77e-01 0.115 0.13 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0851 0.0768 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0369 0.14 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0922 0.12 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0905 0.114 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 2.23e-01 0.167 0.136 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -969684 sc-eQTL 1.98e-01 -0.159 0.123 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -751969 sc-eQTL 3.09e-01 0.121 0.119 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -916215 sc-eQTL 9.60e-01 0.00567 0.113 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 151861 sc-eQTL 4.74e-01 0.076 0.106 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 280740 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0145 0.116 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 401748 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00532 0.14 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -913865 sc-eQTL 9.16e-01 0.0102 0.0969 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 932769 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0348 0.106 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 152774 sc-eQTL 2.39e-02 0.182 0.0801 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 151861 pQTL 0.438 0.0114 0.0147 0.00122 0.0 0.121
ENSG00000136052 SLC41A2 429320 eQTL 0.000505 0.19 0.0545 0.0 0.0 0.117

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina