Genes within 1Mb (chr12:103288099:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0554 0.0494 0.177 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0894 0.108 0.177 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 8.66e-02 -0.173 0.101 0.177 B L1
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 1.10e-01 0.156 0.0971 0.177 B L1
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 4.33e-01 0.0765 0.0974 0.177 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 2.98e-01 0.0637 0.0611 0.177 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 7.62e-01 0.0277 0.0914 0.177 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 9.82e-01 0.0022 0.0964 0.177 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 6.14e-01 0.0531 0.105 0.177 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 9.41e-01 0.00681 0.0921 0.177 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 3.84e-01 0.0807 0.0924 0.177 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 2.38e-01 0.0939 0.0793 0.177 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 4.09e-01 0.0676 0.0818 0.177 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 4.24e-01 0.0708 0.0884 0.177 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 2.85e-02 -0.223 0.101 0.177 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0343 0.086 0.177 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 6.23e-01 0.0432 0.0879 0.177 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 8.41e-01 0.0188 0.094 0.177 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0774 0.101 0.177 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0731 0.0952 0.177 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 4.53e-01 0.0645 0.0857 0.177 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 6.06e-01 0.0469 0.0908 0.177 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0962 0.11 0.177 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 5.05e-01 0.0651 0.0976 0.177 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0361 0.105 0.177 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 8.94e-01 0.015 0.113 0.171 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 4.95e-02 0.237 0.12 0.171 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0184 0.109 0.171 DC L1
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 7.34e-01 0.0378 0.111 0.171 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00916 0.0729 0.171 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 5.96e-01 0.0508 0.0955 0.171 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 6.42e-01 0.0487 0.104 0.171 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 2.82e-01 -0.124 0.115 0.171 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0573 0.118 0.177 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 2.96e-01 0.113 0.108 0.177 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0176 0.101 0.177 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0112 0.0778 0.177 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 3.03e-02 0.168 0.077 0.177 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0323 0.0893 0.177 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 2.37e-01 0.118 0.0997 0.177 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 5.71e-01 0.0593 0.104 0.176 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0731 0.0962 0.176 NK L1
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 7.36e-01 0.0303 0.0897 0.176 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000729 0.0992 0.176 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0741 0.106 0.176 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 1.77e-01 -0.134 0.0986 0.176 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 9.38e-01 0.00283 0.0364 0.177 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00077 0.104 0.177 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0984 0.106 0.177 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00604 0.0964 0.177 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0229 0.0926 0.177 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 8.19e-01 0.0193 0.0839 0.177 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 1.87e-01 -0.139 0.105 0.177 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 2.61e-01 0.0996 0.0884 0.177 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 1.71e-01 -0.148 0.108 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 2.15e-01 -0.029 0.0234 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 1.90e-01 -0.143 0.108 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 7.62e-01 0.0364 0.12 0.176 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00383 0.129 0.176 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 4.15e-01 0.105 0.129 0.176 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 8.93e-02 -0.236 0.138 0.176 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 6.47e-01 0.0488 0.106 0.176 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0262 0.128 0.176 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 1.72e-01 0.159 0.116 0.176 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 7.34e-01 0.0166 0.0488 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0559 0.11 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0313 0.115 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0201 0.122 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 4.20e-01 0.0993 0.123 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 7.92e-01 0.029 0.11 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00367 0.107 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0334 0.119 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 7.51e-01 0.0369 0.116 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0342 0.0442 0.175 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 5.04e-02 -0.218 0.111 0.175 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 2.50e-01 -0.138 0.12 0.175 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 2.85e-01 0.127 0.119 0.175 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 8.47e-01 0.0234 0.121 0.175 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 5.92e-01 0.0574 0.107 0.175 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 5.81e-02 0.209 0.11 0.175 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 4.97e-02 0.218 0.111 0.175 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 6.62e-01 0.0517 0.118 0.175 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 1.62e-01 0.0864 0.0616 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 1.72e-01 -0.15 0.11 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 7.65e-01 0.0361 0.121 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 8.12e-02 0.199 0.114 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 3.73e-01 0.0947 0.106 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 3.85e-01 0.0787 0.0904 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 6.77e-01 -0.049 0.117 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 2.15e-01 -0.147 0.118 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0443 0.116 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0159 0.0553 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 5.95e-01 0.063 0.118 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 3.01e-01 0.129 0.125 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 1.72e-01 0.166 0.121 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0517 0.111 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 7.78e-02 0.198 0.112 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 6.38e-01 0.0551 0.117 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 9.38e-01 0.00928 0.12 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00525 0.123 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 7.06e-01 0.04 0.106 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0117 0.12 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 9.97e-01 0.000445 0.12 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 6.82e-01 0.0516 0.126 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 2.84e-01 0.115 0.107 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 4.90e-02 -0.215 0.108 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 3.51e-01 -0.114 0.122 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0757 0.118 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0872 0.0968 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 2.28e-01 0.122 0.101 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 4.09e-02 0.177 0.0859 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 5.57e-01 0.0515 0.0877 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 6.69e-01 0.0383 0.0894 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 5.40e-02 -0.207 0.107 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 8.62e-01 0.0167 0.096 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0115 0.098 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0784 0.109 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 7.57e-01 -0.036 0.116 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 4.51e-01 0.0786 0.104 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 1.95e-01 0.122 0.0941 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 4.91e-01 0.0641 0.093 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 1.92e-01 -0.141 0.108 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 5.34e-01 -0.064 0.103 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 3.03e-01 0.11 0.107 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 2.17e-01 0.143 0.115 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 8.15e-01 0.0276 0.118 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 3.07e-01 -0.115 0.112 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0383 0.111 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 5.34e-01 0.0689 0.111 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0211 0.115 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 1.27e-02 0.27 0.107 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 5.36e-01 0.0691 0.111 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 8.99e-01 0.0131 0.104 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 1.39e-01 -0.173 0.116 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 9.71e-01 0.00395 0.11 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 8.67e-01 0.0184 0.11 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 6.22e-01 0.0477 0.0964 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 3.70e-01 -0.102 0.113 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 1.44e-01 0.17 0.116 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0559 0.105 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 8.88e-01 0.015 0.107 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 6.13e-01 0.0591 0.117 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 6.44e-01 0.0501 0.108 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 8.23e-01 0.0218 0.0971 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 2.23e-01 0.113 0.0921 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 2.44e-01 -0.129 0.11 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00133 0.114 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 5.10e-01 0.0707 0.107 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 6.15e-02 0.201 0.107 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 7.81e-01 0.0334 0.12 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 4.52e-01 -0.091 0.121 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 1.96e-01 0.154 0.119 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 7.71e-01 -0.033 0.113 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00566 0.111 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0175 0.124 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 6.81e-01 0.0507 0.123 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 4.27e-01 0.0883 0.111 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0399 0.121 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 2.92e-01 0.122 0.115 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 1.07e-01 0.199 0.123 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 8.67e-01 0.0193 0.115 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0141 0.116 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 2.71e-01 0.134 0.122 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0855 0.118 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 4.23e-01 0.0319 0.0397 0.18 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 2.11e-01 -0.139 0.111 0.18 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 8.63e-01 0.0197 0.114 0.18 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 2.01e-01 -0.141 0.11 0.18 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 8.65e-01 0.0204 0.12 0.18 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00566 0.116 0.18 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 1.28e-01 -0.159 0.104 0.18 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 8.80e-02 0.201 0.117 0.18 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 4.52e-02 -0.234 0.116 0.18 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 6.22e-01 0.0567 0.115 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0109 0.116 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0296 0.118 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 5.36e-01 0.0725 0.117 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 4.87e-01 0.082 0.118 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0386 0.124 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 5.11e-01 0.0764 0.116 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 9.70e-01 0.00394 0.104 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 5.81e-01 0.0543 0.0983 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00666 0.0986 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0865 0.107 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 2.98e-01 -0.118 0.113 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 8.71e-02 -0.203 0.118 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00283 0.121 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 4.02e-01 0.1 0.119 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 5.61e-01 0.0682 0.117 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 3.37e-01 0.12 0.125 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 7.32e-01 0.0371 0.108 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 6.49e-01 -0.053 0.117 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0806 0.101 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 6.37e-01 0.0488 0.103 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 3.52e-01 0.0955 0.102 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0551 0.111 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 1.54e-01 -0.153 0.107 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 9.21e-01 0.00864 0.0874 0.174 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 4.46e-01 0.105 0.137 0.174 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 2.10e-01 -0.147 0.117 0.174 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0485 0.137 0.174 PB L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 1.18e-01 0.218 0.138 0.174 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 3.93e-01 0.055 0.0641 0.174 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0619 0.112 0.174 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0585 0.12 0.174 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 1.25e-01 0.215 0.139 0.174 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 7.79e-01 0.0113 0.0403 0.18 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 5.94e-01 0.0538 0.101 0.18 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 1.70e-01 -0.151 0.109 0.18 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00303 0.113 0.18 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 3.50e-01 -0.101 0.107 0.18 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0266 0.0752 0.18 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 8.12e-01 0.0246 0.103 0.18 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 1.95e-01 0.118 0.0911 0.18 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 4.24e-01 -0.085 0.106 0.18 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 5.00e-01 0.0719 0.106 0.177 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 9.05e-01 0.0147 0.122 0.177 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 9.65e-02 -0.18 0.108 0.177 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 4.27e-01 0.0952 0.12 0.177 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 8.58e-01 0.0198 0.111 0.177 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0309 0.0951 0.177 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 2.36e-01 -0.138 0.116 0.177 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 9.54e-02 0.199 0.119 0.177 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 3.70e-01 -0.115 0.127 0.173 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 7.20e-01 0.0401 0.112 0.173 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 4.99e-01 0.081 0.119 0.173 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 9.10e-01 0.0139 0.123 0.173 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00832 0.109 0.173 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 8.55e-02 -0.139 0.0805 0.173 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0839 0.114 0.173 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 1.82e-01 -0.151 0.113 0.173 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 2.68e-01 -0.123 0.111 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 1.70e-01 0.155 0.112 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0274 0.115 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 7.62e-01 0.0268 0.0883 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 5.49e-02 0.164 0.0847 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0244 0.0966 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 7.92e-01 0.0271 0.103 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 1.69e-01 0.156 0.113 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0241 0.118 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 9.08e-01 0.0127 0.11 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 1.08e-01 -0.162 0.101 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 6.16e-01 0.0447 0.089 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0241 0.107 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 3.16e-01 0.113 0.112 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 2.96e-01 0.145 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0393 0.144 0.167 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0573 0.137 0.167 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 7.16e-02 -0.249 0.137 0.167 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 3.50e-01 0.137 0.146 0.167 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 2.14e-01 0.171 0.137 0.167 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0484 0.154 0.167 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0397 0.14 0.167 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 1.73e-01 -0.146 0.107 0.178 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 4.26e-01 0.0907 0.114 0.178 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 1.95e-01 -0.154 0.119 0.178 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 7.20e-01 0.0399 0.111 0.178 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 1.86e-02 0.233 0.098 0.178 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 5.37e-01 0.0709 0.115 0.178 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 3.23e-01 -0.101 0.102 0.178 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0501 0.114 0.174 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00133 0.114 0.174 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0642 0.115 0.174 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 8.76e-01 0.0174 0.111 0.174 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 8.75e-02 0.169 0.0982 0.174 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0102 0.112 0.174 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 6.98e-01 0.0434 0.112 0.174 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 1.19e-01 0.178 0.114 0.178 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 2.00e-01 0.166 0.129 0.178 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 7.89e-02 -0.237 0.134 0.178 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 4.25e-01 0.0919 0.115 0.178 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 2.37e-01 -0.106 0.0895 0.178 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 6.76e-01 0.049 0.117 0.178 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 3.72e-01 0.113 0.126 0.178 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 8.37e-01 -0.023 0.112 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0144 0.0561 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 1.27e-01 -0.167 0.109 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 3.37e-01 -0.113 0.118 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 2.77e-01 0.118 0.108 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 3.18e-01 0.114 0.114 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0265 0.102 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 2.34e-01 0.104 0.0873 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 8.59e-01 0.0192 0.108 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 6.31e-01 0.0571 0.119 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 806355 sc-eQTL 4.25e-01 0.0526 0.0658 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0775 0.111 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 5.75e-01 0.0673 0.12 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 7.21e-03 0.292 0.108 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00326 0.102 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 3.72e-01 0.0834 0.0932 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 sc-eQTL 6.29e-01 0.0555 0.115 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 2.66e-01 -0.13 0.117 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0832 0.119 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0577 0.113 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 3.28e-01 0.113 0.115 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 7.59e-01 0.0328 0.107 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0414 0.08 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 1.37e-01 0.117 0.0781 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0563 0.0909 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 6.53e-01 0.0449 0.0998 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -553135 sc-eQTL 2.22e-01 -0.139 0.113 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 4.51e-01 0.084 0.111 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0769 0.109 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 7.08e-01 0.0397 0.106 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 9.60e-02 0.176 0.105 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 6.49e-01 0.0491 0.108 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 7.79e-01 0.0307 0.109 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -776432 sc-eQTL 7.91e-01 0.0286 0.108 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -850142 sc-eQTL 6.67e-01 -0.041 0.0951 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -677723 sc-eQTL 6.04e-01 0.0487 0.0938 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -642008 sc-eQTL 8.62e-01 0.0171 0.0987 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -927680 sc-eQTL 4.12e-01 -0.088 0.107 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -677609 sc-eQTL 3.31e-01 -0.101 0.103 0.177 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136011 STAB2 -299174 pQTL 0.0182 0.0681 0.0288 0.0 0.0 0.18
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 eQTL 0.00814 -0.0657 0.0248 0.0 0.0 0.169


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000179088 C12orf42 -207911 2.75e-06 2.34e-06 3.23e-07 1.85e-06 4.58e-07 7.87e-07 1.9e-06 6.32e-07 1.86e-06 9.61e-07 2.46e-06 1.28e-06 3.53e-06 1.12e-06 8.32e-07 1.66e-06 1.07e-06 2.18e-06 8.1e-07 1.33e-06 1.14e-06 2.9e-06 2.32e-06 1.15e-06 3.36e-06 1.37e-06 1.39e-06 1.49e-06 1.95e-06 1.9e-06 1.49e-06 3.26e-07 5.85e-07 1.25e-06 9.45e-07 9.27e-07 7.76e-07 4.37e-07 1.07e-06 3.52e-07 2.14e-07 3.29e-06 5.37e-07 1.99e-07 3.69e-07 3.31e-07 7.57e-07 2.41e-07 1.66e-07