logo

Genes within 1Mb (chr12:103257716:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0248 0.0486 0.19 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0434 0.106 0.19 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 6.83e-02 -0.18 0.0984 0.19 B L1
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 1.23e-01 0.147 0.0952 0.19 B L1
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 9.35e-01 0.00779 0.0956 0.19 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 1.23e-01 0.0925 0.0596 0.19 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 4.06e-01 0.0745 0.0894 0.19 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 6.12e-01 0.048 0.0945 0.19 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 1.49e-01 0.149 0.103 0.19 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00453 0.0895 0.19 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 5.75e-01 0.0504 0.0898 0.19 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 2.41e-01 0.0905 0.077 0.19 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 5.43e-01 0.0484 0.0795 0.19 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 9.29e-01 0.00767 0.086 0.19 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 1.69e-02 -0.235 0.0978 0.19 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 6.31e-01 0.0401 0.0835 0.19 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 3.74e-01 0.076 0.0853 0.19 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 5.98e-01 0.048 0.0909 0.19 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 1.82e-01 -0.131 0.0978 0.19 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0377 0.0922 0.19 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 2.13e-01 0.103 0.0827 0.19 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 7.32e-01 0.0302 0.0879 0.19 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0462 0.106 0.19 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 7.45e-01 0.0307 0.0945 0.19 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0818 0.101 0.19 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 4.85e-01 0.0772 0.11 0.185 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 2.63e-01 0.133 0.118 0.185 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0249 0.106 0.185 DC L1
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 9.80e-01 0.00276 0.109 0.185 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0338 0.0713 0.185 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0139 0.0934 0.185 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0262 0.102 0.185 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0603 0.112 0.185 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0327 0.114 0.19 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 2.50e-01 0.121 0.105 0.19 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00623 0.0985 0.19 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 8.65e-01 0.0129 0.0756 0.19 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 6.98e-02 0.137 0.0751 0.19 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0452 0.0868 0.19 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 4.00e-01 0.0819 0.097 0.19 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 9.56e-01 0.0055 0.101 0.189 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0248 0.0928 0.189 NK L1
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 8.02e-01 0.0217 0.0863 0.189 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0256 0.0955 0.189 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0649 0.102 0.189 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 1.45e-01 -0.139 0.0949 0.189 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 8.18e-01 -0.00809 0.0352 0.19 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 7.28e-01 0.0351 0.101 0.19 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0764 0.103 0.19 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00417 0.0932 0.19 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00916 0.0896 0.19 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 6.96e-01 0.0317 0.0811 0.19 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 2.71e-01 -0.112 0.102 0.19 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 9.21e-02 0.144 0.0852 0.19 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 1.73e-01 -0.143 0.104 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0309 0.0222 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 9.35e-02 -0.174 0.103 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 9.29e-01 0.0102 0.114 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0562 0.123 0.191 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 4.47e-01 0.0935 0.123 0.191 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 1.04e-01 -0.215 0.132 0.191 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 5.76e-01 0.0567 0.101 0.191 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0075 0.121 0.191 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 2.63e-01 0.125 0.111 0.191 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 4.11e-01 0.0393 0.0477 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 9.51e-01 0.00662 0.108 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0692 0.112 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 9.92e-01 0.0012 0.12 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 4.37e-01 0.0936 0.12 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00902 0.108 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0179 0.105 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00631 0.117 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 3.97e-01 0.0965 0.114 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0439 0.0433 0.185 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 8.38e-02 -0.189 0.109 0.185 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 2.20e-01 -0.145 0.118 0.185 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 1.64e-01 0.162 0.116 0.185 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 7.39e-01 0.0397 0.119 0.185 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 7.85e-01 0.0288 0.105 0.185 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 3.24e-02 0.231 0.107 0.185 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 2.56e-02 0.243 0.108 0.185 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 3.70e-01 0.104 0.116 0.185 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 1.03e-01 0.0992 0.0606 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 3.96e-01 -0.092 0.108 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 8.97e-01 0.0155 0.119 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 1.59e-01 0.159 0.112 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00314 0.105 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 2.69e-01 0.0986 0.089 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 9.21e-01 0.0114 0.116 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 2.02e-01 -0.149 0.117 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 9.98e-01 0.000309 0.114 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0236 0.0542 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 9.62e-01 0.00554 0.116 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 1.95e-01 0.159 0.122 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 1.28e-01 0.181 0.119 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0572 0.109 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 9.33e-02 0.185 0.11 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 6.80e-01 0.0475 0.115 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 5.71e-01 0.0667 0.117 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 7.37e-01 0.0408 0.121 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 5.27e-01 0.0636 0.1 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 6.49e-01 0.052 0.114 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 8.57e-01 0.0204 0.114 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0938 0.119 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 4.27e-01 0.0805 0.101 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 5.83e-02 -0.196 0.103 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0989 0.116 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 1.76e-01 -0.152 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0927 0.0937 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 2.12e-01 0.122 0.0975 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 5.41e-02 0.161 0.0833 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 8.64e-01 0.0145 0.085 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00128 0.0867 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 3.76e-02 -0.216 0.103 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 3.11e-01 0.0942 0.0928 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 9.99e-01 7.06e-05 0.0949 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0886 0.105 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 6.05e-01 -0.058 0.112 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 4.58e-01 0.0749 0.101 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 1.10e-01 0.146 0.0906 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 6.76e-01 0.0376 0.0898 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 2.34e-01 -0.124 0.104 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0345 0.0993 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 1.87e-01 0.136 0.103 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 1.17e-01 0.178 0.113 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0321 0.116 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 2.39e-01 -0.13 0.11 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0558 0.109 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 8.98e-01 -0.014 0.109 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0404 0.113 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 6.45e-03 0.289 0.105 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 2.19e-01 0.135 0.109 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0202 0.1 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 1.55e-01 -0.161 0.113 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 9.59e-01 0.00554 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 8.15e-01 0.0249 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 5.30e-01 0.0586 0.0932 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0776 0.109 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 2.35e-01 0.133 0.112 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0667 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 4.51e-01 0.0778 0.103 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0122 0.113 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 8.37e-01 0.0216 0.105 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 3.15e-01 0.0945 0.0938 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 3.44e-01 0.0846 0.0893 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0976 0.107 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0447 0.11 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 7.15e-01 0.038 0.104 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 1.95e-01 0.138 0.106 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0534 0.118 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 8.91e-01 0.0163 0.119 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 3.02e-01 0.121 0.117 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0489 0.112 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 4.92e-01 0.0754 0.109 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0102 0.122 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 5.57e-01 0.0713 0.121 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 4.69e-01 0.0763 0.105 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0772 0.114 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 5.93e-01 0.0584 0.109 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 9.53e-03 0.301 0.115 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0177 0.109 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 8.96e-01 0.0144 0.109 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 4.87e-01 0.0802 0.115 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 1.76e-01 -0.152 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 3.25e-01 0.0383 0.0387 0.193 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0168 0.108 0.193 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 6.82e-01 0.0456 0.111 0.193 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 3.15e-01 -0.109 0.108 0.193 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0132 0.117 0.193 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 9.00e-01 0.0143 0.113 0.193 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 1.38e-01 -0.151 0.101 0.193 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 1.33e-01 0.173 0.115 0.193 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 3.79e-02 -0.236 0.113 0.193 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 8.99e-01 0.0141 0.112 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00439 0.113 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0278 0.115 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0395 0.114 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 3.17e-01 0.115 0.115 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0318 0.12 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0229 0.112 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 9.55e-01 0.00565 0.0997 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 5.17e-01 0.0613 0.0944 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0228 0.0947 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0749 0.103 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 8.07e-02 -0.189 0.108 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 9.06e-02 -0.195 0.115 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 7.54e-01 0.0368 0.117 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 4.20e-01 0.0936 0.116 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 4.07e-01 0.0946 0.114 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 7.30e-01 0.0421 0.122 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 4.23e-01 0.0844 0.105 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0291 0.113 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0211 0.0982 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 5.65e-01 0.0577 0.1 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 2.94e-01 0.105 0.0994 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0707 0.108 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 2.77e-01 -0.113 0.104 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0518 0.0813 0.196 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 6.07e-01 0.0658 0.128 0.196 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 1.11e-01 -0.174 0.108 0.196 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 4.17e-01 -0.104 0.127 0.196 PB L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 2.93e-01 0.137 0.13 0.196 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00141 0.0599 0.196 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 6.39e-01 0.0492 0.105 0.196 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00609 0.112 0.196 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 3.20e-02 0.278 0.128 0.196 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 8.09e-01 -0.00947 0.0392 0.193 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 5.61e-01 0.0572 0.0983 0.193 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 3.34e-01 -0.103 0.107 0.193 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 8.09e-01 0.0268 0.11 0.193 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0513 0.105 0.193 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0221 0.0733 0.193 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 3.86e-01 0.0872 0.1 0.193 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 2.50e-02 0.199 0.088 0.193 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 2.12e-01 -0.129 0.103 0.193 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 3.74e-01 0.0929 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0784 0.12 0.19 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 1.09e-01 -0.17 0.106 0.19 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 7.15e-02 0.211 0.117 0.19 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0254 0.109 0.19 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0686 0.0932 0.19 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 3.62e-01 -0.105 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 2.99e-01 0.122 0.117 0.19 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0277 0.128 0.185 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 7.02e-01 0.0429 0.112 0.185 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 2.75e-01 0.131 0.119 0.185 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0987 0.123 0.185 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0277 0.109 0.185 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 1.88e-01 -0.107 0.081 0.185 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 3.44e-01 -0.108 0.114 0.185 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 1.90e-01 -0.149 0.113 0.185 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 1.43e-01 -0.157 0.107 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 1.31e-01 0.165 0.109 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0134 0.111 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 2.93e-01 0.09 0.0853 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 1.53e-01 0.118 0.0824 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00267 0.0936 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 4.88e-01 0.0689 0.0992 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 2.82e-02 0.24 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0347 0.115 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 9.30e-01 0.00944 0.107 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 7.32e-02 -0.175 0.0972 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00739 0.0862 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0298 0.103 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 9.61e-01 0.00536 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 4.53e-01 0.101 0.134 0.188 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0397 0.139 0.188 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0408 0.133 0.188 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 8.12e-02 -0.233 0.133 0.188 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 8.58e-01 0.0254 0.141 0.188 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 1.90e-01 0.174 0.132 0.188 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0377 0.148 0.188 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0139 0.135 0.188 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 4.09e-01 -0.087 0.105 0.191 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 3.77e-01 0.0986 0.111 0.191 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 2.38e-01 -0.137 0.116 0.191 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 4.42e-01 0.0837 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 7.58e-03 0.258 0.0955 0.191 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 7.44e-01 0.0367 0.112 0.191 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 4.05e-01 -0.083 0.0995 0.191 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 9.36e-01 0.00877 0.11 0.19 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 6.47e-01 0.0503 0.11 0.19 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 5.46e-01 -0.067 0.111 0.19 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0833 0.107 0.19 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 2.82e-01 0.103 0.0953 0.19 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0476 0.108 0.19 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 7.88e-01 0.0291 0.108 0.19 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 1.60e-01 0.158 0.112 0.189 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 5.47e-01 0.0768 0.127 0.189 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 2.00e-02 -0.307 0.131 0.189 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 6.94e-01 0.0445 0.113 0.189 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0859 0.0881 0.189 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00655 0.115 0.189 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 3.75e-01 0.11 0.124 0.189 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 6.48e-01 0.0503 0.11 0.189 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 9.64e-01 0.00242 0.0541 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0883 0.106 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 1.41e-01 -0.167 0.113 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 2.10e-01 0.131 0.104 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 2.29e-01 0.132 0.11 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0646 0.0985 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 2.15e-01 0.105 0.0841 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 6.90e-01 0.0415 0.104 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 1.28e-01 0.174 0.114 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 775972 sc-eQTL 2.72e-01 0.0712 0.0646 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0613 0.109 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 5.28e-01 0.0745 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 1.20e-02 0.269 0.106 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0772 0.1 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 2.97e-01 0.0957 0.0916 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 sc-eQTL 3.92e-01 0.0965 0.113 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 3.34e-01 -0.111 0.115 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0128 0.117 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0226 0.11 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 3.22e-01 0.111 0.112 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 8.12e-01 0.0248 0.104 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0112 0.0778 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 3.47e-01 0.0717 0.0762 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0475 0.0883 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 8.95e-01 0.0128 0.0971 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -583518 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0773 0.111 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 2.67e-01 0.12 0.108 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 6.59e-01 -0.047 0.106 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0395 0.103 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 1.43e-01 0.15 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0101 0.105 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 8.80e-01 -0.016 0.106 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -806815 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0262 0.104 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -880525 sc-eQTL 9.24e-01 0.00871 0.0917 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -708106 sc-eQTL 5.65e-01 0.0522 0.0904 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -672391 sc-eQTL 9.78e-01 0.0026 0.0952 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -958063 sc-eQTL 3.21e-01 -0.103 0.103 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -707992 sc-eQTL 3.10e-01 -0.101 0.0997 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136011 STAB2 -329557 pQTL 0.00977 0.073 0.0282 0.0 0.0 0.19
ENSG00000179088 C12orf42 -238294 eQTL 0.00726 -0.0664 0.0247 0.0 0.0 0.178

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina