Genes within 1Mb (chr12:103300534:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0554 0.0494 0.177 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0894 0.108 0.177 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 8.66e-02 -0.173 0.101 0.177 B L1
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 1.10e-01 0.156 0.0971 0.177 B L1
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 4.33e-01 0.0765 0.0974 0.177 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 2.98e-01 0.0637 0.0611 0.177 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 7.62e-01 0.0277 0.0914 0.177 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 9.82e-01 0.0022 0.0964 0.177 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 6.14e-01 0.0531 0.105 0.177 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 9.41e-01 0.00681 0.0921 0.177 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 3.84e-01 0.0807 0.0924 0.177 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 2.38e-01 0.0939 0.0793 0.177 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 4.09e-01 0.0676 0.0818 0.177 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 4.24e-01 0.0708 0.0884 0.177 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 2.85e-02 -0.223 0.101 0.177 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0343 0.086 0.177 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 6.23e-01 0.0432 0.0879 0.177 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 8.41e-01 0.0188 0.094 0.177 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0774 0.101 0.177 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0731 0.0952 0.177 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 4.53e-01 0.0645 0.0857 0.177 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 6.06e-01 0.0469 0.0908 0.177 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0962 0.11 0.177 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 5.05e-01 0.0651 0.0976 0.177 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0361 0.105 0.177 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 8.94e-01 0.015 0.113 0.171 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 4.95e-02 0.237 0.12 0.171 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0184 0.109 0.171 DC L1
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 7.34e-01 0.0378 0.111 0.171 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00916 0.0729 0.171 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 5.96e-01 0.0508 0.0955 0.171 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 6.42e-01 0.0487 0.104 0.171 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 2.82e-01 -0.124 0.115 0.171 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0573 0.118 0.177 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 2.96e-01 0.113 0.108 0.177 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0176 0.101 0.177 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0112 0.0778 0.177 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 3.03e-02 0.168 0.077 0.177 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0323 0.0893 0.177 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 2.37e-01 0.118 0.0997 0.177 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 5.71e-01 0.0593 0.104 0.176 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0731 0.0962 0.176 NK L1
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 7.36e-01 0.0303 0.0897 0.176 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000729 0.0992 0.176 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0741 0.106 0.176 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 1.77e-01 -0.134 0.0986 0.176 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 9.38e-01 0.00283 0.0364 0.177 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00077 0.104 0.177 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0984 0.106 0.177 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00604 0.0964 0.177 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0229 0.0926 0.177 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 8.19e-01 0.0193 0.0839 0.177 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 1.87e-01 -0.139 0.105 0.177 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 2.61e-01 0.0996 0.0884 0.177 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 1.71e-01 -0.148 0.108 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 2.15e-01 -0.029 0.0234 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 1.90e-01 -0.143 0.108 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 7.62e-01 0.0364 0.12 0.176 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00383 0.129 0.176 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 4.15e-01 0.105 0.129 0.176 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 8.93e-02 -0.236 0.138 0.176 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 6.47e-01 0.0488 0.106 0.176 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0262 0.128 0.176 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 1.72e-01 0.159 0.116 0.176 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 7.34e-01 0.0166 0.0488 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0559 0.11 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0313 0.115 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0201 0.122 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 4.20e-01 0.0993 0.123 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 7.92e-01 0.029 0.11 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00367 0.107 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0334 0.119 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 7.51e-01 0.0369 0.116 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0342 0.0442 0.175 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 5.04e-02 -0.218 0.111 0.175 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 2.50e-01 -0.138 0.12 0.175 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 2.85e-01 0.127 0.119 0.175 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 8.47e-01 0.0234 0.121 0.175 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 5.92e-01 0.0574 0.107 0.175 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 5.81e-02 0.209 0.11 0.175 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 4.97e-02 0.218 0.111 0.175 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 6.62e-01 0.0517 0.118 0.175 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 1.62e-01 0.0864 0.0616 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 1.72e-01 -0.15 0.11 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 7.65e-01 0.0361 0.121 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 8.12e-02 0.199 0.114 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 3.73e-01 0.0947 0.106 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 3.85e-01 0.0787 0.0904 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 6.77e-01 -0.049 0.117 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 2.15e-01 -0.147 0.118 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0443 0.116 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0159 0.0553 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 5.95e-01 0.063 0.118 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 3.01e-01 0.129 0.125 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 1.72e-01 0.166 0.121 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0517 0.111 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 7.78e-02 0.198 0.112 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 6.38e-01 0.0551 0.117 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 9.38e-01 0.00928 0.12 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00525 0.123 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 7.06e-01 0.04 0.106 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0117 0.12 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 9.97e-01 0.000445 0.12 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 6.82e-01 0.0516 0.126 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 2.84e-01 0.115 0.107 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 4.90e-02 -0.215 0.108 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 3.51e-01 -0.114 0.122 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0757 0.118 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0872 0.0968 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 2.28e-01 0.122 0.101 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 4.09e-02 0.177 0.0859 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 5.57e-01 0.0515 0.0877 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 6.69e-01 0.0383 0.0894 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 5.40e-02 -0.207 0.107 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 8.62e-01 0.0167 0.096 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0115 0.098 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0784 0.109 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 7.57e-01 -0.036 0.116 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 4.51e-01 0.0786 0.104 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 1.95e-01 0.122 0.0941 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 4.91e-01 0.0641 0.093 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 1.92e-01 -0.141 0.108 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 5.34e-01 -0.064 0.103 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 3.03e-01 0.11 0.107 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 2.17e-01 0.143 0.115 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 8.15e-01 0.0276 0.118 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 3.07e-01 -0.115 0.112 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0383 0.111 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 5.34e-01 0.0689 0.111 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0211 0.115 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 1.27e-02 0.27 0.107 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 5.36e-01 0.0691 0.111 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 8.99e-01 0.0131 0.104 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 1.39e-01 -0.173 0.116 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 9.71e-01 0.00395 0.11 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 8.67e-01 0.0184 0.11 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 6.22e-01 0.0477 0.0964 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 3.70e-01 -0.102 0.113 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 1.44e-01 0.17 0.116 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0559 0.105 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 8.88e-01 0.015 0.107 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 6.13e-01 0.0591 0.117 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 6.44e-01 0.0501 0.108 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 8.23e-01 0.0218 0.0971 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 2.23e-01 0.113 0.0921 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 2.44e-01 -0.129 0.11 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00133 0.114 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 5.10e-01 0.0707 0.107 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 6.15e-02 0.201 0.107 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 7.81e-01 0.0334 0.12 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 4.52e-01 -0.091 0.121 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 1.96e-01 0.154 0.119 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 7.71e-01 -0.033 0.113 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00566 0.111 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0175 0.124 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 6.81e-01 0.0507 0.123 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 4.27e-01 0.0883 0.111 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0399 0.121 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 2.92e-01 0.122 0.115 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 1.07e-01 0.199 0.123 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 8.67e-01 0.0193 0.115 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0141 0.116 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 2.71e-01 0.134 0.122 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0855 0.118 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 4.23e-01 0.0319 0.0397 0.18 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 2.11e-01 -0.139 0.111 0.18 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 8.63e-01 0.0197 0.114 0.18 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 2.01e-01 -0.141 0.11 0.18 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 8.65e-01 0.0204 0.12 0.18 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00566 0.116 0.18 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 1.28e-01 -0.159 0.104 0.18 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 8.80e-02 0.201 0.117 0.18 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 4.52e-02 -0.234 0.116 0.18 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 6.22e-01 0.0567 0.115 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0109 0.116 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0296 0.118 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 5.36e-01 0.0725 0.117 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 4.87e-01 0.082 0.118 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0386 0.124 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 5.11e-01 0.0764 0.116 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 9.70e-01 0.00394 0.104 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 5.81e-01 0.0543 0.0983 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00666 0.0986 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0865 0.107 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 2.98e-01 -0.118 0.113 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 8.71e-02 -0.203 0.118 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00283 0.121 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 4.02e-01 0.1 0.119 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 5.61e-01 0.0682 0.117 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 3.37e-01 0.12 0.125 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 7.32e-01 0.0371 0.108 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 6.49e-01 -0.053 0.117 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0806 0.101 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 6.37e-01 0.0488 0.103 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 3.52e-01 0.0955 0.102 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0551 0.111 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 1.54e-01 -0.153 0.107 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 9.21e-01 0.00864 0.0874 0.174 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 4.46e-01 0.105 0.137 0.174 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 2.10e-01 -0.147 0.117 0.174 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0485 0.137 0.174 PB L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 1.18e-01 0.218 0.138 0.174 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 3.93e-01 0.055 0.0641 0.174 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0619 0.112 0.174 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0585 0.12 0.174 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 1.25e-01 0.215 0.139 0.174 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 7.79e-01 0.0113 0.0403 0.18 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 5.94e-01 0.0538 0.101 0.18 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 1.70e-01 -0.151 0.109 0.18 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00303 0.113 0.18 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 3.50e-01 -0.101 0.107 0.18 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0266 0.0752 0.18 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 8.12e-01 0.0246 0.103 0.18 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 1.95e-01 0.118 0.0911 0.18 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 4.24e-01 -0.085 0.106 0.18 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 5.00e-01 0.0719 0.106 0.177 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 9.05e-01 0.0147 0.122 0.177 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 9.65e-02 -0.18 0.108 0.177 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 4.27e-01 0.0952 0.12 0.177 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 8.58e-01 0.0198 0.111 0.177 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0309 0.0951 0.177 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 2.36e-01 -0.138 0.116 0.177 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 9.54e-02 0.199 0.119 0.177 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 3.70e-01 -0.115 0.127 0.173 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 7.20e-01 0.0401 0.112 0.173 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 4.99e-01 0.081 0.119 0.173 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 9.10e-01 0.0139 0.123 0.173 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00832 0.109 0.173 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 8.55e-02 -0.139 0.0805 0.173 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0839 0.114 0.173 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 1.82e-01 -0.151 0.113 0.173 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 2.68e-01 -0.123 0.111 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 1.70e-01 0.155 0.112 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0274 0.115 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 7.62e-01 0.0268 0.0883 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 5.49e-02 0.164 0.0847 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0244 0.0966 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 7.92e-01 0.0271 0.103 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 1.69e-01 0.156 0.113 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0241 0.118 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 9.08e-01 0.0127 0.11 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 1.08e-01 -0.162 0.101 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 6.16e-01 0.0447 0.089 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0241 0.107 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 3.16e-01 0.113 0.112 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 2.96e-01 0.145 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0393 0.144 0.167 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0573 0.137 0.167 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 7.16e-02 -0.249 0.137 0.167 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 3.50e-01 0.137 0.146 0.167 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 2.14e-01 0.171 0.137 0.167 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0484 0.154 0.167 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0397 0.14 0.167 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 1.73e-01 -0.146 0.107 0.178 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 4.26e-01 0.0907 0.114 0.178 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 1.95e-01 -0.154 0.119 0.178 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 7.20e-01 0.0399 0.111 0.178 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 1.86e-02 0.233 0.098 0.178 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 5.37e-01 0.0709 0.115 0.178 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 3.23e-01 -0.101 0.102 0.178 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0501 0.114 0.174 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00133 0.114 0.174 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0642 0.115 0.174 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 8.76e-01 0.0174 0.111 0.174 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 8.75e-02 0.169 0.0982 0.174 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0102 0.112 0.174 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 6.98e-01 0.0434 0.112 0.174 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 1.19e-01 0.178 0.114 0.178 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 2.00e-01 0.166 0.129 0.178 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 7.89e-02 -0.237 0.134 0.178 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 4.25e-01 0.0919 0.115 0.178 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 2.37e-01 -0.106 0.0895 0.178 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 6.76e-01 0.049 0.117 0.178 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 3.72e-01 0.113 0.126 0.178 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 8.37e-01 -0.023 0.112 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0144 0.0561 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 1.27e-01 -0.167 0.109 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 3.37e-01 -0.113 0.118 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 2.77e-01 0.118 0.108 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 3.18e-01 0.114 0.114 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0265 0.102 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 2.34e-01 0.104 0.0873 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 8.59e-01 0.0192 0.108 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 6.31e-01 0.0571 0.119 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 818790 sc-eQTL 4.25e-01 0.0526 0.0658 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0775 0.111 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 5.75e-01 0.0673 0.12 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 7.21e-03 0.292 0.108 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00326 0.102 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 3.72e-01 0.0834 0.0932 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 sc-eQTL 6.29e-01 0.0555 0.115 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 2.66e-01 -0.13 0.117 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0832 0.119 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0577 0.113 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 3.28e-01 0.113 0.115 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 7.59e-01 0.0328 0.107 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0414 0.08 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 1.37e-01 0.117 0.0781 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0563 0.0909 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 6.53e-01 0.0449 0.0998 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -540700 sc-eQTL 2.22e-01 -0.139 0.113 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 4.51e-01 0.084 0.111 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0769 0.109 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 7.08e-01 0.0397 0.106 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 9.60e-02 0.176 0.105 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 6.49e-01 0.0491 0.108 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 7.79e-01 0.0307 0.109 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -763997 sc-eQTL 7.91e-01 0.0286 0.108 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -837707 sc-eQTL 6.67e-01 -0.041 0.0951 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -665288 sc-eQTL 6.04e-01 0.0487 0.0938 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -629573 sc-eQTL 8.62e-01 0.0171 0.0987 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -915245 sc-eQTL 4.12e-01 -0.088 0.107 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -665174 sc-eQTL 3.31e-01 -0.101 0.103 0.177 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136011 STAB2 -286739 pQTL 0.0137 0.071 0.0287 0.0 0.0 0.181
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 eQTL 0.00869 -0.0651 0.0247 0.0 0.0 0.17


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000179088 C12orf42 -195476 4.99e-06 5.32e-06 7.29e-07 3.87e-06 1.53e-06 1.55e-06 5.03e-06 1.2e-06 5.06e-06 2.81e-06 7.51e-06 3.36e-06 7.64e-06 1.77e-06 9.59e-07 3.85e-06 2e-06 3.96e-06 1.44e-06 1.4e-06 2.77e-06 4.88e-06 4.58e-06 1.35e-06 7.58e-06 2.01e-06 2.34e-06 1.73e-06 4.38e-06 4.14e-06 2.56e-06 4.18e-07 5.23e-07 1.65e-06 1.99e-06 9.06e-07 1.07e-06 5.45e-07 9.23e-07 5.75e-07 4.32e-07 5.79e-06 8.46e-07 1.58e-07 7.43e-07 1.1e-06 1.04e-06 7.35e-07 4.23e-07