logo

Genes within 1Mb (chr12:103302404:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 8.22e-01 0.0117 0.0521 0.177 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 4.32e-01 0.0896 0.114 0.177 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0135 0.106 0.177 B L1
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 1.53e-01 0.147 0.102 0.177 B L1
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 1.17e-01 0.16 0.102 0.177 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 7.99e-01 0.0164 0.0643 0.177 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0595 0.0959 0.177 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 3.10e-01 0.103 0.101 0.177 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 2.73e-01 -0.121 0.11 0.177 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 6.36e-01 0.0467 0.0986 0.177 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 9.91e-02 -0.163 0.0985 0.177 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 9.99e-03 -0.218 0.0839 0.177 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 8.11e-02 0.153 0.0871 0.177 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0689 0.0947 0.177 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 5.98e-02 -0.205 0.108 0.177 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 1.96e-02 -0.214 0.091 0.177 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 4.22e-01 0.0757 0.0941 0.177 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 7.28e-01 0.0348 0.0998 0.177 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0697 0.108 0.177 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 7.30e-01 0.0349 0.101 0.177 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 3.49e-01 0.0854 0.0909 0.177 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 6.81e-01 0.0397 0.0965 0.177 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 1.10e-01 -0.186 0.116 0.177 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0714 0.104 0.177 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 4.74e-01 0.0796 0.111 0.177 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0843 0.125 0.176 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0755 0.134 0.176 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 3.13e-01 -0.121 0.119 0.176 DC L1
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 1.79e-01 0.164 0.122 0.176 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0175 0.0804 0.176 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0851 0.105 0.176 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.115 0.176 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 6.48e-01 0.0579 0.127 0.176 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 8.09e-01 0.031 0.128 0.177 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0551 0.118 0.177 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 9.96e-01 0.00061 0.11 0.177 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 9.16e-01 0.00897 0.0845 0.177 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0146 0.0846 0.177 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0938 0.0968 0.177 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 8.74e-01 0.0173 0.109 0.177 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 6.19e-02 0.211 0.112 0.178 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0242 0.104 0.178 NK L1
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 2.40e-01 0.114 0.0967 0.178 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 6.73e-01 0.0454 0.107 0.178 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0397 0.115 0.178 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 2.93e-01 0.113 0.107 0.178 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0227 0.0403 0.177 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 5.21e-01 0.0742 0.115 0.177 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 2.65e-01 0.131 0.117 0.177 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0918 0.107 0.177 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0267 0.103 0.177 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 5.83e-02 0.175 0.0922 0.177 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0233 0.117 0.177 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 2.50e-01 0.113 0.0979 0.177 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00326 0.12 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 9.70e-01 -0.000932 0.0249 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 2.16e-01 0.143 0.115 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000928 0.127 0.176 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 5.43e-01 0.0837 0.137 0.176 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 5.88e-01 0.0744 0.137 0.176 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0438 0.148 0.176 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 5.25e-01 0.072 0.113 0.176 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0692 0.136 0.176 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 4.39e-01 0.0962 0.124 0.176 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0545 0.0524 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0763 0.118 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0541 0.124 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 5.97e-01 0.0697 0.132 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0113 0.132 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0801 0.118 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 1.32e-01 0.174 0.115 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0465 0.128 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 3.67e-01 -0.113 0.125 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0675 0.048 0.179 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 8.29e-01 0.0264 0.122 0.179 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 7.08e-02 0.236 0.13 0.179 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 2.46e-01 0.15 0.129 0.179 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0338 0.132 0.179 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 2.87e-01 0.124 0.116 0.179 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0401 0.121 0.179 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 5.89e-01 0.0658 0.122 0.179 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0778 0.129 0.179 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 5.04e-03 -0.182 0.0644 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 7.76e-01 0.0332 0.117 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 1.64e-01 -0.178 0.127 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 5.10e-01 -0.08 0.121 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 1.42e-01 0.165 0.112 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0431 0.0959 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 2.81e-01 -0.134 0.124 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 1.75e-01 0.17 0.125 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 9.64e-01 -0.0056 0.123 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 3.17e-01 0.0573 0.0572 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 4.94e-01 0.0841 0.123 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 2.12e-01 -0.162 0.129 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 4.50e-02 0.252 0.125 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 1.37e-01 0.171 0.114 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 2.83e-01 -0.125 0.117 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 7.58e-01 0.0375 0.121 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 8.59e-01 -0.022 0.124 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 1.24e-01 -0.197 0.127 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 2.14e-01 0.144 0.115 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0697 0.131 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 1.92e-01 -0.17 0.13 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 9.17e-01 0.0144 0.137 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 1.23e-01 0.179 0.116 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 1.95e-01 0.154 0.119 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 2.65e-01 0.149 0.133 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 9.21e-01 0.0128 0.129 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 3.77e-01 0.0902 0.102 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 1.06e-02 -0.27 0.105 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 5.85e-02 -0.172 0.0905 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 1.36e-01 0.138 0.0919 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0959 0.0939 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 1.25e-01 -0.173 0.113 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 3.88e-02 -0.208 0.1 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 4.77e-02 0.203 0.102 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0534 0.118 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 5.32e-01 0.0785 0.125 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 1.47e-01 -0.163 0.112 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 9.43e-03 0.263 0.101 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 9.21e-01 0.01 0.101 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 2.05e-02 -0.269 0.115 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0481 0.111 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 3.85e-01 -0.1 0.115 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0609 0.126 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0578 0.129 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0728 0.123 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0283 0.122 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0552 0.121 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 7.83e-02 -0.221 0.125 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 6.47e-03 -0.321 0.117 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0673 0.122 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00314 0.112 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 1.42e-01 -0.186 0.126 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0212 0.119 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 4.92e-02 0.233 0.118 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 6.57e-01 0.0463 0.104 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0559 0.123 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0115 0.126 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0403 0.113 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 5.64e-01 0.0662 0.115 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0667 0.126 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 5.56e-01 0.0686 0.116 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0223 0.105 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 9.75e-01 0.00312 0.0995 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 5.21e-02 -0.231 0.118 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 5.00e-02 -0.239 0.121 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 5.35e-01 0.0717 0.115 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 9.52e-01 0.00737 0.123 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0377 0.137 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 8.00e-01 -0.035 0.138 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 4.88e-01 0.0942 0.136 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0798 0.129 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 9.05e-01 0.0151 0.127 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 3.58e-01 -0.13 0.141 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 9.35e-01 0.0115 0.14 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 5.32e-01 0.0733 0.117 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 3.90e-01 -0.109 0.127 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 6.93e-01 0.0481 0.121 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 9.68e-01 0.00528 0.13 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 1.04e-02 0.308 0.119 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 8.61e-01 0.0214 0.122 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00785 0.128 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 7.61e-01 0.0379 0.125 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0358 0.0434 0.173 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 7.26e-01 0.0426 0.121 0.173 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 9.99e-01 0.000107 0.124 0.173 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 3.28e-01 0.118 0.121 0.173 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0314 0.131 0.173 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 2.31e-03 0.383 0.124 0.173 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 9.48e-01 0.00738 0.114 0.173 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 1.81e-03 0.399 0.126 0.173 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 1.45e-01 0.186 0.127 0.173 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0773 0.129 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0851 0.131 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 5.23e-01 -0.085 0.133 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 8.02e-02 0.229 0.13 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 4.76e-02 -0.262 0.131 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 6.14e-01 0.0703 0.139 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 1.38e-01 0.187 0.125 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0558 0.113 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 1.17e-01 0.167 0.106 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 7.38e-01 0.0358 0.107 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0897 0.116 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 7.32e-01 -0.042 0.123 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 2.42e-01 0.158 0.135 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 8.81e-01 0.0207 0.138 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 3.09e-02 0.292 0.134 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 8.90e-02 0.226 0.132 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 3.45e-01 0.135 0.142 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 3.48e-01 -0.116 0.123 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 5.85e-01 0.0707 0.129 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 6.42e-01 0.0522 0.112 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 1.42e-02 0.28 0.113 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 6.42e-01 0.053 0.114 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 2.39e-01 0.145 0.123 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 1.97e-01 0.154 0.119 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0926 0.088 0.207 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 3.29e-01 -0.135 0.138 0.207 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00678 0.119 0.207 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0389 0.138 0.207 PB L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 4.71e-01 0.102 0.141 0.207 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0869 0.0645 0.207 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 5.04e-01 0.0761 0.114 0.207 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0429 0.121 0.207 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0399 0.142 0.207 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 9.27e-01 0.00406 0.0443 0.172 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 6.84e-01 0.0452 0.111 0.172 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 2.07e-01 0.152 0.12 0.172 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0569 0.125 0.172 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0662 0.118 0.172 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0444 0.0827 0.172 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 1.42e-01 -0.166 0.113 0.172 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 2.75e-01 -0.11 0.1 0.172 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 3.77e-01 -0.103 0.117 0.172 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0139 0.116 0.177 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 1.62e-01 -0.186 0.133 0.177 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 1.43e-01 -0.173 0.118 0.177 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 4.64e-01 -0.096 0.131 0.177 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 4.91e-01 0.0834 0.121 0.177 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 8.55e-01 0.019 0.104 0.177 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 1.87e-02 0.299 0.126 0.177 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00225 0.131 0.177 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 3.71e-01 -0.128 0.142 0.168 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 9.98e-01 0.000388 0.125 0.168 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0944 0.133 0.168 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 1.80e-01 0.184 0.137 0.168 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 8.70e-01 0.02 0.122 0.168 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 5.84e-01 0.0497 0.0907 0.168 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 8.43e-01 0.0253 0.127 0.168 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 6.47e-01 0.0581 0.127 0.168 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 3.57e-01 0.111 0.12 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0605 0.122 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 6.23e-01 0.0614 0.125 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 3.02e-01 0.0987 0.0954 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 1.70e-01 0.127 0.0922 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0418 0.105 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 8.39e-01 0.0227 0.111 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 5.92e-02 -0.228 0.12 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0239 0.126 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 3.94e-01 -0.1 0.117 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0238 0.108 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 7.26e-01 0.0333 0.095 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 1.30e-01 -0.172 0.113 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 8.65e-01 0.0205 0.12 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0156 0.151 0.148 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 2.11e-01 -0.196 0.155 0.148 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 5.02e-01 -0.101 0.149 0.148 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 8.46e-02 0.259 0.149 0.148 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 8.16e-03 0.416 0.155 0.148 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 7.43e-01 -0.049 0.149 0.148 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0836 0.167 0.148 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00587 0.152 0.148 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 6.43e-01 0.055 0.119 0.176 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0422 0.125 0.176 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0197 0.131 0.176 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 3.70e-01 0.11 0.122 0.176 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0707 0.109 0.176 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 8.40e-01 0.0256 0.126 0.176 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 9.98e-01 0.000242 0.112 0.176 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0477 0.122 0.17 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 9.94e-01 0.000918 0.122 0.17 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 2.48e-01 0.142 0.122 0.17 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.119 0.17 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 3.01e-01 0.11 0.106 0.17 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 9.53e-01 -0.007 0.12 0.17 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 7.95e-01 0.0311 0.12 0.17 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0565 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00341 0.145 0.167 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 2.78e-01 -0.165 0.151 0.167 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 1.99e-01 0.166 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0804 0.101 0.167 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00538 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 3.21e-01 0.141 0.141 0.167 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 1.10e-01 -0.2 0.125 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0834 0.0596 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 3.73e-01 0.104 0.117 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 2.82e-01 0.136 0.126 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 2.34e-01 0.137 0.115 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 7.42e-01 0.0403 0.122 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0079 0.109 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 3.28e-01 0.0915 0.0933 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 8.84e-01 0.0168 0.115 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 2.05e-01 -0.161 0.126 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 820660 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0983 0.0694 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 5.00e-01 0.0794 0.117 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 1.45e-01 -0.185 0.126 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 8.99e-01 0.0147 0.116 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 6.70e-02 0.197 0.107 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0836 0.0986 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 sc-eQTL 4.14e-01 -0.099 0.121 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 1.29e-01 0.188 0.123 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 6.29e-01 -0.061 0.126 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 9.13e-01 0.0133 0.121 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 3.52e-01 -0.116 0.124 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0311 0.115 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 5.38e-01 0.0531 0.086 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 2.99e-01 0.0877 0.0842 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0747 0.0977 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 7.25e-01 0.0379 0.107 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -538830 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0591 0.122 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0246 0.119 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 4.85e-01 0.0819 0.117 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 6.83e-01 0.0464 0.114 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 6.76e-01 0.0474 0.113 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0487 0.116 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 7.78e-01 0.033 0.117 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -762127 sc-eQTL 1.88e-02 0.273 0.115 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -835837 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0642 0.103 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -663418 sc-eQTL 1.10e-01 0.162 0.101 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -627703 sc-eQTL 8.59e-01 0.0191 0.107 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -913375 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0138 0.116 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -663304 sc-eQTL 5.89e-01 0.0607 0.112 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 eQTL 0.00507 -0.0646 0.023 0.0 0.0 0.201
ENSG00000214198 TTC41P -627807 eQTL 0.00798 0.125 0.0469 0.00199 0.0 0.201

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000179088 C12orf42 -193606 1.33e-05 1.29e-05 2.27e-06 7.65e-06 2.03e-06 4.42e-06 1.23e-05 1.34e-06 9.63e-06 4.42e-06 1.09e-05 5.59e-06 1.47e-05 3.78e-06 2.52e-06 7.01e-06 4.31e-06 5.6e-06 2.64e-06 2.77e-06 5.19e-06 8.39e-06 1.01e-05 3.32e-06 2.16e-05 3.86e-06 4.46e-06 3.91e-06 1.23e-05 7.74e-06 4.82e-06 4.62e-07 1.1e-06 3.76e-06 5.47e-06 2.67e-06 1.71e-06 1.66e-06 1.38e-06 1.69e-06 1e-06 1.89e-05 2.71e-06 2.91e-07 7.82e-07 1.75e-06 1.14e-06 6.92e-07 4.27e-07