logo

Genes within 1Mb (chr12:105157792:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 5.68e-02 -0.142 0.0742 0.241 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0339 0.0476 0.241 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 4.42e-01 0.0584 0.0759 0.241 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 2.79e-01 0.0993 0.0916 0.241 B L1
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0692 0.071 0.241 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0504 0.0869 0.241 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 9.61e-01 0.00322 0.0654 0.241 B L1
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 7.78e-02 -0.183 0.103 0.241 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 2.04e-01 0.0896 0.0702 0.241 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 1.80e-02 0.163 0.0686 0.241 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0199 0.0961 0.241 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0274 0.0637 0.241 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0887 0.0774 0.241 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 1.18e-01 0.084 0.0535 0.241 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00626 0.0841 0.241 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0701 0.0801 0.241 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 4.27e-04 0.311 0.087 0.241 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0599 0.081 0.241 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0494 0.0508 0.241 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0432 0.0885 0.241 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 2.61e-01 0.04 0.0355 0.241 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 2.43e-01 0.117 0.1 0.241 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 1.18e-01 -0.158 0.101 0.241 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 1.44e-01 -0.119 0.0812 0.241 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0413 0.0692 0.241 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 8.87e-01 0.00881 0.062 0.241 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0137 0.0867 0.241 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0453 0.0955 0.241 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 6.00e-02 -0.0779 0.0412 0.241 DC L1
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0307 0.0979 0.241 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 1.83e-01 -0.129 0.0966 0.241 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 3.49e-04 -0.168 0.0463 0.241 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 9.30e-01 0.00732 0.0838 0.241 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 7.81e-01 0.0201 0.072 0.241 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 8.99e-01 0.0105 0.0827 0.241 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 1.59e-01 -0.131 0.0925 0.241 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -982241 sc-eQTL 7.00e-01 0.0358 0.0927 0.24 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0518 0.083 0.24 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 3.20e-01 0.0862 0.0865 0.24 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 1.97e-02 -0.247 0.105 0.24 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0924 0.0808 0.24 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 9.92e-01 0.000941 0.0983 0.24 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 3.32e-01 0.061 0.0627 0.24 NK L1
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 6.27e-01 0.0527 0.108 0.24 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 1.85e-02 -0.204 0.0859 0.241 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0309 0.114 0.241 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0906 0.0802 0.241 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00299 0.0845 0.241 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0996 0.0832 0.241 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 7.26e-01 0.0235 0.0668 0.241 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 3.61e-01 0.0931 0.102 0.241 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0259 0.117 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0769 0.111 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0129 0.0834 0.235 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 6.95e-01 0.0455 0.116 0.235 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0295 0.113 0.235 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 3.28e-01 0.117 0.119 0.235 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 9.19e-01 0.0114 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0941 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 8.93e-01 -0.013 0.0971 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0755 0.0838 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 8.51e-02 0.158 0.0916 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 1.40e-02 0.261 0.105 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 9.16e-01 0.0092 0.0873 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 2.49e-01 -0.124 0.107 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0453 0.0992 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 1.11e-02 -0.254 0.099 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 3.82e-01 0.0901 0.103 0.244 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 1.47e-01 0.123 0.0847 0.244 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 6.58e-01 0.0442 0.0999 0.244 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 2.55e-01 0.131 0.115 0.244 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 9.01e-02 -0.167 0.0979 0.244 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0549 0.105 0.244 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0258 0.0874 0.244 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 5.63e-02 -0.207 0.108 0.244 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0709 0.0859 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 7.93e-01 0.0203 0.0773 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0011 0.0895 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 3.60e-01 -0.102 0.111 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0607 0.0872 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 3.24e-01 -0.107 0.108 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 9.87e-02 0.163 0.0983 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 9.48e-01 0.00712 0.109 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 6.71e-02 -0.168 0.0915 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0234 0.0833 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0335 0.0875 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 9.62e-01 0.00559 0.118 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0457 0.0853 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 1.88e-01 -0.144 0.109 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 2.63e-01 0.114 0.102 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0167 0.118 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 3.76e-01 0.0944 0.106 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 4.79e-02 0.202 0.101 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 4.07e-01 0.0853 0.103 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 9.58e-01 0.00484 0.092 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0442 0.11 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 1.56e-01 0.0879 0.0618 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 7.74e-02 0.193 0.109 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 8.06e-01 0.018 0.073 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 7.81e-01 0.02 0.072 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 7.04e-01 -0.04 0.105 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 8.42e-01 0.0133 0.0663 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 8.35e-02 -0.147 0.0847 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 6.73e-01 0.0395 0.0936 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 9.64e-01 0.00384 0.0849 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 1.03e-01 0.141 0.0861 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 1.18e-03 0.286 0.087 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0169 0.11 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 8.64e-01 -0.014 0.0816 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0753 0.0947 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 6.23e-04 0.245 0.0706 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 9.26e-01 0.00907 0.0978 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 1.97e-01 0.125 0.0963 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 8.91e-01 0.015 0.109 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 7.77e-01 0.03 0.106 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 7.46e-01 0.0308 0.0949 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 1.11e-01 -0.16 0.0998 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 3.28e-02 0.151 0.0701 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 9.13e-01 0.0116 0.106 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0437 0.0863 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 2.01e-01 0.122 0.0953 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 1.35e-01 -0.168 0.112 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 7.89e-02 -0.146 0.0828 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0402 0.107 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 4.92e-01 0.0497 0.0723 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 1.30e-01 0.165 0.108 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0463 0.0861 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 3.78e-04 0.327 0.0906 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 8.69e-01 0.0165 0.1 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 2.59e-01 0.0752 0.0665 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 6.79e-01 -0.043 0.104 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0546 0.08 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 6.32e-01 0.0503 0.105 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 8.52e-01 -0.02 0.107 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 5.01e-02 0.211 0.107 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 8.94e-01 0.0153 0.115 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0444 0.0751 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 4.87e-01 0.0774 0.111 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 4.41e-01 0.0784 0.101 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 5.49e-01 0.0656 0.109 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 8.29e-01 0.024 0.111 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 2.73e-01 0.126 0.114 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 1.18e-01 -0.174 0.111 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 8.66e-01 0.0184 0.109 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 9.88e-01 0.00158 0.109 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0208 0.0854 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 9.79e-01 0.00289 0.11 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 2.63e-01 -0.114 0.101 0.242 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 5.92e-01 0.0642 0.12 0.242 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0575 0.107 0.242 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 2.35e-01 0.114 0.0954 0.242 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 7.82e-01 0.0308 0.111 0.242 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0284 0.0806 0.242 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 4.88e-02 0.224 0.113 0.242 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -982241 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0443 0.0908 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0227 0.102 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 1.74e-01 0.142 0.104 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 2.60e-02 -0.251 0.112 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 7.29e-01 0.0323 0.0932 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0621 0.109 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0209 0.0982 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 1.75e-01 0.147 0.108 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -982241 sc-eQTL 5.89e-01 0.0503 0.0929 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 9.41e-01 0.0063 0.0857 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 6.87e-02 0.17 0.093 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 4.56e-02 -0.224 0.112 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0203 0.0871 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0318 0.0982 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 6.47e-02 0.125 0.0673 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 8.00e-01 0.0283 0.112 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -982241 sc-eQTL 5.49e-01 0.0625 0.104 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 3.33e-01 -0.103 0.106 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 2.02e-02 0.253 0.108 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 2.74e-01 -0.121 0.11 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00867 0.0967 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0977 0.118 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 5.14e-01 0.0518 0.0793 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 8.84e-01 0.0157 0.107 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -982241 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00844 0.0981 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 4.73e-02 -0.203 0.102 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 2.56e-01 -0.113 0.0991 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0776 0.11 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 5.63e-02 -0.171 0.089 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 7.03e-01 0.0397 0.104 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 6.02e-01 0.0381 0.0729 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0752 0.109 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 4.56e-02 0.297 0.147 0.23 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 2.08e-01 -0.16 0.127 0.23 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 5.57e-01 0.0799 0.136 0.23 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 1.95e-01 -0.173 0.133 0.23 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0439 0.121 0.23 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 6.13e-01 0.0614 0.121 0.23 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 7.33e-01 0.0321 0.0938 0.23 PB L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0588 0.147 0.23 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0126 0.108 0.241 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 2.00e-01 -0.153 0.119 0.241 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 1.61e-01 -0.128 0.091 0.241 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0187 0.103 0.241 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 3.30e-03 -0.258 0.0869 0.241 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 1.53e-01 0.109 0.076 0.241 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0668 0.115 0.241 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0657 0.0948 0.241 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 1.04e-04 0.403 0.102 0.241 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0264 0.106 0.241 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 8.41e-02 -0.13 0.0748 0.241 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 3.92e-01 0.0927 0.108 0.241 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 2.64e-01 0.0767 0.0684 0.241 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 4.76e-01 0.0779 0.109 0.241 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 5.93e-03 -0.291 0.104 0.241 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 3.48e-02 -0.2 0.0941 0.241 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 7.61e-01 0.0253 0.083 0.241 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 1.52e-01 0.106 0.0734 0.241 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0665 0.0987 0.241 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 2.48e-01 -0.121 0.104 0.241 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0532 0.0798 0.241 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0062 0.0969 0.241 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 2.54e-01 -0.12 0.105 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 1.46e-06 -0.255 0.0515 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 1.81e-01 -0.118 0.0882 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0221 0.0803 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 4.57e-01 0.0664 0.0891 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0335 0.0982 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0291 0.114 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0965 0.0789 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 7.84e-02 0.166 0.0939 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 8.16e-01 0.0201 0.0864 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 9.81e-01 0.0023 0.0983 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 5.31e-02 -0.187 0.0963 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 2.16e-02 -0.267 0.115 0.252 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 8.45e-01 -0.027 0.138 0.252 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 9.41e-02 -0.229 0.136 0.252 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 1.37e-01 -0.169 0.113 0.252 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0497 0.135 0.252 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 6.89e-01 0.0437 0.109 0.252 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 7.06e-01 0.0504 0.133 0.252 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 6.69e-01 -0.047 0.11 0.242 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0593 0.0928 0.242 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0881 0.112 0.242 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 2.06e-01 0.128 0.101 0.242 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0436 0.109 0.242 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 9.36e-01 0.00781 0.0972 0.242 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 1.99e-01 -0.129 0.1 0.24 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0449 0.0678 0.24 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 6.01e-01 0.057 0.109 0.24 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 5.37e-03 -0.231 0.082 0.24 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 6.92e-01 -0.041 0.103 0.24 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0838 0.105 0.24 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 6.11e-01 0.0583 0.114 0.246 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 2.00e-01 -0.139 0.108 0.246 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 5.27e-02 -0.163 0.0835 0.246 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 2.22e-01 -0.09 0.0734 0.246 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0285 0.105 0.246 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 5.39e-01 0.0705 0.114 0.246 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0448 0.0709 0.246 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 6.98e-01 0.0365 0.0939 0.246 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 9.65e-01 0.00408 0.0929 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 7.75e-01 -0.019 0.0664 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 3.12e-01 0.0974 0.0962 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 1.63e-03 0.314 0.0985 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 1.55e-01 -0.123 0.0861 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0929 0.0984 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00953 0.0913 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 2.83e-03 -0.314 0.104 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 1.78e-01 -0.106 0.0787 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0258 0.0674 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 199048 sc-eQTL 6.72e-01 -0.035 0.0825 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0232 0.112 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0739 0.0797 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0841 0.106 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 2.58e-02 0.211 0.0938 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0159 0.11 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 3.09e-01 -0.106 0.104 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 2.31e-05 -0.211 0.0487 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 9.12e-01 0.00921 0.083 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0244 0.0743 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 7.73e-01 0.0245 0.0845 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0783 0.0941 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 1.40e-01 -0.151 0.102 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0601 0.0606 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0548 0.11 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0455 0.0896 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0332 0.101 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0807 0.108 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -982241 sc-eQTL 6.19e-01 0.0463 0.0931 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -78411 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0892 0.0826 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 50468 sc-eQTL 2.93e-01 0.0953 0.0904 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 171476 sc-eQTL 9.76e-02 -0.181 0.108 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 702497 sc-eQTL 2.02e-01 -0.105 0.0823 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 942013 sc-eQTL 9.71e-01 0.0036 0.0992 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 sc-eQTL 2.51e-01 0.0727 0.0632 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 854053 sc-eQTL 9.12e-01 -0.012 0.109 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136010 ALDH1L2 50149 eQTL 1.9e-06 0.149 0.031 0.0 0.00126 0.246
ENSG00000136044 APPL2 -78411 pQTL 3.8e-12 -0.0804 0.0115 0.0 0.0 0.249
ENSG00000136044 APPL2 -78411 eQTL 9.58e-05 -0.0865 0.0221 0.0 0.0 0.246
ENSG00000136051 WASHC4 50468 eQTL 5.85e-05 -0.0456 0.0113 0.0 0.0 0.246
ENSG00000151131 C12orf45 171476 eQTL 0.00666 0.0522 0.0192 0.0 0.0 0.246
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 eQTL 1.74e-10 -0.132 0.0204 0.00581 0.00582 0.246

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136010 ALDH1L2 50149 2.55e-05 2.05e-05 2.65e-06 1.04e-05 2.79e-06 8.52e-06 2.4e-05 3.47e-06 1.84e-05 8.28e-06 2.31e-05 8.71e-06 3.11e-05 7.03e-06 5.16e-06 9.71e-06 8.54e-06 1.53e-05 3.58e-06 4.23e-06 8.07e-06 1.66e-05 1.61e-05 4.48e-06 2.45e-05 5.33e-06 8.36e-06 7.68e-06 1.77e-05 1.31e-05 1.23e-05 1.33e-06 1.56e-06 4.09e-06 7.59e-06 3.35e-06 1.78e-06 2.73e-06 2.96e-06 2.62e-06 1.3e-06 1.96e-05 2.92e-06 2.66e-07 1.67e-06 2.34e-06 2.74e-06 1.24e-06 1.04e-06
ENSG00000136051 WASHC4 50468 2.51e-05 2.04e-05 2.67e-06 1.03e-05 2.75e-06 8.49e-06 2.38e-05 3.4e-06 1.84e-05 8.28e-06 2.31e-05 8.71e-06 3.08e-05 6.95e-06 5.11e-06 9.71e-06 8.54e-06 1.52e-05 3.58e-06 4.29e-06 8.07e-06 1.66e-05 1.59e-05 4.43e-06 2.45e-05 5.26e-06 8.36e-06 7.68e-06 1.77e-05 1.31e-05 1.21e-05 1.33e-06 1.56e-06 4.09e-06 7.58e-06 3.28e-06 1.78e-06 2.73e-06 2.96e-06 2.62e-06 1.29e-06 1.96e-05 2.88e-06 2.66e-07 1.67e-06 2.34e-06 2.71e-06 1.24e-06 1.04e-06
ENSG00000235162 C12orf75 -77498 1.59e-05 1.48e-05 2.25e-06 8.26e-06 2.38e-06 6.21e-06 1.78e-05 2.62e-06 1.44e-05 6.09e-06 1.82e-05 6.94e-06 2.28e-05 4.65e-06 4.19e-06 7.94e-06 6.78e-06 1.17e-05 3.09e-06 3.29e-06 6.46e-06 1.24e-05 1.1e-05 3.38e-06 1.85e-05 4.71e-06 7.62e-06 5.29e-06 1.43e-05 9.8e-06 9.19e-06 9.49e-07 1.22e-06 3.54e-06 6.09e-06 2.75e-06 1.76e-06 2.29e-06 2.03e-06 2e-06 1.01e-06 1.53e-05 2.68e-06 2.27e-07 1.02e-06 1.67e-06 1.96e-06 8.32e-07 6.34e-07