Genes within 1Mb (chr12:105312907:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 8.26e-01 0.0104 0.0472 0.276 B L1
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 6.24e-02 -0.129 0.0688 0.276 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0614 0.044 0.276 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 5.97e-02 0.132 0.0699 0.276 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 2.44e-01 0.0992 0.0849 0.276 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 2.46e-01 0.0657 0.0565 0.276 B L1
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0699 0.0658 0.276 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 1.04e-01 -0.0986 0.0603 0.276 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 9.14e-01 0.00616 0.0569 0.276 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 1.31e-01 0.0987 0.0652 0.276 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 2.29e-01 0.0776 0.0644 0.276 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 9.76e-01 0.00273 0.0893 0.276 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 2.67e-02 0.128 0.0572 0.276 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0302 0.0592 0.276 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0772 0.0497 0.276 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 2.28e-01 0.0638 0.0527 0.276 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0319 0.0757 0.276 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 1.20e-01 0.131 0.0841 0.276 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 8.80e-01 0.0116 0.0765 0.276 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 2.52e-01 0.0538 0.0468 0.276 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0265 0.048 0.276 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00429 0.0336 0.276 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0249 0.0647 0.273 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 1.17e-01 -0.151 0.096 0.273 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 8.68e-01 0.0129 0.0779 0.273 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00848 0.0661 0.273 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 3.98e-01 -0.05 0.059 0.273 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 2.01e-01 0.124 0.0968 0.273 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 5.04e-01 0.0552 0.0826 0.273 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0455 0.0395 0.273 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 8.37e-01 0.0116 0.0566 0.276 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0464 0.0894 0.276 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0389 0.0439 0.276 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 1.25e-01 0.118 0.0769 0.276 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 6.17e-01 0.0329 0.0656 0.276 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 7.88e-01 0.0178 0.0664 0.276 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 1.45e-01 -0.125 0.0853 0.276 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -827126 sc-eQTL 4.85e-01 0.0593 0.0848 0.275 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 1.76e-01 -0.104 0.0768 0.275 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0797 0.0759 0.275 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 6.33e-01 0.0379 0.0794 0.275 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 1.30e-01 -0.148 0.097 0.275 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 2.92e-01 0.074 0.0701 0.275 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0657 0.0741 0.275 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0398 0.0575 0.275 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 7.61e-01 0.0187 0.0615 0.276 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 1.10e-01 -0.128 0.0797 0.276 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 1.52e-01 0.151 0.105 0.276 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 2.52e-02 -0.165 0.0732 0.276 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 1.39e-02 0.184 0.0744 0.276 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 6.08e-01 0.04 0.0779 0.276 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0619 0.0615 0.276 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 3.04e-01 -0.102 0.0994 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 8.75e-01 0.0176 0.112 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 3.87e-02 -0.22 0.105 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0333 0.0798 0.265 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 3.15e-01 -0.111 0.111 0.265 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 3.85e-01 0.0964 0.111 0.265 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0635 0.108 0.265 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 4.97e-01 0.0732 0.107 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0274 0.0769 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 9.07e-01 0.0107 0.0915 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0723 0.0789 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 2.92e-01 0.0916 0.0866 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 1.14e-01 0.159 0.0999 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0142 0.0894 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0518 0.0821 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 1.02e-01 -0.152 0.0929 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 1.79e-01 -0.119 0.0881 0.278 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 3.39e-01 0.0913 0.0954 0.278 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 8.69e-01 0.013 0.079 0.278 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 4.19e-02 0.188 0.0917 0.278 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 2.64e-01 0.119 0.107 0.278 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00256 0.0882 0.278 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0785 0.0912 0.278 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 7.77e-01 -0.023 0.0811 0.278 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 2.30e-02 0.161 0.0702 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0619 0.0794 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0121 0.0715 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 3.29e-01 0.0807 0.0825 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0458 0.103 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 2.10e-01 0.0873 0.0695 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 3.86e-01 -0.07 0.0805 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0324 0.0915 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 1.24e-02 0.222 0.0879 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 5.41e-02 -0.164 0.0846 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0679 0.077 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 4.42e-01 0.0623 0.0809 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0219 0.11 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 2.21e-01 0.0931 0.0758 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 6.48e-01 0.0361 0.079 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 2.74e-01 0.103 0.0943 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 5.75e-02 0.157 0.0822 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0839 0.103 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000562 0.0991 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 7.67e-01 0.0296 0.0997 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 7.03e-01 -0.04 0.105 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 4.13e-01 0.0729 0.0889 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 9.05e-01 0.00717 0.0601 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00648 0.0636 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 2.29e-01 0.0816 0.0676 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 5.45e-01 0.0405 0.0668 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0062 0.0976 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 3.11e-02 0.137 0.063 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0143 0.0615 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 1.37e-02 -0.213 0.0857 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 8.04e-01 0.0154 0.0622 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 1.77e-01 0.109 0.0806 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 6.52e-01 0.0376 0.0833 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 5.93e-01 0.0551 0.103 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 1.83e-01 0.0911 0.0682 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0725 0.0761 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0487 0.0677 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 4.94e-01 0.0566 0.0826 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0227 0.0905 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 6.33e-01 -0.049 0.102 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 3.29e-01 0.0967 0.099 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 7.26e-03 0.22 0.0813 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 5.16e-01 0.0577 0.0888 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00682 0.0664 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 2.60e-01 0.0959 0.0848 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 1.06e-01 -0.13 0.0799 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 2.53e-01 0.102 0.0888 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 1.94e-01 -0.137 0.105 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 7.49e-01 0.0293 0.0913 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 1.15e-01 -0.122 0.0773 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 9.94e-02 -0.111 0.067 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 5.85e-02 0.15 0.0787 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 7.11e-01 0.0303 0.0816 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 4.37e-01 0.0688 0.0884 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 8.51e-01 0.0179 0.0951 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0221 0.0709 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 4.27e-01 0.0502 0.0631 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0348 0.0759 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00892 0.0906 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 4.65e-01 0.0745 0.102 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 5.82e-01 0.0565 0.102 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 6.98e-01 0.0425 0.109 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00693 0.0873 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 4.62e-01 0.0526 0.0713 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 2.98e-01 -0.101 0.0963 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 2.29e-01 -0.113 0.0936 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 3.97e-01 0.0877 0.103 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 1.73e-01 0.146 0.106 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0331 0.104 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 9.83e-04 0.318 0.0952 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0103 0.102 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 7.90e-01 0.0212 0.0797 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 3.88e-01 0.0755 0.0873 0.275 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0891 0.0932 0.275 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 6.61e-02 0.202 0.109 0.275 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 3.06e-01 -0.101 0.0985 0.275 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 4.03e-02 0.182 0.0882 0.275 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 1.51e-01 0.126 0.0875 0.275 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0244 0.0741 0.275 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -827126 sc-eQTL 2.86e-01 0.0893 0.0834 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 8.72e-02 -0.134 0.0779 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 2.05e-03 -0.285 0.0913 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 6.76e-01 0.0404 0.0964 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 1.35e-01 -0.156 0.104 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 9.53e-01 0.00591 0.1 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0638 0.0857 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0508 0.0903 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -827126 sc-eQTL 5.10e-01 0.0565 0.0855 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0707 0.0878 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 7.93e-01 0.0208 0.0789 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 4.56e-01 0.0643 0.0862 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 1.26e-01 -0.158 0.103 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 2.07e-01 0.0971 0.0768 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 9.81e-01 0.00196 0.0802 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 9.02e-01 0.00774 0.0624 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -827126 sc-eQTL 2.84e-01 0.105 0.0976 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 2.04e-01 -0.115 0.09 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0756 0.0994 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 1.35e-01 0.154 0.102 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0536 0.104 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 8.97e-01 0.0132 0.102 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 7.33e-01 -0.031 0.0908 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0224 0.0745 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -827126 sc-eQTL 5.43e-01 0.055 0.0902 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0143 0.0894 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 1.83e-01 -0.126 0.0942 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0272 0.0915 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 1.24e-01 0.155 0.101 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 7.06e-01 0.0302 0.0799 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 5.87e-02 -0.156 0.0819 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0759 0.0669 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 4.02e-01 0.0609 0.0724 0.27 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 4.04e-02 0.267 0.129 0.27 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0526 0.112 0.27 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 1.07e-01 0.191 0.118 0.27 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0545 0.117 0.27 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 8.08e-01 0.0295 0.121 0.27 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0501 0.106 0.27 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00266 0.0823 0.27 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 1.38e-01 0.0807 0.0542 0.27 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 6.63e-01 0.0432 0.0989 0.27 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 9.41e-01 0.00814 0.11 0.27 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0747 0.0839 0.27 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0405 0.084 0.27 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 3.95e-02 0.195 0.0941 0.27 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0715 0.0701 0.27 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0244 0.074 0.276 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0254 0.0883 0.276 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 1.63e-02 0.234 0.0969 0.276 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 1.12e-01 -0.157 0.0982 0.276 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 5.03e-02 0.156 0.0791 0.276 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 8.14e-02 -0.122 0.0696 0.276 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0531 0.0638 0.276 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 9.78e-01 0.00192 0.0709 0.271 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 1.14e-02 -0.253 0.099 0.271 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0858 0.0897 0.271 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 4.18e-01 0.0635 0.0783 0.271 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 5.25e-01 0.0443 0.0696 0.271 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0987 0.105 0.271 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 4.25e-01 0.0745 0.0932 0.271 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0434 0.0754 0.271 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0263 0.0649 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0723 0.0976 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 3.81e-02 -0.104 0.0499 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 7.58e-01 0.0254 0.082 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 7.75e-01 0.0222 0.0774 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 6.90e-01 0.0297 0.0744 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 2.44e-01 -0.106 0.0907 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 4.39e-01 0.0553 0.0714 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 4.77e-01 0.0753 0.106 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0322 0.0737 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 8.02e-02 0.154 0.0875 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 9.76e-01 0.00249 0.0838 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0186 0.0805 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0966 0.0903 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0194 0.112 0.273 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 7.99e-02 -0.194 0.11 0.273 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 9.14e-01 0.0141 0.131 0.273 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 2.12e-01 -0.163 0.13 0.273 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 7.10e-01 0.0453 0.122 0.273 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 6.84e-02 -0.196 0.107 0.273 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0797 0.103 0.273 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 7.55e-01 0.0299 0.096 0.276 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 5.50e-02 -0.192 0.0996 0.276 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 7.25e-02 -0.152 0.0843 0.276 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 1.95e-01 0.133 0.102 0.276 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 5.18e-01 0.0697 0.108 0.276 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 5.30e-01 0.0583 0.0928 0.276 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 8.73e-01 0.0143 0.0889 0.276 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0271 0.0928 0.269 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0858 0.0946 0.269 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 4.46e-01 0.0487 0.0638 0.269 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 5.89e-01 0.0554 0.102 0.269 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 6.92e-02 0.165 0.0904 0.269 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0728 0.0785 0.269 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 1.47e-01 -0.144 0.0987 0.269 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0742 0.068 0.282 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 3.02e-01 0.108 0.105 0.282 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 3.51e-01 0.0929 0.0993 0.282 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0601 0.0774 0.282 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 5.38e-02 -0.13 0.0668 0.282 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 2.90e-01 0.108 0.102 0.282 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 6.94e-01 0.0378 0.0961 0.282 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 1.15e-01 -0.102 0.0645 0.282 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00286 0.0692 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 6.63e-01 0.038 0.0872 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0345 0.0623 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 1.14e-01 0.143 0.09 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 7.43e-02 0.169 0.094 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 7.35e-01 0.0284 0.0837 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0721 0.0811 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0736 0.0856 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 2.89e-02 0.155 0.0704 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 4.79e-02 -0.144 0.0723 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 3.04e-01 -0.064 0.0621 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 354163 sc-eQTL 2.85e-01 0.0814 0.076 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0138 0.104 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 1.42e-01 0.0911 0.0618 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0446 0.0736 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 7.07e-01 0.033 0.0875 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 9.34e-01 0.00514 0.0624 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0178 0.0965 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0757 0.0469 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 2.00e-01 0.0987 0.0768 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 8.78e-01 0.0102 0.0663 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00434 0.069 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0773 0.0874 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0271 0.0837 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 5.24e-02 -0.182 0.0935 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00361 0.0558 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 2.74e-01 0.111 0.101 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 7.96e-02 0.152 0.0861 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0117 0.0824 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0731 0.099 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -827126 sc-eQTL 4.48e-01 0.0648 0.0852 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -991372 sc-eQTL 3.95e-01 -0.069 0.081 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 76704 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0378 0.0758 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 205583 sc-eQTL 5.91e-01 0.0447 0.083 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 326591 sc-eQTL 3.16e-01 -0.1 0.0998 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -989022 sc-eQTL 1.90e-01 0.0909 0.0691 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 857612 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0464 0.0756 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 77617 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0419 0.058 0.274 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136010 ALDH1L2 205264 eQTL 5.24e-06 0.135 0.0295 0.0 0.0 0.294
ENSG00000136044 APPL2 76704 pQTL 1.81e-06 -0.0529 0.011 0.0 0.0 0.295
ENSG00000136044 APPL2 76704 eQTL 0.000607 -0.0723 0.021 0.0 0.0 0.294
ENSG00000151131 C12orf45 326591 eQTL 0.00847 0.0481 0.0182 0.0 0.0 0.294
ENSG00000235162 C12orf75 77617 eQTL 9.78e-10 -0.12 0.0194 0.0 0.0 0.294


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136010 ALDH1L2 205264 1.27e-06 1.42e-06 3.48e-07 1.3e-06 2.69e-07 5.95e-07 1.57e-06 3.28e-07 1.32e-06 4.03e-07 1.67e-06 6.63e-07 2.53e-06 2.87e-07 5.01e-07 7.17e-07 8.94e-07 6.21e-07 8.34e-07 6.19e-07 3.99e-07 1.6e-06 8.66e-07 6.33e-07 2.25e-06 3.59e-07 7.6e-07 7.2e-07 1.28e-06 1.27e-06 6.78e-07 7.32e-08 2.57e-07 6.24e-07 5.38e-07 4.42e-07 7.26e-07 1.9e-07 4.94e-07 3.01e-07 2.99e-07 1.55e-06 6.65e-08 1.24e-08 1.89e-07 1.22e-07 1.9e-07 8.51e-08 9.51e-08
ENSG00000235162 C12orf75 77617 5.68e-06 9.04e-06 6.42e-07 3.75e-06 1.64e-06 1.61e-06 7.48e-06 9.98e-07 4.9e-06 2.91e-06 6.97e-06 2.86e-06 1.01e-05 2.19e-06 1.06e-06 3.83e-06 2.78e-06 3.83e-06 1.58e-06 1.51e-06 3.01e-06 5.46e-06 4.68e-06 1.87e-06 9.02e-06 1.96e-06 2.22e-06 1.53e-06 5e-06 7.18e-06 2.86e-06 5.25e-07 7.54e-07 2.16e-06 2e-06 1.16e-06 1.05e-06 5e-07 1.05e-06 6.18e-07 5.18e-07 7.76e-06 4.02e-07 1.74e-07 3.7e-07 1.13e-06 9.47e-07 5.21e-07 3.91e-07