Genes within 1Mb (chr12:105147268:AT:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 1.15e-01 -0.118 0.0743 0.218 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00224 0.0476 0.218 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 1.74e-01 0.103 0.0755 0.218 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0618 0.0916 0.218 B L1
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 5.48e-01 0.0427 0.071 0.218 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00642 0.0869 0.218 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00275 0.0654 0.218 B L1
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 4.60e-02 0.207 0.103 0.218 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 1.33e-03 0.226 0.0694 0.218 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 7.27e-01 0.0245 0.0701 0.218 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 1.09e-01 0.155 0.0964 0.218 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0357 0.0643 0.218 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 3.27e-01 0.0767 0.0782 0.218 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0105 0.0543 0.218 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0643 0.0848 0.218 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 1.78e-01 0.111 0.082 0.218 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 1.16e-02 -0.231 0.0906 0.218 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 3.76e-01 0.0737 0.0831 0.218 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 9.18e-01 0.00536 0.0523 0.218 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 4.30e-01 0.0718 0.0908 0.218 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00449 0.0366 0.218 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 8.48e-01 0.0198 0.103 0.218 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 6.02e-01 -0.054 0.103 0.221 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 1.65e-01 0.116 0.083 0.221 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 8.19e-01 0.0162 0.0708 0.221 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0471 0.0632 0.221 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0165 0.0885 0.221 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 5.03e-01 0.0655 0.0975 0.221 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 9.85e-02 0.0699 0.0421 0.221 DC L1
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00829 0.1 0.221 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 8.87e-01 0.0137 0.0964 0.218 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 1.20e-01 0.0736 0.0471 0.218 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0665 0.0831 0.218 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 8.81e-01 0.0107 0.0716 0.218 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0337 0.0821 0.218 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000591 0.0924 0.218 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -992765 sc-eQTL 4.49e-01 0.0694 0.0916 0.217 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0602 0.0821 0.217 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0239 0.0858 0.217 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 6.54e-02 0.194 0.105 0.217 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 9.17e-01 0.00835 0.0802 0.217 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0395 0.0972 0.217 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 2.74e-01 -0.068 0.062 0.217 NK L1
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 2.65e-01 -0.12 0.107 0.217 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 2.91e-01 0.092 0.0869 0.218 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 3.93e-01 0.0977 0.114 0.218 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0358 0.0805 0.218 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 1.45e-01 0.123 0.0842 0.218 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 7.48e-01 0.0269 0.0836 0.218 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 2.27e-01 0.0808 0.0667 0.218 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 8.32e-01 0.0216 0.102 0.218 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0286 0.117 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 1.88e-01 0.147 0.111 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0162 0.0834 0.224 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 2.65e-01 -0.129 0.115 0.224 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 8.28e-02 0.195 0.112 0.224 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 6.49e-02 -0.219 0.118 0.224 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 2.99e-02 -0.243 0.111 0.224 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 4.56e-01 0.0838 0.112 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 6.56e-01 0.0439 0.0985 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 1.34e-01 -0.127 0.0847 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0211 0.0935 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0291 0.108 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 8.24e-01 0.0197 0.0885 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 3.52e-01 0.102 0.109 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0337 0.101 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 4.88e-01 0.0706 0.102 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 6.20e-01 0.0496 0.1 0.218 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0335 0.0827 0.218 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 3.89e-01 0.0836 0.0969 0.218 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 2.57e-01 -0.127 0.112 0.218 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0566 0.0957 0.218 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 1.79e-01 -0.137 0.102 0.218 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 8.50e-01 0.016 0.085 0.218 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 2.62e-02 0.234 0.105 0.218 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 1.47e-02 -0.211 0.0857 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 5.73e-02 0.148 0.0775 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 9.03e-02 0.153 0.0898 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0573 0.112 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00792 0.0882 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0341 0.11 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0889 0.0999 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 4.11e-01 0.0908 0.11 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 2.65e-01 -0.104 0.093 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0648 0.0842 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0594 0.0884 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 1.96e-01 -0.155 0.119 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 3.42e-01 0.082 0.0862 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 3.41e-01 0.105 0.11 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 8.69e-01 0.017 0.103 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0249 0.119 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 5.47e-01 0.0691 0.114 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 2.70e-01 -0.121 0.109 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 3.64e-01 -0.1 0.11 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0167 0.0987 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0192 0.118 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 8.64e-01 0.0115 0.0666 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 8.60e-01 0.0208 0.118 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 4.53e-04 0.26 0.0728 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 6.56e-01 0.033 0.0739 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 8.71e-02 0.184 0.107 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00697 0.0681 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 8.78e-02 0.149 0.087 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0643 0.0961 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0631 0.0871 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 1.41e-01 0.128 0.0868 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 1.25e-01 -0.138 0.0893 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 1.92e-01 0.145 0.11 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0877 0.0819 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 3.15e-01 0.0959 0.0952 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0171 0.073 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00741 0.0985 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0977 0.0966 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 7.41e-01 0.0363 0.109 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 2.62e-01 0.119 0.106 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 1.37e-01 -0.141 0.0946 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 8.07e-01 0.0247 0.101 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 1.29e-01 -0.108 0.0706 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 1.96e-01 -0.137 0.105 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0517 0.088 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 1.06e-01 -0.158 0.097 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 2.42e-01 0.135 0.115 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 7.22e-01 0.0303 0.0851 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 2.81e-01 0.118 0.109 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0167 0.0738 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0103 0.111 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 3.21e-02 0.193 0.0893 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 2.81e-03 -0.29 0.0958 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 3.95e-01 0.0896 0.105 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0292 0.0698 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 7.60e-01 0.0332 0.109 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 3.61e-01 0.0766 0.0838 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 4.24e-01 0.088 0.11 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0514 0.113 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0748 0.114 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 1.13e-01 -0.192 0.121 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 6.37e-01 0.0375 0.0794 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0423 0.118 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 1.04e-01 -0.174 0.107 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 1.54e-01 0.164 0.115 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0487 0.116 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0474 0.12 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00383 0.117 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 5.21e-01 0.0731 0.114 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 2.29e-01 -0.137 0.114 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 1.53e-01 0.127 0.0886 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00187 0.114 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 4.44e-01 0.0793 0.103 0.219 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 4.28e-01 0.0965 0.122 0.219 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 6.01e-01 0.0572 0.109 0.219 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 2.05e-01 0.123 0.097 0.219 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 5.63e-01 0.0655 0.113 0.219 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 2.76e-01 0.0894 0.0818 0.219 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 3.50e-01 -0.109 0.116 0.219 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -992765 sc-eQTL 1.71e-01 0.129 0.0941 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 6.00e-02 -0.198 0.105 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 3.02e-01 0.112 0.109 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 5.74e-01 0.0665 0.118 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 1.53e-01 -0.139 0.0965 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 1.12e-01 -0.181 0.113 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 6.10e-01 0.0521 0.102 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 8.47e-03 -0.295 0.111 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -992765 sc-eQTL 3.88e-01 0.0805 0.093 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0156 0.0859 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 4.87e-02 -0.185 0.093 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 1.18e-01 0.176 0.112 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000985 0.0872 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 5.65e-01 0.0566 0.0983 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0605 0.0678 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 9.16e-01 0.0119 0.112 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -992765 sc-eQTL 6.63e-01 0.0465 0.107 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00876 0.108 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 4.78e-01 0.0797 0.112 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 2.33e-01 0.135 0.112 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 2.29e-01 -0.119 0.0985 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 7.92e-01 0.0319 0.121 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 7.93e-01 0.0213 0.0811 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 1.44e-01 -0.16 0.109 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -992765 sc-eQTL 7.16e-01 0.0361 0.099 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0156 0.104 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 7.14e-01 0.0368 0.1 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 1.93e-01 0.144 0.11 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0236 0.0906 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0406 0.105 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 8.57e-01 0.0133 0.0737 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0679 0.11 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 4.56e-02 0.251 0.124 0.222 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0798 0.107 0.222 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 1.50e-01 -0.165 0.113 0.222 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 9.86e-01 0.00199 0.113 0.222 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 3.39e-01 0.0974 0.101 0.222 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 9.86e-01 0.00174 0.102 0.222 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 6.51e-01 0.0359 0.0791 0.222 PB L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 1.86e-01 0.163 0.123 0.222 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0306 0.103 0.217 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 4.42e-01 0.0883 0.115 0.217 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0411 0.0876 0.217 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 5.16e-02 0.192 0.0982 0.217 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 2.13e-01 -0.106 0.0848 0.217 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0805 0.073 0.217 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 5.21e-01 0.0712 0.111 0.217 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 2.56e-01 0.11 0.0966 0.218 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 8.47e-01 0.0208 0.108 0.218 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 7.52e-02 -0.192 0.108 0.218 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0159 0.0769 0.218 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 1.80e-01 -0.148 0.11 0.218 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 7.55e-01 0.0219 0.0701 0.218 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 2.19e-01 -0.137 0.111 0.218 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 6.73e-01 0.0471 0.111 0.222 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 8.09e-01 0.0241 0.0995 0.222 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 5.60e-01 0.0506 0.0866 0.222 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0182 0.0771 0.222 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 7.99e-01 0.0263 0.103 0.222 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 5.70e-01 0.0622 0.109 0.222 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00342 0.0835 0.222 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0344 0.101 0.222 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 2.87e-01 0.111 0.104 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 4.62e-02 0.107 0.0534 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 3.98e-01 0.0743 0.0876 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 4.64e-01 0.0583 0.0795 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0635 0.0883 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 2.77e-01 -0.106 0.097 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0911 0.113 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0343 0.0786 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 9.38e-02 -0.157 0.0933 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0459 0.0857 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 7.68e-01 0.0288 0.0975 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 5.88e-01 0.0523 0.0964 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 6.62e-01 0.0551 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 3.01e-01 -0.154 0.148 0.209 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 5.60e-01 0.0862 0.148 0.209 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 2.74e-01 -0.134 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 1.37e-01 0.215 0.144 0.209 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 7.54e-01 0.0368 0.117 0.209 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0761 0.143 0.209 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00493 0.107 0.218 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 6.82e-01 0.0372 0.0907 0.218 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 2.34e-01 0.131 0.11 0.218 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 5.57e-02 -0.189 0.0983 0.218 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 7.83e-01 0.0294 0.107 0.218 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0928 0.0947 0.218 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0934 0.105 0.213 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 7.49e-01 0.0227 0.0707 0.213 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 2.71e-01 -0.125 0.113 0.213 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 1.07e-01 0.14 0.0864 0.213 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 2.56e-01 0.122 0.107 0.213 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0669 0.11 0.213 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 9.88e-03 -0.312 0.119 0.218 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 7.67e-02 0.204 0.114 0.218 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 9.76e-02 0.149 0.0893 0.218 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 5.70e-01 0.0447 0.0784 0.218 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 6.05e-02 0.209 0.11 0.218 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 1.15e-02 0.306 0.12 0.218 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 1.50e-01 0.109 0.0751 0.218 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 7.88e-01 0.027 0.1 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 6.44e-01 0.0436 0.0942 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0642 0.0672 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 6.65e-01 0.0424 0.0978 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 2.16e-01 -0.127 0.102 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 3.62e-01 0.08 0.0876 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 6.75e-01 -0.042 0.1 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 7.54e-01 0.029 0.0926 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 1.75e-01 0.146 0.107 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 1.01e-02 -0.205 0.0789 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 3.02e-01 0.0707 0.0682 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 188524 sc-eQTL 1.76e-01 0.113 0.0834 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 3.48e-01 -0.107 0.114 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 5.68e-01 0.0463 0.0809 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 9.16e-01 0.0114 0.108 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0654 0.0962 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 3.79e-01 0.098 0.111 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 8.24e-01 0.023 0.103 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 1.79e-01 0.0679 0.0504 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0484 0.0825 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 8.00e-01 0.0188 0.0739 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0191 0.0841 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 7.26e-01 -0.033 0.0938 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 6.07e-01 -0.053 0.103 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 2.10e-01 0.0761 0.0606 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 7.73e-01 0.0319 0.111 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 3.16e-01 -0.09 0.0895 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 6.45e-01 0.0466 0.101 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 3.03e-01 -0.111 0.108 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -992765 sc-eQTL 4.25e-01 0.0738 0.0922 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -88935 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00139 0.0821 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 39944 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0796 0.0897 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 160952 sc-eQTL 1.02e-01 0.177 0.108 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 691973 sc-eQTL 8.25e-01 0.0182 0.0819 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 931489 sc-eQTL 8.54e-01 0.0181 0.0984 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -88022 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0732 0.0627 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 843529 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0748 0.108 0.218 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 -88935 pQTL 9.24e-34 0.138 0.0111 0.0 0.0 0.219
ENSG00000136044 APPL2 -88935 eQTL 0.000447 0.0789 0.0224 0.0 0.0 0.224
ENSG00000136051 WASHC4 39944 eQTL 2.9e-07 0.0588 0.0114 0.0 0.0 0.224


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136051 WASHC4 39944 0.000227 1.36e-05 2.44e-06 7.37e-06 1.62e-06 1.2e-05 1.57e-05 9.03e-07 9.91e-06 3.57e-06 1.25e-05 3.89e-06 4.26e-05 4.46e-06 3.75e-06 6.37e-06 4.98e-06 1.06e-05 2.61e-06 1.72e-06 3.25e-06 1.18e-05 9.05e-06 2.15e-06 1.06e-05 1.74e-06 2.72e-06 1.86e-06 1.33e-05 7.53e-06 1.08e-05 4.53e-07 5.21e-07 3.54e-06 2.02e-06 1.15e-06 9.06e-07 4.53e-07 3.01e-06 7.91e-07 4.63e-07 6.49e-05 2.39e-06 1.81e-08 6.09e-07 1.1e-06 8.93e-07 1.15e-07 1.85e-07
ENSG00000198431 \N 931489 2.6e-07 1.16e-07 3.49e-08 1.66e-07 1.03e-07 9.14e-08 1.31e-07 5.29e-08 1.33e-07 3.99e-08 1.55e-07 7.4e-08 1.2e-07 6.1e-08 4.48e-08 7.4e-08 5.2e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.32e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.04e-07 1.08e-07 9.43e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.21e-08 1.06e-07 4.32e-08 3.84e-08 8e-08 8.39e-08 3.96e-08 2.6e-08 1.42e-07 4.51e-08 0.0 1.15e-07 1.86e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08