logo

Genes within 1Mb (chr12:104478265:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000111696 NT5DC3 637031 sc-eQTL 4.95e-01 0.137 0.2 0.052 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 413734 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0352 0.215 0.052 DC L1
ENSG00000120837 NFYB 340024 sc-eQTL 3.06e-03 0.564 0.188 0.052 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -757938 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0281 0.196 0.052 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 -629059 sc-eQTL 9.55e-01 0.00894 0.158 0.052 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 -480479 sc-eQTL 7.87e-01 0.0362 0.134 0.052 DC L1
ENSG00000139372 TDG 512443 sc-eQTL 7.17e-01 0.0713 0.196 0.052 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 -508051 sc-eQTL 6.09e-01 0.0615 0.12 0.052 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 548158 sc-eQTL 2.29e-02 0.292 0.127 0.052 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 22970 sc-eQTL 1.46e-01 0.243 0.167 0.052 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 982255 sc-eQTL 3.43e-02 0.356 0.167 0.052 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 262486 sc-eQTL 7.21e-01 0.0662 0.185 0.052 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 512557 sc-eQTL 4.55e-01 0.152 0.203 0.052 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -757025 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0559 0.0803 0.052 DC L1
ENSG00000255150 EID3 174526 sc-eQTL 2.62e-01 0.212 0.189 0.052 DC L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000111696 NT5DC3 637031 sc-eQTL 2.38e-01 -0.229 0.194 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 413734 sc-eQTL 3.91e-01 -0.189 0.22 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB 340024 sc-eQTL 3.73e-01 0.196 0.219 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -757938 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00892 0.216 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 -629059 sc-eQTL 9.09e-01 0.0237 0.207 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG 512443 sc-eQTL 1.74e-01 -0.313 0.23 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 -508051 sc-eQTL 2.31e-01 -0.25 0.208 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 548158 sc-eQTL 4.60e-01 -0.145 0.196 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 22970 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0149 0.186 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 982255 sc-eQTL 5.43e-01 0.122 0.2 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 262486 sc-eQTL 3.23e-01 -0.221 0.223 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 512557 sc-eQTL 3.78e-02 0.448 0.214 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -757025 sc-eQTL 1.26e-01 0.192 0.125 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 174526 sc-eQTL 4.40e-01 -0.172 0.222 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 413734 sc-eQTL 2.52e-01 -0.252 0.219 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB 340024 sc-eQTL 4.12e-01 0.183 0.223 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -757938 sc-eQTL 4.10e-01 0.171 0.207 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 -629059 sc-eQTL 6.11e-01 -0.109 0.214 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG 512443 sc-eQTL 3.88e-02 0.453 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 -508051 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0346 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 548158 sc-eQTL 9.56e-01 -0.012 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 22970 sc-eQTL 4.52e-01 -0.142 0.189 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 262486 sc-eQTL 2.83e-01 0.248 0.231 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 512557 sc-eQTL 1.22e-01 -0.309 0.199 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -757025 sc-eQTL 8.93e-01 -0.021 0.155 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 174526 sc-eQTL 2.12e-01 0.261 0.208 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111696 NT5DC3 637031 sc-eQTL 3.43e-01 -0.228 0.239 0.052 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 413734 sc-eQTL 2.48e-01 -0.237 0.204 0.052 PB L2
ENSG00000120837 NFYB 340024 sc-eQTL 5.59e-01 -0.14 0.239 0.052 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -757938 sc-eQTL 4.82e-01 -0.182 0.258 0.052 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 -629059 sc-eQTL 5.69e-01 -0.126 0.22 0.052 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 -480479 sc-eQTL 4.11e-01 -0.193 0.234 0.052 PB L2
ENSG00000139372 TDG 512443 sc-eQTL 4.80e-01 -0.173 0.244 0.052 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 -508051 sc-eQTL 8.82e-01 0.0345 0.232 0.052 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 548158 sc-eQTL 4.66e-01 0.082 0.112 0.052 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 22970 sc-eQTL 5.62e-01 -0.121 0.208 0.052 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 982255 sc-eQTL 1.52e-01 0.281 0.195 0.052 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 262486 sc-eQTL 2.48e-01 0.242 0.209 0.052 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 512557 sc-eQTL 4.81e-01 0.173 0.245 0.052 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -757025 sc-eQTL 4.54e-01 0.122 0.162 0.052 PB L2
ENSG00000255150 EID3 174526 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0853 0.254 0.052 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 637031 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0554 0.222 0.054 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 413734 sc-eQTL 3.68e-01 0.174 0.194 0.054 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB 340024 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0982 0.207 0.054 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -757938 sc-eQTL 2.89e-01 -0.214 0.201 0.054 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 -629059 sc-eQTL 6.14e-01 0.0908 0.18 0.054 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 -480479 sc-eQTL 2.08e-01 0.197 0.156 0.054 cDC L2
ENSG00000139372 TDG 512443 sc-eQTL 6.56e-01 0.0952 0.213 0.054 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 -508051 sc-eQTL 2.12e-01 0.174 0.139 0.054 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 548158 sc-eQTL 5.41e-01 0.116 0.189 0.054 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 22970 sc-eQTL 4.10e-01 0.154 0.186 0.054 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 982255 sc-eQTL 2.88e-01 0.15 0.141 0.054 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 262486 sc-eQTL 7.29e-01 0.0685 0.198 0.054 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 512557 sc-eQTL 5.17e-01 -0.128 0.197 0.054 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -757025 sc-eQTL 6.25e-02 -0.28 0.149 0.054 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 174526 sc-eQTL 2.82e-01 0.197 0.182 0.054 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 637031 sc-eQTL 5.66e-01 0.134 0.232 0.055 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 413734 sc-eQTL 8.44e-01 0.0475 0.24 0.055 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB 340024 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0539 0.23 0.055 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -757938 sc-eQTL 5.55e-01 -0.132 0.223 0.055 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 -629059 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0486 0.263 0.055 gdT L2
ENSG00000139372 TDG 512443 sc-eQTL 3.17e-01 -0.232 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 -508051 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0269 0.262 0.055 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 548158 sc-eQTL 4.25e-01 -0.195 0.244 0.055 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 22970 sc-eQTL 5.87e-01 -0.118 0.216 0.055 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 982255 sc-eQTL 5.73e-01 0.129 0.229 0.055 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 262486 sc-eQTL 3.32e-01 0.249 0.256 0.055 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 512557 sc-eQTL 7.84e-01 0.0639 0.233 0.055 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -757025 sc-eQTL 1.18e-01 -0.323 0.206 0.055 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 174526 sc-eQTL 3.93e-01 0.217 0.253 0.055 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 637031 sc-eQTL 2.00e-01 0.252 0.196 0.051 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 413734 sc-eQTL 7.54e-02 -0.37 0.207 0.051 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB 340024 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0994 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -757938 sc-eQTL 9.60e-01 0.0107 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 -629059 sc-eQTL 5.01e-01 -0.12 0.178 0.051 intMono L2
ENSG00000139372 TDG 512443 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0578 0.204 0.051 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 -508051 sc-eQTL 3.70e-01 0.194 0.216 0.051 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 548158 sc-eQTL 7.25e-01 0.064 0.182 0.051 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 22970 sc-eQTL 5.16e-01 0.127 0.195 0.051 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 262486 sc-eQTL 1.69e-01 -0.289 0.209 0.051 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 512557 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0227 0.186 0.051 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -757025 sc-eQTL 5.40e-02 0.359 0.185 0.051 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 637031 sc-eQTL 7.33e-01 0.0665 0.195 0.051 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 413734 sc-eQTL 2.76e-01 -0.24 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB 340024 sc-eQTL 1.62e-02 0.548 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -757938 sc-eQTL 4.72e-01 0.154 0.214 0.051 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 -629059 sc-eQTL 4.45e-01 -0.156 0.203 0.051 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 -480479 sc-eQTL 6.46e-01 0.0729 0.158 0.051 pDC L2
ENSG00000139372 TDG 512443 sc-eQTL 8.98e-01 0.0252 0.196 0.051 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 -508051 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0137 0.138 0.051 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 548158 sc-eQTL 7.53e-03 0.405 0.149 0.051 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 22970 sc-eQTL 4.16e-01 0.16 0.196 0.051 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 982255 sc-eQTL 1.30e-01 0.302 0.198 0.051 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 262486 sc-eQTL 3.43e-01 0.204 0.214 0.051 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 512557 sc-eQTL 3.83e-01 0.166 0.19 0.051 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -757025 sc-eQTL 9.40e-01 -0.01 0.133 0.051 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 174526 sc-eQTL 6.28e-01 0.0854 0.176 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139372 TDG 512443 eQTL 0.0307 -0.0858 0.0396 0.0 0.0 0.0505
ENSG00000171310 CHST11 22970 eQTL 0.000498 -0.116 0.0331 0.0 0.0 0.0505

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina