logo

Genes within 1Mb (chr12:103238142:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0158 0.0506 0.145 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 7.30e-02 -0.199 0.11 0.145 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 5.51e-01 0.0617 0.103 0.145 B L1
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 9.16e-02 -0.168 0.0991 0.145 B L1
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0641 0.0995 0.145 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0409 0.0625 0.145 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.76e-03 -0.289 0.0912 0.145 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 1.19e-01 0.153 0.098 0.145 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 2.53e-01 0.123 0.107 0.145 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 5.33e-02 0.185 0.095 0.145 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 5.75e-01 0.054 0.0961 0.145 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 2.99e-01 0.0858 0.0825 0.145 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0943 0.0849 0.145 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 4.51e-01 0.0695 0.092 0.145 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.34e-02 -0.261 0.105 0.145 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 3.09e-02 0.192 0.0885 0.145 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0134 0.0915 0.145 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 2.45e-01 -0.115 0.099 0.145 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 6.84e-01 0.0437 0.107 0.145 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 8.86e-01 0.0145 0.101 0.145 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0428 0.0906 0.145 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 2.59e-01 0.108 0.0958 0.145 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.89e-01 -0.153 0.116 0.145 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 8.61e-01 0.0181 0.103 0.145 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 3.39e-01 0.106 0.11 0.145 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 8.24e-01 0.0266 0.12 0.149 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 3.75e-01 -0.114 0.128 0.149 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 3.64e-01 0.105 0.115 0.149 DC L1
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 2.67e-01 -0.131 0.117 0.149 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 3.00e-02 0.167 0.0764 0.149 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 2.66e-01 -0.113 0.101 0.149 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 2.29e-01 -0.133 0.11 0.149 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 3.71e-01 0.109 0.122 0.149 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 1.52e-01 -0.176 0.122 0.145 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 2.46e-01 -0.131 0.113 0.145 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 2.70e-01 -0.117 0.105 0.145 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00111 0.0812 0.145 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0415 0.0812 0.145 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0753 0.0931 0.145 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 2.65e-01 0.116 0.104 0.145 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 5.30e-01 0.0684 0.109 0.146 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0242 0.1 0.146 NK L1
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 1.74e-01 -0.127 0.093 0.146 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 4.64e-01 0.0758 0.103 0.146 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 4.58e-02 0.22 0.11 0.146 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 2.09e-01 -0.13 0.103 0.146 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 4.24e-01 0.0308 0.0385 0.145 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0614 0.11 0.145 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 6.76e-01 -0.047 0.113 0.145 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 2.48e-01 -0.118 0.102 0.145 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0131 0.098 0.145 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 8.87e-01 0.0126 0.0888 0.145 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.32e-02 -0.275 0.11 0.145 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0254 0.0938 0.145 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 5.14e-01 -0.075 0.115 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 7.03e-01 0.00955 0.025 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 6.51e-01 0.0527 0.116 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0335 0.128 0.143 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 3.78e-01 -0.121 0.137 0.143 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 3.42e-01 0.131 0.137 0.143 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 6.33e-01 0.0712 0.149 0.143 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.48e-02 -0.275 0.112 0.143 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0186 0.136 0.143 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 2.90e-01 -0.132 0.124 0.143 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0393 0.0504 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0604 0.114 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 6.42e-01 0.0552 0.119 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 7.64e-01 0.0379 0.126 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 9.97e-01 0.000424 0.127 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 2.47e-01 -0.132 0.113 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 3.10e-02 -0.238 0.11 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 5.97e-01 0.0652 0.123 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0778 0.12 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 2.05e-01 0.0583 0.0459 0.144 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0152 0.116 0.144 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 4.29e-01 0.0991 0.125 0.144 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 2.45e-01 -0.144 0.123 0.144 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 6.57e-01 0.056 0.126 0.144 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0953 0.111 0.144 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.42e-01 -0.169 0.115 0.144 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 2.20e-01 0.143 0.116 0.144 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0164 0.123 0.144 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 1.43e-02 0.154 0.0624 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 2.52e-02 -0.251 0.111 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 7.95e-01 0.032 0.123 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0638 0.117 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0353 0.109 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 6.31e-01 0.0445 0.0926 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 7.38e-03 -0.32 0.118 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 1.21e-01 0.188 0.121 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 5.92e-02 0.223 0.118 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 7.77e-01 0.0157 0.0554 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 2.35e-01 -0.141 0.118 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 1.55e-01 -0.178 0.125 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 7.99e-02 -0.213 0.121 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 2.43e-01 0.13 0.111 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0166 0.113 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.30e-01 -0.178 0.117 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0868 0.12 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 7.68e-01 0.0365 0.124 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00592 0.109 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0372 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 5.96e-01 0.0654 0.123 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 5.08e-02 0.252 0.128 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0169 0.11 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.50e-01 0.162 0.112 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 2.81e-01 0.135 0.125 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 4.34e-01 0.0951 0.121 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 1.34e-01 0.148 0.0984 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 2.59e-01 0.116 0.103 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 5.95e-01 0.0471 0.0884 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 2.14e-01 -0.111 0.0892 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 2.91e-01 0.0964 0.0911 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.27e-02 -0.272 0.108 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 1.40e-01 0.144 0.0974 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 1.61e-01 -0.14 0.0995 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 3.36e-01 0.113 0.117 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0467 0.125 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0624 0.112 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 1.25e-01 -0.155 0.101 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00749 0.0999 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.20e-03 -0.371 0.113 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 1.84e-02 0.259 0.109 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 9.57e-01 0.00622 0.115 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 5.82e-01 0.0679 0.123 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 8.88e-02 -0.214 0.125 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 2.38e-01 0.141 0.119 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 8.40e-01 0.024 0.119 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 4.51e-01 0.089 0.118 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 8.59e-01 0.0218 0.123 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0316 0.116 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 5.41e-01 0.0728 0.119 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 9.02e-01 0.0137 0.111 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 6.40e-02 0.231 0.124 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0165 0.118 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 3.33e-01 -0.114 0.117 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 6.09e-01 0.0528 0.103 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 8.34e-01 0.0254 0.121 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 8.55e-02 -0.213 0.123 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 2.47e-01 0.129 0.111 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 5.35e-01 -0.07 0.113 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0558 0.124 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 3.73e-01 -0.102 0.114 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 9.79e-01 0.00276 0.103 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 2.05e-01 0.124 0.0974 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0983 0.117 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 5.36e-01 0.0743 0.12 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 4.98e-01 0.0769 0.113 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 1.12e-01 -0.18 0.113 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 3.23e-01 -0.125 0.126 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 2.54e-01 -0.145 0.127 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 5.04e-01 0.0839 0.125 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 8.19e-01 0.0274 0.119 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 2.84e-01 -0.125 0.117 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 3.44e-01 -0.124 0.131 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0642 0.13 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 2.76e-01 -0.124 0.114 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0626 0.124 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 9.33e-01 0.00996 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 1.39e-01 -0.187 0.126 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0205 0.118 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.15e-01 -0.187 0.118 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 8.36e-01 0.026 0.125 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 9.63e-01 0.0057 0.122 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 8.22e-01 -0.00948 0.0421 0.143 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0446 0.118 0.143 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0173 0.121 0.143 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 2.26e-01 -0.142 0.117 0.143 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 3.64e-01 -0.115 0.127 0.143 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 6.90e-01 0.0491 0.123 0.143 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 2.08e-01 -0.139 0.11 0.143 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 3.82e-01 -0.109 0.125 0.143 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 6.75e-01 -0.052 0.124 0.143 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00668 0.118 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 4.65e-01 0.0873 0.119 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 4.27e-01 0.0965 0.121 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 4.33e-01 0.0941 0.12 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 6.09e-01 -0.062 0.121 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 3.17e-01 -0.127 0.127 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 8.52e-01 0.0224 0.12 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.107 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 9.29e-02 -0.17 0.101 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 4.37e-01 0.0792 0.102 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 1.28e-01 0.169 0.11 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 8.92e-01 0.0159 0.117 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 1.61e-01 0.177 0.126 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0233 0.129 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 3.04e-01 -0.131 0.127 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 9.43e-01 0.009 0.125 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 4.36e-01 0.104 0.133 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 4.41e-01 -0.089 0.115 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 8.39e-01 0.0248 0.122 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0581 0.106 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0433 0.108 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 8.58e-01 0.0192 0.107 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 1.19e-01 0.181 0.116 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 1.20e-01 -0.174 0.112 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 4.79e-01 0.0689 0.097 0.144 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 5.66e-02 -0.289 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0482 0.131 0.144 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0819 0.152 0.144 PB L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 9.96e-01 0.000686 0.155 0.144 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 9.70e-02 0.118 0.0706 0.144 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 1.91e-01 0.163 0.124 0.144 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 4.02e-01 0.112 0.133 0.144 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 9.69e-01 0.00611 0.156 0.144 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0302 0.0418 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0425 0.105 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 4.80e-01 0.0806 0.114 0.143 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 8.98e-02 -0.2 0.117 0.143 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 7.23e-01 0.0397 0.112 0.143 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 2.34e-01 0.0931 0.0779 0.143 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0863 0.107 0.143 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 3.31e-01 0.0924 0.0948 0.143 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 2.94e-02 0.239 0.109 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 9.09e-01 0.0126 0.111 0.145 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 3.13e-01 0.128 0.127 0.145 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 6.76e-01 0.0471 0.113 0.145 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0903 0.125 0.145 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0997 0.115 0.145 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 7.18e-02 -0.178 0.0982 0.145 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 2.88e-01 -0.129 0.121 0.145 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 2.33e-01 0.148 0.124 0.145 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 2.62e-01 0.154 0.137 0.149 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 2.93e-01 -0.126 0.12 0.149 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 6.77e-01 0.0537 0.129 0.149 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0955 0.132 0.149 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 1.09e-01 0.188 0.117 0.149 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 3.31e-01 -0.085 0.0873 0.149 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 4.12e-01 -0.101 0.122 0.149 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 3.05e-01 0.125 0.122 0.149 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0947 0.117 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 2.25e-01 -0.144 0.119 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0486 0.121 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 8.15e-01 0.0219 0.0932 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0524 0.0901 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0936 0.102 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0661 0.108 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 1.79e-01 -0.158 0.117 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 6.29e-01 0.0593 0.123 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 1.50e-02 -0.276 0.112 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 8.71e-01 0.0171 0.105 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 2.18e-01 -0.114 0.0919 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0963 0.11 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 4.33e-01 0.0912 0.116 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0348 0.132 0.164 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0584 0.137 0.164 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 3.72e-01 0.117 0.13 0.164 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0924 0.132 0.164 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 3.47e-01 -0.131 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 3.29e-01 -0.127 0.13 0.164 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0382 0.146 0.164 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 2.62e-01 -0.149 0.132 0.164 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0373 0.118 0.144 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 9.89e-01 0.00173 0.125 0.144 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 3.01e-01 0.135 0.13 0.144 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0581 0.122 0.144 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 1.31e-01 -0.164 0.108 0.144 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0544 0.126 0.144 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 9.89e-01 0.00159 0.111 0.144 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0907 0.116 0.152 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0308 0.117 0.152 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 2.44e-01 -0.137 0.117 0.152 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 4.64e-01 0.0839 0.114 0.152 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0408 0.102 0.152 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00765 0.115 0.152 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 5.33e-02 0.221 0.114 0.152 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0492 0.113 0.158 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 3.66e-01 -0.115 0.127 0.158 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 8.57e-02 0.228 0.132 0.158 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 1.56e-01 -0.161 0.113 0.158 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 2.64e-02 0.196 0.0873 0.158 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 3.59e-01 -0.106 0.115 0.158 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 3.97e-01 0.106 0.124 0.158 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 3.60e-01 0.101 0.11 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 9.62e-01 0.00273 0.0579 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0868 0.113 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 5.32e-01 0.0761 0.122 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 2.49e-01 -0.128 0.111 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 7.39e-01 0.0393 0.118 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0619 0.105 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 3.90e-03 -0.258 0.0886 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 1.73e-01 0.152 0.111 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 5.96e-01 -0.065 0.122 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 756398 sc-eQTL 8.02e-02 0.117 0.0666 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 2.27e-02 -0.256 0.112 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0856 0.122 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 1.18e-01 -0.174 0.111 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00856 0.104 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 6.53e-01 0.0428 0.095 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 sc-eQTL 2.54e-03 -0.349 0.114 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 3.33e-01 0.115 0.119 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 4.67e-02 0.24 0.12 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 1.66e-01 -0.164 0.118 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0653 0.121 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 2.65e-01 -0.125 0.112 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 8.77e-01 -0.013 0.0841 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0956 0.0823 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 2.01e-01 -0.122 0.0952 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 4.82e-01 0.0738 0.105 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -603092 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0321 0.12 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0846 0.117 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0519 0.115 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 7.75e-01 0.0321 0.112 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0561 0.112 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 6.95e-01 0.0447 0.114 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 1.88e-01 0.151 0.115 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -826389 sc-eQTL 7.60e-01 0.0344 0.113 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -900099 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0308 0.0993 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -727680 sc-eQTL 9.88e-02 -0.161 0.0973 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 sc-eQTL 5.84e-01 0.0564 0.103 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -977637 sc-eQTL 1.11e-02 0.282 0.11 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -727566 sc-eQTL 1.91e-01 -0.141 0.108 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136011 STAB2 -349131 pQTL 0.0162 -0.0785 0.0326 0.0 0.0 0.132
ENSG00000166598 HSP90B1 -691965 eQTL 0.0439 0.046 0.0228 0.0 0.0 0.134
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 eQTL 1.34e-08 -0.154 0.0268 0.0 0.0 0.134

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000179088 C12orf42 -257868 1.29e-06 9.55e-07 2.88e-07 6.49e-07 2.66e-07 4.7e-07 1.13e-06 3.38e-07 1.2e-06 3.83e-07 1.41e-06 5.98e-07 1.73e-06 2.54e-07 4.42e-07 7.13e-07 8.4e-07 5.69e-07 5.34e-07 6.44e-07 4.39e-07 1.17e-06 8.1e-07 5.6e-07 1.94e-06 3.71e-07 6.91e-07 6.89e-07 1.04e-06 1.11e-06 5.62e-07 9.54e-08 2.29e-07 5.45e-07 4.63e-07 4.47e-07 4.12e-07 1.68e-07 2.21e-07 1.04e-07 2.86e-07 1.43e-06 5.53e-08 4.2e-08 1.82e-07 1.02e-07 2.21e-07 8.8e-08 1.04e-07