logo

Genes within 1Mb (chr12:105204646:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 8.50e-02 -0.131 0.0755 0.237 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0284 0.0485 0.237 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 4.13e-01 0.0633 0.0771 0.237 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 3.19e-01 0.0931 0.0932 0.237 B L1
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0688 0.0722 0.237 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0561 0.0884 0.237 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 7.67e-01 0.0198 0.0665 0.237 B L1
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 1.33e-01 -0.159 0.105 0.237 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 2.25e-01 0.0867 0.0712 0.237 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 3.39e-02 0.149 0.0697 0.237 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0051 0.0974 0.237 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0537 0.0645 0.237 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 1.95e-01 -0.102 0.0784 0.237 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 2.40e-01 0.064 0.0544 0.237 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 8.23e-01 0.0191 0.0853 0.237 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0615 0.0811 0.237 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 1.03e-04 0.346 0.0875 0.237 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0546 0.0819 0.237 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0631 0.0513 0.237 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0208 0.0896 0.237 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 3.25e-01 0.0354 0.036 0.237 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 3.81e-01 0.089 0.101 0.237 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 1.59e-01 -0.145 0.103 0.236 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 1.01e-01 -0.136 0.0826 0.236 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0431 0.0705 0.236 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 9.69e-01 0.00246 0.0631 0.236 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00392 0.0882 0.236 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0395 0.0973 0.236 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 1.36e-01 -0.063 0.042 0.236 DC L1
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0625 0.0996 0.236 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 2.44e-01 -0.115 0.0985 0.237 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 5.99e-04 -0.165 0.0473 0.237 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 8.34e-01 0.0179 0.0853 0.237 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 8.04e-01 0.0182 0.0733 0.237 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 9.65e-01 0.00365 0.0842 0.237 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 2.13e-01 -0.118 0.0943 0.237 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -935387 sc-eQTL 5.42e-01 0.0574 0.094 0.236 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0462 0.0842 0.236 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 1.88e-01 0.116 0.0876 0.236 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 3.69e-02 -0.225 0.107 0.236 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 1.74e-01 -0.112 0.0818 0.236 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00322 0.0997 0.236 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 3.45e-01 0.0602 0.0636 0.236 NK L1
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 3.97e-01 0.0932 0.11 0.236 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 1.53e-02 -0.211 0.0863 0.237 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0319 0.115 0.237 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0968 0.0806 0.237 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 8.98e-01 0.0109 0.085 0.237 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 2.11e-01 -0.105 0.0837 0.237 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 7.84e-01 0.0185 0.0673 0.237 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 3.31e-01 0.0997 0.102 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0287 0.12 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0493 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 9.50e-01 0.0053 0.0849 0.23 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 7.36e-01 0.0398 0.118 0.23 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0329 0.115 0.23 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 4.32e-01 0.0954 0.121 0.23 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 8.92e-01 0.0155 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 2.08e-01 -0.144 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 8.87e-01 -0.014 0.0987 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0398 0.0853 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 7.51e-02 0.166 0.093 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 8.86e-03 0.282 0.107 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0278 0.0887 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 3.61e-01 -0.1 0.109 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0466 0.101 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 2.83e-02 -0.223 0.101 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 3.09e-01 0.105 0.103 0.239 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 2.01e-01 0.109 0.0852 0.239 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 5.04e-01 0.0671 0.1 0.239 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 8.11e-02 0.202 0.115 0.239 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 1.72e-01 -0.135 0.0985 0.239 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0529 0.106 0.239 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0264 0.0878 0.239 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 7.48e-02 -0.194 0.109 0.239 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0564 0.0873 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 8.02e-01 0.0197 0.0786 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 9.37e-01 0.00718 0.0909 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 2.90e-01 -0.12 0.113 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0575 0.0886 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0991 0.11 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 4.26e-02 0.203 0.0996 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 8.45e-01 0.0217 0.111 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 1.15e-01 -0.147 0.0928 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0381 0.0843 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0433 0.0885 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0371 0.12 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0425 0.0863 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 1.91e-01 -0.145 0.11 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 2.24e-01 0.126 0.103 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 8.53e-01 0.0221 0.119 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 4.26e-01 0.0861 0.108 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 4.05e-02 0.212 0.103 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 3.97e-01 0.0884 0.104 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000733 0.0932 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0356 0.112 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 2.38e-01 0.0741 0.0627 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 5.31e-02 0.214 0.11 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 8.39e-01 0.0151 0.0741 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000603 0.073 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0179 0.107 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 9.96e-01 0.000368 0.0672 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 4.70e-02 -0.171 0.0858 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 6.54e-01 0.0426 0.0949 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 7.68e-01 0.0254 0.0861 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 1.20e-01 0.136 0.0874 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 3.41e-03 0.263 0.0887 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 6.87e-01 -0.045 0.112 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0389 0.0827 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0827 0.096 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 1.36e-03 0.233 0.0718 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 8.16e-01 0.0231 0.0992 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 2.04e-01 0.124 0.0972 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 6.36e-01 0.0522 0.11 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 5.31e-01 0.0671 0.107 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 8.35e-01 0.02 0.0958 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 7.59e-02 -0.18 0.101 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 4.13e-02 0.146 0.0709 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 9.06e-01 0.0127 0.107 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0389 0.0877 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 1.28e-01 0.148 0.0966 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 1.52e-01 -0.164 0.114 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 5.95e-02 -0.159 0.0841 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00984 0.109 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 5.37e-01 0.0454 0.0735 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 1.42e-01 0.162 0.11 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0439 0.0869 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 5.99e-04 0.319 0.0916 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 7.81e-01 0.0282 0.101 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 3.54e-01 0.0623 0.0671 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0214 0.105 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0443 0.0807 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 9.05e-01 0.0127 0.106 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0362 0.108 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 2.82e-02 0.238 0.107 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 9.94e-01 0.000812 0.116 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0423 0.0757 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 4.74e-01 0.0804 0.112 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 3.75e-01 0.0909 0.102 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 7.48e-01 0.0355 0.11 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 7.58e-01 0.0348 0.112 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 1.91e-01 0.152 0.116 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 1.38e-01 -0.168 0.113 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0178 0.111 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00916 0.111 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0179 0.0867 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0164 0.111 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 2.61e-01 -0.116 0.103 0.238 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 6.52e-01 0.0547 0.121 0.238 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0681 0.109 0.238 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 1.88e-01 0.128 0.0967 0.238 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00723 0.113 0.238 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0319 0.0817 0.238 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 2.91e-02 0.252 0.114 0.238 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -935387 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0249 0.0921 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0112 0.103 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 2.42e-01 0.124 0.106 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 4.42e-02 -0.231 0.114 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 8.66e-01 0.016 0.0945 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 3.18e-01 -0.111 0.111 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0445 0.0995 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 1.09e-01 0.176 0.109 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -935387 sc-eQTL 5.01e-01 0.0635 0.0943 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 8.36e-01 0.018 0.087 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 4.84e-02 0.187 0.0943 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 1.09e-01 -0.183 0.114 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0267 0.0884 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0333 0.0997 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 6.96e-02 0.125 0.0683 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 6.08e-01 0.0581 0.113 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -935387 sc-eQTL 4.19e-01 0.0855 0.106 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 3.51e-01 -0.1 0.107 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 1.00e-02 0.284 0.109 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 2.99e-01 -0.116 0.112 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00152 0.0981 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 3.78e-01 -0.106 0.12 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 4.81e-01 0.0568 0.0804 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 7.28e-01 0.0379 0.109 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -935387 sc-eQTL 9.00e-01 0.0125 0.0994 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 3.88e-02 -0.214 0.103 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 2.77e-01 -0.109 0.1 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0976 0.111 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 4.57e-02 -0.181 0.0901 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 7.02e-01 0.0404 0.105 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 5.54e-01 0.0438 0.0739 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0516 0.111 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 6.63e-02 0.275 0.148 0.226 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 3.14e-01 -0.129 0.127 0.226 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 3.96e-01 0.116 0.136 0.226 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 1.44e-01 -0.196 0.133 0.226 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0457 0.121 0.226 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 5.98e-01 0.0643 0.122 0.226 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 5.90e-01 0.0509 0.0941 0.226 PB L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 8.44e-01 -0.029 0.147 0.226 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00398 0.108 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 2.26e-01 -0.145 0.12 0.237 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 1.63e-01 -0.128 0.0915 0.237 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00944 0.104 0.237 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 6.53e-03 -0.241 0.0876 0.237 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 1.28e-01 0.117 0.0764 0.237 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0709 0.116 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0705 0.0958 0.237 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 1.85e-04 0.393 0.103 0.237 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0289 0.107 0.237 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 4.68e-02 -0.151 0.0755 0.237 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 4.18e-01 0.0887 0.109 0.237 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 2.86e-01 0.0741 0.0692 0.237 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 2.87e-01 0.117 0.11 0.237 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 1.14e-02 -0.274 0.107 0.237 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 2.06e-02 -0.224 0.096 0.237 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 9.91e-01 0.00101 0.085 0.237 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 1.77e-01 0.102 0.0751 0.237 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 5.15e-01 -0.066 0.101 0.237 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 3.32e-01 -0.104 0.107 0.237 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 5.91e-01 -0.044 0.0817 0.237 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0289 0.0991 0.237 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 2.51e-01 -0.123 0.107 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 2.17e-06 -0.256 0.0524 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 1.62e-01 -0.126 0.0897 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0211 0.0817 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 4.29e-01 0.0718 0.0906 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0187 0.0999 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0172 0.116 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0813 0.0805 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 6.83e-02 0.175 0.0956 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 8.13e-01 0.0209 0.088 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 8.97e-01 -0.013 0.1 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 7.77e-02 -0.174 0.0983 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 2.16e-02 -0.267 0.115 0.252 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 8.45e-01 -0.027 0.138 0.252 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 9.41e-02 -0.229 0.136 0.252 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 1.37e-01 -0.169 0.113 0.252 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0497 0.135 0.252 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 6.89e-01 0.0437 0.109 0.252 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 7.06e-01 0.0504 0.133 0.252 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0364 0.111 0.238 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0566 0.0938 0.238 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0819 0.114 0.238 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 3.40e-01 0.0981 0.102 0.238 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0347 0.111 0.238 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 7.21e-01 0.0352 0.0982 0.238 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 2.04e-01 -0.13 0.102 0.235 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0347 0.0691 0.235 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 5.55e-01 0.0655 0.111 0.235 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 2.22e-03 -0.258 0.0832 0.235 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0232 0.105 0.235 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0527 0.107 0.235 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 6.20e-01 0.0569 0.114 0.243 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 1.79e-01 -0.146 0.108 0.243 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 5.96e-02 -0.159 0.0837 0.243 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0936 0.0734 0.243 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0307 0.105 0.243 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 4.45e-01 0.0877 0.115 0.243 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0393 0.071 0.243 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 7.94e-01 0.0246 0.094 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 8.36e-01 0.0196 0.0942 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00035 0.0674 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 1.85e-01 0.129 0.0974 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 5.06e-04 0.351 0.0994 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 8.75e-02 -0.15 0.0871 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0993 0.0998 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0182 0.0926 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 5.04e-03 -0.3 0.106 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0967 0.0799 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0359 0.0684 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 245902 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0357 0.0837 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0609 0.114 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0706 0.0808 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0852 0.108 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 1.31e-02 0.238 0.0949 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 8.83e-01 0.0165 0.112 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0982 0.106 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 5.53e-05 -0.205 0.0497 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 8.80e-01 0.0128 0.0844 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0252 0.0756 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 8.38e-01 0.0176 0.086 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0646 0.0959 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 1.77e-01 -0.14 0.104 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0559 0.0615 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0446 0.112 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0864 0.0907 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0129 0.102 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0436 0.109 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -935387 sc-eQTL 4.88e-01 0.0655 0.0944 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -31557 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0771 0.0838 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 97322 sc-eQTL 1.76e-01 0.124 0.0915 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 218330 sc-eQTL 1.65e-01 -0.153 0.11 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 749351 sc-eQTL 1.49e-01 -0.121 0.0833 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 988867 sc-eQTL 9.89e-01 0.00137 0.101 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 sc-eQTL 2.56e-01 0.073 0.0641 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 900907 sc-eQTL 8.00e-01 0.028 0.11 0.235 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136010 ALDH1L2 97003 eQTL 1.09e-05 0.139 0.0314 0.0 0.0 0.241
ENSG00000136044 APPL2 -31557 pQTL 2.91e-12 -0.0815 0.0116 0.0 0.0 0.242
ENSG00000136044 APPL2 -31557 eQTL 2.29e-05 -0.0946 0.0222 0.0 0.0 0.241
ENSG00000136051 WASHC4 97322 eQTL 0.000123 -0.044 0.0114 0.0 0.0 0.241
ENSG00000151131 C12orf45 218330 eQTL 0.00628 0.053 0.0194 0.0 0.0 0.241
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 eQTL 4.74e-10 -0.13 0.0206 0.00742 0.00704 0.241

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136010 ALDH1L2 97003 7.6e-06 1.08e-05 1.63e-06 7.73e-06 2.54e-06 4.17e-06 1.15e-05 2.14e-06 1.05e-05 5.52e-06 1.35e-05 5.89e-06 1.45e-05 3.53e-06 2.83e-06 6.75e-06 4.52e-06 7.74e-06 2.72e-06 2.84e-06 5.35e-06 1.04e-05 8e-06 3.47e-06 1.78e-05 3.74e-06 5.79e-06 4.09e-06 1.02e-05 8.14e-06 6.63e-06 1.08e-06 1.14e-06 3.37e-06 5.46e-06 2.79e-06 1.73e-06 2e-06 2.16e-06 1.26e-06 1.19e-06 1.29e-05 1.49e-06 3.6e-07 9.19e-07 1.74e-06 1.74e-06 8.24e-07 4.78e-07
ENSG00000136051 WASHC4 97322 7.6e-06 1.08e-05 1.59e-06 7.73e-06 2.52e-06 4.17e-06 1.15e-05 2.14e-06 1.05e-05 5.58e-06 1.35e-05 5.9e-06 1.45e-05 3.53e-06 2.83e-06 6.73e-06 4.52e-06 7.74e-06 2.69e-06 2.84e-06 5.26e-06 1.04e-05 7.98e-06 3.4e-06 1.77e-05 3.68e-06 5.62e-06 4.06e-06 1.02e-05 8.14e-06 6.68e-06 1.08e-06 1.1e-06 3.37e-06 5.46e-06 2.69e-06 1.75e-06 1.99e-06 2.16e-06 1.26e-06 1.19e-06 1.29e-05 1.49e-06 3.6e-07 9.19e-07 1.74e-06 1.76e-06 7.99e-07 4.79e-07
ENSG00000198431 \N 988867 2.66e-07 1.11e-07 3.88e-08 1.84e-07 8.83e-08 9.57e-08 1.41e-07 5.19e-08 1.41e-07 4.4e-08 1.59e-07 7.78e-08 1.26e-07 6.21e-08 6.17e-08 7.17e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.82e-08 4.04e-08 1.05e-07 1.26e-07 1.26e-07 4.16e-08 1.33e-07 1.15e-07 1.11e-07 9.32e-08 9.88e-08 1.1e-07 9.73e-08 2.9e-08 3.16e-08 8.55e-08 8.38e-08 3.77e-08 4.95e-08 9.23e-08 6.54e-08 3.77e-08 5.28e-08 1.35e-07 3.99e-08 1.49e-08 6.38e-08 1.83e-08 1.19e-07 3.81e-09 4.79e-08
ENSG00000235162 C12orf75 -30644 1.72e-05 2.45e-05 5.89e-06 1.39e-05 4.86e-06 1.19e-05 3.58e-05 4.74e-06 2.72e-05 1.47e-05 3.34e-05 1.48e-05 3.92e-05 1e-05 5.66e-06 1.49e-05 1.27e-05 2.19e-05 6.64e-06 6.6e-06 1.24e-05 2.73e-05 2.52e-05 8.66e-06 3.83e-05 6.66e-06 1.14e-05 1.08e-05 2.76e-05 2.19e-05 1.69e-05 1.61e-06 2e-06 6.67e-06 1.11e-05 5.31e-06 2.62e-06 3.11e-06 4.1e-06 3.3e-06 1.75e-06 2.84e-05 2.72e-06 4.23e-07 2.43e-06 3.23e-06 3.79e-06 1.53e-06 1.53e-06