logo

Genes within 1Mb (chr12:103213634:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 9.85e-01 0.00143 0.0757 0.06 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 2.91e-01 -0.175 0.166 0.06 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0586 0.155 0.06 B L1
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 5.79e-01 0.0828 0.149 0.06 B L1
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 4.87e-01 0.104 0.149 0.06 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 4.40e-01 0.0722 0.0934 0.06 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 3.11e-02 -0.3 0.138 0.06 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 2.36e-01 0.191 0.16 0.06 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0447 0.139 0.06 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0279 0.139 0.06 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 1.45e-01 0.174 0.119 0.06 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 5.09e-01 0.0815 0.123 0.06 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 8.83e-01 0.0197 0.133 0.06 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 3.94e-01 0.131 0.153 0.06 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0828 0.132 0.06 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 4.67e-01 0.105 0.144 0.06 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 5.26e-01 0.0986 0.155 0.06 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 9.90e-01 0.00189 0.146 0.06 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000108 0.131 0.06 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0698 0.139 0.06 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 4.40e-01 -0.13 0.168 0.06 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 9.66e-01 0.00675 0.16 0.06 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 3.83e-01 0.154 0.176 0.061 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 5.33e-01 -0.118 0.188 0.061 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 5.31e-01 -0.106 0.169 0.061 DC L1
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 8.07e-01 0.0423 0.173 0.061 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0463 0.113 0.061 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00129 0.149 0.061 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 3.65e-01 0.162 0.178 0.061 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 2.83e-01 0.194 0.18 0.06 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 5.17e-01 -0.108 0.166 0.06 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0885 0.156 0.06 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 4.98e-01 0.081 0.119 0.06 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0735 0.119 0.06 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 2.70e-01 -0.17 0.153 0.06 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 2.16e-01 -0.2 0.161 0.06 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 6.86e-01 0.0604 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 9.97e-01 0.000468 0.139 0.06 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0335 0.154 0.06 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 4.03e-01 -0.128 0.153 0.06 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 8.36e-01 0.0118 0.0572 0.06 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 4.67e-01 -0.119 0.163 0.06 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 8.29e-01 0.0362 0.167 0.06 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0621 0.151 0.06 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 8.21e-01 0.033 0.145 0.06 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0694 0.132 0.06 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 3.05e-01 0.169 0.165 0.06 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 5.58e-01 0.0997 0.17 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 8.52e-01 -0.00668 0.0358 0.066 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 4.03e-01 0.139 0.166 0.066 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0796 0.183 0.066 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 6.10e-01 -0.101 0.197 0.066 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 4.15e-01 -0.161 0.197 0.066 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 6.32e-02 0.394 0.211 0.066 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 2.08e-01 -0.204 0.162 0.066 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 7.80e-01 0.0498 0.178 0.066 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 1.55e-01 0.107 0.0748 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 2.50e-01 -0.195 0.169 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 5.35e-02 -0.341 0.175 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 6.56e-02 0.346 0.187 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 6.92e-01 -0.075 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 6.55e-01 0.0756 0.169 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0513 0.165 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 4.89e-01 0.124 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0127 0.0692 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 2.82e-01 0.187 0.174 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0726 0.188 0.06 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0166 0.186 0.06 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00937 0.189 0.06 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0847 0.167 0.06 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 3.26e-01 -0.17 0.173 0.06 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 1.38e-01 0.273 0.184 0.06 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0717 0.0955 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 3.47e-01 -0.16 0.17 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 5.36e-01 0.115 0.186 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 4.83e-01 0.124 0.177 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 1.12e-01 0.261 0.163 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00581 0.14 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 1.07e-01 -0.292 0.18 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 5.49e-01 -0.107 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0797 0.0842 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 1.83e-01 -0.24 0.18 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 3.85e-01 -0.166 0.191 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0784 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 5.48e-01 -0.102 0.169 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 5.00e-01 0.116 0.172 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 8.10e-02 -0.311 0.177 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 1.64e-01 0.262 0.188 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 8.29e-01 0.0353 0.164 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 3.60e-01 0.17 0.185 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0748 0.185 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0203 0.194 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0509 0.165 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 3.39e-01 0.161 0.168 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 5.65e-01 0.105 0.182 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0656 0.145 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 3.94e-01 -0.129 0.151 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 1.12e-01 0.206 0.129 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 2.57e-01 0.149 0.131 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00512 0.134 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 2.04e-01 0.205 0.161 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 9.00e-01 0.0185 0.147 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 7.91e-01 0.0449 0.169 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0685 0.18 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0524 0.162 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0786 0.146 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 2.75e-01 0.158 0.144 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 9.97e-01 0.000647 0.167 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0651 0.166 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 2.71e-01 -0.198 0.18 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 2.42e-01 0.215 0.183 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 1.06e-01 0.282 0.174 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 8.07e-01 0.0423 0.173 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0814 0.172 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 8.03e-01 0.0448 0.179 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 4.95e-01 -0.119 0.174 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 4.61e-01 0.118 0.16 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 9.90e-01 0.00227 0.181 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 2.12e-01 -0.212 0.17 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 5.84e-01 0.0929 0.169 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 8.69e-01 0.0246 0.149 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 4.40e-01 -0.135 0.175 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0971 0.161 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 8.20e-01 0.0381 0.167 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 4.88e-01 -0.127 0.183 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 2.79e-01 0.183 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0548 0.152 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 2.23e-01 -0.177 0.144 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 3.80e-01 -0.152 0.173 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 8.49e-01 0.0321 0.168 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00828 0.169 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 3.51e-02 0.395 0.186 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 5.71e-01 0.107 0.189 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 4.28e-01 -0.148 0.186 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 8.86e-01 0.0256 0.178 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 6.02e-01 0.0911 0.174 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 3.52e-01 -0.18 0.193 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 3.28e-01 0.163 0.166 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 6.08e-01 -0.093 0.181 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0187 0.173 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 2.89e-01 -0.196 0.184 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 8.30e-01 0.0371 0.172 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 3.79e-01 0.152 0.173 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0345 0.177 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 1.50e-01 -0.09 0.0622 0.061 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 2.12e-01 -0.217 0.174 0.061 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 3.20e-01 -0.178 0.178 0.061 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0609 0.174 0.061 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 4.44e-01 0.144 0.188 0.061 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0622 0.182 0.061 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 9.10e-02 0.276 0.163 0.061 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 6.82e-02 0.335 0.183 0.061 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 1.75e-01 -0.241 0.177 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 6.36e-01 0.0851 0.18 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 5.21e-01 -0.118 0.183 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 4.51e-01 -0.136 0.18 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 4.41e-01 0.148 0.191 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0455 0.179 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 6.52e-01 0.0723 0.16 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 5.72e-01 0.0858 0.152 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 4.78e-01 -0.108 0.152 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 3.77e-01 -0.154 0.174 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 1.01e-01 -0.307 0.186 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 1.89e-01 -0.25 0.19 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 3.14e-01 -0.189 0.187 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 5.37e-01 -0.114 0.184 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 9.14e-01 0.0184 0.171 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0522 0.183 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 7.37e-01 0.0535 0.159 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 2.00e-01 -0.208 0.162 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 7.99e-01 0.0411 0.161 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 4.79e-01 0.119 0.168 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 3.80e-01 0.129 0.146 0.063 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 2.24e-01 0.28 0.229 0.063 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 2.34e-01 -0.234 0.196 0.063 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 5.85e-01 0.126 0.23 0.063 PB L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 3.10e-01 -0.238 0.233 0.063 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 7.15e-01 0.0395 0.108 0.063 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0464 0.189 0.063 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0495 0.235 0.063 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 5.17e-01 0.0399 0.0614 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00758 0.154 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 3.57e-01 -0.154 0.167 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0726 0.173 0.061 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 7.67e-01 0.0488 0.164 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 9.73e-01 0.00385 0.115 0.061 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 4.22e-01 0.127 0.157 0.061 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 4.12e-01 -0.133 0.162 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 8.28e-01 0.0366 0.169 0.06 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 8.46e-01 0.0376 0.194 0.06 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 7.11e-01 0.0638 0.172 0.06 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 5.99e-01 0.0999 0.19 0.06 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 3.98e-01 0.148 0.175 0.06 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00335 0.151 0.06 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 2.43e-01 -0.221 0.189 0.06 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0444 0.198 0.061 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 5.12e-01 -0.114 0.173 0.061 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00162 0.185 0.061 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 3.22e-01 -0.188 0.19 0.061 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0634 0.169 0.061 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 1.18e-01 0.196 0.125 0.061 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 5.02e-01 0.118 0.175 0.061 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 3.05e-02 0.366 0.168 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 4.52e-01 -0.131 0.173 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0339 0.177 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 8.30e-01 0.0291 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0906 0.131 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 2.27e-01 -0.19 0.157 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0625 0.174 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 9.94e-01 0.00143 0.181 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 8.00e-01 0.0428 0.168 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 1.57e-01 0.219 0.154 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0454 0.136 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0112 0.172 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00875 0.199 0.061 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 5.82e-01 -0.113 0.206 0.061 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 5.57e-01 -0.116 0.197 0.061 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 2.85e-01 -0.212 0.198 0.061 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0694 0.209 0.061 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 8.29e-01 0.0426 0.196 0.061 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0364 0.2 0.061 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 5.38e-01 -0.104 0.169 0.06 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0997 0.179 0.06 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 3.42e-01 -0.178 0.186 0.06 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 2.06e-01 -0.22 0.174 0.06 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 4.12e-01 -0.128 0.156 0.06 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 5.07e-01 -0.106 0.16 0.06 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 5.12e-01 -0.115 0.174 0.061 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 4.00e-01 -0.147 0.175 0.061 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 4.11e-01 -0.145 0.176 0.061 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00351 0.171 0.061 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 8.71e-01 0.0248 0.152 0.061 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 2.44e-01 -0.2 0.171 0.061 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 8.74e-01 0.0281 0.177 0.056 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 6.06e-01 -0.104 0.201 0.056 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 7.87e-01 0.0566 0.21 0.056 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 3.76e-01 0.158 0.178 0.056 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0265 0.139 0.056 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0103 0.182 0.056 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 3.03e-01 0.179 0.173 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 2.61e-01 0.0976 0.0866 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0381 0.17 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 3.05e-01 -0.187 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 4.32e-01 0.132 0.167 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0645 0.177 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 5.01e-01 0.107 0.158 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 2.62e-01 -0.152 0.135 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 1.58e-01 0.259 0.183 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 731890 sc-eQTL 2.13e-01 -0.126 0.101 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 2.70e-01 -0.188 0.17 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 7.57e-01 0.0571 0.184 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0295 0.168 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 3.39e-01 0.15 0.156 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 6.87e-01 0.0578 0.143 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 sc-eQTL 2.32e-02 -0.398 0.174 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 5.74e-01 0.103 0.183 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 1.50e-01 0.25 0.173 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0537 0.178 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 8.41e-01 0.0333 0.165 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 3.41e-01 0.118 0.123 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0991 0.121 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 3.09e-01 -0.157 0.154 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 sc-eQTL 5.41e-01 -0.108 0.177 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 2.34e-01 -0.206 0.173 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 7.46e-02 -0.302 0.169 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 4.81e-01 -0.116 0.164 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 9.73e-01 0.00549 0.164 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0743 0.169 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -850897 sc-eQTL 2.58e-01 -0.189 0.167 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -924607 sc-eQTL 7.48e-01 0.0474 0.148 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -752188 sc-eQTL 9.08e-01 0.0169 0.146 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -716473 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0103 0.153 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -752074 sc-eQTL 3.29e-01 -0.157 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 eQTL 1.26e-02 0.124 0.0497 0.0 0.0 0.055
ENSG00000179088 C12orf42 -282376 eQTL 0.0455 0.0841 0.042 0.0 0.0 0.055
ENSG00000216285 AC078819.1 -817145 eQTL 0.0465 0.165 0.0829 0.0 0.0 0.055

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111696 NT5DC3 -627600 3.77e-07 1.83e-07 6.57e-08 2.41e-07 1.03e-07 1.03e-07 2.74e-07 5.89e-08 1.89e-07 1.11e-07 2.18e-07 1.62e-07 3.04e-07 8.54e-08 7.79e-08 1.01e-07 6.17e-08 2.33e-07 7.76e-08 7.05e-08 1.33e-07 1.9e-07 1.73e-07 3.67e-08 2.59e-07 1.56e-07 1.29e-07 1.46e-07 1.36e-07 1.58e-07 1.35e-07 5.22e-08 4.97e-08 1.01e-07 6.87e-08 4.6e-08 5.96e-08 7.1e-08 5.59e-08 7.92e-08 2.78e-08 1.68e-07 3.08e-08 1.08e-08 5.4e-08 9.65e-09 7.52e-08 0.0 4.61e-08