logo

Genes within 1Mb (chr12:105168576:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 5.18e-01 0.0735 0.114 0.09 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 6.13e-02 0.135 0.0719 0.09 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 7.82e-02 -0.203 0.115 0.09 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 4.11e-01 -0.115 0.139 0.09 B L1
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0338 0.108 0.09 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 4.88e-01 0.0917 0.132 0.09 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 3.42e-01 0.0945 0.0993 0.09 B L1
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 2.39e-01 0.186 0.158 0.09 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 3.69e-02 -0.22 0.105 0.09 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0363 0.104 0.09 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 8.46e-01 -0.028 0.144 0.09 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0912 0.0955 0.09 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 4.81e-01 0.0822 0.116 0.09 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 2.41e-01 0.0947 0.0805 0.09 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 4.88e-01 0.0876 0.126 0.09 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 2.31e-01 -0.145 0.12 0.09 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0194 0.135 0.09 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 5.80e-01 0.0676 0.122 0.09 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0323 0.0767 0.09 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 1.30e-01 0.202 0.133 0.09 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 2.32e-01 0.0641 0.0535 0.09 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0878 0.151 0.09 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 1.41e-01 0.228 0.155 0.088 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0932 0.125 0.088 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0735 0.106 0.088 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0185 0.0951 0.088 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 1.77e-01 -0.18 0.132 0.088 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 8.81e-01 0.022 0.147 0.088 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 5.23e-02 0.123 0.0631 0.088 DC L1
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 7.95e-01 -0.039 0.15 0.088 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 2.97e-01 0.148 0.142 0.09 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 1.86e-01 0.0924 0.0696 0.09 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 7.39e-01 0.0409 0.123 0.09 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 9.20e-01 0.0106 0.105 0.09 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0245 0.121 0.09 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 3.49e-01 0.127 0.136 0.09 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -971457 sc-eQTL 6.96e-01 -0.054 0.138 0.09 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 8.48e-02 0.213 0.123 0.09 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 1.28e-01 0.196 0.128 0.09 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 7.90e-01 0.0423 0.159 0.09 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 5.96e-01 -0.064 0.121 0.09 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 5.25e-02 0.283 0.145 0.09 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 7.55e-01 0.0292 0.0935 0.09 NK L1
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 5.03e-01 0.108 0.161 0.09 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 3.14e-01 0.13 0.129 0.09 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 6.56e-01 0.0754 0.169 0.09 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 5.93e-01 0.0637 0.119 0.09 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 2.02e-01 -0.16 0.125 0.09 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 8.78e-01 0.0191 0.124 0.09 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 3.93e-01 0.0846 0.0989 0.09 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 1.45e-01 -0.22 0.15 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 5.01e-01 0.123 0.183 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 6.76e-01 -0.073 0.174 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0609 0.13 0.082 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 3.38e-01 0.173 0.18 0.082 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 7.70e-02 -0.31 0.174 0.082 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 3.75e-01 -0.165 0.186 0.082 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0985 0.175 0.082 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0849 0.175 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 9.85e-01 0.00278 0.149 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 2.10e-01 0.162 0.129 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0099 0.142 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 2.83e-01 0.176 0.164 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 7.43e-01 0.044 0.134 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 7.89e-01 0.0445 0.166 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 4.46e-01 -0.116 0.152 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 1.16e-01 0.243 0.154 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 9.32e-01 0.013 0.152 0.091 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 7.68e-01 -0.037 0.125 0.091 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 2.68e-01 -0.163 0.147 0.091 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 2.83e-01 0.182 0.169 0.091 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 6.00e-01 0.0761 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0844 0.155 0.091 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 3.06e-01 0.132 0.129 0.091 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0193 0.161 0.091 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00887 0.131 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 5.81e-01 0.065 0.118 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 1.02e-01 -0.222 0.135 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 5.51e-01 -0.101 0.169 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 1.71e-01 -0.182 0.132 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 2.12e-01 0.206 0.164 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 1.60e-01 0.212 0.15 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 6.27e-01 0.0809 0.166 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 2.53e-01 0.157 0.137 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 6.38e-02 0.23 0.123 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0376 0.13 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 5.63e-01 -0.102 0.176 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 1.86e-01 -0.168 0.127 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 7.78e-01 -0.046 0.163 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 8.09e-01 0.0368 0.152 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 5.44e-01 0.106 0.175 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 4.33e-01 0.123 0.157 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 1.61e-01 -0.211 0.15 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0802 0.152 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 9.87e-02 -0.223 0.135 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 8.86e-01 0.0234 0.163 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0163 0.0915 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 2.76e-01 -0.176 0.161 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 5.81e-03 -0.301 0.108 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 9.18e-01 0.0112 0.108 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0214 0.158 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 2.35e-01 -0.118 0.0995 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 2.96e-01 0.134 0.128 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 1.33e-02 0.347 0.139 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 2.14e-01 0.159 0.127 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0922 0.129 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00253 0.133 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 7.56e-01 -0.051 0.164 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0805 0.121 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 6.32e-01 0.0677 0.141 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 2.78e-01 -0.117 0.108 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0398 0.146 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 4.02e-01 -0.122 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 4.54e-01 0.124 0.165 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0199 0.16 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 1.30e-01 -0.217 0.143 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 4.13e-01 0.124 0.152 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0628 0.107 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 5.76e-01 0.0892 0.159 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 5.03e-01 0.0868 0.129 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00273 0.144 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0551 0.169 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0366 0.125 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 4.08e-01 -0.134 0.161 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 5.17e-01 0.0705 0.109 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 5.32e-01 -0.102 0.163 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 4.36e-01 -0.102 0.13 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00628 0.142 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 5.75e-01 0.0853 0.152 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0818 0.101 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 4.12e-02 0.32 0.156 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 1.99e-01 0.156 0.121 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0596 0.159 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 3.81e-01 0.143 0.163 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 6.21e-01 0.0816 0.165 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 6.14e-01 0.0886 0.175 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0513 0.115 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0773 0.17 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0526 0.155 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 6.12e-01 0.0846 0.167 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 9.24e-01 0.0164 0.17 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 8.33e-02 -0.305 0.175 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 3.25e-01 0.169 0.171 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 4.59e-01 -0.124 0.167 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 5.79e-03 0.46 0.165 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 8.82e-01 0.0195 0.131 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 7.39e-01 0.0564 0.169 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 8.00e-01 0.039 0.154 0.089 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 8.97e-01 0.0235 0.181 0.089 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 9.26e-01 0.0151 0.162 0.089 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 1.14e-02 -0.363 0.142 0.089 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0563 0.168 0.089 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 5.40e-01 0.0746 0.122 0.089 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 5.55e-02 -0.329 0.171 0.089 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -971457 sc-eQTL 6.24e-01 0.0667 0.136 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 4.36e-01 0.118 0.152 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 3.90e-01 0.135 0.156 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 1.69e-01 0.233 0.169 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 1.26e-01 -0.213 0.139 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 6.50e-01 0.0744 0.164 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 4.17e-01 -0.119 0.147 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00276 0.162 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -971457 sc-eQTL 3.05e-01 -0.143 0.139 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 8.35e-01 0.0269 0.129 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 7.92e-01 0.0372 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0577 0.169 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0725 0.13 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 3.63e-01 0.134 0.147 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00155 0.102 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 1.92e-01 0.218 0.167 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -971457 sc-eQTL 6.41e-02 -0.289 0.155 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 1.99e-01 0.204 0.158 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 5.89e-01 0.089 0.165 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0876 0.166 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 3.06e-01 0.149 0.145 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 3.12e-02 0.381 0.176 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0668 0.119 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 4.47e-01 -0.122 0.16 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -971457 sc-eQTL 9.55e-01 0.00832 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 1.77e-02 0.362 0.152 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 1.27e-01 0.226 0.148 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 9.59e-01 0.00838 0.164 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0609 0.134 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 3.02e-01 0.16 0.155 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 6.32e-01 0.0523 0.109 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 8.61e-01 0.0286 0.163 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 2.39e-01 -0.235 0.199 0.093 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 1.47e-02 0.411 0.166 0.093 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 2.31e-01 0.217 0.18 0.093 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 3.70e-01 -0.161 0.178 0.093 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 5.36e-01 0.0999 0.161 0.093 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 6.11e-02 0.302 0.159 0.093 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 3.81e-01 -0.11 0.125 0.093 PB L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 9.08e-01 0.0228 0.196 0.093 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 1.74e-02 0.356 0.148 0.089 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0805 0.167 0.089 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 5.21e-02 0.248 0.127 0.089 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 8.30e-01 0.0311 0.145 0.089 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 3.24e-01 0.122 0.124 0.089 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0513 0.107 0.089 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 5.39e-01 0.0993 0.161 0.089 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 2.57e-01 -0.163 0.144 0.09 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 4.55e-01 -0.12 0.16 0.09 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 3.80e-01 0.141 0.161 0.09 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 4.69e-01 0.0828 0.114 0.09 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 8.19e-01 0.0378 0.164 0.09 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 4.28e-01 0.0826 0.104 0.09 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 3.55e-01 -0.153 0.165 0.09 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 1.01e-01 0.268 0.163 0.085 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 5.15e-01 0.0952 0.146 0.085 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 1.84e-01 -0.169 0.127 0.085 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 2.69e-02 -0.249 0.112 0.085 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 4.35e-01 -0.119 0.151 0.085 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 4.81e-01 0.113 0.161 0.085 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0833 0.123 0.085 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0578 0.149 0.085 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 3.90e-01 0.133 0.154 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 1.30e-01 0.12 0.0792 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0328 0.13 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 9.26e-01 0.0109 0.118 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 7.20e-01 0.0469 0.131 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 4.25e-01 0.115 0.144 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 9.70e-01 0.00621 0.165 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 3.21e-01 0.114 0.115 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 9.56e-01 0.00756 0.138 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 9.53e-01 0.0074 0.126 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 2.70e-01 -0.158 0.143 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 4.10e-01 0.116 0.141 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 3.78e-01 0.149 0.169 0.097 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 8.57e-02 -0.342 0.198 0.097 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 6.81e-01 -0.082 0.199 0.097 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 7.16e-01 0.06 0.165 0.097 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 1.43e-01 -0.285 0.194 0.097 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 9.59e-02 0.262 0.156 0.097 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 8.28e-01 -0.042 0.193 0.097 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 8.70e-01 0.0259 0.157 0.093 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 7.99e-01 0.0339 0.133 0.093 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 4.24e-01 -0.129 0.161 0.093 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0689 0.145 0.093 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 1.53e-01 0.224 0.156 0.093 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 2.02e-01 0.177 0.139 0.093 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 6.38e-02 0.28 0.15 0.093 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 4.36e-01 0.0797 0.102 0.093 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 1.11e-01 0.261 0.163 0.093 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 5.11e-01 0.0828 0.126 0.093 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 3.78e-01 -0.137 0.155 0.093 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0928 0.158 0.093 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 4.20e-01 0.135 0.167 0.096 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 3.47e-01 -0.149 0.158 0.096 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0615 0.123 0.096 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 3.57e-01 0.099 0.107 0.096 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 1.47e-01 -0.221 0.152 0.096 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 7.51e-01 -0.053 0.167 0.096 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 1.79e-01 0.139 0.103 0.096 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 2.02e-01 -0.175 0.136 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 9.35e-01 0.0117 0.143 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 6.03e-01 0.0531 0.102 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00618 0.148 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 1.22e-02 0.386 0.153 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 9.05e-01 0.0159 0.133 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0794 0.151 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 4.50e-01 0.106 0.14 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 2.24e-01 0.198 0.163 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 6.81e-01 0.0491 0.119 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 3.22e-01 0.101 0.101 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 sc-eQTL 7.87e-02 -0.218 0.123 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 4.27e-01 -0.135 0.169 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 2.55e-01 -0.137 0.12 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 2.60e-01 0.181 0.16 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 1.48e-01 0.207 0.142 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 4.46e-01 0.126 0.165 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 4.37e-01 0.118 0.152 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 2.87e-02 0.162 0.0736 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 8.72e-01 0.0197 0.122 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 7.96e-01 0.0282 0.109 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0636 0.124 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 1.32e-01 0.208 0.137 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 2.88e-01 0.158 0.149 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 6.21e-01 0.0436 0.0881 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 6.22e-01 0.079 0.16 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 8.54e-01 0.0239 0.13 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 6.12e-01 0.0743 0.146 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 5.97e-01 0.0828 0.156 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -971457 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0877 0.139 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -67627 sc-eQTL 6.52e-02 0.227 0.123 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 61252 sc-eQTL 2.09e-01 0.17 0.135 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 182260 sc-eQTL 9.12e-01 -0.018 0.163 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 713281 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0136 0.123 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 952797 sc-eQTL 7.28e-02 0.265 0.147 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 sc-eQTL 7.04e-01 0.0359 0.0945 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 864837 sc-eQTL 3.36e-01 0.156 0.162 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136010 ALDH1L2 60933 eQTL 0.0483 -0.099 0.0501 0.0 0.0 0.0819
ENSG00000136044 APPL2 -67627 pQTL 0.0125 -0.0472 0.0189 0.0 0.0 0.0795
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 eQTL 0.000491 -0.237 0.0676 0.0 0.0 0.0819
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 eQTL 2.25e-05 0.141 0.033 0.0 0.0 0.0819

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136052 SLC41A2 209832 1.9e-06 2.71e-06 3.19e-07 1.95e-06 5.1e-07 8.22e-07 1.65e-06 6.34e-07 1.82e-06 8.44e-07 2.11e-06 1.26e-06 3.47e-06 1.15e-06 7.39e-07 1.24e-06 9.63e-07 1.89e-06 6.96e-07 1.16e-06 9.45e-07 2.71e-06 1.75e-06 9.59e-07 2.88e-06 1.26e-06 1.21e-06 1.45e-06 1.86e-06 1.85e-06 1.67e-06 3.23e-07 5.88e-07 1.22e-06 1.27e-06 9.66e-07 8.45e-07 4.39e-07 1.21e-06 3.96e-07 2.29e-07 2.87e-06 5.87e-07 1.99e-07 3.83e-07 3.26e-07 6.27e-07 1.82e-07 1.74e-07
ENSG00000235162 C12orf75 -66714 9.14e-06 1.15e-05 1.85e-06 7.73e-06 2.45e-06 5e-06 1.28e-05 2.14e-06 1.07e-05 5.58e-06 1.4e-05 6.24e-06 1.81e-05 3.95e-06 3.26e-06 6.6e-06 5.57e-06 8.94e-06 2.7e-06 3.17e-06 5.86e-06 1.05e-05 8.83e-06 3.31e-06 1.57e-05 4.4e-06 6.2e-06 4.78e-06 1.22e-05 9.19e-06 6.76e-06 1.01e-06 1.14e-06 3.52e-06 5.48e-06 2.67e-06 1.87e-06 1.95e-06 2.06e-06 1.26e-06 9.49e-07 1.34e-05 1.61e-06 2.01e-07 7.93e-07 1.8e-06 1.8e-06 8.04e-07 4.73e-07