Genes within 1Mb (chr12:105291552:TA:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0494 0.0744 0.201 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00633 0.0475 0.201 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0117 0.0757 0.201 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0701 0.0913 0.201 B L1
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 6.23e-01 0.0349 0.0708 0.201 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0377 0.0651 0.201 B L1
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 2.51e-01 0.119 0.103 0.201 B L1
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 9.22e-05 0.27 0.0678 0.201 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 7.22e-01 0.0247 0.0693 0.201 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 8.83e-02 0.163 0.0952 0.201 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0285 0.0636 0.201 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 7.66e-01 -0.016 0.0537 0.201 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0646 0.0838 0.201 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 8.88e-02 0.139 0.081 0.201 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 9.11e-02 -0.154 0.0905 0.201 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 5.45e-01 0.0499 0.0824 0.201 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 8.67e-01 0.00869 0.0518 0.201 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00372 0.0362 0.201 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 4.12e-01 0.0837 0.102 0.201 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0118 0.102 0.205 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 9.51e-03 0.213 0.0813 0.205 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 9.41e-01 0.00519 0.0701 0.205 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0842 0.0624 0.205 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0374 0.0877 0.205 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 3.44e-01 0.0397 0.0419 0.205 DC L1
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0535 0.0991 0.205 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 9.50e-01 0.00608 0.0959 0.201 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 1.34e-01 0.0707 0.0469 0.201 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0553 0.0827 0.201 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0663 0.0711 0.201 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 6.47e-01 0.0422 0.0919 0.201 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -848481 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00756 0.0908 0.2 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0725 0.0813 0.2 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0738 0.0848 0.2 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 1.33e-01 0.156 0.104 0.2 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 5.72e-01 0.0449 0.0793 0.2 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0881 0.0613 0.2 NK L1
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 9.09e-01 0.0122 0.106 0.2 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 2.63e-01 0.0965 0.0861 0.201 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 7.46e-01 0.0368 0.113 0.201 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0986 0.0795 0.201 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 2.52e-01 0.0961 0.0836 0.201 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 2.12e-01 0.0827 0.0661 0.201 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 8.47e-01 0.0195 0.101 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0588 0.114 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 6.96e-01 0.0423 0.108 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0343 0.0808 0.209 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 6.02e-02 -0.21 0.111 0.209 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 3.44e-01 0.103 0.109 0.209 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 3.23e-01 -0.108 0.109 0.209 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0189 0.109 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 4.94e-01 0.0666 0.0972 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 4.36e-02 -0.169 0.0833 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0454 0.0924 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0239 0.107 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00799 0.0875 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0293 0.0994 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 3.30e-01 0.098 0.1 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 4.05e-01 0.0831 0.0996 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0822 0.0822 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 7.97e-01 0.0249 0.0967 0.2 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0856 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0645 0.0953 0.2 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 9.07e-01 0.0099 0.0846 0.2 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 5.06e-02 0.205 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0982 0.0866 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 1.29e-01 0.118 0.0777 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 8.20e-01 0.0206 0.0903 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 3.04e-01 -0.115 0.112 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 8.64e-01 0.0151 0.0881 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0866 0.0998 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0151 0.11 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 1.55e-01 -0.13 0.0913 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0686 0.0828 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 6.87e-02 -0.158 0.0863 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0679 0.118 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 4.23e-01 0.068 0.0848 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0227 0.102 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0372 0.117 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 9.88e-01 0.0016 0.11 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 7.56e-02 -0.186 0.104 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00565 0.106 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 8.05e-01 0.0234 0.0944 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0153 0.0637 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 6.25e-01 0.0551 0.113 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 1.61e-04 0.274 0.0714 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 7.70e-01 0.0213 0.0727 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 9.98e-02 0.174 0.106 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0207 0.067 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0705 0.0945 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0604 0.0857 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 1.21e-02 0.216 0.0852 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0311 0.0891 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 2.91e-01 0.116 0.11 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0315 0.0815 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 5.42e-01 0.0443 0.0724 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0281 0.0977 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0714 0.0953 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0944 0.108 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 1.26e-01 0.16 0.104 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 4.60e-02 -0.186 0.0928 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 2.13e-01 -0.087 0.0697 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0965 0.104 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 9.00e-01 -0.011 0.0869 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 2.58e-01 -0.109 0.096 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 3.29e-01 0.111 0.113 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 8.17e-01 0.0194 0.084 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0357 0.0728 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 7.88e-01 0.0294 0.109 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 1.02e-02 0.226 0.0873 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 5.02e-02 -0.188 0.0953 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 5.83e-01 0.0568 0.103 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0912 0.0684 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 5.83e-01 0.0453 0.0824 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 8.97e-02 0.183 0.107 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0144 0.112 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 5.80e-01 0.0623 0.112 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 1.77e-01 -0.162 0.119 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 4.58e-01 0.0582 0.0783 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 3.36e-01 -0.102 0.106 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 2.93e-01 0.12 0.114 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 5.80e-01 -0.063 0.114 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 7.31e-01 0.0405 0.118 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 6.85e-01 0.0466 0.115 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 6.55e-01 0.0501 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 9.94e-02 0.144 0.087 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0714 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 4.44e-01 0.0774 0.101 0.201 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 7.38e-01 0.0398 0.119 0.201 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 8.74e-01 0.017 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 4.76e-01 0.0679 0.095 0.201 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 1.51e-01 0.115 0.0797 0.201 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0561 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -848481 sc-eQTL 9.69e-02 0.154 0.0921 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 2.28e-01 -0.125 0.103 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 7.41e-01 0.0353 0.107 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 7.12e-01 0.0428 0.116 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 1.74e-01 -0.129 0.0947 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 7.84e-01 0.0274 0.1 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 1.42e-01 -0.162 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -848481 sc-eQTL 9.57e-01 0.00497 0.0918 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0164 0.0847 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 3.28e-02 -0.197 0.0916 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 7.75e-02 0.196 0.11 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 6.60e-01 0.0378 0.086 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0863 0.0667 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 2.99e-01 0.114 0.11 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -848481 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0311 0.106 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0482 0.108 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 3.81e-01 0.0978 0.111 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 1.59e-01 0.158 0.112 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 3.06e-02 -0.212 0.0973 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 7.01e-01 0.0311 0.0808 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 8.85e-01 0.0158 0.109 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -848481 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0706 0.0977 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0278 0.102 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0606 0.099 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 9.29e-01 0.00977 0.11 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00414 0.0895 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0195 0.0727 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0441 0.109 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 3.62e-02 0.26 0.122 0.219 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0623 0.106 0.219 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0627 0.113 0.219 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0148 0.112 0.219 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 3.73e-01 0.0898 0.1 0.219 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 3.69e-01 0.0704 0.078 0.219 PB L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 4.99e-01 0.0828 0.122 0.219 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 2.09e-01 -0.128 0.102 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 8.58e-01 0.0204 0.114 0.2 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0416 0.0868 0.2 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 7.22e-02 0.176 0.0975 0.2 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0693 0.0724 0.2 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000368 0.11 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 3.78e-02 0.197 0.0942 0.201 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 4.62e-01 0.0778 0.106 0.201 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0772 0.106 0.201 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0197 0.0755 0.201 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 9.70e-01 0.00256 0.0688 0.201 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0325 0.109 0.201 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 8.79e-01 0.0172 0.112 0.202 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 3.70e-01 0.09 0.1 0.202 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 5.39e-01 0.0538 0.0874 0.202 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0521 0.0777 0.202 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 8.33e-01 0.0219 0.104 0.202 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 1.81e-01 0.113 0.0839 0.202 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 6.32e-01 -0.049 0.102 0.202 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 2.32e-01 0.125 0.104 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 1.82e-02 0.126 0.053 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 3.60e-01 0.0801 0.0874 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 8.20e-01 0.0181 0.0794 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0743 0.0969 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0811 0.113 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0302 0.0786 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0696 0.0938 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0745 0.0856 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0525 0.0964 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 3.44e-01 0.118 0.124 0.182 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 3.39e-01 -0.141 0.147 0.182 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0226 0.147 0.182 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 1.98e-01 -0.156 0.121 0.182 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 3.58e-01 0.107 0.116 0.182 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0542 0.142 0.182 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0441 0.108 0.198 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 3.26e-01 0.0895 0.0909 0.198 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 5.91e-01 0.0593 0.11 0.198 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 2.14e-01 -0.124 0.0993 0.198 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0723 0.0952 0.198 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 5.58e-01 -0.061 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 3.09e-01 0.0713 0.0699 0.195 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 3.19e-01 -0.112 0.112 0.195 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 6.17e-01 0.0431 0.0862 0.195 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 5.83e-01 0.0598 0.109 0.195 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 3.26e-02 -0.262 0.121 0.203 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 1.37e-02 0.285 0.114 0.203 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 3.75e-01 0.0808 0.0907 0.203 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 3.29e-01 0.0774 0.079 0.203 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 7.67e-02 0.199 0.112 0.203 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 5.85e-01 0.0417 0.0762 0.203 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 6.52e-01 0.0457 0.101 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 3.77e-01 0.0821 0.0926 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 3.38e-02 -0.14 0.0656 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 8.85e-01 -0.014 0.0963 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 3.20e-01 -0.1 0.1 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 7.04e-01 0.0329 0.0864 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 8.27e-01 0.0199 0.0912 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 1.45e-01 0.154 0.106 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 1.13e-01 -0.125 0.0789 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 4.00e-01 0.0569 0.0676 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 332808 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0266 0.0828 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 2.82e-01 -0.121 0.112 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 4.99e-01 0.0542 0.08 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0917 0.095 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.11 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 6.76e-01 0.0431 0.103 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 2.02e-01 0.0642 0.0502 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0117 0.0823 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0134 0.0737 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0679 0.0934 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 5.48e-01 -0.061 0.101 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 2.78e-02 0.131 0.0592 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 8.91e-01 -0.015 0.109 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 1.09e-01 -0.142 0.0879 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0334 0.106 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -848481 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00632 0.0913 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 55349 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0257 0.0812 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 184228 sc-eQTL 1.33e-01 -0.133 0.0884 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 305236 sc-eQTL 1.76e-01 0.145 0.107 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 836257 sc-eQTL 5.59e-01 0.0474 0.0809 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 56262 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0927 0.0618 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 987813 sc-eQTL 7.00e-01 0.0411 0.106 0.2 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 55349 pQTL 6.3e-39 0.152 0.0113 0.0016 0.00105 0.208
ENSG00000136044 APPL2 55349 eQTL 1.71e-05 0.101 0.0234 0.0 0.0 0.207
ENSG00000136051 WASHC4 184228 eQTL 0.00394 0.0348 0.012 0.0 0.0 0.207


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 55349 0.000124 0.000107 1.65e-05 3.21e-05 1.38e-05 3.66e-05 9.47e-05 9.25e-06 7.99e-05 3.56e-05 0.000111 4.27e-05 0.000136 3.48e-05 1.97e-05 6.55e-05 4.81e-05 4.84e-05 2.06e-05 1.54e-05 3.51e-05 0.000105 7.45e-05 2.8e-05 0.000131 2.55e-05 3.53e-05 3.07e-05 8.01e-05 4.28e-05 5.89e-05 5.59e-06 7.25e-06 1.69e-05 2.2e-05 1.16e-05 7.05e-06 6.91e-06 1.1e-05 7.02e-06 4.29e-06 9.8e-05 9.75e-06 9.04e-07 5.78e-06 1.14e-05 1.04e-05 5.15e-06 3.52e-06