logo

Genes within 1Mb (chr12:103427337:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 1.40e-01 -0.103 0.0695 0.075 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 6.45e-01 0.0707 0.153 0.075 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 1.96e-01 -0.185 0.142 0.075 B L1
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.80e-01 0.149 0.137 0.075 B L1
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 1.11e-01 -0.219 0.137 0.075 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0295 0.0863 0.075 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 9.23e-02 0.216 0.128 0.075 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 3.53e-02 -0.285 0.135 0.075 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0612 0.148 0.075 B L1
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0315 0.163 0.075 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0318 0.132 0.075 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 1.20e-01 0.206 0.132 0.075 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 1.44e-02 0.277 0.112 0.075 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0478 0.117 0.075 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 5.23e-01 -0.081 0.127 0.075 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 9.83e-01 0.0031 0.146 0.075 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 1.39e-01 -0.182 0.123 0.075 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0607 0.126 0.075 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0391 0.133 0.075 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 8.90e-01 0.0186 0.135 0.075 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0669 0.145 0.075 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.95e-01 0.143 0.136 0.075 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 4.66e-01 0.0896 0.123 0.075 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 5.72e-01 0.0735 0.13 0.075 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 8.50e-02 -0.27 0.156 0.075 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 7.60e-01 0.0428 0.14 0.075 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 2.89e-01 0.159 0.149 0.075 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 6.09e-01 0.0811 0.158 0.075 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 4.55e-01 0.12 0.161 0.074 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 7.17e-01 0.0628 0.173 0.074 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.25e-01 0.188 0.154 0.074 DC L1
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 4.94e-02 0.31 0.157 0.074 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 1.92e-01 -0.136 0.104 0.074 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 1.56e-01 0.193 0.135 0.074 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 3.34e-01 0.144 0.149 0.074 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 2.03e-02 -0.378 0.162 0.074 DC L1
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 5.49e-01 0.0916 0.153 0.074 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 9.35e-01 0.0138 0.17 0.075 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 6.55e-02 0.287 0.155 0.075 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 9.20e-01 0.0146 0.146 0.075 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 3.81e-01 0.0982 0.112 0.075 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 1.27e-01 0.171 0.112 0.075 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 8.37e-01 0.0266 0.129 0.075 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 6.98e-02 0.261 0.143 0.075 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 1.77e-02 0.356 0.149 0.075 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 4.94e-01 0.0952 0.139 0.075 NK L1
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 4.38e-01 0.1 0.129 0.075 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 5.11e-01 0.0943 0.143 0.075 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 4.79e-01 -0.109 0.153 0.075 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 1.66e-01 -0.198 0.142 0.075 NK L1
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0788 0.169 0.075 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0379 0.0533 0.075 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 9.91e-01 0.00178 0.153 0.075 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 1.47e-01 -0.225 0.155 0.075 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0417 0.141 0.075 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0896 0.135 0.075 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 4.60e-01 0.0908 0.123 0.075 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 4.50e-01 -0.117 0.154 0.075 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 7.76e-01 -0.037 0.13 0.075 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 5.04e-01 -0.106 0.159 0.075 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 1.62e-01 -0.221 0.158 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 9.50e-01 0.00206 0.033 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0583 0.153 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 2.90e-01 0.178 0.168 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 9.86e-01 0.00321 0.182 0.079 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 9.39e-01 0.014 0.181 0.079 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0855 0.196 0.079 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0243 0.15 0.079 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 2.22e-01 0.219 0.178 0.079 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 8.77e-02 0.28 0.163 0.079 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0219 0.169 0.079 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 1.44e-01 0.103 0.0701 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0249 0.159 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 2.41e-01 -0.194 0.165 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 8.02e-01 0.0443 0.176 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 8.15e-01 0.0415 0.177 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00087 0.159 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0224 0.155 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 2.27e-02 -0.39 0.17 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 9.67e-01 0.00695 0.168 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 1.44e-01 0.234 0.159 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 8.90e-01 0.00891 0.0642 0.075 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 7.99e-01 0.0414 0.162 0.075 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 2.58e-01 -0.197 0.174 0.075 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 5.10e-01 -0.114 0.172 0.075 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 9.73e-01 0.00594 0.176 0.075 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 2.46e-01 -0.18 0.155 0.075 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 7.98e-01 -0.041 0.161 0.075 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0433 0.162 0.075 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 5.35e-01 -0.106 0.171 0.075 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 8.19e-02 0.291 0.166 0.075 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0654 0.0885 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 2.67e-01 0.175 0.157 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 2.31e-01 -0.206 0.172 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 5.29e-01 -0.103 0.164 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0736 0.152 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 3.54e-01 -0.12 0.129 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 2.43e-02 0.377 0.166 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 3.92e-02 -0.349 0.168 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 2.69e-01 -0.183 0.166 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 3.37e-01 -0.165 0.171 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 6.81e-01 0.0323 0.0784 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 7.70e-01 0.0492 0.168 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 6.13e-01 0.09 0.177 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.08e-03 0.525 0.169 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 1.80e-01 -0.211 0.157 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 5.60e-01 0.0932 0.16 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 2.89e-01 0.176 0.166 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00344 0.17 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 7.82e-01 0.0486 0.175 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 6.17e-01 0.0915 0.183 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 9.94e-01 0.00108 0.148 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 6.32e-01 0.0807 0.168 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.09e-01 -0.21 0.167 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 3.72e-02 0.366 0.174 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 2.41e-01 0.175 0.149 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 8.41e-01 0.0307 0.153 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 6.56e-01 0.0763 0.171 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0455 0.166 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0542 0.17 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0662 0.136 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 7.09e-01 0.053 0.142 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.52e-02 0.272 0.12 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00173 0.123 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0475 0.126 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 3.65e-01 0.137 0.151 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 1.13e-01 -0.213 0.134 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 3.70e-01 -0.123 0.137 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 7.09e-01 0.0501 0.134 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 4.54e-01 0.119 0.159 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 9.15e-01 0.0182 0.169 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 9.03e-02 0.257 0.151 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0443 0.138 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 3.62e-01 -0.124 0.135 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 5.05e-01 0.105 0.157 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0468 0.15 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 4.80e-01 0.11 0.156 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00806 0.155 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 5.34e-01 -0.104 0.167 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 6.81e-03 0.457 0.167 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.88e-01 0.173 0.162 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 1.55e-01 -0.228 0.16 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 2.15e-01 -0.198 0.159 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0412 0.166 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 5.49e-01 0.0941 0.157 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 5.22e-01 -0.103 0.161 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 7.91e-01 0.0439 0.165 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0985 0.15 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 8.37e-01 -0.035 0.169 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0478 0.16 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 1.02e-01 0.259 0.158 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 6.44e-01 0.0646 0.139 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 2.68e-01 -0.181 0.163 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 5.80e-01 0.093 0.168 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0337 0.151 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 9.48e-01 0.0112 0.17 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 6.04e-01 0.0796 0.153 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0943 0.168 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 7.26e-02 0.278 0.154 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0812 0.139 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0465 0.133 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 1.57e-01 -0.225 0.158 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 5.11e-01 -0.107 0.163 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 2.89e-02 0.335 0.152 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 8.49e-01 0.0314 0.165 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 3.50e-01 0.143 0.152 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 7.27e-01 0.0593 0.17 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.34e-01 0.203 0.17 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0298 0.168 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 7.87e-02 -0.281 0.159 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 9.23e-01 0.0153 0.157 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 1.52e-01 -0.252 0.175 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 7.61e-01 0.053 0.174 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 5.13e-01 0.113 0.172 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 1.01e-01 0.269 0.163 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 1.53e-01 0.255 0.178 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 6.66e-01 0.0736 0.17 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 6.48e-02 0.336 0.181 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 8.58e-01 0.0305 0.17 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 2.04e-01 -0.217 0.17 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 9.00e-01 0.0228 0.18 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 9.52e-01 0.0105 0.175 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 5.62e-01 -0.105 0.181 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 6.00e-01 0.0299 0.0568 0.076 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0217 0.159 0.076 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0834 0.162 0.076 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00454 0.158 0.076 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0691 0.171 0.076 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 6.52e-01 0.0749 0.166 0.076 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 7.23e-01 0.0528 0.149 0.076 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 8.50e-01 0.032 0.169 0.076 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 4.23e-01 -0.134 0.167 0.076 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 2.65e-01 -0.193 0.173 0.076 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 2.40e-01 -0.195 0.166 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00164 0.168 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 1.76e-01 0.232 0.17 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 7.15e-02 0.304 0.168 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 2.04e-01 -0.217 0.17 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 1.64e-01 -0.249 0.178 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 5.38e-01 0.104 0.169 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 4.23e-02 0.337 0.165 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 6.75e-01 0.0625 0.149 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 2.00e-01 0.181 0.141 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 4.31e-01 0.111 0.141 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 2.05e-01 -0.195 0.153 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 1.93e-01 -0.211 0.162 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 2.06e-01 -0.221 0.174 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0708 0.177 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.62e-01 -0.202 0.18 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0275 0.178 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0118 0.175 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 2.84e-01 0.2 0.186 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 9.86e-01 0.00278 0.162 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0161 0.169 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 3.67e-01 0.152 0.168 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 1.12e-02 0.369 0.144 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 1.89e-01 0.196 0.149 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 6.61e-01 0.0653 0.149 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0413 0.161 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 2.28e-01 -0.187 0.155 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 3.34e-01 -0.164 0.169 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 6.25e-02 -0.245 0.13 0.078 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 1.85e-01 0.275 0.206 0.078 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 9.28e-01 0.0161 0.178 0.078 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 6.93e-01 0.0821 0.207 0.078 PB L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 1.39e-02 0.515 0.206 0.078 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 7.73e-01 0.0281 0.0973 0.078 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 5.06e-03 -0.47 0.164 0.078 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0408 0.182 0.078 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 8.69e-01 0.0352 0.212 0.078 PB L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 6.94e-01 0.0866 0.22 0.078 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 3.50e-01 -0.058 0.0619 0.076 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 3.43e-01 0.147 0.155 0.076 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 1.36e-01 -0.251 0.168 0.076 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.20e-01 -0.214 0.174 0.076 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 2.78e-01 -0.179 0.165 0.076 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0836 0.116 0.076 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 4.70e-01 0.115 0.159 0.076 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 1.46e-02 -0.342 0.139 0.076 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 4.43e-01 -0.125 0.163 0.076 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 4.35e-01 0.143 0.183 0.076 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 7.13e-01 0.0579 0.157 0.075 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 2.15e-01 0.224 0.18 0.075 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.45e-01 0.186 0.16 0.075 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0308 0.177 0.075 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 8.58e-02 -0.281 0.163 0.075 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0914 0.14 0.075 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 3.74e-01 -0.153 0.172 0.075 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 9.26e-01 0.0165 0.177 0.075 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 9.88e-02 -0.286 0.173 0.075 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0744 0.178 0.08 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0409 0.156 0.08 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 5.65e-02 0.317 0.165 0.08 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 2.88e-02 0.373 0.169 0.08 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0197 0.152 0.08 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 6.85e-02 -0.206 0.112 0.08 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0552 0.159 0.08 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 1.84e-02 -0.371 0.156 0.08 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 5.39e-01 0.0905 0.147 0.08 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0136 0.161 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 2.67e-01 0.182 0.163 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 5.40e-01 0.102 0.167 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 6.58e-01 0.0566 0.128 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 1.39e-01 0.183 0.123 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 2.57e-01 -0.159 0.14 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 4.96e-01 0.101 0.148 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 5.75e-02 0.307 0.161 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 2.66e-02 0.374 0.167 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0854 0.157 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 2.52e-01 0.165 0.144 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 7.35e-01 0.0431 0.127 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 4.11e-01 0.125 0.152 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 2.89e-02 0.349 0.159 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 3.03e-01 -0.202 0.196 0.07 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0274 0.203 0.07 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 4.70e-01 -0.14 0.194 0.07 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 5.80e-01 -0.109 0.196 0.07 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 7.03e-01 0.0788 0.207 0.07 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 1.23e-01 -0.298 0.192 0.07 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 5.54e-01 0.129 0.217 0.07 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0326 0.197 0.07 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 9.14e-01 0.0232 0.215 0.07 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 2.06e-01 -0.196 0.155 0.078 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 6.74e-01 0.0693 0.164 0.078 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 4.37e-01 -0.134 0.172 0.078 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 2.18e-01 0.198 0.16 0.078 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 6.47e-02 0.264 0.142 0.078 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0639 0.166 0.078 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 3.09e-02 -0.316 0.145 0.078 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 1.59e-01 -0.234 0.166 0.072 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 3.43e-01 -0.158 0.166 0.072 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 3.24e-01 -0.166 0.168 0.072 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0194 0.163 0.072 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 4.46e-01 0.111 0.145 0.072 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 2.88e-02 0.356 0.162 0.072 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 3.89e-01 0.141 0.164 0.072 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 4.20e-02 0.325 0.159 0.073 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 9.69e-01 0.00706 0.182 0.073 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 5.52e-01 -0.113 0.19 0.073 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0992 0.162 0.073 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 4.20e-02 -0.256 0.125 0.073 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 8.34e-03 0.43 0.161 0.073 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 1.94e-01 0.23 0.177 0.073 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 1.57e-01 -0.222 0.156 0.073 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 4.78e-01 0.104 0.145 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 6.52e-01 0.037 0.082 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0248 0.161 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 1.05e-01 -0.279 0.172 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 6.21e-01 0.0783 0.158 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0649 0.167 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0248 0.15 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 8.54e-01 0.0236 0.128 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 3.10e-02 -0.339 0.156 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0582 0.174 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 8.62e-02 0.292 0.169 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 945593 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0838 0.0941 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 3.12e-01 0.161 0.159 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0614 0.172 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 9.41e-02 0.261 0.156 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 1.80e-01 -0.195 0.145 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0831 0.133 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -68673 sc-eQTL 1.05e-02 0.417 0.161 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 1.05e-01 -0.271 0.166 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 3.63e-01 -0.155 0.17 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 3.26e-01 -0.17 0.173 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 3.15e-01 0.165 0.163 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 2.36e-02 0.377 0.165 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 5.03e-01 0.104 0.155 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 4.49e-01 0.0881 0.116 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 1.42e-01 0.167 0.113 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00999 0.132 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 8.81e-02 0.246 0.144 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -413897 sc-eQTL 1.79e-02 -0.386 0.162 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0618 0.16 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 2.46e-01 -0.183 0.157 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 5.43e-01 0.0929 0.152 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 3.20e-01 0.152 0.152 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 1.58e-01 0.219 0.155 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0226 0.157 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -637194 sc-eQTL 5.37e-03 0.429 0.153 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -710904 sc-eQTL 3.45e-01 0.129 0.137 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -538485 sc-eQTL 3.95e-01 0.115 0.135 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -502770 sc-eQTL 5.31e-01 0.0892 0.142 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -788442 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0576 0.154 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -538371 sc-eQTL 2.96e-01 -0.156 0.149 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -876402 sc-eQTL 3.53e-01 -0.157 0.169 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139372 TDG -538485 eQTL 0.0187 0.0706 0.03 0.0 0.0 0.0893

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina