logo

Genes within 1Mb (chr12:103298657:GC:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 8.22e-01 0.0117 0.0521 0.177 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 4.32e-01 0.0896 0.114 0.177 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0135 0.106 0.177 B L1
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 1.53e-01 0.147 0.102 0.177 B L1
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 1.17e-01 0.16 0.102 0.177 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 7.99e-01 0.0164 0.0643 0.177 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0595 0.0959 0.177 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 3.10e-01 0.103 0.101 0.177 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 2.73e-01 -0.121 0.11 0.177 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 6.36e-01 0.0467 0.0986 0.177 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 9.91e-02 -0.163 0.0985 0.177 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 9.99e-03 -0.218 0.0839 0.177 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 8.11e-02 0.153 0.0871 0.177 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0689 0.0947 0.177 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 5.98e-02 -0.205 0.108 0.177 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 1.96e-02 -0.214 0.091 0.177 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 4.22e-01 0.0757 0.0941 0.177 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 7.28e-01 0.0348 0.0998 0.177 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0697 0.108 0.177 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 7.30e-01 0.0349 0.101 0.177 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 3.49e-01 0.0854 0.0909 0.177 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 6.81e-01 0.0397 0.0965 0.177 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 1.10e-01 -0.186 0.116 0.177 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0714 0.104 0.177 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 4.74e-01 0.0796 0.111 0.177 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0843 0.125 0.176 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0755 0.134 0.176 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 3.13e-01 -0.121 0.119 0.176 DC L1
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 1.79e-01 0.164 0.122 0.176 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0175 0.0804 0.176 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0851 0.105 0.176 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.115 0.176 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 6.48e-01 0.0579 0.127 0.176 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 8.09e-01 0.031 0.128 0.177 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0551 0.118 0.177 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 9.96e-01 0.00061 0.11 0.177 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 9.16e-01 0.00897 0.0845 0.177 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0146 0.0846 0.177 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0938 0.0968 0.177 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 8.74e-01 0.0173 0.109 0.177 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 6.19e-02 0.211 0.112 0.178 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0242 0.104 0.178 NK L1
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 2.40e-01 0.114 0.0967 0.178 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 6.73e-01 0.0454 0.107 0.178 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0397 0.115 0.178 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 2.93e-01 0.113 0.107 0.178 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0227 0.0403 0.177 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 5.21e-01 0.0742 0.115 0.177 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 2.65e-01 0.131 0.117 0.177 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0918 0.107 0.177 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0267 0.103 0.177 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 5.83e-02 0.175 0.0922 0.177 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0233 0.117 0.177 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 2.50e-01 0.113 0.0979 0.177 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00326 0.12 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 9.70e-01 -0.000932 0.0249 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 2.16e-01 0.143 0.115 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000928 0.127 0.176 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 5.43e-01 0.0837 0.137 0.176 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 5.88e-01 0.0744 0.137 0.176 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0438 0.148 0.176 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 5.25e-01 0.072 0.113 0.176 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0692 0.136 0.176 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 4.39e-01 0.0962 0.124 0.176 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0545 0.0524 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0763 0.118 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0541 0.124 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 5.97e-01 0.0697 0.132 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0113 0.132 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0801 0.118 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 1.32e-01 0.174 0.115 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0465 0.128 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 3.67e-01 -0.113 0.125 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0675 0.048 0.179 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 8.29e-01 0.0264 0.122 0.179 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 7.08e-02 0.236 0.13 0.179 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 2.46e-01 0.15 0.129 0.179 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0338 0.132 0.179 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 2.87e-01 0.124 0.116 0.179 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0401 0.121 0.179 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 5.89e-01 0.0658 0.122 0.179 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0778 0.129 0.179 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 5.04e-03 -0.182 0.0644 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 7.76e-01 0.0332 0.117 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 1.64e-01 -0.178 0.127 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 5.10e-01 -0.08 0.121 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 1.42e-01 0.165 0.112 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0431 0.0959 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 2.81e-01 -0.134 0.124 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 1.75e-01 0.17 0.125 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 9.64e-01 -0.0056 0.123 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 3.17e-01 0.0573 0.0572 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 4.94e-01 0.0841 0.123 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 2.12e-01 -0.162 0.129 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 4.50e-02 0.252 0.125 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 1.37e-01 0.171 0.114 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 2.83e-01 -0.125 0.117 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 7.58e-01 0.0375 0.121 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 8.59e-01 -0.022 0.124 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 1.24e-01 -0.197 0.127 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 2.14e-01 0.144 0.115 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0697 0.131 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 1.92e-01 -0.17 0.13 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 9.17e-01 0.0144 0.137 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 1.23e-01 0.179 0.116 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 1.95e-01 0.154 0.119 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 2.65e-01 0.149 0.133 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 9.21e-01 0.0128 0.129 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 3.77e-01 0.0902 0.102 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 1.06e-02 -0.27 0.105 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 5.85e-02 -0.172 0.0905 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 1.36e-01 0.138 0.0919 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0959 0.0939 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 1.25e-01 -0.173 0.113 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 3.88e-02 -0.208 0.1 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 4.77e-02 0.203 0.102 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0534 0.118 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 5.32e-01 0.0785 0.125 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 1.47e-01 -0.163 0.112 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 9.43e-03 0.263 0.101 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 9.21e-01 0.01 0.101 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 2.05e-02 -0.269 0.115 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0481 0.111 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 3.85e-01 -0.1 0.115 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0609 0.126 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0578 0.129 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0728 0.123 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0283 0.122 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0552 0.121 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 7.83e-02 -0.221 0.125 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 6.47e-03 -0.321 0.117 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0673 0.122 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00314 0.112 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 1.42e-01 -0.186 0.126 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0212 0.119 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 4.92e-02 0.233 0.118 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 6.57e-01 0.0463 0.104 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0559 0.123 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0115 0.126 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0403 0.113 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 5.64e-01 0.0662 0.115 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0667 0.126 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 5.56e-01 0.0686 0.116 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0223 0.105 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 9.75e-01 0.00312 0.0995 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 5.21e-02 -0.231 0.118 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 5.00e-02 -0.239 0.121 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 5.35e-01 0.0717 0.115 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 9.52e-01 0.00737 0.123 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0377 0.137 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 8.00e-01 -0.035 0.138 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 4.88e-01 0.0942 0.136 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0798 0.129 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 9.05e-01 0.0151 0.127 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 3.58e-01 -0.13 0.141 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 9.35e-01 0.0115 0.14 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 5.32e-01 0.0733 0.117 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 3.90e-01 -0.109 0.127 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 6.93e-01 0.0481 0.121 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 9.68e-01 0.00528 0.13 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 1.04e-02 0.308 0.119 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 8.61e-01 0.0214 0.122 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00785 0.128 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 7.61e-01 0.0379 0.125 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0358 0.0434 0.173 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 7.26e-01 0.0426 0.121 0.173 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 9.99e-01 0.000107 0.124 0.173 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 3.28e-01 0.118 0.121 0.173 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0314 0.131 0.173 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 2.31e-03 0.383 0.124 0.173 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 9.48e-01 0.00738 0.114 0.173 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 1.81e-03 0.399 0.126 0.173 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 1.45e-01 0.186 0.127 0.173 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0773 0.129 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0851 0.131 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 5.23e-01 -0.085 0.133 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 8.02e-02 0.229 0.13 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 4.76e-02 -0.262 0.131 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 6.14e-01 0.0703 0.139 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 1.38e-01 0.187 0.125 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0558 0.113 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 1.17e-01 0.167 0.106 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 7.38e-01 0.0358 0.107 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0897 0.116 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 7.32e-01 -0.042 0.123 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 2.42e-01 0.158 0.135 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 8.81e-01 0.0207 0.138 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 3.09e-02 0.292 0.134 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 8.90e-02 0.226 0.132 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 3.45e-01 0.135 0.142 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 3.48e-01 -0.116 0.123 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 5.85e-01 0.0707 0.129 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 6.42e-01 0.0522 0.112 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 1.42e-02 0.28 0.113 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 6.42e-01 0.053 0.114 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 2.39e-01 0.145 0.123 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 1.97e-01 0.154 0.119 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0926 0.088 0.207 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 3.29e-01 -0.135 0.138 0.207 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00678 0.119 0.207 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0389 0.138 0.207 PB L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 4.71e-01 0.102 0.141 0.207 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0869 0.0645 0.207 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 5.04e-01 0.0761 0.114 0.207 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0429 0.121 0.207 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0399 0.142 0.207 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 9.27e-01 0.00406 0.0443 0.172 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 6.84e-01 0.0452 0.111 0.172 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 2.07e-01 0.152 0.12 0.172 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0569 0.125 0.172 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0662 0.118 0.172 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0444 0.0827 0.172 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 1.42e-01 -0.166 0.113 0.172 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 2.75e-01 -0.11 0.1 0.172 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 3.77e-01 -0.103 0.117 0.172 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0139 0.116 0.177 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 1.62e-01 -0.186 0.133 0.177 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 1.43e-01 -0.173 0.118 0.177 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 4.64e-01 -0.096 0.131 0.177 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 4.91e-01 0.0834 0.121 0.177 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 8.55e-01 0.019 0.104 0.177 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 1.87e-02 0.299 0.126 0.177 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00225 0.131 0.177 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 3.71e-01 -0.128 0.142 0.168 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 9.98e-01 0.000388 0.125 0.168 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0944 0.133 0.168 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 1.80e-01 0.184 0.137 0.168 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 8.70e-01 0.02 0.122 0.168 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 5.84e-01 0.0497 0.0907 0.168 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 8.43e-01 0.0253 0.127 0.168 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 6.47e-01 0.0581 0.127 0.168 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 3.57e-01 0.111 0.12 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0605 0.122 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 6.23e-01 0.0614 0.125 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 3.02e-01 0.0987 0.0954 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 1.70e-01 0.127 0.0922 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0418 0.105 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 8.39e-01 0.0227 0.111 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 5.92e-02 -0.228 0.12 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0239 0.126 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 3.94e-01 -0.1 0.117 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0238 0.108 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 7.26e-01 0.0333 0.095 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 1.30e-01 -0.172 0.113 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 8.65e-01 0.0205 0.12 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0156 0.151 0.148 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 2.11e-01 -0.196 0.155 0.148 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 5.02e-01 -0.101 0.149 0.148 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 8.46e-02 0.259 0.149 0.148 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 8.16e-03 0.416 0.155 0.148 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 7.43e-01 -0.049 0.149 0.148 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0836 0.167 0.148 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00587 0.152 0.148 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 6.43e-01 0.055 0.119 0.176 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0422 0.125 0.176 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0197 0.131 0.176 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 3.70e-01 0.11 0.122 0.176 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0707 0.109 0.176 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 8.40e-01 0.0256 0.126 0.176 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 9.98e-01 0.000242 0.112 0.176 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0477 0.122 0.17 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 9.94e-01 0.000918 0.122 0.17 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 2.48e-01 0.142 0.122 0.17 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.119 0.17 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 3.01e-01 0.11 0.106 0.17 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 9.53e-01 -0.007 0.12 0.17 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 7.95e-01 0.0311 0.12 0.17 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0565 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00341 0.145 0.167 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 2.78e-01 -0.165 0.151 0.167 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 1.99e-01 0.166 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0804 0.101 0.167 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00538 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 3.21e-01 0.141 0.141 0.167 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 1.10e-01 -0.2 0.125 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0834 0.0596 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 3.73e-01 0.104 0.117 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 2.82e-01 0.136 0.126 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 2.34e-01 0.137 0.115 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 7.42e-01 0.0403 0.122 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0079 0.109 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 3.28e-01 0.0915 0.0933 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 8.84e-01 0.0168 0.115 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 2.05e-01 -0.161 0.126 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 816913 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0983 0.0694 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 5.00e-01 0.0794 0.117 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 1.45e-01 -0.185 0.126 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 8.99e-01 0.0147 0.116 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 6.70e-02 0.197 0.107 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0836 0.0986 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 sc-eQTL 4.14e-01 -0.099 0.121 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 1.29e-01 0.188 0.123 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 6.29e-01 -0.061 0.126 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 9.13e-01 0.0133 0.121 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 3.52e-01 -0.116 0.124 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0311 0.115 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 5.38e-01 0.0531 0.086 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 2.99e-01 0.0877 0.0842 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0747 0.0977 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 7.25e-01 0.0379 0.107 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -542577 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0591 0.122 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0246 0.119 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 4.85e-01 0.0819 0.117 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 6.83e-01 0.0464 0.114 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 6.76e-01 0.0474 0.113 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0487 0.116 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 7.78e-01 0.033 0.117 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -765874 sc-eQTL 1.88e-02 0.273 0.115 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -839584 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0642 0.103 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -667165 sc-eQTL 1.10e-01 0.162 0.101 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -631450 sc-eQTL 8.59e-01 0.0191 0.107 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -917122 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0138 0.116 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -667051 sc-eQTL 5.89e-01 0.0607 0.112 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 eQTL 0.00385 -0.067 0.0231 0.0 0.0 0.201
ENSG00000214198 TTC41P -631554 eQTL 0.00498 0.133 0.0472 0.00246 0.0 0.201

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000179088 C12orf42 -197353 4.26e-06 3.7e-06 9.13e-07 1.25e-06 1.32e-06 1.29e-06 2.07e-06 3.62e-07 1.71e-06 7.24e-07 1.93e-06 1.35e-06 3.28e-06 1.34e-06 9.26e-07 1.96e-06 1.09e-06 1.09e-06 5.54e-07 6.21e-07 7.86e-07 1.96e-06 2.28e-06 7.82e-07 3.92e-06 1.02e-06 1.02e-06 8.14e-07 2.07e-06 1.39e-06 8.43e-07 3.87e-08 2.77e-07 1.24e-06 1.67e-06 5.22e-07 6.81e-07 3.47e-07 2.9e-07 3.01e-07 1.91e-07 4.34e-06 1.42e-06 2.07e-07 3.05e-07 3.15e-07 2.08e-07 2.3e-07 1.91e-07