logo

Genes within 1Mb (chr12:105355315:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 4.47e-01 0.0403 0.0529 0.216 B L1
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0727 0.0778 0.216 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0372 0.0496 0.216 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 8.27e-01 0.0174 0.0791 0.216 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 8.81e-01 0.0143 0.0957 0.216 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000851 0.0636 0.216 B L1
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0248 0.0741 0.216 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0396 0.0681 0.216 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 8.23e-01 0.0142 0.0633 0.216 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 8.56e-05 0.282 0.0703 0.216 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 3.72e-01 0.0642 0.0718 0.216 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 1.78e-01 0.134 0.0991 0.216 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 6.00e-01 0.0339 0.0644 0.216 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000383 0.066 0.216 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00777 0.0557 0.216 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0288 0.0584 0.216 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 1.36e-02 0.205 0.0825 0.216 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 5.81e-02 -0.177 0.0927 0.216 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 5.36e-01 0.0524 0.0845 0.216 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 6.47e-01 0.0238 0.0518 0.216 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 9.41e-01 0.00395 0.0531 0.216 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00413 0.0372 0.216 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 3.64e-01 0.0642 0.0707 0.214 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0244 0.106 0.214 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 2.08e-01 0.107 0.0849 0.214 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0161 0.0723 0.214 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0739 0.0645 0.214 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 3.51e-01 0.0992 0.106 0.214 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0321 0.0904 0.214 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 8.51e-02 -0.0745 0.043 0.214 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0218 0.0628 0.216 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 8.00e-01 0.0252 0.0993 0.216 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 5.68e-01 0.0279 0.0488 0.216 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 3.11e-01 0.0869 0.0856 0.216 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 2.01e-01 0.0932 0.0727 0.216 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0751 0.0736 0.216 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 9.41e-02 -0.159 0.0946 0.216 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -784718 sc-eQTL 4.89e-01 0.0659 0.0951 0.215 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0966 0.0863 0.215 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 2.56e-01 0.097 0.0851 0.215 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 2.15e-01 -0.11 0.0887 0.215 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 3.66e-01 0.0989 0.109 0.215 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 3.79e-01 0.0693 0.0786 0.215 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0435 0.0831 0.215 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 7.84e-02 -0.113 0.0641 0.215 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0785 0.0683 0.216 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 7.93e-01 0.0235 0.0893 0.216 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 1.47e-01 0.17 0.117 0.216 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0726 0.0823 0.216 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 3.49e-01 0.0787 0.0838 0.216 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 3.97e-01 0.0735 0.0866 0.216 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 5.21e-02 0.133 0.068 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 6.52e-01 0.0479 0.106 0.222 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 1.38e-01 0.177 0.119 0.222 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 6.36e-01 0.0538 0.113 0.222 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0569 0.0847 0.222 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 1.10e-01 -0.188 0.117 0.222 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 4.26e-02 -0.238 0.117 0.222 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 9.07e-01 0.0134 0.115 0.222 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0153 0.114 0.222 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 5.26e-01 0.0544 0.0857 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 4.19e-01 0.0826 0.102 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 8.03e-02 -0.154 0.0876 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 9.38e-01 0.00753 0.0969 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 8.31e-01 0.0239 0.112 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 1.83e-01 -0.133 0.0993 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 4.40e-01 0.0708 0.0916 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 9.25e-02 -0.175 0.104 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 1.44e-01 -0.142 0.0969 0.218 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 9.59e-01 0.00544 0.105 0.218 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 2.50e-01 0.0998 0.0866 0.218 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 6.96e-01 0.0399 0.102 0.218 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 7.96e-01 0.0305 0.118 0.218 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0921 0.0968 0.218 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0123 0.101 0.218 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 9.68e-01 0.0036 0.0892 0.218 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 6.80e-01 0.033 0.08 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 1.02e-01 -0.146 0.089 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 9.93e-01 0.000744 0.0805 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0732 0.093 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 5.57e-01 -0.068 0.116 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 4.32e-01 0.0617 0.0784 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 2.32e-01 -0.109 0.0906 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 1.86e-01 -0.136 0.103 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 4.65e-01 0.0723 0.0988 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 2.35e-01 -0.112 0.0943 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 5.23e-01 0.0546 0.0854 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 8.72e-01 0.0145 0.0898 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 3.30e-01 0.118 0.121 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0767 0.0842 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 8.86e-01 0.0125 0.0876 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 4.20e-01 0.0845 0.105 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 6.23e-01 0.0438 0.0888 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 6.88e-01 0.0444 0.111 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0576 0.106 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 5.73e-01 0.0603 0.107 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 7.97e-01 0.0289 0.112 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 8.57e-01 0.0172 0.0954 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 3.20e-01 -0.064 0.0642 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 1.46e-01 0.103 0.0709 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 8.89e-04 0.25 0.074 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 2.02e-01 0.0956 0.0746 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 2.70e-01 0.12 0.109 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 4.09e-01 0.0589 0.0712 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0406 0.0689 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0337 0.0974 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0667 0.0693 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 4.44e-03 0.255 0.0887 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 2.80e-01 -0.101 0.0929 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 4.68e-01 0.0836 0.115 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0165 0.0765 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0553 0.0851 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 2.70e-01 0.0834 0.0755 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 2.05e-01 -0.116 0.0911 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 2.52e-01 0.115 0.0998 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 9.97e-01 0.000404 0.113 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 2.91e-01 0.116 0.109 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 1.04e-01 0.148 0.091 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 7.10e-01 0.0365 0.0983 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0955 0.0731 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 8.47e-01 0.0183 0.0947 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 3.37e-01 0.086 0.0893 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 2.89e-03 -0.293 0.0971 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 6.69e-01 0.05 0.117 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0307 0.102 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 6.81e-01 0.0356 0.0865 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 7.27e-01 0.0263 0.075 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 7.27e-01 0.0308 0.0881 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 1.86e-02 0.212 0.0894 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 2.74e-01 -0.107 0.0979 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 4.11e-01 0.0868 0.105 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00945 0.0787 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0529 0.07 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0474 0.0842 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 6.47e-02 -0.187 0.1 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 2.31e-02 0.258 0.112 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 4.96e-01 0.0781 0.115 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 6.75e-01 0.0513 0.122 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 6.75e-01 -0.041 0.0977 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0348 0.0799 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0905 0.108 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 4.93e-01 0.0746 0.109 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 3.00e-01 0.124 0.119 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 4.47e-01 0.0941 0.124 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 3.69e-01 -0.108 0.12 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 5.60e-02 0.215 0.112 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 3.55e-01 0.109 0.117 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0259 0.0922 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 1.38e-01 -0.147 0.0985 0.216 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 5.31e-01 0.0663 0.106 0.216 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 7.69e-02 0.22 0.124 0.216 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 6.54e-01 0.0502 0.112 0.216 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 7.48e-01 0.0324 0.101 0.216 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0269 0.0996 0.216 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 1.73e-01 0.114 0.0835 0.216 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -784718 sc-eQTL 7.08e-01 0.0355 0.0945 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0377 0.0886 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 7.18e-01 0.0382 0.106 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 1.89e-01 -0.143 0.109 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 4.14e-01 0.0966 0.118 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 4.39e-01 0.0876 0.113 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0495 0.097 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 1.29e-01 0.155 0.102 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -784718 sc-eQTL 6.23e-01 0.0475 0.0964 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 7.55e-01 0.0309 0.099 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 9.85e-01 0.00172 0.0889 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 2.06e-01 -0.123 0.0968 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0297 0.117 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 8.55e-01 0.0159 0.0868 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 5.58e-01 -0.053 0.0902 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 3.14e-02 -0.151 0.0696 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -784718 sc-eQTL 4.33e-01 0.0877 0.111 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 1.99e-02 -0.239 0.102 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 2.20e-01 0.139 0.113 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 3.62e-01 0.107 0.117 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 4.73e-01 0.0848 0.118 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 8.40e-01 0.0235 0.116 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0932 0.103 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 2.30e-01 -0.102 0.0847 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -784718 sc-eQTL 9.73e-01 0.00349 0.102 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 2.75e-01 -0.11 0.1 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 3.28e-01 0.104 0.106 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 5.03e-01 -0.069 0.103 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 1.43e-02 0.277 0.112 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 1.28e-01 0.137 0.0896 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0582 0.093 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0865 0.0754 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0117 0.0764 0.248 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 5.74e-02 0.261 0.136 0.248 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 2.20e-01 -0.144 0.117 0.248 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 4.38e-01 0.0973 0.125 0.248 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 7.62e-01 0.0375 0.124 0.248 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 2.10e-02 0.291 0.125 0.248 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0646 0.111 0.248 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 1.38e-01 0.128 0.0857 0.248 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 6.34e-01 0.0285 0.0599 0.215 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 2.03e-01 -0.138 0.108 0.215 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 1.21e-01 -0.187 0.12 0.215 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0275 0.0924 0.215 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 1.60e-01 -0.13 0.092 0.215 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 1.14e-01 0.165 0.104 0.215 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 5.34e-01 0.0481 0.0772 0.215 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0994 0.082 0.216 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 1.13e-01 0.155 0.0975 0.216 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 1.32e-01 0.164 0.108 0.216 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 7.61e-01 0.0334 0.11 0.216 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 9.63e-02 0.147 0.0881 0.216 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 6.73e-01 0.0329 0.0779 0.216 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 5.30e-01 0.0446 0.0709 0.216 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 6.81e-01 0.0325 0.0789 0.217 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0726 0.112 0.217 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00976 0.1 0.217 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 6.04e-01 0.0453 0.0872 0.217 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0573 0.0775 0.217 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 7.26e-01 0.0413 0.118 0.217 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0205 0.104 0.217 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00725 0.084 0.217 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0149 0.0717 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 5.23e-01 0.0691 0.108 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 3.57e-02 0.116 0.0551 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 2.50e-01 0.104 0.0904 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 3.38e-01 0.082 0.0854 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0493 0.0822 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0752 0.1 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 5.59e-01 -0.046 0.0785 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0602 0.116 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0106 0.081 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 2.05e-01 0.123 0.0965 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0097 0.0921 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0924 0.0882 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 1.93e-01 -0.129 0.099 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 1.53e-01 -0.179 0.124 0.194 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0766 0.124 0.194 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 3.36e-01 0.141 0.146 0.194 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0162 0.146 0.194 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 3.17e-01 -0.136 0.136 0.194 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 9.31e-01 0.0105 0.12 0.194 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0232 0.115 0.194 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 3.26e-01 -0.107 0.108 0.213 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 2.45e-01 -0.132 0.113 0.213 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 8.62e-01 0.0168 0.0961 0.213 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0687 0.116 0.213 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 3.46e-01 0.115 0.122 0.213 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 7.93e-01 0.0277 0.105 0.213 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 1.64e-01 -0.14 0.1 0.213 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 2.47e-01 0.119 0.102 0.215 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 8.20e-01 0.0238 0.105 0.215 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0623 0.0705 0.215 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 8.70e-01 0.0185 0.113 0.215 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 7.10e-01 0.0374 0.101 0.215 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 8.92e-01 0.0118 0.0869 0.215 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 3.61e-02 -0.229 0.108 0.215 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 6.30e-01 0.038 0.0787 0.22 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 1.90e-01 -0.159 0.12 0.22 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 1.90e-01 0.15 0.114 0.22 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 1.06e-01 -0.144 0.0887 0.22 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00545 0.078 0.22 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 3.00e-01 0.123 0.118 0.22 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0436 0.111 0.22 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 7.11e-02 -0.135 0.0743 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 7.86e-01 0.0211 0.0774 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 4.75e-01 0.0698 0.0976 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0194 0.0698 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 9.64e-01 -0.0046 0.101 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 7.31e-01 0.0365 0.106 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 2.31e-01 -0.112 0.0935 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 4.57e-01 0.0676 0.0908 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0468 0.0959 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 5.74e-01 0.0453 0.0805 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 6.33e-02 -0.153 0.0819 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 7.27e-01 0.0246 0.0704 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 396571 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0572 0.0861 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 8.82e-01 0.0175 0.117 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0197 0.0703 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0532 0.0832 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0416 0.0991 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0298 0.0686 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 8.46e-01 0.0207 0.106 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 5.28e-01 0.0328 0.0519 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 1.23e-01 0.131 0.0844 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 3.11e-01 0.0739 0.0729 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0671 0.0758 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 1.18e-01 -0.151 0.0959 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0012 0.0944 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0247 0.106 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00295 0.0629 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0425 0.114 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 7.67e-01 0.0291 0.0978 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 6.47e-01 0.0426 0.0928 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 3.99e-02 -0.229 0.111 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -784718 sc-eQTL 3.59e-01 0.0877 0.0955 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -948964 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0994 0.0907 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 119112 sc-eQTL 3.57e-01 0.0783 0.0849 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 247991 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0873 0.0929 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 368999 sc-eQTL 6.64e-01 0.0488 0.112 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -946614 sc-eQTL 4.57e-01 0.0579 0.0776 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 900020 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0383 0.0848 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 120025 sc-eQTL 6.34e-02 -0.12 0.0645 0.216 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136010 ALDH1L2 247672 eQTL 0.00151 0.111 0.0349 0.0 0.0 0.194
ENSG00000136044 APPL2 119112 eQTL 0.00774 0.0661 0.0248 0.0 0.0 0.194
ENSG00000235162 C12orf75 120025 eQTL 1.48e-11 -0.155 0.0228 0.00913 0.0101 0.194

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 119112 1.87e-06 2.63e-06 2.24e-07 2.03e-06 3.81e-07 7.8e-07 1.3e-06 4.97e-07 1.7e-06 7.2e-07 1.92e-06 1.34e-06 3.49e-06 1.4e-06 4.02e-07 9.62e-07 1.04e-06 1.29e-06 5.45e-07 8.15e-07 7.11e-07 1.91e-06 1.58e-06 5.67e-07 3.4e-06 7.46e-07 1.04e-06 1.07e-06 1.65e-06 1.86e-06 1.18e-06 2.85e-07 3.56e-07 7.02e-07 1.35e-06 6.12e-07 6.72e-07 3.65e-07 6.79e-07 3.76e-07 2.73e-07 2.75e-06 4.24e-07 1.86e-07 1.7e-07 3.28e-07 2.16e-07 1.27e-07 1.35e-07
ENSG00000235162 C12orf75 120025 1.92e-06 2.53e-06 2.48e-07 1.96e-06 3.79e-07 7.61e-07 1.29e-06 4.95e-07 1.76e-06 7.15e-07 1.99e-06 1.34e-06 3.5e-06 1.4e-06 4e-07 9.7e-07 1.02e-06 1.29e-06 5.56e-07 7.96e-07 6.81e-07 1.92e-06 1.55e-06 5.94e-07 3.4e-06 7.53e-07 1.01e-06 1.01e-06 1.64e-06 1.87e-06 1.15e-06 2.58e-07 3.55e-07 6.84e-07 1.35e-06 6.22e-07 6.85e-07 3.63e-07 6.78e-07 3.75e-07 2.6e-07 2.82e-06 4.23e-07 1.86e-07 1.7e-07 3.28e-07 2.15e-07 1.16e-07 1.35e-07