Genes within 1Mb (chr12:103396757:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0591 0.0606 0.113 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 1.33e-01 0.2 0.132 0.113 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 4.83e-01 -0.087 0.124 0.113 B L1
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 1.19e-01 0.186 0.119 0.113 B L1
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0428 0.119 0.113 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 9.64e-01 0.00336 0.075 0.113 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 9.05e-01 0.0134 0.112 0.113 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 1.04e-01 -0.192 0.117 0.113 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0731 0.129 0.113 B L1
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 3.42e-01 0.134 0.141 0.113 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 8.32e-02 -0.198 0.114 0.113 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 5.78e-01 0.0641 0.115 0.113 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 3.98e-02 0.202 0.0978 0.113 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0272 0.102 0.113 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0723 0.11 0.113 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 4.60e-02 -0.252 0.126 0.113 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 1.37e-01 -0.159 0.106 0.113 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 1.95e-01 -0.142 0.109 0.113 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0344 0.116 0.113 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 2.85e-01 0.124 0.116 0.113 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0184 0.126 0.113 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 6.00e-02 0.221 0.117 0.113 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 7.53e-01 0.0335 0.106 0.113 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 8.45e-01 0.022 0.113 0.113 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 3.68e-01 -0.123 0.136 0.113 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 9.58e-01 0.00642 0.121 0.113 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0555 0.13 0.113 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0487 0.137 0.113 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 6.67e-01 0.061 0.142 0.108 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 3.74e-01 0.135 0.152 0.108 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 6.21e-01 0.0674 0.136 0.108 DC L1
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 7.66e-02 0.246 0.138 0.108 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0898 0.0912 0.108 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 2.35e-02 0.27 0.118 0.108 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 6.12e-01 0.0665 0.131 0.108 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 9.09e-02 -0.243 0.143 0.108 DC L1
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 6.31e-01 0.0644 0.134 0.108 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0986 0.146 0.113 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 4.28e-01 0.107 0.134 0.113 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 9.74e-01 0.00403 0.126 0.113 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 8.25e-01 0.0214 0.0966 0.113 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 1.12e-01 0.153 0.096 0.113 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0804 0.111 0.113 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 1.60e-02 0.297 0.122 0.113 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 5.67e-02 0.247 0.129 0.112 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0212 0.12 0.112 NK L1
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 4.04e-01 0.0932 0.111 0.112 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 7.58e-01 0.0382 0.123 0.112 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 2.59e-01 -0.149 0.132 0.112 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 6.18e-02 -0.23 0.122 0.112 NK L1
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 7.16e-01 0.0531 0.146 0.112 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00438 0.046 0.113 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0249 0.132 0.113 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0932 0.134 0.113 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0275 0.122 0.113 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.19e-01 0.0119 0.117 0.113 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 6.77e-01 0.0441 0.106 0.113 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0733 0.133 0.113 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 9.14e-01 0.0121 0.112 0.113 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 2.24e-01 -0.166 0.136 0.113 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 2.41e-02 -0.306 0.135 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0114 0.0282 0.117 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 5.83e-01 -0.072 0.131 0.117 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000321 0.144 0.117 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0517 0.155 0.117 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0325 0.155 0.117 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 3.39e-01 -0.16 0.167 0.117 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0224 0.128 0.117 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 5.85e-01 0.0839 0.153 0.117 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 6.88e-02 0.255 0.139 0.117 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 7.93e-01 -0.038 0.144 0.117 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 2.72e-02 0.133 0.0599 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 8.78e-01 0.0209 0.137 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 3.53e-01 -0.132 0.142 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 8.18e-01 0.035 0.152 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00483 0.153 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0707 0.136 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 3.80e-01 0.117 0.133 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 3.55e-02 -0.31 0.146 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 8.09e-01 -0.035 0.144 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 1.56e-01 0.195 0.137 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 9.03e-01 0.00685 0.0559 0.112 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 5.08e-01 0.0935 0.141 0.112 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0617 0.152 0.112 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 7.37e-01 0.0504 0.15 0.112 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 4.25e-01 0.122 0.153 0.112 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 4.61e-01 0.0999 0.135 0.112 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0514 0.14 0.112 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 5.61e-01 -0.082 0.141 0.112 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 3.33e-01 -0.144 0.149 0.112 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 8.83e-01 0.0215 0.146 0.112 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0842 0.0761 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 1.95e-01 0.176 0.135 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0746 0.149 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 8.51e-01 0.0266 0.141 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0393 0.131 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 2.75e-01 -0.122 0.111 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 4.78e-01 0.103 0.145 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 1.67e-01 -0.202 0.146 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 2.81e-01 -0.154 0.143 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 3.73e-01 0.132 0.147 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 4.51e-01 0.0505 0.0668 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 3.05e-02 0.309 0.142 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 2.47e-01 0.176 0.151 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 1.37e-02 0.36 0.145 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.21e-01 0.0133 0.134 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 6.35e-01 0.0649 0.136 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 8.57e-01 0.0256 0.142 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 9.89e-01 0.00194 0.145 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 2.76e-01 0.163 0.149 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 8.79e-01 0.0238 0.156 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 4.90e-01 -0.088 0.127 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0458 0.144 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0606 0.144 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 1.78e-01 0.204 0.151 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 6.03e-01 0.0668 0.128 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 3.64e-01 -0.119 0.131 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000456 0.147 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 1.38e-01 -0.21 0.141 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00842 0.146 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 4.63e-02 -0.235 0.117 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 8.20e-01 0.028 0.123 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 3.33e-02 0.224 0.105 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00459 0.107 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0858 0.109 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 1.60e-01 -0.184 0.13 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 4.78e-02 -0.231 0.116 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 1.05e-01 -0.193 0.119 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 7.10e-01 0.0433 0.116 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 4.12e-01 -0.113 0.138 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 9.48e-01 0.00965 0.147 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 4.70e-01 0.0953 0.132 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0779 0.119 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0902 0.117 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0278 0.136 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 9.35e-01 0.0106 0.13 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 5.58e-01 0.0792 0.135 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0955 0.134 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 6.85e-01 0.0586 0.144 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 9.91e-02 0.242 0.146 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0276 0.14 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 3.30e-01 -0.135 0.139 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 4.24e-01 -0.11 0.138 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0921 0.144 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 2.20e-01 0.167 0.135 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 2.91e-01 -0.147 0.139 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 5.38e-01 0.0879 0.143 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0397 0.13 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0661 0.147 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 6.56e-01 0.0617 0.138 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 7.22e-01 0.049 0.138 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 6.83e-01 0.0494 0.121 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0873 0.142 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0414 0.146 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 3.21e-01 -0.13 0.131 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 9.17e-01 0.0155 0.147 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 3.47e-01 0.125 0.133 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 7.71e-01 0.0424 0.146 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 4.02e-02 0.276 0.133 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 7.36e-01 0.0409 0.121 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 5.21e-01 0.0739 0.115 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 2.43e-01 -0.161 0.137 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0783 0.141 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 4.15e-01 0.109 0.134 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 5.70e-01 0.0814 0.143 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 2.69e-01 0.145 0.131 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 9.18e-01 -0.015 0.146 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 3.87e-01 0.127 0.147 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00923 0.145 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 9.65e-02 -0.228 0.137 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 9.46e-01 0.00917 0.135 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 4.75e-01 -0.108 0.151 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0498 0.15 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0868 0.148 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 1.26e-02 0.339 0.135 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 6.47e-02 0.274 0.147 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 3.94e-01 0.121 0.142 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 6.54e-02 0.279 0.151 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0732 0.142 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 2.02e-01 -0.181 0.142 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 4.44e-01 0.115 0.15 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 4.54e-01 -0.109 0.146 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 2.10e-01 -0.189 0.15 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 3.01e-01 0.0515 0.0497 0.115 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 9.26e-01 0.0128 0.139 0.115 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 7.87e-01 0.0385 0.143 0.115 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0313 0.139 0.115 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0104 0.15 0.115 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 4.72e-01 0.105 0.145 0.115 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0104 0.131 0.115 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 5.21e-01 0.0951 0.148 0.115 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 2.10e-01 -0.184 0.146 0.115 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 8.98e-02 -0.257 0.151 0.115 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0993 0.143 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 9.76e-01 0.00439 0.145 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 6.55e-01 0.0659 0.147 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 1.77e-01 0.196 0.145 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 4.27e-01 -0.117 0.146 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00454 0.154 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 3.88e-02 0.298 0.143 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 1.84e-01 0.19 0.142 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 7.17e-01 0.0464 0.128 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 2.70e-01 0.134 0.121 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 8.51e-01 0.0228 0.121 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 5.65e-02 -0.251 0.131 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 1.95e-03 -0.427 0.136 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0891 0.15 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 6.32e-01 0.0732 0.153 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0162 0.155 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00933 0.153 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 7.72e-01 0.0436 0.15 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 2.17e-01 0.198 0.16 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 6.58e-01 0.0617 0.139 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 1.95e-01 -0.188 0.145 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 2.45e-01 0.171 0.147 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 7.03e-01 0.0487 0.128 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 2.71e-01 0.143 0.13 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 7.04e-01 0.0493 0.129 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0492 0.14 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0395 0.135 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000135 0.148 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 9.04e-02 -0.208 0.122 0.104 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 9.07e-02 0.327 0.192 0.104 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0774 0.166 0.104 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 6.83e-01 0.0793 0.193 0.104 PB L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 1.64e-01 0.274 0.196 0.104 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 9.83e-01 0.00189 0.0909 0.104 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 6.76e-02 -0.289 0.157 0.104 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 8.83e-01 -0.025 0.17 0.104 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0126 0.198 0.104 PB L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 2.01e-01 0.262 0.204 0.104 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 9.01e-01 0.00652 0.0526 0.115 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 8.77e-01 0.0205 0.132 0.115 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 1.25e-01 -0.22 0.142 0.115 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 7.53e-01 0.0467 0.148 0.115 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 3.62e-01 -0.128 0.14 0.115 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0286 0.0982 0.115 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 5.85e-01 0.0737 0.135 0.115 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0325 0.119 0.115 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 3.10e-02 -0.298 0.137 0.115 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 5.56e-01 0.0917 0.155 0.115 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 6.91e-01 0.0534 0.134 0.113 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 5.83e-01 0.0845 0.154 0.113 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 7.96e-01 0.0352 0.136 0.113 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0678 0.151 0.113 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 3.31e-01 -0.136 0.139 0.113 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0905 0.12 0.113 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 3.54e-01 -0.136 0.147 0.113 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 6.90e-01 0.0602 0.151 0.113 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 2.65e-01 -0.165 0.148 0.113 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 2.87e-01 -0.168 0.158 0.112 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0278 0.138 0.112 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 1.59e-01 0.208 0.147 0.112 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 2.90e-02 0.331 0.15 0.112 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 6.20e-01 -0.067 0.135 0.112 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 1.98e-01 -0.129 0.1 0.112 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0231 0.141 0.112 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 3.56e-02 -0.294 0.139 0.112 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 9.41e-01 0.0097 0.13 0.112 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0778 0.138 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 5.12e-01 0.0927 0.141 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 6.94e-01 0.0567 0.144 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00456 0.11 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 1.57e-01 0.151 0.106 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 2.14e-01 -0.15 0.12 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 2.59e-01 0.145 0.128 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 4.44e-01 0.106 0.139 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 8.86e-02 0.246 0.144 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0818 0.135 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 8.34e-01 0.026 0.124 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 8.75e-01 0.0172 0.109 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0434 0.13 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 1.23e-02 0.342 0.135 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 3.84e-01 -0.144 0.165 0.115 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00667 0.171 0.115 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0578 0.163 0.115 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.52e-01 0.00987 0.165 0.115 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 7.44e-01 0.0569 0.174 0.115 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0228 0.163 0.115 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0374 0.183 0.115 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 5.43e-01 0.101 0.166 0.115 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 8.00e-01 0.046 0.181 0.115 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 2.99e-01 -0.141 0.136 0.113 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 9.53e-01 0.00848 0.144 0.113 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 2.99e-01 -0.156 0.15 0.113 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 2.92e-01 0.148 0.14 0.113 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 4.22e-02 0.254 0.124 0.113 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 6.36e-01 0.0689 0.145 0.113 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0973 0.129 0.113 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 3.42e-01 -0.135 0.142 0.109 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0846 0.142 0.109 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0473 0.144 0.109 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 4.03e-01 -0.117 0.139 0.109 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 3.58e-01 0.114 0.124 0.109 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 2.65e-01 0.156 0.139 0.109 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 4.10e-01 0.116 0.14 0.109 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 1.10e-01 0.223 0.139 0.107 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 6.95e-01 0.0624 0.159 0.107 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 4.57e-01 -0.123 0.165 0.107 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0174 0.141 0.107 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 7.32e-02 -0.197 0.109 0.107 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 5.91e-04 0.485 0.138 0.107 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 5.39e-01 0.0952 0.155 0.107 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 3.08e-01 -0.14 0.137 0.107 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 4.64e-01 0.093 0.127 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 2.42e-01 0.0816 0.0696 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 9.28e-01 0.0124 0.137 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 2.58e-01 -0.166 0.146 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 2.80e-01 0.145 0.134 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00715 0.142 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0077 0.127 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 4.57e-01 0.0811 0.109 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 5.95e-02 -0.252 0.133 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0803 0.148 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 3.86e-01 0.126 0.145 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 915013 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0719 0.081 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 5.03e-02 0.267 0.136 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 7.26e-01 0.0519 0.148 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 4.14e-02 0.274 0.133 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0557 0.126 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 3.47e-01 -0.108 0.115 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 sc-eQTL 3.59e-01 0.129 0.141 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 2.13e-01 -0.179 0.144 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0887 0.146 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 6.00e-01 0.0782 0.149 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00877 0.142 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 1.42e-01 0.212 0.144 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 7.51e-01 0.0426 0.134 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.31e-01 0.00866 0.1 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 1.65e-01 0.137 0.0981 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 2.53e-01 -0.13 0.114 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 5.75e-02 0.237 0.124 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -444477 sc-eQTL 4.04e-02 -0.29 0.141 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0702 0.139 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 8.15e-01 -0.032 0.137 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 9.37e-01 0.0105 0.132 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 2.28e-01 0.159 0.132 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 2.15e-01 0.167 0.134 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 2.58e-01 0.154 0.136 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -667774 sc-eQTL 2.35e-02 0.302 0.132 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -741484 sc-eQTL 8.33e-01 0.0249 0.118 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -569065 sc-eQTL 3.24e-01 0.115 0.116 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -533350 sc-eQTL 7.85e-01 0.0335 0.123 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -819022 sc-eQTL 3.67e-01 -0.12 0.133 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -568951 sc-eQTL 8.70e-02 -0.22 0.128 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -906982 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0839 0.146 0.112 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 eQTL 0.0489 -0.0542 0.0275 0.0 0.0 0.13


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000179088 C12orf42 -99253 4.65e-06 4.82e-06 6.06e-07 3.14e-06 1.58e-06 1.6e-06 5.49e-06 1.15e-06 4.91e-06 2.59e-06 5.7e-06 3.27e-06 7.48e-06 2.13e-06 1.17e-06 3.78e-06 1.92e-06 3.98e-06 1.44e-06 1.41e-06 2.87e-06 4.88e-06 4.48e-06 1.96e-06 7.15e-06 2.14e-06 2.31e-06 1.77e-06 4.56e-06 4.73e-06 2.85e-06 4.44e-07 7.24e-07 2.24e-06 2.09e-06 1.07e-06 1.03e-06 4.36e-07 9.96e-07 6.1e-07 9.82e-07 5.67e-06 4.37e-07 1.58e-07 7.73e-07 1.18e-06 1.08e-06 6.58e-07 5.83e-07