logo

Genes within 1Mb (chr12:103381641:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 1.02e-01 0.0994 0.0605 0.096 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0505 0.133 0.096 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00816 0.124 0.096 B L1
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 2.54e-01 -0.137 0.12 0.096 B L1
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 1.04e-01 0.194 0.119 0.096 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 2.96e-01 0.0785 0.0749 0.096 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 1.19e-01 0.175 0.112 0.096 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.17e-02 -0.213 0.117 0.096 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 8.62e-01 0.0225 0.129 0.096 B L1
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0668 0.142 0.096 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 9.28e-01 0.0102 0.113 0.096 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 3.46e-01 0.107 0.113 0.096 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 4.74e-01 0.0697 0.0971 0.096 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 4.85e-02 0.197 0.0992 0.096 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0172 0.108 0.096 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 3.48e-01 0.117 0.124 0.096 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 5.90e-01 0.0568 0.105 0.096 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 5.96e-02 0.202 0.107 0.096 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0611 0.114 0.096 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0047 0.117 0.096 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 2.20e-01 -0.154 0.125 0.096 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 2.78e-01 0.128 0.118 0.096 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 2.39e-03 0.32 0.104 0.096 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 6.87e-01 0.0455 0.113 0.096 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 6.77e-02 0.248 0.135 0.096 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 1.18e-01 -0.189 0.12 0.096 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 3.02e-01 -0.134 0.129 0.096 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 7.35e-01 0.0464 0.137 0.096 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0827 0.146 0.097 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 7.50e-01 0.05 0.157 0.097 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00574 0.141 0.097 DC L1
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 4.43e-01 0.111 0.144 0.097 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 1.78e-03 -0.292 0.0922 0.097 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 7.96e-01 0.0321 0.124 0.097 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0823 0.135 0.097 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0784 0.149 0.097 DC L1
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 8.80e-01 -0.021 0.139 0.097 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 9.82e-01 0.00334 0.149 0.096 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 1.99e-01 0.176 0.137 0.096 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 2.03e-01 -0.163 0.128 0.096 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 4.58e-01 0.0731 0.0983 0.096 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0811 0.0983 0.096 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0434 0.113 0.096 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 5.91e-01 0.068 0.126 0.096 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 7.85e-01 0.0356 0.13 0.097 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0805 0.12 0.097 NK L1
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 7.53e-03 0.296 0.11 0.097 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 7.17e-01 0.0448 0.123 0.097 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 4.22e-01 -0.106 0.132 0.097 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00749 0.123 0.097 NK L1
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 5.10e-01 0.0963 0.146 0.097 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0508 0.0459 0.096 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0793 0.132 0.096 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0363 0.134 0.096 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0554 0.122 0.096 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 8.91e-02 0.199 0.116 0.096 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0965 0.106 0.096 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 4.13e-02 0.271 0.132 0.096 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 1.65e-01 -0.155 0.112 0.096 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0416 0.137 0.096 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 5.18e-01 0.0884 0.137 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 8.37e-01 -0.00585 0.0283 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 3.61e-01 -0.12 0.131 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 7.21e-01 0.0517 0.145 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0396 0.156 0.102 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 2.96e-01 0.163 0.156 0.102 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 7.09e-01 0.0631 0.169 0.102 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 1.30e-01 0.195 0.128 0.102 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0889 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 4.11e-01 0.116 0.141 0.102 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0505 0.145 0.102 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 6.46e-01 0.0278 0.0605 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 5.92e-01 0.0732 0.136 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 8.53e-02 0.245 0.142 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 1.79e-01 -0.204 0.151 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 4.18e-01 0.124 0.152 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 1.98e-01 -0.176 0.136 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 4.50e-02 -0.266 0.132 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 4.21e-01 -0.119 0.147 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 4.74e-01 0.103 0.144 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 4.71e-02 -0.272 0.136 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 3.03e-01 0.0566 0.0548 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 2.15e-01 -0.172 0.138 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 9.89e-02 -0.246 0.148 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 9.45e-01 0.0102 0.148 0.095 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 8.01e-01 0.038 0.15 0.095 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 3.90e-01 -0.114 0.133 0.095 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 8.75e-01 0.0217 0.137 0.095 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 2.59e-01 -0.157 0.138 0.095 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 6.64e-01 0.0637 0.147 0.095 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 1.78e-02 -0.338 0.142 0.095 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 8.19e-01 0.0176 0.0771 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0451 0.137 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 1.79e-01 -0.202 0.15 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 4.08e-01 -0.118 0.143 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 7.70e-01 0.0387 0.132 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0421 0.113 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 1.56e-01 0.207 0.146 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 3.19e-01 -0.148 0.148 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0619 0.144 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 8.02e-01 0.0374 0.149 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 8.68e-01 0.0113 0.0677 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0983 0.145 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 2.94e-01 0.161 0.153 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0336 0.149 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 1.63e-01 0.189 0.135 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0249 0.138 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 1.52e-01 0.205 0.143 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.03e-01 0.0559 0.147 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 3.30e-01 -0.147 0.151 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 9.70e-01 0.0059 0.158 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 2.67e-01 -0.151 0.136 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0303 0.155 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 9.30e-01 0.0136 0.154 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 2.60e-02 -0.359 0.16 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 6.99e-02 -0.249 0.136 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0905 0.14 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 1.79e-01 -0.211 0.156 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 1.72e-01 0.208 0.151 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 8.37e-01 0.0323 0.156 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0227 0.117 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 2.18e-01 0.15 0.122 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 5.22e-01 0.0673 0.105 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 8.14e-02 0.185 0.106 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 6.25e-01 -0.053 0.108 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 4.12e-01 0.107 0.13 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.69e-01 0.0342 0.116 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 1.78e-01 0.16 0.118 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0258 0.116 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 7.38e-02 0.244 0.136 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 6.57e-01 0.0647 0.146 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0546 0.131 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 1.83e-01 0.157 0.118 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 5.03e-01 0.0782 0.117 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 1.87e-01 0.179 0.135 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 6.91e-01 0.0514 0.129 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 4.02e-01 0.112 0.134 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0928 0.133 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 5.98e-01 0.0774 0.147 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 1.84e-01 -0.199 0.149 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0699 0.143 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 4.17e-01 0.115 0.141 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0507 0.14 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0643 0.146 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0201 0.138 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 8.72e-01 0.0228 0.142 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 6.43e-01 0.0674 0.145 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 7.73e-02 -0.232 0.13 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00651 0.148 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 7.65e-02 0.247 0.139 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 4.66e-01 0.101 0.139 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0321 0.122 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 3.00e-01 0.149 0.143 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.33e-01 0.0503 0.147 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 3.06e-01 -0.136 0.132 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0271 0.149 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 2.01e-01 0.171 0.134 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0834 0.147 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0579 0.136 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 8.51e-02 0.21 0.121 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0492 0.116 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 5.72e-01 0.0788 0.139 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 3.63e-01 -0.13 0.143 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 3.26e-01 -0.133 0.135 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 5.77e-01 0.0806 0.144 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 9.25e-01 0.013 0.138 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 1.19e-01 -0.239 0.153 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 3.55e-01 -0.143 0.154 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 1.65e-01 0.211 0.152 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0814 0.145 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 5.33e-01 0.0888 0.142 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.12e-01 0.0587 0.159 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 5.78e-01 0.0877 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 8.47e-01 0.0301 0.156 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 3.57e-02 -0.282 0.134 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00586 0.147 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 2.49e-01 0.162 0.14 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 7.70e-01 0.0439 0.15 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0444 0.14 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 3.81e-01 0.123 0.14 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 4.88e-01 -0.103 0.148 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 3.04e-01 -0.148 0.144 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0904 0.149 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0211 0.0525 0.093 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 1.34e-01 0.219 0.146 0.093 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0718 0.15 0.093 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0701 0.146 0.093 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 4.55e-01 0.118 0.158 0.093 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 8.86e-02 -0.261 0.152 0.093 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 2.74e-01 0.15 0.137 0.093 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 1.09e-01 -0.249 0.155 0.093 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 4.90e-01 0.107 0.154 0.093 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0151 0.16 0.093 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 1.90e-01 0.192 0.146 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 4.52e-01 -0.112 0.148 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 6.82e-02 0.274 0.15 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 7.52e-02 -0.264 0.148 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 4.17e-01 -0.122 0.15 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 6.16e-01 0.0792 0.158 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 6.67e-01 -0.064 0.149 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 9.01e-01 0.018 0.144 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0821 0.129 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 2.22e-02 0.278 0.121 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0282 0.122 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 2.99e-01 -0.138 0.133 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0337 0.14 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 9.63e-01 0.00712 0.151 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 3.48e-02 -0.32 0.151 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 9.71e-01 0.00565 0.155 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0395 0.153 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 1.30e-01 0.227 0.149 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00339 0.16 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0896 0.139 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 1.10e-01 0.231 0.144 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 9.69e-01 0.0058 0.148 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 6.36e-01 -0.061 0.129 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 3.85e-01 0.114 0.131 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 3.02e-01 0.135 0.13 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0483 0.141 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 8.14e-01 0.0322 0.136 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 2.39e-01 0.175 0.148 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0291 0.105 0.1 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 3.92e-01 -0.141 0.165 0.1 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 5.47e-01 0.0852 0.141 0.1 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 8.05e-01 0.0407 0.165 0.1 PB L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 9.28e-01 0.0153 0.168 0.1 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0665 0.0771 0.1 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 7.97e-01 -0.035 0.135 0.1 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.27e-01 0.0506 0.144 0.1 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 7.85e-02 0.296 0.167 0.1 PB L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0938 0.175 0.1 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00762 0.0506 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 1.11e-02 -0.32 0.125 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 4.69e-01 0.0999 0.138 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 1.96e-01 -0.184 0.142 0.096 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 3.23e-01 0.134 0.135 0.096 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0153 0.0946 0.096 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 6.76e-02 0.237 0.129 0.096 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 3.32e-01 -0.112 0.115 0.096 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 3.70e-01 -0.12 0.133 0.096 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 6.12e-01 0.0759 0.15 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 2.28e-02 -0.318 0.139 0.096 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 9.65e-01 0.00707 0.161 0.096 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 1.81e-01 0.191 0.142 0.096 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 4.95e-01 0.108 0.158 0.096 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 7.80e-01 0.0408 0.146 0.096 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 3.16e-01 0.125 0.125 0.096 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 1.07e-01 0.247 0.153 0.096 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 1.58e-01 0.222 0.157 0.096 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0217 0.155 0.096 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0118 0.165 0.093 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0235 0.144 0.093 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 6.74e-01 0.0652 0.155 0.093 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0665 0.159 0.093 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 1.46e-02 -0.342 0.139 0.093 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0362 0.105 0.093 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 2.38e-01 -0.174 0.147 0.093 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 3.59e-01 -0.135 0.146 0.093 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 1.90e-01 -0.178 0.136 0.093 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0184 0.139 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 5.91e-02 0.267 0.141 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 1.86e-01 -0.191 0.144 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 2.73e-01 0.122 0.111 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0588 0.107 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 3.93e-01 -0.104 0.121 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 1.91e-01 0.168 0.128 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 2.24e-01 0.173 0.142 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0642 0.148 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 1.30e-01 0.208 0.137 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0765 0.127 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0845 0.111 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 4.73e-01 0.0957 0.133 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0533 0.141 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 3.34e-01 -0.161 0.167 0.097 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 3.53e-01 0.161 0.172 0.097 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0184 0.165 0.097 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 2.25e-02 0.378 0.164 0.097 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00922 0.176 0.097 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 1.02e-01 0.269 0.163 0.097 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 1.62e-01 0.257 0.183 0.097 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 1.34e-01 -0.251 0.166 0.097 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 2.98e-01 -0.19 0.182 0.097 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 5.36e-01 -0.085 0.137 0.1 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 6.50e-01 0.0659 0.145 0.1 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 2.34e-02 -0.342 0.15 0.1 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 5.12e-01 0.0931 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 1.87e-01 -0.167 0.126 0.1 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0442 0.146 0.1 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 9.00e-01 0.0163 0.13 0.1 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 3.87e-01 -0.123 0.142 0.097 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 3.46e-01 0.134 0.142 0.097 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0108 0.144 0.097 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00504 0.14 0.097 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 1.15e-01 -0.195 0.123 0.097 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.44e-01 0.0457 0.14 0.097 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 3.03e-01 -0.144 0.14 0.097 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 3.94e-01 -0.127 0.149 0.088 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0639 0.169 0.088 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 6.08e-01 0.0905 0.176 0.088 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 5.88e-01 0.0812 0.15 0.088 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 1.78e-01 -0.158 0.116 0.088 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 8.56e-01 0.0278 0.153 0.088 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 9.97e-01 0.00056 0.165 0.088 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 9.25e-01 0.0137 0.146 0.088 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00287 0.135 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 3.46e-01 0.0657 0.0696 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0677 0.136 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 7.04e-01 0.0557 0.147 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0603 0.134 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 2.25e-01 0.172 0.142 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 3.20e-01 -0.126 0.127 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 2.74e-01 -0.119 0.109 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 7.81e-02 -0.236 0.133 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 2.12e-01 0.184 0.147 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 6.66e-03 -0.39 0.142 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 899897 sc-eQTL 7.34e-01 0.0278 0.0819 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 6.33e-01 -0.066 0.138 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 4.82e-01 -0.105 0.149 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 3.83e-01 -0.119 0.136 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 3.45e-01 0.12 0.127 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0162 0.116 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -114369 sc-eQTL 1.12e-01 0.226 0.142 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 4.70e-01 -0.105 0.145 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0431 0.148 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 7.18e-01 0.0543 0.15 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 8.45e-01 0.0282 0.144 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 3.66e-01 0.133 0.147 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0873 0.136 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 5.12e-01 0.067 0.102 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0338 0.1 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0779 0.116 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 2.83e-01 0.136 0.127 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -459593 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0507 0.142 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 3.11e-01 0.141 0.139 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 2.21e-01 -0.168 0.136 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0218 0.132 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 1.33e-01 -0.198 0.132 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 8.20e-01 0.0308 0.135 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0969 0.136 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -682890 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0611 0.134 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -756600 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0532 0.118 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -584181 sc-eQTL 3.48e-02 0.246 0.116 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -548466 sc-eQTL 6.36e-01 0.0582 0.123 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -834138 sc-eQTL 3.06e-01 -0.137 0.133 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -584067 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0108 0.129 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -922098 sc-eQTL 3.44e-01 0.139 0.146 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136011 \N -205632 2.64e-06 3.13e-06 4.52e-07 1.94e-06 7.65e-07 7.56e-07 2.46e-06 9.82e-07 2.43e-06 1.4e-06 3.2e-06 1.53e-06 3.93e-06 1.41e-06 9.62e-07 1.95e-06 1.56e-06 2.15e-06 1.56e-06 1.23e-06 1.64e-06 3.21e-06 2.62e-06 1.44e-06 4.05e-06 1.17e-06 1.58e-06 1.74e-06 3.12e-06 2.13e-06 1.93e-06 4.53e-07 6.07e-07 1.27e-06 1.47e-06 9.68e-07 8.89e-07 4.89e-07 1.33e-06 3.64e-07 4.03e-07 3.42e-06 4.6e-07 1.46e-07 4.19e-07 3.54e-07 7.69e-07 2.26e-07 3.38e-07