logo

Genes within 1Mb (chr12:105352350:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0141 0.0526 0.205 B L1
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0189 0.0774 0.205 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.52e-01 0.0564 0.0492 0.205 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0878 0.0783 0.205 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 3.97e-02 0.195 0.094 0.205 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 2.23e-01 -0.077 0.063 0.205 B L1
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0845 0.0733 0.205 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 4.70e-02 -0.134 0.0671 0.205 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0273 0.0648 0.205 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0105 0.0746 0.205 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0764 0.0734 0.205 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 7.27e-01 0.0356 0.102 0.205 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0306 0.0659 0.205 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 6.39e-01 0.0317 0.0675 0.205 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0639 0.0568 0.205 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0936 0.0599 0.205 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 1.97e-01 0.111 0.0859 0.205 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0244 0.0963 0.205 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 4.16e-01 0.071 0.087 0.205 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0368 0.0534 0.205 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 9.70e-01 0.00203 0.0548 0.205 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0121 0.0383 0.205 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 4.79e-01 0.0516 0.0728 0.2 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 1.03e-01 0.177 0.108 0.2 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 9.65e-01 0.0038 0.0878 0.2 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 5.64e-01 0.043 0.0744 0.2 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 5.80e-01 0.0368 0.0665 0.2 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00167 0.11 0.2 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0147 0.0931 0.2 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0319 0.0446 0.2 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 2.73e-01 0.0692 0.063 0.205 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 2.29e-03 0.302 0.0977 0.205 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0564 0.049 0.205 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 4.83e-02 0.17 0.0855 0.205 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 4.05e-01 -0.061 0.0732 0.205 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0242 0.0741 0.205 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0109 0.0957 0.205 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -787683 sc-eQTL 2.32e-01 -0.116 0.0967 0.204 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0594 0.0881 0.204 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0619 0.0869 0.204 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.20e-01 0.111 0.0904 0.204 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0291 0.112 0.204 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 1.61e-01 -0.112 0.0799 0.204 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 2.61e-01 0.0954 0.0846 0.204 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 7.49e-01 0.0211 0.0658 0.204 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 7.38e-01 -0.023 0.0686 0.205 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 2.94e-02 0.194 0.0884 0.205 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0784 0.117 0.205 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 3.69e-01 0.0743 0.0825 0.205 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 6.58e-02 -0.154 0.0835 0.205 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 2.09e-01 0.109 0.0866 0.205 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 1.85e-02 -0.161 0.0678 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 6.99e-02 0.195 0.107 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 3.30e-02 0.258 0.12 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 7.81e-01 0.0322 0.116 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 8.17e-01 0.02 0.0864 0.209 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 1.84e-01 0.159 0.119 0.209 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0104 0.12 0.209 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0638 0.117 0.209 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0862 0.116 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 9.58e-01 0.00463 0.087 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 1.27e-01 -0.157 0.103 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 3.40e-01 0.0853 0.0892 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 7.23e-01 0.0349 0.0982 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 7.82e-01 0.0315 0.114 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 4.86e-01 0.0704 0.101 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0778 0.0928 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0931 0.105 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 2.70e-01 0.109 0.0985 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0644 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00802 0.0882 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 8.41e-01 0.0207 0.103 0.2 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0889 0.119 0.2 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 9.65e-01 0.00432 0.0984 0.2 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0999 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 2.42e-02 -0.203 0.0894 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 1.83e-01 -0.106 0.0792 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 4.41e-01 0.0686 0.0889 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 5.01e-01 0.054 0.08 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0734 0.0925 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 1.29e-01 0.174 0.114 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0892 0.0778 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0224 0.0903 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0828 0.102 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 9.45e-01 0.00675 0.0981 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 9.58e-01 0.00491 0.0939 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 5.14e-01 0.0554 0.0848 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 7.79e-01 0.025 0.0891 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 4.76e-01 0.0859 0.12 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0875 0.0835 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 7.21e-02 -0.156 0.0862 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 2.31e-01 -0.124 0.104 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 4.60e-02 -0.177 0.0881 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 2.94e-01 0.116 0.11 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.50e-01 -0.122 0.106 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 2.11e-01 -0.134 0.106 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 6.38e-02 -0.208 0.111 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0436 0.0954 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0414 0.0644 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0205 0.0724 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 3.13e-01 0.0779 0.0771 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 7.93e-01 0.02 0.0761 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 4.05e-01 0.0926 0.111 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00459 0.0725 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0292 0.0701 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0486 0.099 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0469 0.0702 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 1.69e-01 -0.126 0.091 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 1.91e-01 -0.123 0.0937 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0176 0.116 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0475 0.0772 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 1.38e-01 0.128 0.0856 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 6.62e-02 -0.14 0.0759 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 2.08e-01 -0.121 0.0955 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 1.86e-01 0.139 0.105 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 4.77e-02 -0.234 0.118 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 5.10e-01 0.0758 0.115 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0876 0.0957 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 4.02e-01 0.0863 0.103 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0889 0.0767 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 4.53e-01 0.0712 0.0947 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0322 0.0896 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0152 0.0993 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 6.40e-01 0.0549 0.117 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0538 0.102 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 3.75e-01 0.077 0.0865 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0716 0.075 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 2.03e-01 -0.118 0.0924 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 1.20e-01 0.148 0.0948 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00796 0.103 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.111 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 6.84e-01 0.0337 0.0828 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 1.29e-01 -0.112 0.0734 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 1.66e-01 0.123 0.0883 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0748 0.103 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 5.04e-01 0.0779 0.116 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0109 0.117 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 3.20e-01 0.124 0.125 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0621 0.0998 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 7.30e-01 0.0282 0.0817 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0474 0.11 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0174 0.105 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 2.75e-01 0.127 0.116 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.55e-01 0.137 0.12 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 1.88e-02 0.273 0.115 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 1.90e-01 -0.144 0.109 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 4.49e-01 0.0863 0.114 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00339 0.0894 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 1.92e-01 0.129 0.0989 0.203 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 1.61e-01 0.149 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 5.26e-01 0.0793 0.125 0.203 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 5.95e-01 0.0597 0.112 0.203 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 3.28e-01 -0.099 0.101 0.203 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 5.62e-02 0.19 0.0991 0.203 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 1.44e-01 -0.123 0.0837 0.203 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -787683 sc-eQTL 2.87e-01 -0.101 0.095 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 5.68e-01 -0.051 0.0892 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 3.15e-01 -0.107 0.106 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.24e-01 0.134 0.109 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 6.07e-01 0.0612 0.119 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 1.08e-01 -0.183 0.113 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 3.58e-01 0.0897 0.0975 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 9.24e-01 0.00985 0.103 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -787683 sc-eQTL 2.01e-01 -0.124 0.0969 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 3.30e-02 -0.212 0.0988 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0411 0.0896 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 8.48e-02 0.169 0.0974 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 4.36e-01 0.0918 0.118 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0729 0.0874 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 5.08e-01 0.0604 0.091 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0395 0.0709 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -787683 sc-eQTL 1.61e-01 -0.154 0.11 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 1.76e-02 0.24 0.1 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 1.71e-01 -0.153 0.111 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.98e-02 -0.251 0.114 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00846 0.117 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 3.82e-01 0.1 0.114 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0582 0.102 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0712 0.0837 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -787683 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0567 0.105 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 7.98e-01 0.0265 0.104 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 8.47e-01 0.0211 0.11 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 7.31e-01 0.0365 0.106 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0689 0.117 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 9.58e-02 -0.154 0.0921 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 2.03e-01 0.122 0.0954 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 7.54e-01 0.0244 0.0778 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0712 0.0743 0.219 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0612 0.135 0.219 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.27e-01 0.139 0.114 0.219 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 2.87e-02 -0.265 0.12 0.219 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 1.28e-01 0.183 0.119 0.219 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0469 0.125 0.219 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0259 0.109 0.219 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 4.66e-02 -0.167 0.083 0.219 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0275 0.0579 0.204 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 8.43e-02 0.181 0.104 0.204 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00827 0.117 0.204 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0111 0.0894 0.204 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0836 0.0892 0.204 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 1.12e-01 -0.16 0.1 0.204 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 7.87e-01 0.0202 0.0747 0.204 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0618 0.0836 0.205 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 4.59e-01 -0.074 0.0997 0.205 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0321 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 8.34e-01 0.0235 0.112 0.205 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0592 0.0902 0.205 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 3.81e-01 0.0694 0.0792 0.205 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 4.22e-01 0.058 0.0721 0.205 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 9.75e-02 0.137 0.0822 0.193 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 3.61e-02 0.245 0.116 0.193 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0523 0.105 0.193 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 7.43e-01 -0.03 0.0915 0.193 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 3.85e-02 0.168 0.0804 0.193 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 1.84e-01 0.164 0.123 0.193 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 8.06e-01 0.0268 0.109 0.193 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 8.37e-02 0.152 0.0874 0.193 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 3.65e-01 0.0661 0.0727 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 7.69e-02 0.194 0.109 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 7.16e-01 0.0206 0.0566 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 1.17e-02 0.231 0.0908 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0503 0.0869 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0627 0.0835 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0638 0.102 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 2.97e-01 0.0831 0.0796 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 3.59e-03 0.341 0.116 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 4.80e-02 -0.162 0.0816 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 8.66e-02 0.168 0.0977 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0289 0.0935 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 8.08e-01 0.0218 0.0898 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 8.08e-01 0.0246 0.101 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 8.03e-01 0.0309 0.124 0.188 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 6.31e-02 0.227 0.121 0.188 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.01e-01 -0.185 0.144 0.188 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 3.79e-01 -0.127 0.143 0.188 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 5.49e-01 0.0806 0.134 0.188 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 6.91e-01 0.0474 0.119 0.188 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0377 0.114 0.188 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 3.37e-02 0.23 0.108 0.198 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 2.24e-02 0.259 0.113 0.198 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 1.28e-02 0.238 0.0949 0.198 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 8.27e-01 0.0255 0.117 0.198 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0318 0.122 0.198 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 5.61e-01 0.0614 0.105 0.198 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 9.16e-01 0.0107 0.101 0.198 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 3.31e-01 0.0992 0.102 0.208 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 2.73e-01 -0.114 0.104 0.208 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 9.90e-02 -0.116 0.0698 0.208 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 7.56e-01 -0.035 0.113 0.208 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0381 0.1 0.208 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0332 0.0865 0.208 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 6.98e-02 0.197 0.108 0.208 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 1.22e-01 0.124 0.08 0.203 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 3.12e-01 -0.125 0.124 0.203 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 4.06e-01 0.0977 0.117 0.203 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 4.72e-02 0.181 0.0905 0.203 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 9.71e-01 0.00292 0.0799 0.203 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 5.75e-01 -0.068 0.121 0.203 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0546 0.114 0.203 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 7.54e-01 0.0241 0.0769 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 8.63e-01 0.0134 0.0773 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0694 0.0974 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 3.34e-01 0.0674 0.0696 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0121 0.101 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0356 0.106 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0314 0.0936 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0722 0.0907 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 3.51e-03 -0.277 0.0939 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0993 0.08 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 7.15e-01 0.03 0.0822 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 4.17e-01 0.0569 0.07 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0426 0.0858 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 1.28e-01 0.178 0.116 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 5.02e-01 -0.047 0.07 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0849 0.0828 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 8.51e-02 -0.17 0.098 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 3.96e-01 0.059 0.0693 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 4.75e-03 0.301 0.105 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0625 0.0523 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 1.09e-02 0.217 0.0845 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0453 0.0737 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0413 0.0767 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0451 0.0974 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 1.42e-01 0.136 0.0923 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 7.96e-01 0.027 0.105 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0359 0.0618 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 9.67e-01 0.00464 0.113 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0556 0.0961 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 5.77e-01 0.051 0.0913 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 3.08e-01 0.112 0.11 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -787683 sc-eQTL 2.49e-01 -0.112 0.097 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -951929 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0676 0.0925 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 116147 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0673 0.0864 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 245026 sc-eQTL 4.09e-01 0.0783 0.0946 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 366034 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0365 0.114 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -949579 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0884 0.0789 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 897055 sc-eQTL 4.20e-01 0.0696 0.0862 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 117060 sc-eQTL 6.72e-01 0.0281 0.0662 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 116147 eQTL 0.0314 0.0482 0.0224 0.0 0.0 0.233
ENSG00000136052 SLC41A2 393606 eQTL 0.0492 -0.0843 0.0428 0.0 0.0 0.233
ENSG00000151131 C12orf45 366034 eQTL 0.0451 0.0389 0.0194 0.0 0.0 0.233
ENSG00000235162 C12orf75 117060 eQTL 0.000456 0.0734 0.0209 0.0 0.0 0.233

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000235162 C12orf75 117060 4.19e-06 4.19e-06 4.62e-07 2e-06 6.39e-07 1.21e-06 2.46e-06 6.18e-07 2.73e-06 1.66e-06 3.32e-06 1.57e-06 4.18e-06 2.13e-06 8.59e-07 2.66e-06 1.56e-06 2.14e-06 1.48e-06 7.62e-07 1.98e-06 3.43e-06 3.44e-06 9.73e-07 4.9e-06 1.26e-06 1.88e-06 1.75e-06 2.71e-06 2.23e-06 1.99e-06 4.59e-07 3.58e-07 1.22e-06 1.82e-06 6.3e-07 7.48e-07 4.21e-07 1.37e-06 1.71e-07 3.54e-07 5.76e-06 1.32e-06 1.53e-07 6.1e-07 3.6e-07 6.8e-07 2.72e-07 2e-07