logo

Genes within 1Mb (chr12:105239358:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0329 0.0868 0.147 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0211 0.0553 0.147 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 6.24e-02 -0.164 0.0875 0.147 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 5.47e-02 -0.204 0.106 0.147 B L1
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00479 0.0825 0.147 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 5.02e-01 -0.051 0.0759 0.147 B L1
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00358 0.121 0.147 B L1
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 3.38e-01 0.0788 0.0821 0.147 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0238 0.0811 0.147 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 1.48e-04 -0.419 0.108 0.147 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 1.30e-01 -0.112 0.074 0.147 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0721 0.0626 0.147 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 7.23e-01 0.0348 0.0982 0.147 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 6.27e-01 0.0451 0.0928 0.147 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 3.76e-02 -0.215 0.103 0.147 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 1.96e-02 -0.218 0.0926 0.147 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0871 0.0586 0.147 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0034 0.0412 0.147 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0456 0.116 0.147 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 9.00e-01 0.0146 0.116 0.153 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 2.96e-02 0.203 0.0927 0.153 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 5.17e-01 0.0516 0.0795 0.153 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 6.53e-01 0.032 0.0711 0.153 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 1.28e-01 0.151 0.099 0.153 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 8.90e-02 -0.0809 0.0474 0.153 DC L1
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 2.37e-01 0.133 0.112 0.153 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0225 0.111 0.147 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 2.60e-04 0.196 0.0529 0.147 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 1.03e-02 -0.244 0.0943 0.147 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 3.92e-01 0.0705 0.0822 0.147 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 9.55e-01 0.00603 0.106 0.147 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -900675 sc-eQTL 2.09e-01 -0.132 0.104 0.148 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 9.05e-01 0.0113 0.0939 0.148 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 7.33e-01 0.0334 0.0979 0.148 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 5.34e-02 -0.232 0.119 0.148 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 2.43e-01 0.107 0.0913 0.148 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 4.18e-01 0.0576 0.0709 0.148 NK L1
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 6.54e-01 0.0551 0.123 0.148 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 6.90e-01 0.0403 0.101 0.147 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0663 0.133 0.147 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0912 0.0932 0.147 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00336 0.0982 0.147 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 4.96e-01 0.0529 0.0776 0.147 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 5.55e-01 0.0698 0.118 0.147 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 7.63e-01 0.0403 0.134 0.148 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0239 0.127 0.148 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0537 0.0948 0.148 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 4.28e-01 0.104 0.131 0.148 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 9.00e-01 0.0162 0.128 0.148 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 1.14e-01 0.202 0.127 0.148 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 1.98e-01 0.164 0.127 0.148 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 1.83e-01 0.151 0.113 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 8.84e-01 0.0143 0.0982 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0855 0.108 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 2.09e-02 -0.287 0.123 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 1.51e-02 -0.246 0.101 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 2.88e-01 -0.123 0.116 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 3.40e-01 0.112 0.117 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0329 0.116 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0835 0.0958 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 1.60e-01 -0.158 0.112 0.149 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0755 0.13 0.149 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0245 0.111 0.149 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00276 0.0986 0.149 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 1.97e-01 0.158 0.122 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 8.77e-02 -0.171 0.0998 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0716 0.0902 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 2.31e-01 -0.125 0.104 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 5.35e-02 -0.25 0.129 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 2.61e-01 0.114 0.102 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 5.97e-02 -0.217 0.115 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0332 0.128 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 7.70e-01 0.0304 0.104 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0281 0.0938 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 7.53e-01 0.031 0.0984 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 4.53e-01 0.1 0.133 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0872 0.0959 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 1.33e-02 -0.283 0.113 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 2.76e-01 0.144 0.132 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0187 0.125 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 5.33e-01 0.075 0.12 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0592 0.121 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 6.66e-01 0.0467 0.108 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0627 0.0728 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0913 0.129 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 5.28e-01 0.0539 0.0852 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00422 0.0841 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 2.66e-04 -0.441 0.119 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 1.00e-01 -0.127 0.0769 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 2.72e-01 -0.12 0.109 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0343 0.0991 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 1.45e-01 0.147 0.101 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0201 0.104 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 4.91e-02 -0.252 0.127 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0659 0.0951 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00857 0.0846 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 4.22e-01 0.0916 0.114 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0204 0.112 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0629 0.126 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 2.62e-01 -0.137 0.122 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 1.10e-01 -0.175 0.109 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0485 0.0817 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 7.33e-01 0.0416 0.122 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 1.38e-01 0.149 0.0999 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 2.42e-01 -0.13 0.111 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 9.70e-01 0.00487 0.131 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00389 0.0971 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 1.49e-01 0.121 0.0838 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 4.72e-01 -0.091 0.126 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 7.28e-01 0.0352 0.101 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 2.19e-01 -0.134 0.109 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 5.99e-02 -0.22 0.117 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 4.29e-02 -0.157 0.0773 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 1.09e-01 -0.15 0.0932 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0028 0.123 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 4.19e-01 -0.104 0.128 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 9.11e-02 -0.217 0.128 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 2.01e-01 -0.176 0.137 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 2.63e-02 -0.198 0.0886 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00287 0.121 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 1.02e-02 -0.333 0.128 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 4.48e-01 -0.102 0.134 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 4.62e-01 -0.102 0.138 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 1.35e-01 -0.201 0.134 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 3.59e-01 0.121 0.131 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0901 0.103 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0909 0.132 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 7.16e-01 0.0417 0.115 0.147 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 3.38e-01 -0.129 0.135 0.147 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 1.92e-03 -0.372 0.118 0.147 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 1.54e-01 -0.154 0.107 0.147 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 8.29e-01 0.0196 0.0909 0.147 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 1.31e-01 0.194 0.128 0.147 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -900675 sc-eQTL 1.68e-02 -0.251 0.104 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 2.68e-01 0.131 0.118 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 1.05e-02 -0.309 0.12 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 3.38e-01 -0.126 0.132 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 5.07e-01 0.0719 0.108 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 3.14e-01 0.115 0.114 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 5.35e-01 0.0781 0.126 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -900675 sc-eQTL 2.07e-01 -0.134 0.106 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0514 0.0976 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 4.90e-01 0.0738 0.107 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 3.46e-01 -0.121 0.128 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 6.05e-01 0.0514 0.0991 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 9.03e-01 0.0094 0.0773 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0289 0.127 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -900675 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0377 0.123 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 3.66e-01 0.113 0.125 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 9.42e-01 0.00947 0.13 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 8.07e-01 0.032 0.131 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00213 0.115 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 6.32e-01 0.0451 0.0939 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 2.33e-01 0.151 0.126 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -900675 sc-eQTL 2.92e-01 -0.118 0.112 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 7.45e-01 0.0382 0.117 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 8.66e-01 0.0191 0.113 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 1.16e-01 -0.196 0.125 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 2.14e-01 0.127 0.102 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00245 0.0832 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 7.40e-01 0.0414 0.125 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 3.86e-01 -0.136 0.157 0.144 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 3.59e-02 -0.279 0.131 0.144 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0276 0.143 0.144 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0828 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 4.97e-01 0.0862 0.126 0.144 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 5.54e-02 0.188 0.0969 0.144 PB L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 1.24e-01 -0.236 0.152 0.144 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 8.11e-03 -0.325 0.121 0.15 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 3.62e-01 0.125 0.137 0.15 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 6.68e-01 0.0451 0.105 0.15 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 7.70e-01 0.0348 0.119 0.15 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 4.56e-01 0.0655 0.0876 0.15 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0619 0.133 0.15 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 7.06e-01 0.0416 0.11 0.147 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 4.14e-01 -0.1 0.122 0.147 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 2.68e-01 -0.137 0.123 0.147 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 7.76e-01 0.0249 0.0876 0.147 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 1.08e-01 -0.128 0.0793 0.147 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 6.35e-01 0.0604 0.127 0.147 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 8.90e-01 0.0171 0.124 0.154 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 7.71e-03 0.291 0.108 0.154 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 3.84e-01 0.0837 0.096 0.154 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 3.52e-02 0.179 0.0844 0.154 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 7.25e-03 0.305 0.112 0.154 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00658 0.0926 0.154 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 2.01e-01 0.143 0.112 0.154 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 7.51e-01 0.0383 0.12 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 2.75e-03 0.184 0.0608 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 1.25e-01 -0.155 0.101 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 1.61e-01 0.129 0.0913 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0856 0.112 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 8.25e-01 -0.029 0.131 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 5.22e-03 0.253 0.0896 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 3.54e-01 -0.101 0.109 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0673 0.0994 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0512 0.112 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 6.64e-01 0.0619 0.142 0.136 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 1.68e-01 0.231 0.167 0.136 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 3.63e-01 0.152 0.166 0.136 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 4.13e-01 0.113 0.138 0.136 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 2.11e-01 -0.165 0.132 0.136 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 3.79e-01 0.143 0.162 0.136 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0584 0.125 0.147 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 1.80e-01 0.141 0.105 0.147 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 3.25e-01 -0.126 0.127 0.147 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0864 0.115 0.147 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 3.83e-01 0.0964 0.11 0.147 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0824 0.113 0.154 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 7.21e-01 0.0273 0.0763 0.154 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 1.86e-01 -0.162 0.122 0.154 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 2.10e-01 0.118 0.0935 0.154 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 5.40e-01 0.0726 0.118 0.154 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 8.41e-01 0.0272 0.135 0.155 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0235 0.128 0.155 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 6.56e-01 0.0444 0.0996 0.155 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 1.84e-01 -0.115 0.0864 0.155 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 4.85e-01 0.0864 0.123 0.155 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0618 0.0835 0.155 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00392 0.111 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 2.63e-01 0.121 0.108 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0715 0.0775 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 9.39e-02 -0.188 0.112 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 9.25e-02 -0.198 0.117 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 4.49e-02 -0.202 0.1 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0678 0.107 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 3.48e-02 0.261 0.123 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 2.45e-01 -0.105 0.0902 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0233 0.0772 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 sc-eQTL 2.56e-01 -0.107 0.0942 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 3.11e-01 -0.13 0.128 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 7.92e-01 0.0241 0.0914 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 4.86e-03 -0.303 0.107 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0258 0.126 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 7.92e-01 0.0315 0.119 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 6.00e-04 0.198 0.0567 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 5.81e-02 -0.18 0.0944 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 2.50e-01 0.0981 0.085 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 3.07e-01 -0.11 0.108 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 3.19e-01 -0.115 0.115 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 2.75e-01 0.0747 0.0682 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 3.02e-02 -0.268 0.123 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 8.07e-01 0.0246 0.101 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 4.19e-01 0.0983 0.121 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -900675 sc-eQTL 2.97e-01 -0.11 0.105 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 3155 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0122 0.0936 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 132034 sc-eQTL 3.62e-01 0.0935 0.102 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 253042 sc-eQTL 8.06e-02 -0.215 0.123 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 784063 sc-eQTL 2.71e-01 0.103 0.0931 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 4068 sc-eQTL 6.08e-01 0.0368 0.0716 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 935619 sc-eQTL 6.32e-01 0.0589 0.123 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 3155 pQTL 4.21e-10 0.0906 0.0144 0.0 0.0 0.119
ENSG00000136044 APPL2 3155 eQTL 0.000607 0.0966 0.0281 0.0 0.0 0.117
ENSG00000136051 WASHC4 132034 eQTL 8.09e-07 0.0709 0.0143 0.0 0.0 0.117
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 eQTL 2.51e-18 0.463 0.052 0.0 0.0 0.117
ENSG00000151131 C12orf45 253042 eQTL 0.017 -0.0583 0.0244 0.0 0.0 0.117
ENSG00000171310 CHST11 784063 eQTL 0.00169 0.0693 0.022 0.0 0.0 0.117
ENSG00000279176 AC079316.2 687285 eQTL 0.00248 0.115 0.0379 0.00195 0.0 0.117

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 \N -900675 2.67e-07 1.3e-07 5.03e-08 1.81e-07 9.24e-08 9.91e-08 1.61e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 9.19e-08 1.52e-07 7.13e-08 6.25e-08 7.49e-08 4.17e-08 1.27e-07 5.97e-08 4.23e-08 1.21e-07 1.26e-07 1.44e-07 3.03e-08 1.5e-07 1.21e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.12e-07 1.02e-07 9.92e-08 3.26e-08 3.61e-08 8.25e-08 6.67e-08 3.49e-08 4.99e-08 9.25e-08 6.37e-08 3.87e-08 5.14e-08 1.33e-07 5.22e-08 1.11e-08 3.84e-08 1.86e-08 1.18e-07 3.79e-09 4.94e-08
ENSG00000136051 WASHC4 132034 4.65e-06 4.88e-06 6.91e-07 3.14e-06 1.62e-06 1.68e-06 4.48e-06 1.09e-06 5.13e-06 2.88e-06 5.68e-06 3.43e-06 7.12e-06 2.31e-06 1.23e-06 3.97e-06 1.9e-06 3.39e-06 1.48e-06 1.09e-06 2.88e-06 4.73e-06 4.21e-06 1.39e-06 6.72e-06 1.91e-06 2.25e-06 1.64e-06 4.48e-06 3.62e-06 2.83e-06 4.02e-07 6.32e-07 1.52e-06 2.22e-06 9.39e-07 9.46e-07 5.28e-07 1.06e-06 3.57e-07 4.51e-07 5.66e-06 5.08e-07 1.59e-07 6.11e-07 1.03e-06 1.11e-06 4.11e-07 3.74e-07
ENSG00000136052 SLC41A2 280614 1.3e-06 1.08e-06 2.74e-07 1.13e-06 3.5e-07 6.05e-07 1.55e-06 3.97e-07 1.51e-06 5.86e-07 2.03e-06 8.32e-07 2.41e-06 2.83e-07 4.89e-07 9.52e-07 9.2e-07 7.83e-07 8.34e-07 6.56e-07 8.13e-07 1.89e-06 9.11e-07 5.43e-07 2.25e-06 6.17e-07 1.02e-06 9.43e-07 1.46e-06 1.25e-06 7.64e-07 2.85e-07 1.89e-07 6.95e-07 5.21e-07 4.63e-07 6.41e-07 1.9e-07 4.18e-07 3.21e-07 2.87e-07 1.62e-06 2.9e-07 9.64e-08 3.24e-07 1.72e-07 2.43e-07 5.39e-08 1.36e-07
ENSG00000171310 CHST11 784063 2.91e-07 1.33e-07 6.04e-08 2.05e-07 9.8e-08 8.21e-08 1.81e-07 5.85e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.59e-07 1.15e-07 1.79e-07 7.95e-08 5.43e-08 7.89e-08 4.18e-08 1.51e-07 6.92e-08 4.92e-08 1.27e-07 1.42e-07 1.58e-07 2.83e-08 1.72e-07 1.22e-07 1.17e-07 1.06e-07 1.24e-07 9.49e-08 1.07e-07 3.59e-08 3.43e-08 8.72e-08 3.81e-08 3.05e-08 5.61e-08 8.71e-08 6.71e-08 4.55e-08 5.28e-08 1.46e-07 4.76e-08 1.18e-08 2.64e-08 1.65e-08 9.96e-08 1.9e-09 5.01e-08