logo

Genes within 1Mb (chr12:105063825:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 1.93e-01 0.232 0.177 0.051 B L1
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 1.59e-02 -0.412 0.169 0.051 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 8.43e-01 0.0289 0.146 0.051 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 3.17e-02 0.199 0.0919 0.051 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 105081 sc-eQTL 1.53e-01 -0.211 0.147 0.051 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 9.29e-01 0.0159 0.179 0.051 B L1
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 8.59e-01 0.0247 0.139 0.051 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 8.70e-01 0.0278 0.169 0.051 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 8.26e-01 0.0281 0.128 0.051 B L1
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 3.39e-01 0.194 0.202 0.051 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 6.57e-01 0.0717 0.161 0.051 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00476 0.139 0.051 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 1.31e-01 -0.205 0.136 0.051 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 1.72e-01 0.183 0.134 0.051 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 7.64e-01 0.0558 0.186 0.051 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 8.82e-02 -0.21 0.122 0.051 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0253 0.15 0.051 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0633 0.104 0.051 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 7.65e-01 0.0488 0.163 0.051 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 4.26e-01 0.142 0.178 0.051 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 5.52e-01 0.0997 0.167 0.051 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 7.76e-02 -0.273 0.154 0.051 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 8.97e-01 0.0224 0.173 0.051 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 1.68e-01 0.216 0.156 0.051 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0972 0.0983 0.051 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 1.43e-01 0.251 0.171 0.051 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 6.82e-01 0.0282 0.0689 0.051 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 5.59e-01 -0.114 0.194 0.051 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 9.02e-01 0.0232 0.188 0.051 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 3.37e-01 0.169 0.175 0.051 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 4.10e-01 0.15 0.181 0.051 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 2.90e-01 0.0946 0.0892 0.051 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 6.23e-01 0.0773 0.157 0.051 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 3.61e-01 -0.123 0.135 0.051 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 2.74e-01 -0.17 0.154 0.051 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 6.00e-01 0.0913 0.174 0.051 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 4.48e-01 0.139 0.183 0.052 NK L1
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 6.28e-01 0.0819 0.169 0.052 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 5.73e-01 0.0887 0.157 0.052 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 9.29e-02 -0.275 0.163 0.052 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 7.80e-01 0.0564 0.202 0.052 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0561 0.153 0.052 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 1.55e-01 0.264 0.185 0.052 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 3.69e-01 0.107 0.119 0.052 NK L1
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 3.54e-01 0.19 0.205 0.052 NK L1
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 8.63e-01 0.0326 0.189 0.051 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0113 0.171 0.051 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0462 0.164 0.051 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 6.53e-01 0.0969 0.215 0.051 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 2.13e-01 0.189 0.151 0.051 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 4.61e-01 -0.117 0.159 0.051 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0575 0.157 0.051 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 2.48e-01 0.146 0.126 0.051 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 1.64e-01 -0.267 0.191 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 2.25e-01 0.263 0.216 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 3.97e-01 0.181 0.213 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0532 0.197 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0299 0.162 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 105081 sc-eQTL 5.46e-02 -0.365 0.189 0.052 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 3.30e-02 0.467 0.218 0.052 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 5.50e-01 0.113 0.188 0.052 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 3.82e-01 -0.176 0.2 0.052 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 6.29e-01 0.0807 0.167 0.052 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 4.68e-01 -0.151 0.208 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 1.38e-01 0.315 0.212 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 1.23e-03 -0.646 0.197 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 3.77e-01 -0.147 0.166 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 3.18e-01 0.149 0.149 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 105081 sc-eQTL 3.32e-02 -0.367 0.171 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00932 0.215 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0124 0.169 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 8.32e-01 0.0447 0.21 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 4.05e-01 0.16 0.191 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 3.14e-01 0.213 0.211 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0463 0.22 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 5.68e-01 -0.122 0.214 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 6.82e-01 0.0728 0.177 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 5.53e-02 0.307 0.159 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 105081 sc-eQTL 7.71e-01 -0.049 0.168 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 3.91e-01 -0.195 0.228 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 7.70e-01 0.0481 0.164 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0961 0.21 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0219 0.197 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 3.58e-01 0.208 0.226 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 9.16e-01 0.0214 0.202 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 6.42e-01 0.0937 0.201 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 8.53e-01 0.0367 0.198 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 3.40e-01 0.181 0.19 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0987 0.191 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 2.01e-01 -0.219 0.17 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 1.63e-01 -0.286 0.204 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 3.48e-02 -0.243 0.114 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 5.41e-01 -0.125 0.204 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 2.10e-01 0.22 0.175 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0585 0.151 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 1.01e-01 -0.234 0.142 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 7.51e-01 0.0448 0.141 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 5.16e-01 0.133 0.205 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 6.14e-02 -0.242 0.129 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 2.13e-01 0.208 0.166 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 3.46e-01 0.173 0.183 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 4.67e-01 0.121 0.166 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 7.94e-01 0.0533 0.204 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0163 0.183 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 1.24e-01 -0.254 0.164 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 2.14e-01 0.211 0.17 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0124 0.21 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 3.36e-01 -0.15 0.155 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 2.60e-01 -0.204 0.18 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 1.22e-01 -0.214 0.138 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 4.97e-01 -0.127 0.187 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0552 0.211 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 1.38e-01 -0.297 0.2 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 1.30e-01 -0.283 0.186 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 3.90e-01 0.182 0.211 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 2.78e-01 -0.222 0.204 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 7.07e-01 -0.069 0.184 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00556 0.194 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 3.35e-01 -0.132 0.137 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 8.09e-01 0.0494 0.204 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 7.98e-01 0.0533 0.208 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 1.32e-01 0.295 0.195 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 7.58e-01 0.0512 0.166 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0772 0.184 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 7.58e-01 0.0669 0.217 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00845 0.16 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 9.81e-01 0.00485 0.206 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 5.64e-01 0.0803 0.139 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 9.00e-02 -0.353 0.207 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 9.14e-01 0.0227 0.211 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 3.03e-01 0.201 0.195 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 4.95e-02 -0.333 0.168 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 6.86e-01 0.0746 0.184 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 1.32e-01 0.298 0.197 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 1.37e-01 -0.196 0.131 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 1.02e-01 0.334 0.204 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 4.02e-01 0.133 0.158 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00316 0.207 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 5.77e-01 0.119 0.212 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 3.19e-01 0.213 0.213 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 9.44e-01 0.015 0.212 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 4.85e-01 0.149 0.213 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 8.89e-01 0.0319 0.227 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0216 0.148 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0752 0.22 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 3.01e-01 0.207 0.2 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 9.50e-01 0.0135 0.216 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0561 0.207 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 3.85e-01 0.172 0.198 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 9.38e-01 0.0165 0.212 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 7.24e-01 0.0777 0.219 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00824 0.214 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0524 0.209 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 8.86e-02 0.355 0.208 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 2.24e-01 0.199 0.163 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 7.97e-01 0.054 0.21 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 7.36e-01 0.0674 0.2 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 7.91e-01 0.0537 0.203 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0214 0.19 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 3.78e-01 -0.173 0.196 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 6.46e-01 0.0979 0.213 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0673 0.175 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 7.07e-01 0.0773 0.205 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0906 0.184 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 7.06e-01 0.0768 0.203 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 3.16e-01 -0.203 0.201 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 1.37e-01 0.268 0.179 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 8.47e-01 0.0315 0.163 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 6.70e-02 -0.325 0.177 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 4.32e-01 0.168 0.214 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 2.38e-01 -0.195 0.165 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 2.75e-01 0.203 0.186 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 5.95e-01 0.0686 0.129 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 1.40e-01 0.312 0.211 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 3.82e-02 0.421 0.202 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0717 0.207 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 2.86e-01 0.205 0.192 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 6.84e-01 0.0811 0.199 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 1.92e-01 -0.261 0.199 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 2.62e-01 0.197 0.175 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 2.22e-02 0.489 0.212 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0695 0.144 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0301 0.194 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 2.62e-01 0.23 0.204 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 5.76e-01 0.0996 0.178 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 2.44e-01 0.225 0.192 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 3.42e-01 -0.178 0.186 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0926 0.206 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 8.83e-01 0.0249 0.169 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 3.64e-01 0.177 0.195 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 3.45e-01 0.13 0.137 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 9.85e-01 0.00388 0.206 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 5.35e-01 0.119 0.192 0.05 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 5.56e-01 -0.117 0.198 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0478 0.194 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 8.55e-01 0.0393 0.216 0.05 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 2.47e-01 0.191 0.164 0.05 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 5.12e-01 -0.122 0.186 0.05 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 8.57e-01 0.0288 0.16 0.05 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 4.43e-01 0.106 0.138 0.05 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 3.09e-01 0.212 0.208 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 3.33e-01 -0.21 0.217 0.051 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 6.45e-01 0.0889 0.193 0.051 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 2.91e-01 0.192 0.181 0.051 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 5.02e-01 -0.136 0.202 0.051 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0928 0.203 0.051 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 8.84e-01 -0.021 0.144 0.051 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 3.27e-01 -0.204 0.207 0.051 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0943 0.131 0.051 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 1.05e-01 -0.339 0.208 0.051 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0795 0.196 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0188 0.2 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 7.67e-01 0.0586 0.198 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0279 0.102 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 9.24e-01 0.016 0.166 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 5.60e-01 -0.088 0.151 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 5.17e-01 -0.109 0.167 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 9.80e-01 0.00454 0.184 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 3.00e-01 0.211 0.203 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 4.46e-01 0.144 0.189 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 7.72e-01 0.0614 0.212 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 1.65e-02 0.352 0.146 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0418 0.177 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 2.41e-01 -0.189 0.161 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 2.68e-01 -0.203 0.183 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 2.18e-01 0.223 0.181 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 4.81e-01 0.165 0.234 0.055 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 1.31e-01 0.337 0.222 0.055 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 5.79e-01 0.121 0.217 0.055 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 8.71e-01 0.0415 0.256 0.055 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 5.14e-01 0.167 0.255 0.055 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0205 0.211 0.055 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0857 0.25 0.055 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 5.46e-01 0.122 0.202 0.055 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 3.01e-01 -0.256 0.247 0.055 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0308 0.2 0.053 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0113 0.209 0.053 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 6.25e-01 0.0991 0.203 0.053 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 6.90e-01 0.0685 0.171 0.053 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0607 0.207 0.053 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0254 0.187 0.053 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 1.04e-01 0.328 0.2 0.053 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 4.29e-01 0.142 0.179 0.053 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 8.94e-01 0.0274 0.205 0.052 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 5.69e-01 0.118 0.206 0.052 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 5.03e-01 0.131 0.196 0.052 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 2.19e-01 0.162 0.132 0.052 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 9.45e-02 0.353 0.21 0.052 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 7.53e-01 0.0512 0.163 0.052 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 1.56e-02 -0.483 0.198 0.052 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 3.60e-01 -0.188 0.205 0.052 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 2.37e-01 -0.257 0.217 0.054 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 8.89e-01 0.0318 0.227 0.054 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 3.44e-01 0.2 0.211 0.054 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 1.80e-01 -0.269 0.2 0.054 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 105081 sc-eQTL 3.12e-01 0.158 0.156 0.054 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 6.82e-01 0.056 0.136 0.054 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0655 0.194 0.054 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 1.63e-01 -0.296 0.211 0.054 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 6.90e-01 0.0525 0.131 0.054 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 1.07e-01 -0.28 0.173 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 2.35e-01 0.259 0.217 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 1.29e-01 -0.303 0.199 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0969 0.188 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 5.43e-01 0.0819 0.134 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 105081 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0705 0.195 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 3.49e-02 0.429 0.202 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 4.31e-01 0.138 0.175 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 2.48e-01 -0.23 0.199 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0403 0.185 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 5.82e-01 0.118 0.215 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 1.71e-01 0.29 0.211 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 2.55e-02 -0.43 0.191 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0946 0.154 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 9.26e-02 0.22 0.13 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 105081 sc-eQTL 6.65e-02 -0.294 0.159 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 5.84e-01 -0.12 0.218 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00884 0.155 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 8.75e-01 0.0325 0.207 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 6.17e-01 0.0924 0.184 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 1.98e-01 0.274 0.213 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 9.62e-01 0.00963 0.201 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 5.25e-01 0.119 0.187 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 6.51e-01 0.0883 0.195 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 1.36e-01 0.142 0.0949 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0112 0.156 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 4.50e-01 -0.105 0.139 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 3.14e-01 -0.16 0.158 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 5.84e-01 0.0969 0.177 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0117 0.193 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 6.98e-01 0.0737 0.19 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 3.76e-01 0.168 0.19 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 3.64e-01 0.102 0.112 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 3.50e-01 0.191 0.204 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0429 0.166 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0188 0.187 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 5.84e-01 0.11 0.2 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 999294 sc-eQTL 6.46e-01 0.0867 0.189 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB 925584 sc-eQTL 6.35e-01 0.0791 0.166 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -172378 sc-eQTL 3.23e-01 0.155 0.156 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 -43499 sc-eQTL 9.85e-02 -0.282 0.17 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 77509 sc-eQTL 8.37e-01 0.0426 0.206 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 608530 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0279 0.156 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 sc-eQTL 8.05e-02 0.327 0.186 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 sc-eQTL 4.14e-01 0.0979 0.12 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 760086 sc-eQTL 4.68e-01 0.149 0.205 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136052 SLC41A2 105081 eQTL 0.000416 -0.265 0.0748 0.0 0.0 0.0608
ENSG00000198431 TXNRD1 848046 pQTL 0.00798 -0.0737 0.0278 0.00165 0.0 0.0625
ENSG00000235162 C12orf75 -171465 eQTL 0.0101 0.0946 0.0367 0.0 0.0 0.0608

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136052 SLC41A2 105081 5.07e-06 5.79e-06 6.57e-07 3.4e-06 1.47e-06 1.52e-06 7.61e-06 1.24e-06 4.54e-06 3.06e-06 7.56e-06 2.94e-06 9.33e-06 2.18e-06 9e-07 4e-06 2.76e-06 3.95e-06 1.63e-06 1.64e-06 2.65e-06 5.46e-06 4.73e-06 1.96e-06 8.97e-06 2.16e-06 2.55e-06 1.71e-06 5.8e-06 6.2e-06 2.91e-06 4.84e-07 7.77e-07 2.34e-06 2e-06 1.32e-06 1.11e-06 5.55e-07 9.34e-07 7.13e-07 8.22e-07 7.35e-06 5.26e-07 1.59e-07 7.32e-07 1.1e-06 1.01e-06 6.84e-07 5.12e-07
ENSG00000213442 \N 798516 2.76e-07 1.35e-07 5.03e-08 2.09e-07 9.8e-08 8.21e-08 1.73e-07 5.75e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.63e-07 1.05e-07 1.71e-07 7.64e-08 6.25e-08 7.5e-08 4.24e-08 1.44e-07 6.75e-08 4.95e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.5e-07 2.83e-08 1.65e-07 1.22e-07 1.18e-07 9.92e-08 1.22e-07 9.88e-08 1.08e-07 3.72e-08 3.59e-08 9.52e-08 3.71e-08 2.95e-08 5.42e-08 8.25e-08 6.76e-08 3.67e-08 5.53e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.1e-08 3.41e-08 1.8e-08 1.15e-07 1.93e-09 4.99e-08