logo

Genes within 1Mb (chr12:105180772:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 1.42e-01 -0.108 0.0735 0.22 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0126 0.0471 0.22 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 1.99e-01 0.0963 0.0747 0.22 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0802 0.0905 0.22 B L1
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 5.81e-01 0.0388 0.0701 0.22 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 9.36e-01 0.00693 0.0858 0.22 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00433 0.0646 0.22 B L1
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 3.63e-02 0.214 0.102 0.22 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 1.16e-03 0.226 0.0685 0.22 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 6.90e-01 0.0276 0.0692 0.22 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 1.03e-01 0.156 0.0951 0.22 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0288 0.0635 0.22 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 3.65e-01 0.07 0.0772 0.22 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0218 0.0536 0.22 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0504 0.0837 0.22 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 2.17e-01 0.0999 0.0807 0.22 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 1.19e-02 -0.226 0.0891 0.22 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 4.27e-01 0.065 0.0817 0.22 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 7.34e-01 0.0175 0.0514 0.22 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 5.41e-01 0.0547 0.0894 0.22 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0121 0.036 0.22 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 8.04e-01 0.0251 0.101 0.22 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0565 0.102 0.223 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 1.48e-01 0.119 0.0819 0.223 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 8.63e-01 0.012 0.0698 0.223 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0429 0.0624 0.223 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00361 0.0874 0.223 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 5.02e-01 0.0647 0.0962 0.223 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 1.51e-01 0.0601 0.0416 0.223 DC L1
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00557 0.0988 0.223 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 8.57e-01 0.0172 0.0953 0.22 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 1.55e-01 0.0665 0.0466 0.22 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0675 0.0822 0.22 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000395 0.0707 0.22 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0435 0.0812 0.22 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00245 0.0913 0.22 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -959261 sc-eQTL 5.32e-01 0.0565 0.0904 0.219 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0712 0.0809 0.219 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0322 0.0846 0.219 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 8.85e-02 0.177 0.103 0.219 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 7.71e-01 0.023 0.079 0.219 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0518 0.0958 0.219 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0763 0.0611 0.219 NK L1
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 2.89e-01 -0.112 0.106 0.219 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 3.66e-01 0.0776 0.0856 0.22 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 3.52e-01 0.105 0.112 0.22 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0717 0.0792 0.22 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 1.48e-01 0.121 0.083 0.22 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 7.01e-01 0.0317 0.0824 0.22 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 3.53e-01 0.0612 0.0658 0.22 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 7.47e-01 0.0324 0.1 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0325 0.115 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 2.15e-01 0.136 0.109 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 7.70e-01 -0.024 0.082 0.227 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 2.94e-01 -0.12 0.114 0.227 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 8.93e-02 0.188 0.11 0.227 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 7.00e-02 -0.212 0.116 0.227 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 1.90e-02 -0.258 0.109 0.227 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 3.48e-01 0.104 0.11 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 6.28e-01 0.047 0.0969 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 7.32e-02 -0.15 0.0832 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0225 0.0921 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0519 0.106 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 8.02e-01 0.0219 0.0872 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 3.12e-01 0.109 0.107 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0413 0.0991 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 5.16e-01 0.0652 0.1 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 4.34e-01 0.0775 0.0988 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0355 0.0817 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 5.06e-01 0.0638 0.0958 0.22 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 2.33e-01 -0.132 0.11 0.22 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0477 0.0946 0.22 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 1.70e-01 -0.139 0.101 0.22 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 8.32e-01 0.0178 0.084 0.22 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 1.77e-02 0.247 0.103 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 1.68e-02 -0.204 0.0848 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 6.95e-02 0.14 0.0767 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 1.03e-01 0.145 0.0889 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0628 0.111 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00658 0.0872 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0196 0.108 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0958 0.0987 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 3.56e-01 0.101 0.109 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 2.76e-01 -0.101 0.092 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0787 0.0832 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0594 0.0875 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 1.66e-01 -0.164 0.118 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 3.91e-01 0.0733 0.0853 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 2.76e-01 0.119 0.109 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 8.90e-01 0.0142 0.102 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0221 0.118 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 7.70e-01 0.0329 0.113 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 2.25e-01 -0.131 0.107 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 4.62e-01 -0.08 0.108 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0241 0.097 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0383 0.116 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 8.65e-01 0.0111 0.0655 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 7.76e-01 0.0329 0.116 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 3.80e-04 0.259 0.0718 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 7.05e-01 0.0276 0.0728 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 7.05e-02 0.192 0.106 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00743 0.0671 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 8.51e-02 0.148 0.0858 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0806 0.0946 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0487 0.0859 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 1.23e-01 0.132 0.0854 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 1.73e-01 -0.121 0.0881 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 2.61e-01 0.123 0.109 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0694 0.0808 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 3.55e-01 0.087 0.0939 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0189 0.072 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 9.16e-01 0.0103 0.097 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 2.64e-01 -0.106 0.095 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 6.44e-01 0.0499 0.108 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 1.88e-01 0.137 0.104 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 1.67e-01 -0.129 0.0932 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 9.96e-01 0.00047 0.0991 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 1.18e-01 -0.109 0.0695 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 2.13e-01 -0.13 0.104 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0503 0.0867 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 1.08e-01 -0.154 0.0956 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 3.21e-01 0.113 0.113 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 5.97e-01 0.0444 0.0839 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 2.93e-01 0.114 0.108 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0274 0.0727 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0195 0.109 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 4.77e-02 0.175 0.0879 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 2.84e-03 -0.284 0.0941 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 4.14e-01 0.0845 0.103 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0259 0.0686 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00289 0.107 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 5.42e-01 0.0503 0.0824 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 4.02e-01 0.0905 0.108 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0385 0.111 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0841 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 1.12e-01 -0.189 0.118 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 5.59e-01 0.0456 0.0778 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0379 0.115 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 9.50e-02 -0.175 0.105 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 1.17e-01 0.177 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0356 0.114 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0211 0.118 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0153 0.115 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 5.16e-01 0.0729 0.112 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 1.82e-01 -0.15 0.112 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 1.52e-01 0.126 0.0873 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000963 0.113 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 4.52e-01 0.0769 0.102 0.221 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 3.73e-01 0.107 0.12 0.221 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 7.92e-01 0.0286 0.108 0.221 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 2.21e-01 0.118 0.0958 0.221 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 5.49e-01 0.067 0.112 0.221 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 3.09e-01 0.0824 0.0807 0.221 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 3.52e-01 -0.107 0.114 0.221 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -959261 sc-eQTL 1.38e-01 0.137 0.0924 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 9.35e-02 -0.174 0.103 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 4.12e-01 0.0879 0.107 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 6.56e-01 0.0518 0.116 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 2.30e-01 -0.114 0.095 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 1.36e-01 -0.167 0.111 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 7.00e-01 0.0387 0.1 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 6.34e-03 -0.3 0.109 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -959261 sc-eQTL 4.38e-01 0.0712 0.0917 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0319 0.0847 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 6.16e-02 -0.173 0.0918 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 1.35e-01 0.166 0.111 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 8.42e-01 0.0172 0.086 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 6.32e-01 0.0465 0.097 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 3.17e-01 -0.067 0.0668 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 8.48e-01 0.0212 0.11 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -959261 sc-eQTL 7.37e-01 0.0353 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 8.92e-01 0.0144 0.107 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 4.85e-01 0.077 0.11 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 3.13e-01 0.112 0.111 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 2.61e-01 -0.109 0.0969 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 8.34e-01 0.025 0.119 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 8.85e-01 0.0115 0.0798 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 2.16e-01 -0.133 0.107 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -959261 sc-eQTL 8.08e-01 0.0237 0.0976 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0271 0.102 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 8.10e-01 0.0238 0.0989 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 2.32e-01 0.131 0.109 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0139 0.0893 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 6.36e-01 -0.049 0.103 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 9.03e-01 0.00884 0.0726 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0583 0.109 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 5.93e-02 0.232 0.122 0.226 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0744 0.105 0.226 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 1.91e-01 -0.146 0.111 0.226 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000449 0.111 0.226 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 2.69e-01 0.11 0.0991 0.226 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0227 0.1 0.226 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 7.46e-01 0.0252 0.0775 0.226 PB L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 1.37e-01 0.18 0.12 0.226 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0457 0.102 0.22 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 4.12e-01 0.0929 0.113 0.22 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0413 0.0865 0.22 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 4.29e-02 0.197 0.0968 0.22 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 2.34e-01 -0.1 0.0837 0.22 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0895 0.072 0.22 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 4.57e-01 0.0813 0.109 0.22 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 2.40e-01 0.112 0.0949 0.22 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 8.98e-01 0.0136 0.106 0.22 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 7.36e-02 -0.19 0.106 0.22 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0123 0.0756 0.22 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 1.98e-01 -0.14 0.108 0.22 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 8.34e-01 0.0145 0.0689 0.22 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 2.05e-01 -0.139 0.109 0.22 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 7.25e-01 0.0386 0.11 0.224 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 7.20e-01 0.0351 0.0978 0.224 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 5.38e-01 0.0526 0.0853 0.224 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0191 0.0758 0.224 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 7.16e-01 0.037 0.102 0.224 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 5.64e-01 0.0622 0.108 0.224 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0166 0.0821 0.224 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0425 0.0995 0.224 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 2.35e-01 0.122 0.103 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 6.15e-02 0.0989 0.0526 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 4.20e-01 0.0697 0.0862 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 5.47e-01 0.0472 0.0783 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0736 0.0869 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 1.97e-01 -0.123 0.0954 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0879 0.111 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0315 0.0775 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 1.09e-01 -0.148 0.0921 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0479 0.0845 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 6.96e-01 0.0376 0.0962 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 5.86e-01 0.0518 0.0951 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 6.62e-01 0.0551 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 3.01e-01 -0.154 0.148 0.209 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 5.60e-01 0.0862 0.148 0.209 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 2.74e-01 -0.134 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 1.37e-01 0.215 0.144 0.209 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 7.54e-01 0.0368 0.117 0.209 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0761 0.143 0.209 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0126 0.106 0.22 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 9.77e-01 0.00261 0.0893 0.22 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 2.05e-01 0.137 0.108 0.22 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 7.59e-02 -0.173 0.0969 0.22 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 6.60e-01 0.0463 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 2.50e-01 -0.107 0.0931 0.22 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 3.23e-01 -0.102 0.103 0.215 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 8.11e-01 0.0166 0.0696 0.215 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 2.95e-01 -0.117 0.111 0.215 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 7.72e-02 0.151 0.085 0.215 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 2.89e-01 0.112 0.106 0.215 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0844 0.108 0.215 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 1.16e-02 -0.302 0.118 0.22 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 5.86e-02 0.215 0.113 0.22 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 1.08e-01 0.143 0.0884 0.22 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 5.60e-01 0.0454 0.0776 0.22 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 4.63e-02 0.219 0.109 0.22 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 1.35e-02 0.296 0.118 0.22 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 2.40e-01 0.0879 0.0745 0.22 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 7.71e-01 0.0289 0.0991 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 5.22e-01 0.0595 0.0927 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0802 0.0661 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 7.81e-01 0.0268 0.0963 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 1.53e-01 -0.144 0.1 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 3.36e-01 0.0832 0.0862 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0386 0.0984 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 8.09e-01 0.0221 0.0912 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 1.53e-01 0.151 0.106 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 1.07e-02 -0.201 0.0781 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 3.94e-01 0.0577 0.0675 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 222028 sc-eQTL 1.82e-01 0.11 0.0825 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 2.94e-01 -0.118 0.112 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 5.86e-01 0.0437 0.08 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 7.87e-01 0.0289 0.107 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0689 0.0951 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 3.39e-01 0.106 0.11 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 7.46e-01 0.0331 0.102 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 2.06e-01 0.063 0.0497 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0465 0.0814 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 8.82e-01 0.0108 0.0729 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0257 0.0829 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0439 0.0925 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0664 0.101 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 3.12e-01 0.0606 0.0598 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 7.69e-01 0.032 0.109 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0775 0.0884 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 5.92e-01 0.0536 0.0997 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 1.92e-01 -0.139 0.106 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -959261 sc-eQTL 5.04e-01 0.0609 0.091 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -55431 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0145 0.081 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 73448 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0791 0.0884 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 194456 sc-eQTL 1.26e-01 0.163 0.106 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 725477 sc-eQTL 6.86e-01 0.0326 0.0807 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 964993 sc-eQTL 9.62e-01 0.00468 0.097 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -54518 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0813 0.0617 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 877033 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0648 0.106 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 -55431 pQTL 4.11e-34 0.139 0.0111 0.0 0.0 0.22
ENSG00000136044 APPL2 -55431 eQTL 0.000321 0.0806 0.0223 0.0 0.0 0.224
ENSG00000136051 WASHC4 73448 eQTL 3.07e-07 0.0585 0.0114 0.0 0.0 0.224

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136051 WASHC4 73448 1.07e-05 1.18e-05 1.82e-06 6.74e-06 2.43e-06 5.21e-06 1.23e-05 2.14e-06 1.01e-05 5.31e-06 1.38e-05 6.24e-06 1.59e-05 3.66e-06 3.46e-06 6.67e-06 4.79e-06 9.67e-06 2.93e-06 3.06e-06 5.71e-06 9.58e-06 9.75e-06 3.39e-06 1.61e-05 4.35e-06 6.28e-06 4.64e-06 1.21e-05 8.58e-06 6.28e-06 1.02e-06 1.17e-06 3.54e-06 4.83e-06 2.81e-06 1.67e-06 1.93e-06 2.19e-06 1.01e-06 1.01e-06 1.3e-05 1.49e-06 2.07e-07 7.9e-07 1.76e-06 1.74e-06 7.25e-07 4.51e-07
ENSG00000198431 \N 964993 3.92e-07 2.3e-07 6.86e-08 2.36e-07 9.94e-08 1.08e-07 3.11e-07 6.2e-08 1.98e-07 9.72e-08 2.18e-07 1.57e-07 2.94e-07 8.66e-08 7.79e-08 9.35e-08 5.42e-08 2.43e-07 7.11e-08 6.73e-08 1.23e-07 1.89e-07 1.73e-07 4.07e-08 2.74e-07 1.65e-07 1.37e-07 1.28e-07 1.34e-07 1.46e-07 1.35e-07 3.59e-08 3.74e-08 9.58e-08 6.25e-08 3.24e-08 4.28e-08 7.61e-08 6.45e-08 5.35e-08 5.71e-08 1.59e-07 3.59e-08 1.11e-08 3.3e-08 9.44e-09 7.12e-08 2e-09 4.82e-08