logo

Genes within 1Mb (chr12:104476281:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000111696 NT5DC3 635047 sc-eQTL 4.95e-01 0.137 0.2 0.052 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 411750 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0352 0.215 0.052 DC L1
ENSG00000120837 NFYB 338040 sc-eQTL 3.06e-03 0.564 0.188 0.052 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -759922 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0281 0.196 0.052 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 -631043 sc-eQTL 9.55e-01 0.00894 0.158 0.052 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 -482463 sc-eQTL 7.87e-01 0.0362 0.134 0.052 DC L1
ENSG00000139372 TDG 510459 sc-eQTL 7.17e-01 0.0713 0.196 0.052 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 -510035 sc-eQTL 6.09e-01 0.0615 0.12 0.052 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 546174 sc-eQTL 2.29e-02 0.292 0.127 0.052 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 20986 sc-eQTL 1.46e-01 0.243 0.167 0.052 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 980271 sc-eQTL 3.43e-02 0.356 0.167 0.052 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 260502 sc-eQTL 7.21e-01 0.0662 0.185 0.052 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 510573 sc-eQTL 4.55e-01 0.152 0.203 0.052 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -759009 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0559 0.0803 0.052 DC L1
ENSG00000255150 EID3 172542 sc-eQTL 2.62e-01 0.212 0.189 0.052 DC L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000111696 NT5DC3 635047 sc-eQTL 2.38e-01 -0.229 0.194 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 411750 sc-eQTL 3.91e-01 -0.189 0.22 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB 338040 sc-eQTL 3.73e-01 0.196 0.219 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -759922 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00892 0.216 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 -631043 sc-eQTL 9.09e-01 0.0237 0.207 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG 510459 sc-eQTL 1.74e-01 -0.313 0.23 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 -510035 sc-eQTL 2.31e-01 -0.25 0.208 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 546174 sc-eQTL 4.60e-01 -0.145 0.196 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 20986 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0149 0.186 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 980271 sc-eQTL 5.43e-01 0.122 0.2 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 260502 sc-eQTL 3.23e-01 -0.221 0.223 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 510573 sc-eQTL 3.78e-02 0.448 0.214 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -759009 sc-eQTL 1.26e-01 0.192 0.125 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 172542 sc-eQTL 4.40e-01 -0.172 0.222 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 411750 sc-eQTL 2.52e-01 -0.252 0.219 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB 338040 sc-eQTL 4.12e-01 0.183 0.223 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -759922 sc-eQTL 4.10e-01 0.171 0.207 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 -631043 sc-eQTL 6.11e-01 -0.109 0.214 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG 510459 sc-eQTL 3.88e-02 0.453 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 -510035 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0346 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 546174 sc-eQTL 9.56e-01 -0.012 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 20986 sc-eQTL 4.52e-01 -0.142 0.189 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 260502 sc-eQTL 2.83e-01 0.248 0.231 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 510573 sc-eQTL 1.22e-01 -0.309 0.199 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -759009 sc-eQTL 8.93e-01 -0.021 0.155 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 172542 sc-eQTL 2.12e-01 0.261 0.208 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111696 NT5DC3 635047 sc-eQTL 3.43e-01 -0.228 0.239 0.052 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 411750 sc-eQTL 2.48e-01 -0.237 0.204 0.052 PB L2
ENSG00000120837 NFYB 338040 sc-eQTL 5.59e-01 -0.14 0.239 0.052 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -759922 sc-eQTL 4.82e-01 -0.182 0.258 0.052 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 -631043 sc-eQTL 5.69e-01 -0.126 0.22 0.052 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 -482463 sc-eQTL 4.11e-01 -0.193 0.234 0.052 PB L2
ENSG00000139372 TDG 510459 sc-eQTL 4.80e-01 -0.173 0.244 0.052 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 -510035 sc-eQTL 8.82e-01 0.0345 0.232 0.052 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 546174 sc-eQTL 4.66e-01 0.082 0.112 0.052 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 20986 sc-eQTL 5.62e-01 -0.121 0.208 0.052 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 980271 sc-eQTL 1.52e-01 0.281 0.195 0.052 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 260502 sc-eQTL 2.48e-01 0.242 0.209 0.052 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 510573 sc-eQTL 4.81e-01 0.173 0.245 0.052 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -759009 sc-eQTL 4.54e-01 0.122 0.162 0.052 PB L2
ENSG00000255150 EID3 172542 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0853 0.254 0.052 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 635047 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0554 0.222 0.054 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 411750 sc-eQTL 3.68e-01 0.174 0.194 0.054 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB 338040 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0982 0.207 0.054 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -759922 sc-eQTL 2.89e-01 -0.214 0.201 0.054 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 -631043 sc-eQTL 6.14e-01 0.0908 0.18 0.054 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 -482463 sc-eQTL 2.08e-01 0.197 0.156 0.054 cDC L2
ENSG00000139372 TDG 510459 sc-eQTL 6.56e-01 0.0952 0.213 0.054 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 -510035 sc-eQTL 2.12e-01 0.174 0.139 0.054 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 546174 sc-eQTL 5.41e-01 0.116 0.189 0.054 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 20986 sc-eQTL 4.10e-01 0.154 0.186 0.054 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 980271 sc-eQTL 2.88e-01 0.15 0.141 0.054 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 260502 sc-eQTL 7.29e-01 0.0685 0.198 0.054 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 510573 sc-eQTL 5.17e-01 -0.128 0.197 0.054 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -759009 sc-eQTL 6.25e-02 -0.28 0.149 0.054 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 172542 sc-eQTL 2.82e-01 0.197 0.182 0.054 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 635047 sc-eQTL 5.66e-01 0.134 0.232 0.055 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 411750 sc-eQTL 8.44e-01 0.0475 0.24 0.055 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB 338040 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0539 0.23 0.055 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -759922 sc-eQTL 5.55e-01 -0.132 0.223 0.055 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 -631043 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0486 0.263 0.055 gdT L2
ENSG00000139372 TDG 510459 sc-eQTL 3.17e-01 -0.232 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 -510035 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0269 0.262 0.055 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 546174 sc-eQTL 4.25e-01 -0.195 0.244 0.055 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 20986 sc-eQTL 5.87e-01 -0.118 0.216 0.055 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 980271 sc-eQTL 5.73e-01 0.129 0.229 0.055 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 260502 sc-eQTL 3.32e-01 0.249 0.256 0.055 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 510573 sc-eQTL 7.84e-01 0.0639 0.233 0.055 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -759009 sc-eQTL 1.18e-01 -0.323 0.206 0.055 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 172542 sc-eQTL 3.93e-01 0.217 0.253 0.055 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 635047 sc-eQTL 2.00e-01 0.252 0.196 0.051 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 411750 sc-eQTL 7.54e-02 -0.37 0.207 0.051 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB 338040 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0994 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -759922 sc-eQTL 9.60e-01 0.0107 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 -631043 sc-eQTL 5.01e-01 -0.12 0.178 0.051 intMono L2
ENSG00000139372 TDG 510459 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0578 0.204 0.051 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 -510035 sc-eQTL 3.70e-01 0.194 0.216 0.051 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 546174 sc-eQTL 7.25e-01 0.064 0.182 0.051 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 20986 sc-eQTL 5.16e-01 0.127 0.195 0.051 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 260502 sc-eQTL 1.69e-01 -0.289 0.209 0.051 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 510573 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0227 0.186 0.051 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -759009 sc-eQTL 5.40e-02 0.359 0.185 0.051 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 635047 sc-eQTL 7.33e-01 0.0665 0.195 0.051 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 411750 sc-eQTL 2.76e-01 -0.24 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB 338040 sc-eQTL 1.62e-02 0.548 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -759922 sc-eQTL 4.72e-01 0.154 0.214 0.051 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 -631043 sc-eQTL 4.45e-01 -0.156 0.203 0.051 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 -482463 sc-eQTL 6.46e-01 0.0729 0.158 0.051 pDC L2
ENSG00000139372 TDG 510459 sc-eQTL 8.98e-01 0.0252 0.196 0.051 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 -510035 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0137 0.138 0.051 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 546174 sc-eQTL 7.53e-03 0.405 0.149 0.051 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 20986 sc-eQTL 4.16e-01 0.16 0.196 0.051 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 980271 sc-eQTL 1.30e-01 0.302 0.198 0.051 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 260502 sc-eQTL 3.43e-01 0.204 0.214 0.051 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 510573 sc-eQTL 3.83e-01 0.166 0.19 0.051 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -759009 sc-eQTL 9.40e-01 -0.01 0.133 0.051 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 172542 sc-eQTL 6.28e-01 0.0854 0.176 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139372 TDG 510459 eQTL 0.0307 -0.0857 0.0396 0.0 0.0 0.05
ENSG00000171310 CHST11 20986 eQTL 0.000476 -0.116 0.0331 0.0 0.0 0.05

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina