logo

Genes within 1Mb (chr12:103220670:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00149 0.0562 0.126 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0988 0.123 0.126 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 8.39e-01 0.0234 0.115 0.126 B L1
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 4.33e-02 -0.223 0.11 0.126 B L1
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 3.27e-01 -0.108 0.11 0.126 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 1.72e-02 -0.165 0.0685 0.126 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 7.57e-01 0.0321 0.104 0.126 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 3.89e-01 0.0943 0.109 0.126 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0749 0.119 0.126 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 1.75e-01 0.142 0.104 0.126 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 2.68e-01 0.116 0.105 0.126 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0574 0.0903 0.126 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 2.12e-01 -0.116 0.0927 0.126 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0695 0.1 0.126 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 1.05e-01 0.188 0.115 0.126 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 6.61e-01 0.0429 0.0977 0.126 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0323 0.0999 0.126 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0349 0.108 0.126 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 5.70e-03 0.321 0.115 0.126 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0643 0.11 0.126 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 2.68e-03 -0.294 0.0966 0.126 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0454 0.105 0.126 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0372 0.126 0.126 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 2.06e-02 0.259 0.111 0.126 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0319 0.12 0.126 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 4.38e-01 -0.104 0.134 0.128 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00565 0.144 0.128 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 9.35e-01 0.0105 0.129 0.128 DC L1
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 7.39e-01 0.0441 0.132 0.128 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 2.97e-01 0.0904 0.0865 0.128 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0698 0.113 0.128 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 8.94e-01 0.0166 0.124 0.128 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 1.33e-01 0.205 0.136 0.128 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 3.30e-01 -0.134 0.138 0.126 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 8.88e-01 0.0178 0.127 0.126 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 3.48e-01 0.112 0.118 0.126 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0572 0.0911 0.126 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 6.83e-02 0.166 0.0905 0.126 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 3.18e-03 0.306 0.102 0.126 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 1.92e-03 -0.36 0.115 0.126 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 2.95e-01 -0.129 0.123 0.127 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 6.66e-01 0.0493 0.114 0.127 NK L1
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0981 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 8.78e-01 0.018 0.117 0.127 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 3.04e-01 -0.129 0.125 0.127 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 6.11e-01 0.0596 0.117 0.127 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0607 0.0436 0.126 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 6.46e-01 0.0577 0.125 0.126 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 4.10e-01 0.105 0.128 0.126 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 3.76e-01 0.102 0.116 0.126 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 2.75e-01 -0.121 0.111 0.126 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0884 0.101 0.126 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 1.82e-01 0.168 0.126 0.126 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 9.69e-01 0.00412 0.107 0.126 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 3.89e-01 -0.112 0.13 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0056 0.0268 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 5.19e-01 0.0805 0.125 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 2.90e-01 0.145 0.137 0.13 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 5.85e-03 -0.404 0.145 0.13 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 6.26e-01 -0.072 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0348 0.16 0.13 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00212 0.122 0.13 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 1.72e-01 -0.199 0.145 0.13 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0488 0.134 0.13 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0287 0.0568 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 4.03e-01 -0.107 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 3.60e-01 0.122 0.134 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 4.28e-01 -0.113 0.142 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 1.15e-01 -0.225 0.142 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 4.31e-01 0.101 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 4.94e-01 0.0856 0.125 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 7.95e-02 0.243 0.138 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 5.02e-01 -0.091 0.135 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0585 0.0513 0.127 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 1.51e-01 -0.186 0.129 0.127 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0983 0.14 0.127 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 9.55e-01 0.00777 0.138 0.127 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 4.56e-03 -0.397 0.138 0.127 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0643 0.125 0.127 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 7.34e-01 0.0437 0.129 0.127 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 4.54e-01 0.0973 0.13 0.127 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 9.19e-01 0.0139 0.137 0.127 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 8.80e-01 0.0108 0.0717 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 6.74e-01 0.0536 0.127 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 5.96e-01 0.0742 0.14 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 4.09e-01 0.11 0.133 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 3.18e-01 -0.123 0.123 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 5.16e-02 -0.204 0.104 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 2.80e-01 0.147 0.136 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 2.57e-01 0.156 0.137 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 2.64e-01 -0.15 0.134 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0526 0.0628 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 4.51e-01 -0.102 0.135 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 2.78e-01 0.155 0.142 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 1.45e-02 -0.336 0.136 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0803 0.126 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 3.29e-01 -0.125 0.128 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 5.82e-01 0.0735 0.133 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 5.14e-01 -0.089 0.136 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0652 0.14 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 7.38e-01 0.0408 0.122 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 7.82e-01 0.0383 0.138 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 8.82e-01 0.0204 0.138 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 2.47e-02 -0.323 0.143 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 9.34e-01 0.0102 0.123 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 1.76e-01 -0.17 0.125 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0175 0.14 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0154 0.136 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 3.80e-02 0.225 0.108 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00766 0.114 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 9.61e-01 0.0048 0.0975 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 2.64e-01 -0.11 0.0983 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0318 0.101 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 1.07e-01 0.194 0.12 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 1.67e-01 0.149 0.107 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0566 0.11 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 7.33e-01 0.0434 0.127 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 1.04e-02 0.344 0.133 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0723 0.121 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 1.43e-01 -0.161 0.109 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0397 0.108 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 4.69e-02 0.249 0.124 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 9.84e-02 -0.197 0.119 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 5.96e-01 -0.066 0.124 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0285 0.134 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 4.04e-02 0.279 0.135 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 5.06e-01 0.0866 0.13 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 1.95e-01 -0.167 0.129 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0377 0.128 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 2.82e-01 0.144 0.133 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 6.44e-01 0.0583 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 1.41e-01 0.19 0.129 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0364 0.124 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 1.57e-01 0.197 0.139 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 2.77e-01 -0.143 0.131 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 2.68e-01 -0.145 0.131 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 3.24e-01 0.114 0.115 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 5.13e-01 0.0885 0.135 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 3.00e-01 0.144 0.138 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 2.41e-01 -0.146 0.124 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 4.44e-01 0.0946 0.123 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 1.05e-01 0.219 0.135 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 6.30e-02 0.232 0.124 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 5.15e-04 -0.386 0.109 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 2.58e-01 -0.121 0.107 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 9.66e-01 0.00551 0.128 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 1.90e-02 0.307 0.13 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 8.82e-01 0.0185 0.124 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 1.33e-01 0.19 0.126 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 3.13e-01 0.142 0.141 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 9.68e-02 -0.235 0.141 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 2.24e-01 -0.17 0.139 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 9.42e-02 0.223 0.132 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 1.61e-02 -0.313 0.129 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 1.07e-02 0.371 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 6.44e-01 0.067 0.145 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 7.69e-02 -0.23 0.129 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 6.99e-01 0.0548 0.142 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0636 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0974 0.145 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 1.58e-01 -0.191 0.134 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0904 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 4.57e-01 -0.107 0.143 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0129 0.139 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0409 0.0467 0.128 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0137 0.131 0.128 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 7.89e-01 0.0358 0.134 0.128 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0606 0.13 0.128 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 5.72e-02 -0.267 0.14 0.128 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0619 0.137 0.128 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 4.75e-01 0.0876 0.123 0.128 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 1.43e-01 -0.203 0.138 0.128 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0748 0.138 0.128 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 4.01e-01 -0.115 0.137 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 5.43e-01 0.0846 0.139 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 8.67e-01 0.0237 0.141 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0302 0.14 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 3.83e-01 0.123 0.141 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 5.13e-01 0.0968 0.148 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0776 0.138 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 1.67e-01 0.17 0.123 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 2.08e-01 -0.147 0.116 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0273 0.117 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 5.78e-01 -0.071 0.127 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 2.93e-01 0.141 0.134 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 9.63e-01 0.00691 0.147 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0957 0.15 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 1.01e-01 -0.242 0.147 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 4.38e-01 0.113 0.145 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 2.36e-01 -0.184 0.155 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0104 0.134 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 9.53e-01 0.0082 0.14 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0756 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 1.28e-01 -0.189 0.124 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0414 0.124 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 1.80e-01 -0.179 0.133 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00255 0.129 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 1.64e-01 -0.131 0.0938 0.144 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 2.27e-01 0.179 0.148 0.144 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00547 0.127 0.144 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 8.00e-01 0.0376 0.148 0.144 PB L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 9.00e-01 0.0191 0.151 0.144 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 4.19e-01 0.0563 0.0693 0.144 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0641 0.122 0.144 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 2.57e-01 0.147 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 1.57e-01 -0.214 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0612 0.0472 0.128 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 5.60e-01 0.0693 0.119 0.128 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0956 0.129 0.128 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 1.14e-01 0.211 0.133 0.128 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 5.58e-01 0.0742 0.126 0.128 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0323 0.0885 0.128 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 3.73e-01 0.108 0.121 0.128 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 6.49e-01 0.049 0.108 0.128 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 9.08e-01 0.0145 0.125 0.128 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 7.49e-02 -0.222 0.124 0.126 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 9.74e-02 -0.237 0.142 0.126 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 5.06e-01 0.0848 0.127 0.126 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 7.25e-01 0.0495 0.141 0.126 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0496 0.13 0.126 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 5.66e-01 0.0642 0.112 0.126 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0911 0.137 0.126 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0386 0.14 0.126 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0019 0.148 0.134 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 8.40e-01 0.0261 0.129 0.134 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 2.43e-01 -0.161 0.138 0.134 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 8.28e-01 0.0308 0.142 0.134 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 3.08e-02 0.27 0.124 0.134 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 8.82e-01 0.0139 0.0938 0.134 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 5.38e-01 0.081 0.131 0.134 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 3.25e-01 0.129 0.131 0.134 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 3.59e-01 -0.119 0.13 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 8.68e-01 -0.022 0.132 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 6.01e-01 0.0705 0.135 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0196 0.103 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 9.26e-02 0.168 0.0994 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 2.87e-02 0.246 0.112 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 6.43e-02 -0.222 0.119 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 3.49e-01 -0.124 0.132 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 8.55e-01 0.0253 0.139 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 1.93e-02 0.3 0.127 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 4.28e-01 0.0939 0.118 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 1.99e-02 0.241 0.103 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 5.10e-03 0.346 0.122 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 1.33e-02 -0.323 0.129 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 9.98e-01 0.000507 0.166 0.106 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 7.29e-01 0.0598 0.172 0.106 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 6.45e-02 0.303 0.163 0.106 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 4.89e-01 -0.115 0.166 0.106 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 5.62e-01 -0.102 0.175 0.106 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 6.61e-02 0.301 0.162 0.106 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 8.50e-01 0.0348 0.184 0.106 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 1.37e-02 -0.408 0.164 0.106 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0802 0.129 0.129 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 2.04e-01 -0.174 0.136 0.129 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 8.01e-01 0.0361 0.143 0.129 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 2.17e-03 -0.405 0.13 0.129 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 1.35e-01 0.178 0.119 0.129 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0689 0.138 0.129 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0838 0.122 0.129 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0185 0.134 0.124 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 7.84e-01 0.0367 0.134 0.124 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 4.56e-01 0.101 0.135 0.124 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 2.11e-01 -0.163 0.13 0.124 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 7.57e-01 -0.036 0.116 0.124 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 6.51e-01 0.0594 0.131 0.124 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0416 0.131 0.124 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 2.00e-01 -0.182 0.142 0.121 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 7.22e-02 0.289 0.16 0.121 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 1.52e-01 0.241 0.167 0.121 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0576 0.143 0.121 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 3.97e-01 0.0949 0.112 0.121 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 2.00e-01 -0.187 0.145 0.121 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 2.86e-01 -0.168 0.157 0.121 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 6.60e-02 0.255 0.138 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0312 0.0657 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 9.37e-02 -0.215 0.128 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 7.36e-01 0.0467 0.138 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 3.51e-02 -0.266 0.125 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 6.94e-03 -0.359 0.132 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.12 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 6.82e-01 0.042 0.103 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 2.68e-01 0.14 0.126 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0603 0.139 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 738926 sc-eQTL 8.37e-01 0.0156 0.0758 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 7.90e-01 0.034 0.128 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 4.22e-01 0.111 0.138 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 4.17e-01 -0.102 0.126 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0968 0.117 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 7.55e-02 -0.19 0.107 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -275340 sc-eQTL 2.31e-01 0.158 0.131 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 5.43e-01 0.082 0.135 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 1.66e-01 -0.189 0.136 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 1.60e-01 -0.187 0.133 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 9.43e-01 0.00969 0.137 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 1.67e-01 0.175 0.126 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 8.44e-01 0.0187 0.0947 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 3.41e-02 0.196 0.0919 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 1.95e-03 0.33 0.105 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 8.68e-04 -0.389 0.115 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -620564 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0373 0.133 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00809 0.13 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 5.21e-01 0.0821 0.128 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 1.94e-02 -0.287 0.122 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 5.66e-01 0.0709 0.123 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 9.68e-01 0.00512 0.126 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 4.05e-01 -0.106 0.127 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -843861 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0826 0.127 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -917571 sc-eQTL 6.84e-01 0.0457 0.112 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -745152 sc-eQTL 1.35e-01 -0.166 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -709437 sc-eQTL 8.77e-01 0.0181 0.117 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 -995109 sc-eQTL 2.26e-01 -0.153 0.126 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -745038 sc-eQTL 5.71e-01 0.0694 0.122 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136011 \N -366603 9.47e-07 5.67e-07 3.05e-07 4.72e-07 1.12e-07 3.36e-07 7.96e-07 1.09e-07 1.03e-06 2.67e-07 1.08e-06 5.28e-07 7.53e-07 2.83e-07 4.33e-07 6e-07 2.53e-07 5.26e-07 3.56e-07 1.43e-07 2.38e-07 5.86e-07 6.63e-07 2.92e-07 1.92e-06 2.13e-07 5.76e-07 2.69e-07 5.9e-07 9.2e-07 5.23e-07 3.6e-08 4.98e-08 2.1e-07 3.67e-07 1.83e-07 9.77e-08 1.06e-07 4.04e-08 3.67e-08 5.53e-08 7.53e-07 9.42e-08 1.07e-08 1.85e-07 1.22e-07 9.1e-08 7.14e-09 4.55e-08
ENSG00000214198 \N -709541 2.69e-07 1.16e-07 5.82e-08 2.01e-07 8.83e-08 9.8e-08 1.6e-07 5.33e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.52e-07 8.55e-08 1.41e-07 8.13e-08 6.12e-08 7.23e-08 4.48e-08 1.33e-07 6.07e-08 4.2e-08 1.19e-07 1.24e-07 1.5e-07 3.68e-08 1.85e-07 1.15e-07 1.1e-07 9.65e-08 1.09e-07 1.03e-07 1.07e-07 3.72e-08 2.74e-08 8.55e-08 3.52e-08 3.94e-08 4.67e-08 9.55e-08 7.92e-08 3.69e-08 3.16e-08 1.36e-07 5.2e-08 1.55e-08 5.59e-08 1.55e-08 1.27e-07 4.26e-09 4.74e-08