Genes within 1Mb (chr12:103329154:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 8.22e-01 0.0117 0.0521 0.177 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 4.32e-01 0.0896 0.114 0.177 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0135 0.106 0.177 B L1
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 1.53e-01 0.147 0.102 0.177 B L1
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 1.17e-01 0.16 0.102 0.177 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 7.99e-01 0.0164 0.0643 0.177 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0595 0.0959 0.177 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 3.10e-01 0.103 0.101 0.177 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 2.73e-01 -0.121 0.11 0.177 B L1
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 5.01e-02 0.237 0.12 0.177 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 6.36e-01 0.0467 0.0986 0.177 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 9.91e-02 -0.163 0.0985 0.177 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 9.99e-03 -0.218 0.0839 0.177 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 8.11e-02 0.153 0.0871 0.177 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0689 0.0947 0.177 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 5.98e-02 -0.205 0.108 0.177 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 1.96e-02 -0.214 0.091 0.177 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 4.22e-01 0.0757 0.0941 0.177 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 3.15e-02 0.214 0.0988 0.177 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 7.28e-01 0.0348 0.0998 0.177 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0697 0.108 0.177 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 7.30e-01 0.0349 0.101 0.177 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 3.49e-01 0.0854 0.0909 0.177 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 6.81e-01 0.0397 0.0965 0.177 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 1.10e-01 -0.186 0.116 0.177 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0714 0.104 0.177 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 4.74e-01 0.0796 0.111 0.177 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 2.08e-01 0.148 0.117 0.177 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0843 0.125 0.176 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0755 0.134 0.176 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 3.13e-01 -0.121 0.119 0.176 DC L1
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 1.79e-01 0.164 0.122 0.176 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0175 0.0804 0.176 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0851 0.105 0.176 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.115 0.176 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 6.48e-01 0.0579 0.127 0.176 DC L1
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0505 0.118 0.176 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 8.09e-01 0.031 0.128 0.177 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0551 0.118 0.177 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 9.96e-01 0.00061 0.11 0.177 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 9.16e-01 0.00897 0.0845 0.177 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0146 0.0846 0.177 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0938 0.0968 0.177 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 8.74e-01 0.0173 0.109 0.177 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 6.19e-02 0.211 0.112 0.178 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0242 0.104 0.178 NK L1
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 2.40e-01 0.114 0.0967 0.178 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 6.73e-01 0.0454 0.107 0.178 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0397 0.115 0.178 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 2.93e-01 0.113 0.107 0.178 NK L1
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 2.81e-01 0.137 0.126 0.178 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0227 0.0403 0.177 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 5.21e-01 0.0742 0.115 0.177 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 2.65e-01 0.131 0.117 0.177 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0918 0.107 0.177 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0267 0.103 0.177 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 5.83e-02 0.175 0.0922 0.177 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0233 0.117 0.177 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 2.50e-01 0.113 0.0979 0.177 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00326 0.12 0.177 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 8.34e-01 0.0251 0.12 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 9.70e-01 -0.000932 0.0249 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 2.16e-01 0.143 0.115 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000928 0.127 0.176 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 5.43e-01 0.0837 0.137 0.176 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 5.88e-01 0.0744 0.137 0.176 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0438 0.148 0.176 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 5.25e-01 0.072 0.113 0.176 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0692 0.136 0.176 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 4.39e-01 0.0962 0.124 0.176 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 2.60e-01 -0.144 0.127 0.176 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0545 0.0524 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0763 0.118 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0541 0.124 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 5.97e-01 0.0697 0.132 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0113 0.132 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0801 0.118 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 1.32e-01 0.174 0.115 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0465 0.128 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 3.67e-01 -0.113 0.125 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0125 0.12 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0675 0.048 0.179 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 8.29e-01 0.0264 0.122 0.179 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 7.08e-02 0.236 0.13 0.179 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 2.46e-01 0.15 0.129 0.179 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0338 0.132 0.179 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 2.87e-01 0.124 0.116 0.179 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0401 0.121 0.179 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 5.89e-01 0.0658 0.122 0.179 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0778 0.129 0.179 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 5.89e-01 0.0681 0.126 0.179 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 5.04e-03 -0.182 0.0644 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 7.76e-01 0.0332 0.117 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 1.64e-01 -0.178 0.127 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 5.10e-01 -0.08 0.121 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 1.42e-01 0.165 0.112 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0431 0.0959 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 2.81e-01 -0.134 0.124 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 1.75e-01 0.17 0.125 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 9.64e-01 -0.0056 0.123 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 2.55e-03 0.379 0.124 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 3.17e-01 0.0573 0.0572 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 4.94e-01 0.0841 0.123 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 2.12e-01 -0.162 0.129 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 4.50e-02 0.252 0.125 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 1.37e-01 0.171 0.114 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 2.83e-01 -0.125 0.117 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 7.58e-01 0.0375 0.121 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 8.59e-01 -0.022 0.124 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 1.24e-01 -0.197 0.127 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 9.80e-01 0.00336 0.133 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 2.14e-01 0.144 0.115 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0697 0.131 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 1.92e-01 -0.17 0.13 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 9.17e-01 0.0144 0.137 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 1.23e-01 0.179 0.116 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 1.95e-01 0.154 0.119 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 2.65e-01 0.149 0.133 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 9.21e-01 0.0128 0.129 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 7.09e-01 0.0495 0.133 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 3.77e-01 0.0902 0.102 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 1.06e-02 -0.27 0.105 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 5.85e-02 -0.172 0.0905 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 1.36e-01 0.138 0.0919 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0959 0.0939 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 1.25e-01 -0.173 0.113 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 3.88e-02 -0.208 0.1 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 4.77e-02 0.203 0.102 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 5.46e-02 0.193 0.0996 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0534 0.118 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 5.32e-01 0.0785 0.125 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 1.47e-01 -0.163 0.112 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 9.43e-03 0.263 0.101 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 9.21e-01 0.01 0.101 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 2.05e-02 -0.269 0.115 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0481 0.111 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 3.85e-01 -0.1 0.115 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 5.27e-01 0.0726 0.115 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0609 0.126 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0578 0.129 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0728 0.123 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0283 0.122 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0552 0.121 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 7.83e-02 -0.221 0.125 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 6.47e-03 -0.321 0.117 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0673 0.122 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 7.73e-01 0.0361 0.125 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00314 0.112 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 1.42e-01 -0.186 0.126 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0212 0.119 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 4.92e-02 0.233 0.118 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 6.57e-01 0.0463 0.104 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0559 0.123 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0115 0.126 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0403 0.113 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 3.61e-02 0.266 0.126 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 5.64e-01 0.0662 0.115 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0667 0.126 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 5.56e-01 0.0686 0.116 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0223 0.105 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 9.75e-01 0.00312 0.0995 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 5.21e-02 -0.231 0.118 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 5.00e-02 -0.239 0.121 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 5.35e-01 0.0717 0.115 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 5.42e-01 0.0755 0.123 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 9.52e-01 0.00737 0.123 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0377 0.137 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 8.00e-01 -0.035 0.138 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 4.88e-01 0.0942 0.136 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0798 0.129 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 9.05e-01 0.0151 0.127 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 3.58e-01 -0.13 0.141 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 9.35e-01 0.0115 0.14 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 6.80e-01 0.0575 0.139 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 5.32e-01 0.0733 0.117 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 3.90e-01 -0.109 0.127 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 6.93e-01 0.0481 0.121 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 9.68e-01 0.00528 0.13 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 1.04e-02 0.308 0.119 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 8.61e-01 0.0214 0.122 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00785 0.128 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 7.61e-01 0.0379 0.125 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 3.85e-01 0.112 0.129 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0358 0.0434 0.173 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 7.26e-01 0.0426 0.121 0.173 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 9.99e-01 0.000107 0.124 0.173 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 3.28e-01 0.118 0.121 0.173 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0314 0.131 0.173 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 2.31e-03 0.383 0.124 0.173 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 9.48e-01 0.00738 0.114 0.173 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 1.81e-03 0.399 0.126 0.173 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 1.45e-01 0.186 0.127 0.173 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 9.54e-01 0.00758 0.133 0.173 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0773 0.129 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0851 0.131 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 5.23e-01 -0.085 0.133 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 8.02e-02 0.229 0.13 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 4.76e-02 -0.262 0.131 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 6.14e-01 0.0703 0.139 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 1.34e-01 0.196 0.13 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 1.38e-01 0.187 0.125 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0558 0.113 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 1.17e-01 0.167 0.106 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 7.38e-01 0.0358 0.107 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0897 0.116 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 7.32e-01 -0.042 0.123 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 6.00e-02 0.248 0.131 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 2.42e-01 0.158 0.135 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 8.81e-01 0.0207 0.138 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 3.09e-02 0.292 0.134 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 8.90e-02 0.226 0.132 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 3.45e-01 0.135 0.142 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 3.48e-01 -0.116 0.123 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 1.41e-01 0.189 0.128 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 5.85e-01 0.0707 0.129 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 6.42e-01 0.0522 0.112 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 1.42e-02 0.28 0.113 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 6.42e-01 0.053 0.114 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 2.39e-01 0.145 0.123 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 1.97e-01 0.154 0.119 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 4.51e-01 -0.098 0.13 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0926 0.088 0.207 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 3.29e-01 -0.135 0.138 0.207 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00678 0.119 0.207 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0389 0.138 0.207 PB L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 4.71e-01 0.102 0.141 0.207 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0869 0.0645 0.207 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 5.04e-01 0.0761 0.114 0.207 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0429 0.121 0.207 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0399 0.142 0.207 PB L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 4.23e-01 0.118 0.146 0.207 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 9.27e-01 0.00406 0.0443 0.172 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 6.84e-01 0.0452 0.111 0.172 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 2.07e-01 0.152 0.12 0.172 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0569 0.125 0.172 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0662 0.118 0.172 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0444 0.0827 0.172 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 1.42e-01 -0.166 0.113 0.172 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 2.75e-01 -0.11 0.1 0.172 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 3.77e-01 -0.103 0.117 0.172 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 6.35e-01 0.0623 0.131 0.172 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0139 0.116 0.177 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 1.62e-01 -0.186 0.133 0.177 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 1.43e-01 -0.173 0.118 0.177 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 4.64e-01 -0.096 0.131 0.177 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 4.91e-01 0.0834 0.121 0.177 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 8.55e-01 0.019 0.104 0.177 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 1.87e-02 0.299 0.126 0.177 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00225 0.131 0.177 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 3.88e-01 0.111 0.128 0.177 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 3.71e-01 -0.128 0.142 0.168 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 9.98e-01 0.000388 0.125 0.168 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0944 0.133 0.168 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 1.80e-01 0.184 0.137 0.168 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 8.70e-01 0.02 0.122 0.168 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 5.84e-01 0.0497 0.0907 0.168 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 8.43e-01 0.0253 0.127 0.168 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 6.47e-01 0.0581 0.127 0.168 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 2.73e-01 0.129 0.117 0.168 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 3.57e-01 0.111 0.12 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0605 0.122 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 6.23e-01 0.0614 0.125 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 3.02e-01 0.0987 0.0954 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 1.70e-01 0.127 0.0922 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0418 0.105 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 8.39e-01 0.0227 0.111 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 5.92e-02 -0.228 0.12 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0239 0.126 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 3.94e-01 -0.1 0.117 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0238 0.108 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 7.26e-01 0.0333 0.095 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 1.30e-01 -0.172 0.113 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 8.65e-01 0.0205 0.12 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0156 0.151 0.148 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 2.11e-01 -0.196 0.155 0.148 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 5.02e-01 -0.101 0.149 0.148 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 8.46e-02 0.259 0.149 0.148 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 8.16e-03 0.416 0.155 0.148 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 7.43e-01 -0.049 0.149 0.148 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0836 0.167 0.148 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00587 0.152 0.148 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 5.64e-01 0.0955 0.165 0.148 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 6.43e-01 0.055 0.119 0.176 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0422 0.125 0.176 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0197 0.131 0.176 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 3.70e-01 0.11 0.122 0.176 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0707 0.109 0.176 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 8.40e-01 0.0256 0.126 0.176 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 9.98e-01 0.000242 0.112 0.176 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0477 0.122 0.17 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 9.94e-01 0.000918 0.122 0.17 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 2.48e-01 0.142 0.122 0.17 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.119 0.17 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 3.01e-01 0.11 0.106 0.17 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 9.53e-01 -0.007 0.12 0.17 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 7.95e-01 0.0311 0.12 0.17 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0565 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00341 0.145 0.167 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 2.78e-01 -0.165 0.151 0.167 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 1.99e-01 0.166 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0804 0.101 0.167 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00538 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 3.21e-01 0.141 0.141 0.167 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 1.10e-01 -0.2 0.125 0.167 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 1.17e-01 -0.182 0.115 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0834 0.0596 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 3.73e-01 0.104 0.117 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 2.82e-01 0.136 0.126 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 2.34e-01 0.137 0.115 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 7.42e-01 0.0403 0.122 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0079 0.109 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 3.28e-01 0.0915 0.0933 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 8.84e-01 0.0168 0.115 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 2.05e-01 -0.161 0.126 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 5.69e-01 0.0709 0.124 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 847410 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0983 0.0694 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 5.00e-01 0.0794 0.117 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 1.45e-01 -0.185 0.126 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 8.99e-01 0.0147 0.116 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 6.70e-02 0.197 0.107 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0836 0.0986 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 sc-eQTL 4.14e-01 -0.099 0.121 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 1.29e-01 0.188 0.123 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 6.29e-01 -0.061 0.126 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 1.64e-02 0.305 0.126 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 9.13e-01 0.0133 0.121 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 3.52e-01 -0.116 0.124 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0311 0.115 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 5.38e-01 0.0531 0.086 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 2.99e-01 0.0877 0.0842 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0747 0.0977 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 7.25e-01 0.0379 0.107 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -512080 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0591 0.122 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0246 0.119 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 4.85e-01 0.0819 0.117 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 6.83e-01 0.0464 0.114 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 6.76e-01 0.0474 0.113 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0487 0.116 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 7.78e-01 0.033 0.117 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -735377 sc-eQTL 1.88e-02 0.273 0.115 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -809087 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0642 0.103 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -636668 sc-eQTL 1.10e-01 0.162 0.101 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -600953 sc-eQTL 8.59e-01 0.0191 0.107 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -886625 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0138 0.116 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -636554 sc-eQTL 5.89e-01 0.0607 0.112 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 -974585 sc-eQTL 1.88e-01 0.167 0.127 0.177 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000179088 C12orf42 -166856 eQTL 0.00443 -0.0663 0.0233 0.0 0.0 0.201
ENSG00000214198 TTC41P -601057 eQTL 0.00452 0.135 0.0474 0.00246 0.0 0.201


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina