logo

Genes within 1Mb (chr12:105151747:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 3.68e-02 -0.153 0.0729 0.226 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 7.87e-01 0.0127 0.0469 0.226 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 1.95e-01 0.0969 0.0745 0.226 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0586 0.0903 0.226 B L1
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 4.81e-01 0.0494 0.0699 0.226 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00402 0.0856 0.226 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00322 0.0644 0.226 B L1
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 5.00e-02 0.2 0.102 0.226 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 2.15e-03 0.213 0.0685 0.226 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 8.09e-01 0.0167 0.069 0.226 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 1.08e-01 0.153 0.0949 0.226 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0336 0.0633 0.226 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 3.08e-01 0.0786 0.0769 0.226 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0197 0.0534 0.226 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0582 0.0835 0.226 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 4.16e-01 0.0661 0.0811 0.226 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 1.02e-02 -0.231 0.0893 0.226 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 3.90e-01 0.0705 0.0819 0.226 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 8.61e-01 0.00902 0.0516 0.226 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 6.21e-01 0.0444 0.0896 0.226 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 9.83e-01 -0.000749 0.0361 0.226 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 7.40e-01 0.0337 0.102 0.226 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0657 0.102 0.23 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 3.35e-01 0.0796 0.0823 0.23 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 6.96e-01 0.0274 0.07 0.23 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0289 0.0626 0.23 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0505 0.0875 0.23 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 4.96e-01 0.0658 0.0965 0.23 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 9.22e-02 0.0705 0.0417 0.23 DC L1
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0324 0.099 0.23 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0186 0.0955 0.226 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 1.13e-01 0.0744 0.0467 0.226 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0469 0.0825 0.226 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00205 0.0709 0.226 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0574 0.0814 0.226 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 9.12e-01 0.0101 0.0916 0.226 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -988286 sc-eQTL 2.73e-01 0.0989 0.0901 0.225 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0703 0.0808 0.225 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0421 0.0844 0.225 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 8.33e-02 0.179 0.103 0.225 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 8.50e-01 0.0149 0.0789 0.225 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0359 0.0957 0.225 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0712 0.061 0.225 NK L1
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 3.21e-01 -0.105 0.105 0.225 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 3.17e-01 0.0858 0.0856 0.226 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 3.54e-01 0.104 0.112 0.226 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0347 0.0793 0.226 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 1.26e-01 0.127 0.0829 0.226 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 9.00e-01 0.0104 0.0824 0.226 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 1.72e-01 0.09 0.0656 0.226 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 7.70e-01 0.0295 0.1 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0454 0.115 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 2.79e-01 0.119 0.109 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0308 0.082 0.232 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 1.58e-01 -0.16 0.113 0.232 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 2.52e-01 0.127 0.11 0.232 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 8.26e-02 -0.203 0.116 0.232 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 2.09e-02 -0.254 0.109 0.232 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 4.80e-01 0.078 0.11 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 9.52e-01 0.00579 0.097 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0988 0.0835 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0184 0.0921 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0351 0.106 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00253 0.0871 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 3.21e-01 0.107 0.107 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0574 0.099 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 5.09e-01 0.0663 0.1 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 5.44e-01 0.0602 0.0991 0.226 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 9.87e-01 0.00136 0.082 0.226 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 6.98e-01 0.0373 0.0961 0.226 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 3.36e-01 -0.107 0.111 0.226 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0452 0.0948 0.226 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 1.64e-01 -0.141 0.101 0.226 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0268 0.0841 0.226 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 3.38e-02 0.222 0.104 0.226 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 4.00e-03 -0.245 0.0842 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 5.24e-02 0.149 0.0766 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 9.86e-02 0.147 0.0888 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0681 0.111 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 8.98e-01 0.0111 0.0872 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0467 0.108 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0859 0.0987 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 3.53e-01 0.101 0.109 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 1.40e-01 -0.136 0.0915 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0508 0.083 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0793 0.087 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 2.51e-01 -0.135 0.118 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 2.06e-01 0.108 0.0848 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 2.55e-01 0.124 0.109 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 8.36e-01 0.0211 0.102 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0275 0.117 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 8.24e-01 0.025 0.112 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 3.08e-01 -0.11 0.108 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 3.03e-01 -0.112 0.108 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 9.74e-01 0.00321 0.0969 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0604 0.116 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 9.80e-01 0.00165 0.0654 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000678 0.116 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 9.77e-04 0.242 0.0722 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 9.55e-01 0.00409 0.0731 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 6.46e-02 0.196 0.106 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00657 0.0673 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 4.48e-02 0.173 0.0858 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0744 0.0949 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0479 0.0861 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 2.25e-01 0.104 0.0853 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 1.46e-01 -0.128 0.0878 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 2.30e-01 0.131 0.109 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0741 0.0805 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 4.17e-01 0.0761 0.0936 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0257 0.0717 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0382 0.0967 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 2.83e-01 -0.102 0.095 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 6.82e-01 0.0442 0.108 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 4.08e-01 0.0863 0.104 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 1.10e-01 -0.149 0.0929 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 7.00e-01 0.0382 0.0989 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 1.32e-01 -0.105 0.0695 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 1.84e-01 -0.138 0.104 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0536 0.0869 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 5.79e-02 -0.182 0.0955 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 2.26e-01 0.138 0.113 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 7.59e-01 0.0258 0.084 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 4.91e-01 0.0746 0.108 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0184 0.0729 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 9.66e-01 0.00467 0.11 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 1.16e-01 0.14 0.0888 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 4.51e-03 -0.273 0.095 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 3.83e-01 0.0908 0.104 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0236 0.0691 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 8.62e-01 0.0187 0.108 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 3.11e-01 0.0841 0.0828 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 2.98e-01 0.113 0.108 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0951 0.113 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0766 0.114 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 4.86e-02 -0.238 0.12 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 5.86e-01 0.0432 0.0792 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0688 0.117 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 2.00e-01 -0.137 0.107 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 2.74e-01 0.126 0.115 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0839 0.113 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0254 0.117 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0102 0.115 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 4.12e-01 0.0917 0.112 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 2.28e-01 -0.135 0.112 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 7.33e-02 0.156 0.0868 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 6.73e-01 0.0474 0.112 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 4.47e-01 0.0774 0.102 0.227 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 7.97e-01 0.0309 0.12 0.227 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 7.59e-01 0.033 0.107 0.227 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 2.19e-01 0.118 0.0954 0.227 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 8.24e-01 0.0247 0.111 0.227 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 2.51e-01 0.0925 0.0803 0.227 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0916 0.114 0.227 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -988286 sc-eQTL 1.42e-01 0.137 0.0929 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 3.61e-02 -0.218 0.103 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 5.64e-01 0.0622 0.108 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 3.70e-01 0.105 0.116 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 2.09e-01 -0.12 0.0955 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 1.67e-01 -0.155 0.112 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 6.93e-01 0.0399 0.101 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 6.34e-03 -0.301 0.109 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -988286 sc-eQTL 2.33e-01 0.109 0.0913 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0314 0.0845 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 4.67e-02 -0.183 0.0916 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 1.07e-01 0.179 0.11 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00977 0.0858 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 5.85e-01 0.053 0.0968 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0608 0.0667 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 7.38e-01 0.0368 0.11 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -988286 sc-eQTL 6.02e-01 0.0548 0.105 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 8.08e-01 0.0259 0.107 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 4.13e-01 0.0903 0.11 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 2.28e-01 0.134 0.111 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0963 0.0971 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 7.58e-01 0.0368 0.119 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 7.94e-01 0.0208 0.0798 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 1.50e-01 -0.155 0.107 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -988286 sc-eQTL 6.70e-01 0.0418 0.0978 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 9.51e-01 0.00633 0.102 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 7.72e-01 0.0288 0.0991 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 3.72e-01 0.0979 0.109 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00389 0.0895 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0221 0.104 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00664 0.0727 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0471 0.109 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 7.14e-02 0.223 0.122 0.233 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 2.59e-01 -0.119 0.105 0.233 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 1.19e-01 -0.175 0.111 0.233 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 9.92e-01 0.00113 0.111 0.233 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 2.60e-01 0.113 0.0995 0.233 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 9.58e-01 0.0053 0.101 0.233 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 7.86e-01 0.0212 0.0778 0.233 PB L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 4.25e-01 0.097 0.121 0.233 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 3.79e-01 -0.089 0.101 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 2.39e-01 0.132 0.112 0.226 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0384 0.0858 0.226 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 5.32e-02 0.187 0.0962 0.226 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 2.08e-01 -0.105 0.083 0.226 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0803 0.0715 0.226 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 4.63e-01 0.0797 0.108 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 9.52e-02 0.159 0.0949 0.226 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 9.34e-01 0.00879 0.106 0.226 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 2.94e-02 -0.232 0.106 0.226 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0252 0.0758 0.226 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 1.26e-01 -0.166 0.108 0.226 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 9.15e-01 0.00738 0.0691 0.226 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 1.25e-01 -0.169 0.109 0.226 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 6.69e-01 0.0469 0.11 0.229 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 8.99e-01 0.0125 0.0978 0.229 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 4.61e-01 0.063 0.0851 0.229 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 9.30e-01 0.0067 0.0758 0.229 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 9.42e-01 0.00735 0.102 0.229 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 4.92e-01 0.074 0.107 0.229 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 8.46e-01 0.0159 0.0821 0.229 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 7.48e-01 -0.032 0.0995 0.229 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 3.72e-01 0.0925 0.103 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 8.50e-02 0.0917 0.053 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 2.14e-01 0.108 0.0867 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 5.23e-01 0.0504 0.0788 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 3.15e-01 -0.088 0.0874 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 2.86e-01 -0.103 0.0962 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 3.56e-01 -0.103 0.112 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 9.86e-01 0.00133 0.0779 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 1.06e-01 -0.15 0.0925 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0707 0.0848 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 6.68e-01 0.0415 0.0966 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 5.54e-01 0.0565 0.0955 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 4.19e-01 0.101 0.125 0.215 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0709 0.147 0.215 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 5.71e-01 0.0832 0.147 0.215 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 1.98e-01 -0.156 0.121 0.215 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 1.48e-01 0.208 0.143 0.215 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 6.82e-01 0.0478 0.116 0.215 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 4.66e-01 -0.104 0.142 0.215 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0384 0.107 0.227 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 6.46e-01 0.0416 0.0904 0.227 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 2.65e-01 0.122 0.109 0.227 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 4.74e-02 -0.195 0.098 0.227 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 6.75e-01 0.0447 0.106 0.227 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0901 0.0944 0.227 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 2.28e-01 -0.125 0.104 0.222 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 7.78e-01 0.0198 0.0702 0.222 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 1.59e-01 -0.158 0.112 0.222 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 1.11e-01 0.138 0.0859 0.222 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 4.83e-01 0.0751 0.107 0.222 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0645 0.109 0.222 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 5.07e-03 -0.332 0.117 0.226 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 1.60e-01 0.159 0.113 0.226 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 7.59e-02 0.157 0.0876 0.226 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 3.34e-01 0.0746 0.077 0.226 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 9.03e-02 0.185 0.109 0.226 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 1.52e-02 0.289 0.118 0.226 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 1.34e-01 0.111 0.0738 0.226 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00156 0.0984 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 8.44e-01 0.0183 0.0928 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0398 0.0663 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 8.69e-01 0.016 0.0963 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 2.53e-01 -0.115 0.1 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 4.71e-01 0.0623 0.0863 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0472 0.0984 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0099 0.0912 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 1.93e-01 0.138 0.106 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 1.56e-03 -0.248 0.0774 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 2.47e-01 0.0782 0.0674 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 193003 sc-eQTL 2.33e-01 0.0986 0.0824 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 3.73e-01 -0.1 0.112 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 3.94e-01 0.0682 0.0798 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 9.19e-01 0.0108 0.107 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0595 0.095 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 3.47e-01 0.104 0.11 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 9.64e-01 0.0046 0.103 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 1.47e-01 0.0725 0.0499 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 8.07e-01 -0.02 0.0818 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 9.42e-01 0.00536 0.0733 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0338 0.0834 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0328 0.093 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0889 0.102 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 2.25e-01 0.0732 0.0601 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00159 0.11 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 2.52e-01 -0.102 0.0887 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 7.90e-01 0.0268 0.1 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 3.21e-01 -0.106 0.107 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -988286 sc-eQTL 2.73e-01 0.0997 0.0906 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -84456 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00478 0.0808 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 44423 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0873 0.0882 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 165431 sc-eQTL 1.49e-01 0.154 0.106 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 696452 sc-eQTL 7.47e-01 0.026 0.0806 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 935968 sc-eQTL 8.39e-01 0.0197 0.0968 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -83543 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0763 0.0616 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 848008 sc-eQTL 6.04e-01 -0.055 0.106 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 -84456 pQTL 4.820000000000001e-31 0.129 0.0109 0.0 0.0 0.233
ENSG00000136044 APPL2 -84456 eQTL 0.00181 0.0682 0.0218 0.00123 0.0 0.236
ENSG00000136051 WASHC4 44423 eQTL 1.4e-07 0.0586 0.0111 0.0 0.0 0.236

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136051 WASHC4 44423 8.82e-06 9.5e-06 1.36e-06 4.85e-06 2.22e-06 4.18e-06 1.01e-05 1.69e-06 7.74e-06 4.73e-06 1.08e-05 5.02e-06 1.29e-05 3.95e-06 2.19e-06 6.48e-06 3.89e-06 6.85e-06 2.61e-06 2.81e-06 4.72e-06 8.15e-06 7.13e-06 3.08e-06 1.27e-05 3.36e-06 4.47e-06 3.3e-06 8.7e-06 8.21e-06 5.02e-06 7.85e-07 1.14e-06 2.92e-06 3.62e-06 2.31e-06 1.73e-06 1.86e-06 1.63e-06 1e-06 9.94e-07 1.24e-05 1.27e-06 1.68e-07 7.71e-07 1.47e-06 1.29e-06 6.93e-07 4.44e-07