Genes within 1Mb (chr12:105140825:TAATC:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 1.59e-02 -0.176 0.0726 0.25 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0179 0.0469 0.25 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 4.76e-01 0.0533 0.0746 0.25 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 2.80e-01 0.0975 0.0901 0.25 B L1
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 3.99e-01 -0.059 0.0698 0.25 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0465 0.0855 0.25 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 9.68e-01 0.00257 0.0644 0.25 B L1
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 8.16e-02 -0.178 0.102 0.25 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 2.45e-01 0.0804 0.069 0.25 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 2.66e-02 0.151 0.0674 0.25 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0163 0.0943 0.25 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0253 0.0626 0.25 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0812 0.076 0.25 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 1.74e-01 0.0717 0.0526 0.25 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00211 0.0826 0.25 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 1.75e-01 -0.107 0.0783 0.25 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 7.38e-04 0.293 0.0855 0.25 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0587 0.0794 0.25 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0439 0.0498 0.25 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0654 0.0867 0.25 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 2.31e-01 0.0418 0.0348 0.25 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 1.99e-01 0.126 0.0979 0.25 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 9.59e-02 -0.166 0.0991 0.25 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 6.59e-02 -0.148 0.0798 0.25 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0291 0.0682 0.25 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 6.84e-01 0.0249 0.061 0.25 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 5.90e-01 -0.046 0.0853 0.25 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0423 0.0941 0.25 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 7.11e-02 -0.0737 0.0406 0.25 DC L1
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0529 0.0965 0.25 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 1.01e-01 -0.156 0.0944 0.25 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 5.48e-04 -0.159 0.0454 0.25 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 7.58e-01 0.0253 0.082 0.25 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 9.23e-01 0.00683 0.0705 0.25 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0139 0.081 0.25 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 2.07e-01 -0.115 0.0907 0.25 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -999208 sc-eQTL 4.66e-01 0.0662 0.0906 0.249 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0617 0.0812 0.249 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 4.54e-01 0.0636 0.0848 0.249 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 1.80e-02 -0.245 0.103 0.249 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0817 0.0791 0.249 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 9.72e-01 0.00335 0.0962 0.249 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 3.89e-01 0.053 0.0614 0.249 NK L1
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 5.61e-01 0.0618 0.106 0.249 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 1.90e-02 -0.199 0.084 0.25 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0201 0.112 0.25 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0867 0.0784 0.25 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 9.53e-01 0.00487 0.0827 0.25 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 1.75e-01 -0.111 0.0814 0.25 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 6.04e-01 0.0339 0.0654 0.25 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 3.28e-01 0.0975 0.0994 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0431 0.116 0.242 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0983 0.11 0.242 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0278 0.0823 0.242 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 9.41e-01 0.00846 0.114 0.242 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0907 0.111 0.242 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 2.97e-01 0.123 0.117 0.242 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00794 0.111 0.242 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0946 0.111 0.242 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0486 0.0957 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0494 0.0827 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 8.55e-02 0.156 0.0903 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 1.85e-02 0.247 0.104 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0122 0.0861 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 2.88e-01 -0.113 0.106 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0682 0.0977 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 1.16e-02 -0.249 0.0976 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 3.30e-01 0.098 0.1 0.252 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 6.50e-02 0.153 0.0826 0.252 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00381 0.0976 0.252 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 2.02e-01 0.144 0.112 0.252 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 1.22e-01 -0.149 0.0958 0.252 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0589 0.103 0.252 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0684 0.0853 0.252 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 5.17e-02 -0.206 0.106 0.252 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 2.08e-01 -0.106 0.084 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 7.51e-01 0.0241 0.0758 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0029 0.0877 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 3.15e-01 -0.11 0.109 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0402 0.0855 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 2.76e-01 -0.116 0.106 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 1.04e-01 0.158 0.0964 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 8.58e-01 0.0192 0.107 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 2.93e-02 -0.197 0.0898 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0109 0.0821 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0537 0.0861 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 8.63e-01 0.0201 0.117 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0171 0.0841 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 2.72e-01 -0.118 0.107 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 2.51e-01 0.115 0.1 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0194 0.116 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 6.01e-01 0.0547 0.105 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 4.54e-02 0.2 0.0993 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 4.94e-01 0.0691 0.101 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 8.13e-01 0.0214 0.0902 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0788 0.108 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 2.09e-01 0.0765 0.0606 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 1.18e-01 0.168 0.107 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 9.32e-01 0.00612 0.0716 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00701 0.0706 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 8.23e-01 -0.023 0.103 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 8.42e-01 0.013 0.065 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 1.65e-01 -0.116 0.0833 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 7.67e-01 0.0273 0.0918 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 8.43e-01 0.0165 0.0833 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 1.71e-01 0.116 0.0847 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 1.21e-03 0.281 0.0855 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0248 0.108 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00325 0.0802 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0889 0.093 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 1.25e-03 0.228 0.0695 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0219 0.0961 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 2.35e-01 0.113 0.0948 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 8.26e-01 0.0237 0.107 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 9.97e-01 0.000419 0.104 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 8.57e-01 0.0169 0.0933 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 1.54e-01 -0.141 0.0984 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 3.70e-02 0.145 0.069 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 9.59e-01 0.00535 0.104 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 5.95e-01 -0.045 0.0845 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 3.36e-01 0.0903 0.0935 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 1.59e-01 -0.156 0.11 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 7.75e-02 -0.144 0.0812 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0771 0.105 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 5.19e-01 0.0458 0.0709 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 1.06e-01 0.172 0.106 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0882 0.0844 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 3.14e-04 0.326 0.089 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 8.49e-01 0.0188 0.0986 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 2.39e-01 0.0771 0.0653 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0539 0.102 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0446 0.0786 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 4.80e-01 0.0728 0.103 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0575 0.105 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 5.65e-02 0.202 0.105 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0259 0.113 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0378 0.0738 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 6.38e-01 0.0516 0.109 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 2.83e-01 0.107 0.0996 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 7.75e-01 0.0308 0.107 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0107 0.109 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 2.13e-01 0.14 0.112 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 1.11e-01 -0.175 0.109 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 7.28e-01 0.0373 0.107 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000976 0.108 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 8.98e-01 0.0108 0.0841 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 6.56e-01 0.0482 0.108 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 2.73e-01 -0.11 0.0999 0.251 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 9.88e-01 0.00173 0.118 0.251 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0774 0.106 0.251 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 2.48e-01 0.109 0.094 0.251 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00759 0.11 0.251 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0215 0.0794 0.251 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 3.98e-02 0.23 0.111 0.251 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -999208 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0327 0.089 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0441 0.0995 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 3.63e-01 0.0935 0.103 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 6.41e-02 -0.205 0.11 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 6.27e-01 0.0444 0.0913 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0407 0.107 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 7.55e-01 -0.03 0.0962 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 2.27e-01 0.128 0.106 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -999208 sc-eQTL 3.84e-01 0.0793 0.0909 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0101 0.084 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 8.27e-02 0.159 0.0912 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 5.99e-02 -0.207 0.109 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0282 0.0853 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0323 0.0962 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 7.58e-02 0.118 0.066 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 6.34e-01 0.0521 0.109 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -999208 sc-eQTL 4.98e-01 0.0694 0.102 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 5.26e-01 -0.066 0.104 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 1.66e-02 0.256 0.106 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 2.97e-01 -0.113 0.108 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 9.19e-01 0.00964 0.0949 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0884 0.116 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 5.21e-01 0.05 0.0778 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 8.86e-01 0.0151 0.105 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -999208 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00176 0.0962 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 8.27e-02 -0.174 0.1 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 2.37e-01 -0.115 0.0971 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 2.82e-01 -0.116 0.107 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 9.73e-02 -0.146 0.0875 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 5.89e-01 0.0552 0.102 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 8.05e-01 0.0177 0.0715 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0538 0.107 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 8.19e-02 0.25 0.142 0.241 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 9.26e-02 -0.206 0.121 0.241 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 6.86e-01 0.0531 0.131 0.241 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 2.08e-01 -0.163 0.128 0.241 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0159 0.116 0.241 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 5.96e-01 0.0621 0.117 0.241 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 8.98e-01 0.0116 0.0905 0.241 PB L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 3.32e-01 -0.137 0.141 0.241 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 4.65e-01 -0.077 0.105 0.25 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0955 0.117 0.25 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 1.74e-01 -0.122 0.0892 0.25 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0151 0.101 0.25 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 3.49e-03 -0.252 0.0852 0.25 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 1.76e-01 0.101 0.0745 0.25 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0516 0.113 0.25 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0137 0.093 0.25 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 2.25e-04 0.376 0.1 0.25 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0677 0.104 0.25 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 6.91e-02 -0.134 0.0732 0.25 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 5.24e-01 0.0677 0.106 0.25 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 3.69e-01 0.0604 0.0671 0.25 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 7.01e-01 0.0412 0.107 0.25 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 6.94e-03 -0.281 0.103 0.249 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 2.87e-02 -0.204 0.0926 0.249 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 6.47e-01 0.0375 0.0818 0.249 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 8.50e-02 0.125 0.0721 0.249 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0813 0.0972 0.249 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 3.10e-01 -0.105 0.103 0.249 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 6.67e-01 -0.034 0.0787 0.249 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00489 0.0955 0.249 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 2.00e-01 -0.133 0.103 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 6.02e-07 -0.259 0.0503 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0789 0.0867 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0281 0.0788 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 6.62e-01 0.0383 0.0875 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0313 0.0963 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0418 0.112 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0583 0.0777 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 7.63e-02 0.164 0.0923 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00621 0.0849 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 8.73e-01 0.0154 0.0966 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 6.51e-02 -0.176 0.0947 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 5.86e-02 -0.215 0.113 0.258 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 7.58e-01 0.0415 0.135 0.258 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 1.00e-01 -0.22 0.133 0.258 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 1.02e-01 -0.181 0.11 0.258 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0507 0.131 0.258 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 6.31e-01 0.0511 0.106 0.258 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 8.55e-01 0.0238 0.13 0.258 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0785 0.107 0.251 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0519 0.0906 0.251 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0921 0.11 0.251 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 2.46e-01 0.115 0.0989 0.251 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0261 0.107 0.251 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 9.20e-01 0.00956 0.0949 0.251 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 1.18e-01 -0.154 0.098 0.249 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0454 0.0664 0.249 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 8.29e-01 0.0231 0.107 0.249 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 6.32e-03 -0.222 0.0803 0.249 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 4.29e-01 -0.08 0.101 0.249 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 4.44e-01 -0.079 0.103 0.249 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 7.97e-01 0.0289 0.112 0.254 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 1.17e-01 -0.167 0.106 0.254 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 7.81e-02 -0.146 0.0821 0.254 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 4.15e-01 -0.059 0.0721 0.254 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0418 0.103 0.254 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 5.81e-01 0.0621 0.112 0.254 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0377 0.0695 0.254 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 9.07e-01 0.0108 0.0921 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0193 0.0913 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 9.59e-01 0.00332 0.0653 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 4.61e-01 0.0699 0.0947 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 1.51e-03 0.311 0.0968 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 1.16e-01 -0.133 0.0845 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0962 0.0967 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 6.08e-01 -0.046 0.0897 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 3.02e-03 -0.307 0.102 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 5.49e-02 -0.149 0.077 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 8.10e-01 -0.016 0.0662 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 182081 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0451 0.081 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0185 0.11 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0492 0.0783 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0814 0.104 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 2.55e-02 0.207 0.0921 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00767 0.108 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 2.40e-01 -0.12 0.102 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 5.66e-05 -0.197 0.048 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 6.58e-01 0.036 0.0814 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0364 0.0729 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 9.17e-01 0.00868 0.083 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0759 0.0924 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 7.14e-02 -0.181 0.0998 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0593 0.0593 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0846 0.108 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0566 0.0877 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0503 0.0988 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0742 0.106 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -999208 sc-eQTL 4.24e-01 0.0729 0.091 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -95378 sc-eQTL 2.72e-01 -0.089 0.0808 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 33501 sc-eQTL 3.61e-01 0.081 0.0885 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 154509 sc-eQTL 7.37e-02 -0.191 0.106 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 685530 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0924 0.0806 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 925046 sc-eQTL 9.54e-01 0.00565 0.0971 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 sc-eQTL 3.01e-01 0.0642 0.0619 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 837086 sc-eQTL 9.54e-01 0.00607 0.106 0.248 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136010 ALDH1L2 33182 eQTL 7.64e-06 0.137 0.0305 0.0 0.0 0.257
ENSG00000136044 APPL2 -95378 pQTL 1.25e-12 -0.0804 0.0112 0.0 0.0 0.262
ENSG00000136044 APPL2 -95378 eQTL 4.41e-05 -0.089 0.0217 0.0 0.0 0.257
ENSG00000136051 WASHC4 33501 eQTL 0.000316 -0.0402 0.0111 0.0 0.0 0.257
ENSG00000151131 C12orf45 154509 eQTL 0.00703 0.0509 0.0189 0.0 0.0 0.257
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 eQTL 2.39e-09 -0.121 0.0201 0.0011 0.0 0.257


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136010 ALDH1L2 33182 0.000127 7.84e-05 9.9e-06 1.81e-05 5.1e-06 2.46e-05 6.4e-05 4.94e-06 4e-05 1.44e-05 5.66e-05 2.12e-05 9.49e-05 1.75e-05 8.64e-06 2.5e-05 2.62e-05 2.46e-05 7.5e-06 6.77e-06 1.94e-05 4.48e-05 4.78e-05 1.06e-05 5.75e-05 9.82e-06 1.73e-05 1.31e-05 5.29e-05 2.57e-05 2.84e-05 1.55e-06 3.8e-06 7.83e-06 1.36e-05 5.78e-06 2.82e-06 3.12e-06 4.54e-06 3.57e-06 1.92e-06 8.72e-05 6.92e-06 2.86e-07 2.21e-06 4.25e-06 4.54e-06 1.42e-06 1.5e-06
ENSG00000198431 \N 925046 2.77e-07 1.3e-07 3.35e-08 1.82e-07 1.02e-07 1e-07 1.9e-07 5.24e-08 1.45e-07 4.24e-08 2.18e-07 8.02e-08 3.4e-07 6.38e-08 4.89e-08 7.37e-08 4.94e-08 1.14e-07 5.22e-08 2.85e-08 1.04e-07 1.26e-07 1.34e-07 4.99e-08 1.65e-07 1.09e-07 1.12e-07 8.71e-08 1.08e-07 1e-07 1.08e-07 3.29e-08 2.75e-08 8.65e-08 8.93e-08 4.14e-08 4.7e-08 8.48e-08 8.22e-08 3.8e-08 3.31e-08 1.62e-07 4.23e-08 0.0 1.15e-07 1.7e-08 1.45e-07 4.96e-09 4.72e-08
ENSG00000235162 C12orf75 -94465 4.71e-05 2.85e-05 4.28e-06 1.02e-05 2.54e-06 1.07e-05 2.7e-05 2.18e-06 1.41e-05 4.92e-06 1.82e-05 5.59e-06 3.45e-05 5.14e-06 4.13e-06 8.68e-06 8.25e-06 9.66e-06 2.98e-06 3.14e-06 6.67e-06 1.39e-05 1.81e-05 4.02e-06 1.87e-05 3.8e-06 7.19e-06 4.97e-06 2.04e-05 1.14e-05 8.88e-06 1.09e-06 1.67e-06 3.89e-06 6.13e-06 2.9e-06 1.61e-06 1.98e-06 2.26e-06 1.04e-06 9.34e-07 3.49e-05 3.47e-06 1.79e-07 7.75e-07 1.72e-06 1.72e-06 7.01e-07 5.7e-07