logo

Genes within 1Mb (chr12:105315110:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 8.61e-01 0.00822 0.0468 0.278 B L1
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 7.19e-02 -0.123 0.0682 0.278 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0638 0.0436 0.278 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 6.07e-02 0.131 0.0693 0.278 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 1.97e-01 0.109 0.0841 0.278 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 2.30e-01 0.0674 0.056 0.278 B L1
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0606 0.0652 0.278 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0883 0.0599 0.278 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 8.29e-01 0.0122 0.0563 0.278 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 8.48e-02 0.111 0.0644 0.278 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 2.00e-01 0.0819 0.0636 0.278 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 9.09e-01 0.0101 0.0884 0.278 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 2.63e-02 0.127 0.0566 0.278 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0316 0.0586 0.278 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 1.07e-01 -0.0796 0.0492 0.278 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 2.35e-01 0.0621 0.0522 0.278 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0234 0.0749 0.278 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 1.09e-01 0.134 0.0832 0.278 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 8.18e-01 0.0174 0.0757 0.278 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 2.07e-01 0.0585 0.0463 0.278 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0205 0.0476 0.278 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00352 0.0333 0.278 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0201 0.0647 0.275 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 1.54e-01 -0.137 0.0961 0.275 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 9.90e-01 0.000936 0.0779 0.275 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00641 0.0661 0.275 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0439 0.059 0.275 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 1.83e-01 0.129 0.0968 0.275 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 4.88e-01 0.0574 0.0826 0.275 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0437 0.0395 0.275 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 8.39e-01 0.0114 0.0561 0.278 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0458 0.0886 0.278 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0352 0.0436 0.278 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 1.34e-01 0.115 0.0762 0.278 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 6.88e-01 0.0262 0.0651 0.278 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 9.02e-01 0.00813 0.0658 0.278 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 1.25e-01 -0.13 0.0845 0.278 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -824923 sc-eQTL 3.81e-01 0.0737 0.0839 0.277 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 2.13e-01 -0.095 0.0761 0.277 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0937 0.0751 0.277 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 5.17e-01 0.0509 0.0785 0.277 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 1.93e-01 -0.126 0.0962 0.277 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 2.31e-01 0.0833 0.0693 0.277 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0542 0.0734 0.277 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0436 0.0569 0.277 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 7.70e-01 0.0178 0.0608 0.278 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 1.10e-01 -0.127 0.0788 0.278 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 1.39e-01 0.154 0.104 0.278 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 1.75e-02 -0.173 0.0723 0.278 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 1.06e-02 0.189 0.0735 0.278 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 6.18e-01 0.0384 0.077 0.278 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 3.16e-01 -0.061 0.0608 0.278 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 2.30e-01 -0.118 0.0979 0.268 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 9.36e-01 0.00887 0.111 0.268 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 4.87e-02 -0.207 0.104 0.268 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0398 0.0787 0.268 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 2.57e-01 -0.124 0.109 0.268 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 3.44e-01 0.104 0.109 0.268 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0688 0.106 0.268 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 5.58e-01 0.0623 0.106 0.268 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0424 0.076 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 9.36e-01 0.00729 0.0905 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0699 0.0781 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 3.13e-01 0.0867 0.0857 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 1.21e-01 0.154 0.0988 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 8.74e-01 -0.014 0.0884 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0436 0.0813 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 1.31e-01 -0.14 0.092 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 1.94e-01 -0.114 0.0872 0.28 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 3.26e-01 0.0929 0.0943 0.28 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 7.68e-01 0.0231 0.0781 0.28 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 3.12e-02 0.197 0.0906 0.28 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 3.21e-01 0.105 0.106 0.28 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00687 0.0872 0.28 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0548 0.0903 0.28 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0113 0.0802 0.28 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 3.13e-02 0.151 0.0696 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0669 0.0786 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0138 0.0708 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 2.91e-01 0.0865 0.0817 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 7.09e-01 -0.038 0.102 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 2.06e-01 0.0872 0.0688 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0621 0.0798 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0232 0.0906 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 2.11e-02 0.203 0.0872 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 7.43e-02 -0.15 0.0839 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0777 0.0762 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 5.00e-01 0.054 0.0801 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0161 0.108 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 2.32e-01 0.09 0.075 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 5.03e-01 0.0524 0.0781 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 2.54e-01 0.107 0.0933 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 6.38e-02 0.151 0.0812 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0927 0.102 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 8.19e-01 0.0224 0.0977 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 7.86e-01 0.0267 0.0983 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0239 0.103 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 3.83e-01 0.0766 0.0877 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 9.22e-01 0.00578 0.0593 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00212 0.063 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 1.73e-01 0.0916 0.0669 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 4.94e-01 0.0454 0.0662 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00299 0.0967 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 3.08e-02 0.136 0.0624 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00695 0.061 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 1.04e-02 -0.219 0.0848 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 7.76e-01 0.0175 0.0615 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 1.40e-01 0.118 0.0796 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 6.56e-01 0.0368 0.0824 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 5.36e-01 0.0631 0.102 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 1.89e-01 0.0888 0.0674 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0795 0.0752 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0475 0.0669 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 4.58e-01 0.0607 0.0816 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00801 0.0894 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0448 0.101 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 3.12e-01 0.099 0.0978 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 1.01e-02 0.209 0.0805 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 5.36e-01 0.0544 0.0877 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00833 0.0656 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 3.14e-01 0.0846 0.0839 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 1.22e-01 -0.123 0.079 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 1.76e-01 0.119 0.0877 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 2.48e-01 -0.12 0.104 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 7.16e-01 0.0328 0.0902 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 9.27e-02 -0.129 0.0763 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 1.14e-01 -0.105 0.0663 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 7.37e-02 0.14 0.078 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 6.49e-01 0.0368 0.0807 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 5.15e-01 0.0571 0.0875 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 8.43e-01 0.0186 0.0941 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0127 0.0702 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 3.41e-01 0.0595 0.0624 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0428 0.075 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000592 0.0895 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 4.80e-01 0.0711 0.1 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 5.88e-01 0.0548 0.101 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 7.16e-01 0.0393 0.108 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00613 0.0862 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 3.83e-01 0.0616 0.0704 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0988 0.0951 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 2.37e-01 -0.11 0.0925 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 4.20e-01 0.0825 0.102 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 1.77e-01 0.143 0.105 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0326 0.103 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 1.24e-03 0.309 0.0942 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 9.99e-01 0.000182 0.101 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 7.59e-01 0.0243 0.0788 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 3.52e-01 0.0805 0.0862 0.277 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0817 0.0922 0.277 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 6.27e-02 0.202 0.108 0.277 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 2.36e-01 -0.116 0.0972 0.277 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 3.65e-02 0.183 0.0871 0.277 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 1.61e-01 0.122 0.0865 0.277 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 8.06e-01 -0.018 0.0732 0.277 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -824923 sc-eQTL 2.58e-01 0.0938 0.0828 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 8.96e-02 -0.132 0.0773 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 1.10e-03 -0.299 0.0903 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 6.67e-01 0.0412 0.0957 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 1.12e-01 -0.165 0.103 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 9.44e-01 0.00694 0.0993 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0593 0.0851 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0443 0.0896 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -824923 sc-eQTL 4.03e-01 0.0708 0.0846 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0539 0.0869 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 8.06e-01 0.0192 0.0781 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 3.99e-01 0.0721 0.0853 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 2.22e-01 -0.125 0.102 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 1.32e-01 0.115 0.0759 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 9.37e-01 0.00631 0.0793 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 9.10e-01 0.00698 0.0618 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -824923 sc-eQTL 1.84e-01 0.128 0.0962 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 1.87e-01 -0.117 0.0888 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0776 0.0981 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 1.26e-01 0.155 0.101 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0669 0.102 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 9.33e-01 0.00842 0.1 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0246 0.0896 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0291 0.0735 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -824923 sc-eQTL 5.01e-01 0.0602 0.0893 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0147 0.0885 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 1.41e-01 -0.138 0.0931 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0203 0.0905 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 8.00e-02 0.175 0.0993 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 6.92e-01 0.0314 0.0791 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 7.54e-02 -0.145 0.0811 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 2.59e-01 -0.075 0.0662 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 4.01e-01 0.0598 0.0709 0.274 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 3.25e-02 0.272 0.126 0.274 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0443 0.109 0.274 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 1.37e-01 0.173 0.115 0.274 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0499 0.115 0.274 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 6.63e-01 0.0518 0.119 0.274 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0405 0.104 0.274 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000266 0.0806 0.274 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 1.48e-01 0.0777 0.0535 0.272 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 6.94e-01 0.0385 0.0976 0.272 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 9.57e-01 0.00581 0.109 0.272 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0742 0.0828 0.272 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0449 0.0829 0.272 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 2.96e-02 0.203 0.0928 0.272 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0747 0.0691 0.272 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0225 0.0732 0.278 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0242 0.0872 0.278 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 1.93e-02 0.226 0.0958 0.278 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 1.18e-01 -0.152 0.0971 0.278 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 4.81e-02 0.155 0.0782 0.278 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 6.38e-02 -0.128 0.0687 0.278 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0553 0.063 0.278 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 9.78e-01 0.00192 0.0709 0.271 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 1.14e-02 -0.253 0.099 0.271 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0858 0.0897 0.271 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 4.18e-01 0.0635 0.0783 0.271 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 5.25e-01 0.0443 0.0696 0.271 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0987 0.105 0.271 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 4.25e-01 0.0745 0.0932 0.271 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0434 0.0754 0.271 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0258 0.0643 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0627 0.0968 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 6.13e-02 -0.0932 0.0495 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 7.25e-01 0.0287 0.0813 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 7.77e-01 0.0217 0.0768 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 7.12e-01 0.0272 0.0738 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 1.74e-01 -0.123 0.0898 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 4.32e-01 0.0557 0.0708 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 5.16e-01 0.0683 0.105 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0369 0.0731 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 8.39e-02 0.151 0.0868 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00958 0.0831 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0359 0.0798 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0924 0.0895 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0194 0.112 0.273 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 7.99e-02 -0.194 0.11 0.273 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 9.14e-01 0.0141 0.131 0.273 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 2.12e-01 -0.163 0.13 0.273 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 7.10e-01 0.0453 0.122 0.273 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 6.84e-02 -0.196 0.107 0.273 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0797 0.103 0.273 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 6.57e-01 0.0423 0.0949 0.278 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 5.06e-02 -0.194 0.0985 0.278 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 6.68e-02 -0.154 0.0833 0.278 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 1.83e-01 0.136 0.101 0.278 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 5.59e-01 0.0622 0.106 0.278 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 4.31e-01 0.0725 0.0918 0.278 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 7.75e-01 0.0252 0.0879 0.278 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0271 0.0928 0.269 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0858 0.0946 0.269 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 4.46e-01 0.0487 0.0638 0.269 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 5.89e-01 0.0554 0.102 0.269 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 6.92e-02 0.165 0.0904 0.269 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0728 0.0785 0.269 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 1.47e-01 -0.144 0.0987 0.269 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0742 0.068 0.282 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 3.02e-01 0.108 0.105 0.282 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 3.51e-01 0.0929 0.0993 0.282 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0601 0.0774 0.282 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 5.38e-02 -0.13 0.0668 0.282 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 2.90e-01 0.108 0.102 0.282 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 6.94e-01 0.0378 0.0961 0.282 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 1.15e-01 -0.102 0.0645 0.282 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00816 0.0685 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 6.90e-01 0.0345 0.0864 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0278 0.0617 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 1.05e-01 0.145 0.0891 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 9.33e-02 0.157 0.0931 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 7.44e-01 0.0271 0.0829 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0558 0.0803 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0578 0.0848 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 4.31e-02 0.142 0.0698 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 5.08e-02 -0.141 0.0716 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 2.49e-01 -0.071 0.0614 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 356366 sc-eQTL 2.74e-01 0.0826 0.0752 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00376 0.103 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 1.48e-01 0.0889 0.0612 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0348 0.0729 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 6.34e-01 0.0414 0.0867 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 9.15e-01 0.0066 0.0618 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0155 0.0957 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0723 0.0465 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 1.99e-01 0.098 0.0761 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 9.58e-01 0.00345 0.0657 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 8.15e-01 -0.016 0.0684 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0901 0.0866 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0156 0.0829 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 4.85e-02 -0.184 0.0925 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00675 0.0552 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 2.83e-01 0.108 0.1 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 9.81e-02 0.142 0.0853 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00563 0.0815 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0575 0.098 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -824923 sc-eQTL 3.37e-01 0.0811 0.0843 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -989169 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0635 0.0802 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 78907 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0502 0.075 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 207786 sc-eQTL 5.03e-01 0.0551 0.0821 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 328794 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0729 0.099 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -986819 sc-eQTL 1.45e-01 0.1 0.0683 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 859815 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0353 0.0749 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 79820 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0441 0.0574 0.276 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136010 ALDH1L2 207467 eQTL 6.69e-06 0.134 0.0295 0.0 0.0 0.295
ENSG00000136044 APPL2 78907 pQTL 1.34e-06 -0.0533 0.011 0.0 0.0 0.296
ENSG00000136044 APPL2 78907 eQTL 0.000389 -0.0747 0.021 0.0 0.0 0.295
ENSG00000151131 C12orf45 328794 eQTL 0.00746 0.0488 0.0182 0.0 0.0 0.295
ENSG00000235162 C12orf75 79820 eQTL 9.26e-10 -0.12 0.0194 0.0 0.0 0.295

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136010 ALDH1L2 207467 1.27e-06 1.08e-06 2.79e-07 1.26e-06 2.19e-07 6.42e-07 1.58e-06 3.31e-07 1.41e-06 3.95e-07 1.5e-06 5.98e-07 2.5e-06 2.77e-07 4.31e-07 8.27e-07 7.93e-07 5.82e-07 5.72e-07 5.62e-07 3.6e-07 1.28e-06 9.29e-07 5.86e-07 2.21e-06 2.99e-07 7.31e-07 5.65e-07 1.07e-06 1.2e-06 6.9e-07 2.62e-07 1.82e-07 6.58e-07 5.67e-07 3.98e-07 5.19e-07 1.47e-07 4.41e-07 2.17e-07 2.75e-07 1.62e-06 5.73e-08 1.06e-07 1.69e-07 1.38e-07 1.9e-07 3.66e-08 8.28e-08
ENSG00000235162 C12orf75 79820 6.15e-06 8.97e-06 8.35e-07 3.95e-06 1.64e-06 2.09e-06 8.05e-06 1.19e-06 4.55e-06 2.59e-06 7.51e-06 3.33e-06 1.01e-05 2.7e-06 1.02e-06 3.99e-06 1.97e-06 3.98e-06 1.54e-06 1.15e-06 2.98e-06 5.44e-06 4.77e-06 1.48e-06 9.25e-06 1.81e-06 2.31e-06 1.82e-06 5.21e-06 4.73e-06 3.32e-06 3.85e-07 7.91e-07 1.69e-06 2e-06 9.21e-07 9.67e-07 4.08e-07 9.61e-07 7.4e-07 2.39e-07 8.29e-06 6.3e-07 1.51e-07 3.97e-07 7.77e-07 7.75e-07 4.43e-07 3.18e-07