logo

Genes within 1Mb (chr12:103282030:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 7.50e-01 0.0161 0.0503 0.141 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 3.49e-01 -0.103 0.11 0.141 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 5.96e-01 0.0544 0.103 0.141 B L1
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 9.47e-02 -0.165 0.0985 0.141 B L1
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 7.68e-02 -0.175 0.0982 0.141 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0612 0.062 0.141 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 1.05e-04 -0.354 0.0895 0.141 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 7.27e-02 0.175 0.0971 0.141 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 8.67e-02 0.183 0.106 0.141 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 1.21e-01 0.148 0.0948 0.141 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 8.07e-01 0.0234 0.0957 0.141 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 3.21e-01 0.0817 0.0821 0.141 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 6.16e-02 -0.158 0.0841 0.141 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 4.34e-01 0.0717 0.0915 0.141 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 5.45e-02 -0.202 0.105 0.141 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 1.98e-02 0.206 0.0879 0.141 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0156 0.091 0.141 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0953 0.0987 0.141 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 6.82e-01 0.0438 0.107 0.141 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 5.65e-01 0.0577 0.1 0.141 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 2.45e-01 -0.105 0.09 0.141 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 6.02e-01 0.0499 0.0956 0.141 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 1.83e-01 -0.154 0.115 0.141 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00162 0.103 0.141 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 5.77e-01 0.0615 0.11 0.141 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 5.98e-01 0.0625 0.118 0.144 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 1.52e-01 -0.182 0.126 0.144 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 9.17e-01 0.0118 0.114 0.144 DC L1
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 8.91e-02 -0.197 0.115 0.144 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 4.34e-02 0.154 0.0756 0.144 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0679 0.0999 0.144 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 6.79e-02 -0.199 0.108 0.144 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 1.87e-01 0.159 0.12 0.144 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0801 0.122 0.141 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0947 0.112 0.141 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0748 0.105 0.141 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0124 0.0809 0.141 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0661 0.0808 0.141 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 2.27e-01 -0.112 0.0925 0.141 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 4.46e-01 0.0793 0.104 0.141 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 8.25e-01 0.024 0.108 0.142 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0124 0.0999 0.142 NK L1
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 4.44e-02 -0.186 0.0921 0.142 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00499 0.103 0.142 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 2.02e-01 0.14 0.11 0.142 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 1.70e-01 -0.141 0.102 0.142 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 3.53e-01 0.0357 0.0383 0.141 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 3.33e-01 -0.106 0.11 0.141 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0915 0.112 0.141 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 2.42e-01 -0.119 0.101 0.141 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0831 0.0975 0.141 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0461 0.0884 0.141 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 1.22e-02 -0.277 0.109 0.141 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0592 0.0934 0.141 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 6.56e-01 -0.051 0.114 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 7.84e-01 0.00675 0.0246 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00254 0.114 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0465 0.126 0.14 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 2.14e-01 -0.168 0.135 0.14 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 8.83e-01 0.0199 0.135 0.14 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0435 0.146 0.14 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 1.91e-01 -0.146 0.111 0.14 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0294 0.134 0.14 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 1.45e-01 -0.178 0.122 0.14 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 8.22e-01 0.0113 0.0502 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00546 0.113 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 7.32e-01 0.0404 0.118 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 7.47e-01 0.0405 0.126 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 6.87e-01 -0.051 0.126 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 1.12e-01 -0.179 0.112 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 5.25e-02 -0.213 0.109 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 4.18e-01 0.0992 0.122 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0482 0.119 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 2.10e-01 0.0574 0.0457 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 6.97e-01 0.045 0.116 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 2.96e-01 0.13 0.124 0.14 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 1.70e-01 -0.169 0.122 0.14 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 7.86e-01 0.0341 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 1.19e-01 -0.173 0.11 0.14 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 1.90e-01 -0.15 0.114 0.14 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 2.84e-01 0.124 0.115 0.14 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 5.60e-01 0.0714 0.122 0.14 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 1.03e-02 0.161 0.0622 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 2.17e-01 -0.139 0.112 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00503 0.123 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0117 0.117 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 1.94e-01 -0.141 0.108 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 5.22e-01 0.0593 0.0924 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 4.97e-04 -0.412 0.117 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 1.60e-01 0.17 0.121 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 4.54e-02 0.236 0.117 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 6.84e-01 0.0226 0.0553 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0764 0.119 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 3.35e-01 -0.121 0.125 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 1.91e-02 -0.283 0.12 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 5.80e-01 0.0616 0.111 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0222 0.113 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 2.31e-02 -0.265 0.116 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0165 0.12 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 5.15e-01 0.0805 0.123 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 5.16e-01 0.071 0.109 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0923 0.124 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00953 0.123 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 6.63e-02 0.237 0.128 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0117 0.11 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 1.84e-01 0.149 0.112 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 1.50e-01 0.181 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 3.75e-01 0.108 0.121 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 1.81e-01 0.132 0.0981 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 1.67e-01 0.142 0.102 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 5.97e-01 0.0467 0.088 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 6.03e-02 -0.167 0.0884 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 2.02e-01 0.116 0.0906 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 4.20e-02 -0.221 0.108 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 1.48e-01 0.141 0.097 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 8.76e-02 -0.17 0.0988 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 6.84e-01 0.0476 0.117 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0658 0.124 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0502 0.112 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 7.62e-02 -0.179 0.1 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 8.62e-01 0.0174 0.0997 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 1.40e-02 -0.282 0.114 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 6.94e-03 0.296 0.108 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 9.00e-01 0.0145 0.114 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 2.39e-01 0.144 0.122 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 4.45e-02 -0.251 0.124 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 2.87e-01 0.127 0.119 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 9.44e-01 0.00836 0.118 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 8.23e-01 0.0263 0.117 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 4.75e-01 0.0875 0.122 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0667 0.115 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 2.95e-01 0.124 0.118 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00407 0.112 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 1.73e-01 0.171 0.125 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 7.02e-01 0.0456 0.119 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 8.26e-02 -0.205 0.117 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 8.96e-01 0.0136 0.104 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 8.27e-01 0.0267 0.122 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 8.45e-02 -0.215 0.124 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 2.93e-01 0.118 0.112 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0608 0.112 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00819 0.123 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0619 0.114 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 6.89e-01 -0.041 0.102 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 5.87e-01 0.053 0.0974 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 4.01e-01 -0.098 0.116 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 6.38e-01 0.0563 0.12 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 7.18e-01 0.041 0.113 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 1.25e-01 -0.173 0.112 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 2.66e-01 -0.14 0.125 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0901 0.126 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 5.54e-01 0.0737 0.124 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 6.59e-01 0.0524 0.118 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0899 0.116 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 4.30e-01 -0.103 0.13 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0617 0.129 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0917 0.114 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0846 0.124 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0484 0.119 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 1.40e-01 -0.187 0.126 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 3.47e-01 -0.111 0.118 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 6.85e-02 -0.216 0.118 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 6.64e-01 0.0544 0.125 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0766 0.122 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 8.78e-01 -0.00645 0.0421 0.139 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 3.27e-01 -0.115 0.117 0.139 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0718 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 2.73e-01 -0.128 0.117 0.139 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 1.03e-01 -0.206 0.126 0.139 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 9.13e-01 0.0134 0.123 0.139 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 2.89e-01 -0.117 0.11 0.139 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 2.14e-01 -0.155 0.124 0.139 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0461 0.124 0.139 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0165 0.118 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 5.63e-01 0.069 0.119 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 5.62e-01 0.0703 0.121 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 5.68e-01 0.0684 0.12 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0887 0.121 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 3.30e-01 -0.123 0.127 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0199 0.119 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00723 0.107 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 1.89e-02 -0.236 0.0999 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00569 0.101 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 2.52e-01 0.126 0.11 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0061 0.116 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 3.16e-01 0.127 0.126 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0176 0.129 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 3.40e-01 -0.121 0.127 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0614 0.125 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 8.27e-01 0.0292 0.133 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0642 0.115 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 8.59e-01 0.0217 0.122 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0545 0.105 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 3.32e-01 -0.104 0.107 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0542 0.107 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 4.40e-01 0.0896 0.116 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 1.22e-01 -0.173 0.111 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 4.55e-01 0.0702 0.0936 0.141 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 5.98e-02 -0.276 0.145 0.141 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0587 0.126 0.141 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0566 0.147 0.141 PB L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 9.36e-01 0.0122 0.15 0.141 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 1.15e-01 0.108 0.0682 0.141 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 5.40e-01 0.0741 0.12 0.141 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 3.88e-01 0.111 0.128 0.141 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 7.75e-01 0.0432 0.15 0.141 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0287 0.0416 0.139 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0635 0.104 0.139 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 5.11e-01 0.0747 0.113 0.139 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 1.06e-01 -0.189 0.117 0.139 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 8.09e-01 0.027 0.111 0.139 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 1.60e-01 0.109 0.0775 0.139 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0603 0.107 0.139 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 1.85e-01 0.125 0.0943 0.139 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 1.18e-01 0.171 0.109 0.139 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 9.52e-01 0.00659 0.11 0.141 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 6.19e-01 0.0628 0.126 0.141 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 3.38e-01 0.107 0.112 0.141 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 3.15e-01 -0.125 0.124 0.141 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 2.61e-01 -0.129 0.114 0.141 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 6.31e-02 -0.182 0.0975 0.141 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 3.50e-01 -0.113 0.121 0.141 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 2.04e-01 0.157 0.123 0.141 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 1.27e-01 0.205 0.134 0.144 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 2.77e-01 -0.128 0.117 0.144 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 6.21e-01 0.0624 0.126 0.144 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 3.11e-01 -0.131 0.129 0.144 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 5.01e-02 0.224 0.114 0.144 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0319 0.0855 0.144 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0952 0.12 0.144 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 4.33e-01 0.0937 0.119 0.144 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0256 0.116 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 3.27e-01 -0.116 0.118 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00789 0.12 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 8.03e-01 0.0231 0.0923 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0888 0.0891 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 1.35e-01 -0.151 0.1 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0877 0.107 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0878 0.117 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 3.04e-01 0.126 0.122 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 7.05e-03 -0.305 0.112 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0154 0.105 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 1.52e-01 -0.132 0.0917 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 2.22e-01 -0.135 0.11 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 5.14e-01 0.076 0.116 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0515 0.131 0.158 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 2.98e-01 -0.141 0.135 0.158 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 2.93e-01 0.136 0.129 0.158 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 3.53e-01 -0.121 0.13 0.158 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 6.59e-02 -0.252 0.136 0.158 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 2.32e-01 -0.154 0.129 0.158 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 3.56e-01 -0.134 0.144 0.158 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0459 0.131 0.158 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 9.64e-01 0.0052 0.116 0.14 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 3.72e-01 -0.11 0.123 0.14 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 1.11e-01 0.204 0.128 0.14 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0587 0.12 0.14 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 1.64e-01 -0.149 0.107 0.14 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 2.97e-01 -0.129 0.124 0.14 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 7.53e-01 0.0347 0.11 0.14 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 8.40e-01 0.0234 0.116 0.147 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0188 0.116 0.147 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 2.03e-01 -0.149 0.117 0.147 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 6.39e-01 0.0533 0.114 0.147 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0471 0.101 0.147 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 8.40e-01 0.023 0.114 0.147 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 1.41e-01 0.168 0.113 0.147 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0406 0.113 0.15 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 6.79e-02 -0.232 0.126 0.15 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 5.71e-01 0.0756 0.133 0.15 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 5.85e-02 -0.214 0.112 0.15 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 1.08e-01 0.142 0.088 0.15 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0978 0.115 0.15 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00573 0.125 0.15 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 1.63e-01 0.154 0.11 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 5.11e-01 0.0378 0.0574 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0314 0.112 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 4.89e-01 0.0837 0.121 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 1.96e-01 -0.143 0.11 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0258 0.117 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 1.89e-01 -0.138 0.104 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 1.83e-02 -0.211 0.0886 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 1.36e-01 0.165 0.11 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 9.91e-01 0.00135 0.122 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 800286 sc-eQTL 6.32e-02 0.124 0.0665 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 1.65e-01 -0.157 0.113 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0734 0.122 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 1.32e-01 -0.168 0.111 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 2.71e-01 -0.114 0.104 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 6.10e-01 0.0485 0.0949 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 sc-eQTL 4.87e-05 -0.465 0.112 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 2.80e-01 0.129 0.119 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 2.84e-02 0.264 0.12 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0793 0.118 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00229 0.121 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0987 0.112 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 7.84e-01 -0.023 0.0838 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 1.24e-01 -0.126 0.0818 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 7.55e-02 -0.169 0.0946 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 7.22e-01 0.0372 0.105 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -559204 sc-eQTL 8.35e-01 0.0249 0.119 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 2.22e-01 -0.142 0.116 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0252 0.114 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0132 0.111 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0531 0.11 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 7.42e-01 0.037 0.113 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 2.94e-01 0.119 0.113 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -782501 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0113 0.112 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -856211 sc-eQTL 8.40e-01 -0.02 0.0988 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -683792 sc-eQTL 2.69e-02 -0.215 0.0963 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -648077 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0236 0.103 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -933749 sc-eQTL 5.86e-02 0.21 0.11 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -683678 sc-eQTL 1.39e-01 -0.159 0.107 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136011 STAB2 -305243 pQTL 0.0464 -0.0646 0.0324 0.0 0.0 0.129
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 eQTL 3.87e-10 -0.166 0.0263 0.0 0.0 0.131

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000179088 C12orf42 -213980 1.49e-06 1.29e-06 2.13e-07 1.3e-06 3.45e-07 5.91e-07 1.43e-06 4.06e-07 1.66e-06 5.93e-07 2.08e-06 9.12e-07 2.6e-06 3.24e-07 4.98e-07 9.97e-07 9.23e-07 1.05e-06 8.2e-07 5.23e-07 7.49e-07 1.93e-06 1.12e-06 5.91e-07 2.41e-06 6.17e-07 1.02e-06 8.92e-07 1.6e-06 1.31e-06 8.18e-07 2.07e-07 2.42e-07 5.94e-07 5.64e-07 5e-07 6.25e-07 2.15e-07 4.75e-07 3.13e-07 3.06e-07 2.09e-06 1.37e-07 4.13e-08 3.24e-07 1.12e-07 2.15e-07 5.28e-08 1.46e-07
ENSG00000213442 \N -983279 2.67e-07 1.11e-07 3.62e-08 1.79e-07 9.02e-08 9.57e-08 1.38e-07 5.33e-08 1.4e-07 4.4e-08 1.56e-07 7.78e-08 1.33e-07 6.21e-08 5.55e-08 7.26e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.26e-07 4.26e-08 1.33e-07 1.19e-07 1.12e-07 8.71e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.73e-08 3.71e-08 2.91e-08 8.82e-08 8.93e-08 3.99e-08 4.67e-08 9.44e-08 7.92e-08 3.03e-08 4.51e-08 1.33e-07 3.98e-08 3.48e-08 7.26e-08 1.7e-08 1.26e-07 4.2e-09 4.91e-08