Genes within 1Mb (chr12:105318654:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 4.05e-01 0.0502 0.0601 0.137 B L1
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 5.57e-01 -0.052 0.0885 0.137 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 9.46e-01 0.00382 0.0565 0.137 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 1.22e-02 -0.224 0.0886 0.137 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 5.91e-02 -0.205 0.108 0.137 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00716 0.0723 0.137 B L1
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 6.83e-01 0.0344 0.0842 0.137 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 7.00e-01 0.0299 0.0775 0.137 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 9.86e-01 0.00132 0.0728 0.137 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 2.43e-01 0.0979 0.0836 0.137 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 5.92e-01 0.0444 0.0826 0.137 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 7.98e-03 -0.301 0.112 0.137 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0478 0.074 0.137 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0914 0.0756 0.137 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0307 0.064 0.137 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 6.46e-01 0.0306 0.0667 0.137 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 5.48e-01 0.0575 0.0955 0.137 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 9.95e-02 -0.175 0.106 0.137 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 1.06e-01 -0.156 0.096 0.137 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0425 0.0591 0.137 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 2.26e-02 -0.138 0.0599 0.137 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 8.29e-01 -0.00917 0.0424 0.137 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 3.09e-01 0.082 0.0805 0.142 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 9.14e-01 0.0131 0.12 0.142 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 2.73e-01 0.106 0.0968 0.142 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 6.14e-01 0.0416 0.0823 0.142 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 6.21e-01 0.0365 0.0736 0.142 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 1.59e-01 -0.171 0.121 0.142 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 1.11e-01 0.164 0.102 0.142 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 5.83e-02 -0.0932 0.0489 0.142 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 1.08e-01 0.116 0.0718 0.137 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0133 0.114 0.137 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 1.75e-03 0.174 0.0549 0.137 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 9.08e-03 -0.256 0.097 0.137 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 7.38e-02 -0.149 0.0832 0.137 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 3.91e-01 0.0727 0.0846 0.137 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 7.53e-01 0.0344 0.109 0.137 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -821379 sc-eQTL 1.80e-01 -0.145 0.108 0.137 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 6.20e-01 -0.049 0.0986 0.137 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 4.97e-01 0.0662 0.0972 0.137 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 6.97e-01 0.0396 0.101 0.137 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 2.67e-01 -0.138 0.124 0.137 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0476 0.0898 0.137 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00291 0.0948 0.137 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 3.07e-01 0.0752 0.0734 0.137 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0836 0.079 0.137 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 4.20e-01 0.0832 0.103 0.137 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 2.25e-01 -0.164 0.135 0.137 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 7.73e-01 0.0275 0.0954 0.137 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 6.06e-01 0.0501 0.0971 0.137 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0422 0.1 0.137 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 4.47e-01 0.0603 0.0792 0.137 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 6.40e-01 0.0573 0.122 0.135 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 7.33e-01 0.047 0.138 0.135 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 5.96e-01 0.0694 0.131 0.135 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 7.42e-01 0.0322 0.0978 0.135 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 8.72e-01 0.0219 0.136 0.135 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0357 0.136 0.135 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 7.85e-01 0.0362 0.132 0.135 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 9.15e-02 0.222 0.131 0.135 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 1.69e-01 0.134 0.0971 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 2.91e-01 0.123 0.116 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 6.90e-01 0.0401 0.1 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0879 0.11 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 2.37e-02 -0.287 0.126 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0675 0.113 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 6.89e-02 -0.189 0.103 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0634 0.118 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 3.76e-01 0.0985 0.111 0.138 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 3.26e-01 -0.118 0.12 0.138 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 6.00e-01 -0.052 0.0991 0.138 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 2.45e-01 -0.135 0.116 0.138 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0524 0.134 0.138 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 4.63e-02 0.22 0.11 0.138 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 2.97e-01 -0.12 0.115 0.138 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 6.88e-01 0.0409 0.102 0.138 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 5.02e-01 0.0627 0.0933 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 8.25e-02 -0.181 0.104 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 6.40e-01 -0.044 0.094 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 2.73e-02 -0.239 0.107 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 7.44e-02 -0.24 0.134 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 2.22e-01 -0.112 0.0913 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 3.11e-01 0.108 0.106 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0894 0.12 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0735 0.111 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 6.93e-01 0.0422 0.107 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 6.41e-01 0.045 0.0964 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 9.55e-01 0.00567 0.101 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 7.81e-01 0.0381 0.137 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0173 0.0951 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 5.51e-01 -0.059 0.0987 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 1.29e-01 -0.179 0.118 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 2.86e-01 -0.109 0.102 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 9.70e-01 0.00483 0.127 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 3.42e-01 0.116 0.122 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00899 0.123 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 7.75e-01 0.037 0.129 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0141 0.11 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0486 0.074 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 9.76e-01 0.00242 0.0818 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 5.13e-01 0.057 0.0871 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 7.26e-01 0.0302 0.0859 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 4.45e-03 -0.354 0.123 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0705 0.0817 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0594 0.079 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0108 0.112 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00765 0.0796 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 1.13e-01 0.164 0.103 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 2.74e-01 0.117 0.106 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 1.75e-01 -0.179 0.131 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 1.49e-01 -0.126 0.0872 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 2.78e-01 -0.106 0.0973 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 9.65e-01 0.00379 0.0867 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0269 0.105 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0364 0.115 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 9.85e-01 0.00241 0.13 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 1.21e-01 -0.195 0.125 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 9.36e-03 -0.271 0.103 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 2.79e-01 -0.122 0.112 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0136 0.0843 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 7.54e-01 0.0344 0.11 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 1.70e-01 0.142 0.103 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 3.30e-01 -0.112 0.115 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 6.89e-01 0.0544 0.136 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 5.90e-02 -0.222 0.117 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0872 0.1 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 2.07e-01 0.11 0.0866 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0348 0.1 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 6.30e-01 0.0496 0.103 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 2.15e-01 -0.138 0.111 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 2.76e-01 -0.13 0.119 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 5.30e-01 0.0562 0.0892 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 3.95e-02 -0.163 0.0788 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 2.36e-01 -0.113 0.0953 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 7.16e-01 0.0422 0.116 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 4.57e-01 -0.097 0.13 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 1.20e-01 -0.204 0.13 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0741 0.14 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 8.46e-01 0.0217 0.112 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 6.49e-02 -0.168 0.0907 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0643 0.124 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 8.57e-01 0.0223 0.124 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 3.48e-01 -0.128 0.136 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 9.46e-01 0.00955 0.141 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 4.18e-02 -0.279 0.136 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0889 0.129 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 3.30e-01 0.131 0.134 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 1.57e-01 -0.148 0.105 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 7.21e-01 0.0393 0.11 0.136 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 6.43e-01 0.0546 0.117 0.136 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 2.25e-01 -0.168 0.138 0.136 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 1.54e-02 -0.299 0.122 0.136 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 6.51e-01 0.0507 0.112 0.136 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 6.43e-02 -0.204 0.11 0.136 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 5.24e-01 0.0593 0.0931 0.136 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -821379 sc-eQTL 1.36e-03 -0.337 0.104 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 4.64e-01 0.0732 0.0997 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 9.34e-02 0.199 0.118 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 5.75e-02 -0.233 0.122 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 2.91e-01 -0.14 0.133 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 9.85e-01 0.0024 0.127 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 8.40e-01 -0.022 0.109 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 3.83e-02 0.237 0.114 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -821379 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0868 0.109 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 5.55e-01 0.0664 0.112 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00509 0.101 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 3.24e-01 0.109 0.11 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 6.52e-01 -0.06 0.133 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0402 0.0986 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0368 0.103 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 8.66e-01 0.0135 0.0799 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -821379 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0917 0.125 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 2.81e-01 -0.125 0.115 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0108 0.128 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00287 0.132 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 8.91e-01 0.0182 0.133 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 1.61e-01 0.182 0.13 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0718 0.116 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 8.75e-01 0.0151 0.0955 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -821379 sc-eQTL 8.92e-02 -0.197 0.115 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 1.08e-01 -0.185 0.114 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 7.90e-01 0.0325 0.122 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0244 0.118 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 4.02e-01 -0.109 0.13 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 6.27e-01 -0.05 0.103 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 5.89e-01 0.0574 0.106 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 7.29e-01 0.0299 0.0863 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 7.42e-01 0.0306 0.0927 0.122 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 3.94e-01 -0.143 0.167 0.122 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 4.51e-02 -0.284 0.14 0.122 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0281 0.152 0.122 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 2.50e-01 -0.173 0.149 0.122 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 7.23e-01 0.0549 0.155 0.122 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 8.76e-01 0.0212 0.135 0.122 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 3.56e-02 0.219 0.103 0.122 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0484 0.0694 0.139 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 8.91e-02 -0.214 0.125 0.139 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0223 0.14 0.139 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 4.72e-01 0.0771 0.107 0.139 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0122 0.107 0.139 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0978 0.121 0.139 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 3.59e-01 0.0821 0.0894 0.139 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 7.82e-01 -0.026 0.094 0.137 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 4.38e-01 0.0869 0.112 0.137 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 3.53e-01 -0.116 0.124 0.137 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 9.84e-01 0.00258 0.125 0.137 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0348 0.101 0.137 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 7.60e-01 0.0272 0.089 0.137 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0717 0.0809 0.137 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 2.30e-01 0.107 0.0887 0.144 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 9.59e-01 0.00648 0.127 0.144 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 5.19e-02 0.219 0.112 0.144 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 9.19e-01 0.01 0.0985 0.144 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 8.72e-02 0.149 0.0868 0.144 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0081 0.133 0.144 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 2.13e-02 0.268 0.116 0.144 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 9.88e-01 0.00139 0.0948 0.144 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 2.58e-02 0.183 0.0814 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 7.70e-01 0.0364 0.124 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 2.28e-02 0.145 0.0632 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 8.68e-02 -0.178 0.103 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 1.98e-01 -0.127 0.0979 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 1.63e-01 0.132 0.094 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0496 0.115 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 6.04e-01 0.0465 0.0897 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 9.22e-01 -0.013 0.133 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 9.55e-03 0.238 0.0911 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 1.65e-01 -0.153 0.11 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 2.38e-01 -0.124 0.105 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0914 0.101 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 6.77e-01 0.0474 0.114 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0897 0.147 0.13 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00919 0.146 0.13 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 2.97e-01 0.179 0.171 0.13 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 1.19e-01 0.266 0.17 0.13 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 2.70e-01 0.176 0.159 0.13 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 8.92e-01 0.0192 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 3.70e-02 -0.281 0.133 0.13 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 8.07e-01 0.0302 0.124 0.138 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 8.55e-01 0.0237 0.13 0.138 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 1.08e-01 0.176 0.109 0.138 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 2.56e-01 -0.151 0.132 0.138 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 1.52e-01 -0.199 0.138 0.138 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 3.41e-01 -0.114 0.119 0.138 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 2.01e-01 0.146 0.114 0.138 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 1.35e-01 0.171 0.114 0.143 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 2.61e-01 -0.132 0.117 0.143 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 4.93e-01 0.0542 0.0789 0.143 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 2.81e-01 -0.136 0.126 0.143 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 1.78e-01 -0.151 0.112 0.143 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 3.00e-01 0.101 0.097 0.143 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 6.61e-01 0.0539 0.123 0.143 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 2.26e-01 0.109 0.0899 0.147 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 8.74e-01 0.0221 0.139 0.147 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 1.19e-01 -0.205 0.131 0.147 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 5.45e-01 0.0622 0.102 0.147 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 6.72e-01 -0.038 0.0894 0.147 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 1.97e-01 -0.175 0.135 0.147 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 7.05e-01 0.0483 0.127 0.147 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0707 0.0859 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 9.05e-02 0.15 0.0883 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 5.33e-01 0.07 0.112 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0324 0.0801 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 1.77e-01 -0.157 0.116 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 2.13e-01 -0.152 0.121 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 2.02e-01 0.137 0.107 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 3.82e-02 -0.216 0.103 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 9.23e-01 0.0107 0.11 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 1.62e-01 0.127 0.0904 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0973 0.0928 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 7.30e-01 0.0275 0.0794 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 sc-eQTL 3.59e-02 -0.203 0.0962 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 1.94e-01 -0.172 0.132 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0905 0.0791 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 7.31e-01 0.0323 0.0939 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 1.46e-01 -0.162 0.111 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 7.08e-02 0.142 0.0783 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 7.23e-01 0.0433 0.122 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 7.70e-03 0.158 0.0587 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 2.33e-02 -0.22 0.0964 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 8.53e-02 -0.144 0.0834 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 3.98e-01 0.0739 0.0872 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0629 0.111 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 2.98e-01 0.11 0.105 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0651 0.119 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 2.66e-01 0.0783 0.0703 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 7.15e-02 -0.23 0.127 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 3.92e-02 -0.225 0.108 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 7.18e-01 0.0377 0.104 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 3.98e-01 0.106 0.125 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -821379 sc-eQTL 2.58e-01 -0.123 0.109 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -985625 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0857 0.104 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 82451 sc-eQTL 9.13e-01 0.0106 0.0969 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 211330 sc-eQTL 3.12e-01 0.107 0.106 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 332338 sc-eQTL 3.36e-01 -0.123 0.128 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -983275 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0569 0.0886 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 863359 sc-eQTL 9.38e-01 0.00751 0.0967 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 83364 sc-eQTL 4.97e-01 0.0505 0.0741 0.138 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 82451 pQTL 4.27e-08 0.0852 0.0155 0.0 0.0 0.109
ENSG00000136044 APPL2 82451 eQTL 0.0129 0.0748 0.03 0.0 0.0 0.107
ENSG00000136051 WASHC4 211330 eQTL 0.000146 0.0584 0.0153 0.0 0.0 0.107
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 eQTL 8.37e-14 0.424 0.056 0.0 0.0 0.107
ENSG00000171310 CHST11 863359 eQTL 0.0392 0.0486 0.0235 0.0 0.0 0.107


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136051 WASHC4 211330 2.21e-06 5.32e-06 7.85e-07 1.71e-06 3.71e-07 6.06e-07 1.26e-06 3.37e-07 1.66e-06 4.48e-07 1.86e-06 6.58e-07 2.68e-06 1.36e-06 5.41e-07 9.52e-07 9.77e-07 1.18e-06 8.67e-07 6.86e-07 8.13e-07 1.88e-06 1.12e-06 6.51e-07 3.3e-06 7.45e-07 1.06e-06 9.25e-07 1.63e-06 1.21e-06 7.57e-07 3.51e-08 1.04e-07 8.18e-07 6.29e-07 5.35e-07 6.86e-07 7.64e-08 4.67e-07 2.79e-07 4.49e-08 4.16e-06 4.38e-07 1.38e-07 1.82e-07 1.26e-07 1.62e-07 3.25e-09 5.15e-08
ENSG00000136052 SLC41A2 359910 1.2e-06 2.35e-06 3.25e-07 5.17e-07 1.07e-07 1.74e-07 6.02e-07 7.52e-08 3.62e-07 1.39e-07 9.39e-07 3.11e-07 9.44e-07 2.54e-07 4.05e-07 2.14e-07 5.63e-07 4.11e-07 1.51e-07 7.54e-08 1.87e-07 4.99e-07 3.7e-07 5.11e-08 1.54e-06 2.6e-07 2.52e-07 2.19e-07 3.58e-07 2.97e-07 3.68e-07 3.03e-08 3.65e-08 2.19e-07 3.52e-07 1.44e-07 1e-07 8.63e-08 6.08e-08 3.58e-08 5.03e-08 1.51e-06 2.91e-07 1.24e-08 3.61e-08 1.84e-08 7.12e-08 1.88e-09 4.88e-08