logo

Genes within 1Mb (chr12:103211343:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 9.51e-01 0.003 0.0493 0.175 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 6.78e-01 0.0448 0.108 0.175 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 1.72e-01 0.137 0.1 0.175 B L1
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0827 0.0969 0.175 B L1
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0914 0.0967 0.175 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0295 0.0608 0.175 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 2.04e-01 0.115 0.0904 0.175 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.44e-01 0.122 0.104 0.175 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 5.89e-01 0.0507 0.0935 0.175 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 6.40e-01 -0.044 0.094 0.175 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 1.82e-01 0.108 0.0805 0.175 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 1.48e-01 -0.12 0.0828 0.175 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 1.63e-01 0.125 0.0896 0.175 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 1.28e-01 0.158 0.103 0.175 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00876 0.0894 0.175 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 7.05e-01 0.036 0.0949 0.175 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00821 0.103 0.175 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0428 0.0963 0.175 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 1.04e-01 -0.141 0.0862 0.175 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 6.79e-01 0.038 0.0918 0.175 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 1.26e-01 0.169 0.11 0.175 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 4.73e-01 0.0759 0.106 0.175 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0381 0.112 0.182 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 2.50e-01 -0.138 0.12 0.182 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 8.82e-01 0.0161 0.108 0.182 DC L1
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 9.28e-01 -0.01 0.11 0.182 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 2.41e-01 0.0851 0.0723 0.182 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 5.08e-01 0.063 0.0949 0.182 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0287 0.114 0.182 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 8.52e-01 0.0221 0.118 0.175 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0983 0.109 0.175 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0805 0.102 0.175 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0125 0.0782 0.175 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 8.28e-01 -0.017 0.0782 0.175 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 6.65e-01 0.0436 0.1 0.175 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 4.31e-02 -0.214 0.105 0.176 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 2.26e-01 -0.118 0.0973 0.176 NK L1
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 4.73e-02 -0.18 0.09 0.176 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 5.98e-01 -0.053 0.1 0.176 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.14e-01 0.125 0.1 0.176 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 5.98e-01 0.0194 0.0368 0.175 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0222 0.105 0.175 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 9.96e-01 0.000551 0.108 0.175 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0453 0.0975 0.175 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 8.01e-01 0.0236 0.0937 0.175 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 2.89e-01 -0.09 0.0846 0.175 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 6.56e-01 0.0474 0.106 0.175 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 1.02e-01 0.179 0.109 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 9.75e-01 0.000739 0.0236 0.181 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 8.25e-01 0.0243 0.11 0.181 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 8.03e-01 -0.03 0.12 0.181 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 3.22e-01 0.129 0.13 0.181 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 1.65e-01 -0.18 0.129 0.181 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0783 0.14 0.181 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0686 0.107 0.181 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.98e-01 -0.122 0.117 0.181 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 8.31e-01 0.0109 0.051 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 5.99e-01 0.0605 0.115 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 8.29e-01 0.026 0.12 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 3.12e-01 0.129 0.127 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0461 0.128 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 8.33e-02 0.198 0.114 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 7.08e-01 0.0421 0.112 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 3.51e-01 0.113 0.121 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 7.79e-01 0.0127 0.0453 0.177 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 3.53e-01 0.106 0.114 0.177 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0193 0.123 0.177 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 9.93e-01 0.00103 0.122 0.177 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 2.79e-01 0.134 0.124 0.177 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 9.63e-01 0.00503 0.11 0.177 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0796 0.113 0.177 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.30e-01 -0.145 0.121 0.177 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 1.95e-01 0.0798 0.0613 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 1.41e-01 0.161 0.109 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 2.74e-02 0.263 0.119 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 1.26e-01 -0.174 0.113 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0787 0.106 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 6.57e-01 0.0401 0.09 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 8.25e-01 0.0259 0.117 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 6.86e-01 0.0467 0.115 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 7.19e-01 -0.02 0.0554 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 4.00e-01 0.1 0.119 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 3.96e-01 0.107 0.125 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0901 0.122 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0803 0.111 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 8.70e-01 0.0185 0.113 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 3.19e-01 0.117 0.117 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 1.95e-01 0.16 0.123 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 2.99e-01 -0.108 0.104 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 1.27e-01 0.179 0.117 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 4.02e-01 0.0983 0.117 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 9.28e-01 0.0111 0.123 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0115 0.105 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 4.73e-01 0.0769 0.107 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0782 0.116 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 7.09e-01 0.0361 0.0967 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 9.59e-01 0.00517 0.101 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 2.86e-01 0.0923 0.0862 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 1.36e-01 -0.13 0.087 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 2.95e-01 0.0935 0.089 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 2.86e-01 0.114 0.107 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0532 0.0976 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 6.32e-01 0.0532 0.111 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 3.03e-02 -0.255 0.117 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 7.37e-01 0.0356 0.106 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 1.87e-02 -0.225 0.0949 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000973 0.0947 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 5.44e-01 0.0667 0.11 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 1.32e-01 0.163 0.108 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 2.24e-01 -0.143 0.117 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 5.77e-01 0.0667 0.12 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 2.54e-02 0.254 0.113 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000179 0.113 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 1.93e-01 0.146 0.112 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 5.73e-01 0.0659 0.117 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.88e-01 0.12 0.113 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0352 0.105 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 6.22e-01 0.0583 0.118 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 9.84e-01 0.00224 0.111 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 3.15e-01 -0.111 0.111 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0636 0.0972 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0303 0.114 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 4.82e-02 0.208 0.105 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 3.40e-01 -0.105 0.11 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0813 0.121 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 6.49e-02 -0.205 0.111 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0457 0.1 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 9.45e-01 0.00664 0.0954 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 3.15e-01 0.115 0.114 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 5.04e-01 -0.074 0.111 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 3.93e-01 0.0917 0.107 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 8.88e-01 0.0168 0.12 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 7.26e-01 0.0422 0.12 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 3.45e-01 -0.112 0.118 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 4.31e-01 0.089 0.113 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 1.77e-01 0.15 0.11 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 5.61e-01 0.0713 0.123 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 6.44e-01 0.0522 0.113 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 3.51e-01 0.115 0.122 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0237 0.117 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 2.60e-01 -0.141 0.125 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00754 0.117 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0536 0.117 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.03e-01 0.153 0.12 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 9.17e-02 0.0673 0.0397 0.177 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 7.39e-01 0.0373 0.112 0.177 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 6.66e-01 0.0494 0.114 0.177 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0935 0.111 0.177 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 4.95e-01 0.0821 0.12 0.177 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 1.03e-01 -0.19 0.116 0.177 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 7.42e-01 0.0346 0.105 0.177 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0733 0.118 0.177 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 7.54e-01 0.0357 0.114 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 4.48e-01 0.0876 0.115 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 2.01e-01 -0.15 0.117 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 1.93e-01 0.151 0.116 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 3.68e-01 -0.111 0.123 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 1.90e-01 -0.156 0.118 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 3.08e-01 -0.108 0.106 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 6.14e-02 -0.188 0.0998 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0833 0.101 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.00e-02 0.268 0.114 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 3.94e-01 -0.103 0.121 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0167 0.123 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 4.25e-01 -0.097 0.121 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 5.49e-02 -0.229 0.118 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0732 0.11 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 1.17e-01 -0.185 0.118 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 1.96e-01 -0.133 0.102 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 2.82e-01 -0.113 0.104 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0793 0.104 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 6.55e-01 0.0487 0.109 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 1.63e-01 0.14 0.0996 0.148 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 3.87e-01 -0.137 0.157 0.148 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0743 0.135 0.148 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 3.94e-01 -0.134 0.157 0.148 PB L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 2.90e-02 -0.347 0.157 0.148 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 8.43e-02 0.127 0.0729 0.148 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 4.83e-01 0.0907 0.129 0.148 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 4.88e-01 0.112 0.161 0.148 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0297 0.0407 0.174 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 2.94e-01 -0.107 0.102 0.174 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00897 0.111 0.174 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0943 0.115 0.174 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 5.76e-01 0.0609 0.109 0.174 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0149 0.0761 0.174 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 4.47e-01 0.0794 0.104 0.174 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 1.43e-03 0.339 0.105 0.174 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 2.81e-01 0.116 0.108 0.175 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0173 0.124 0.175 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 8.48e-01 -0.021 0.11 0.175 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0972 0.121 0.175 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0194 0.112 0.175 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 2.84e-01 -0.103 0.096 0.175 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.29e-02 -0.274 0.12 0.175 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 6.65e-01 0.0555 0.128 0.188 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 1.64e-01 -0.156 0.111 0.188 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0392 0.12 0.188 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 6.91e-01 0.049 0.123 0.188 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0821 0.109 0.188 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00811 0.0814 0.188 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 1.08e-01 0.182 0.113 0.188 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 5.20e-01 0.0713 0.111 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0625 0.113 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0759 0.115 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 2.32e-01 -0.106 0.0881 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 1.07e-01 -0.138 0.085 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.67e-01 0.114 0.102 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0148 0.112 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00474 0.117 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0152 0.109 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 5.05e-01 0.0668 0.0999 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0573 0.0879 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0619 0.111 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0582 0.132 0.191 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 1.78e-01 0.183 0.135 0.191 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0944 0.13 0.191 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0799 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 2.91e-01 -0.146 0.138 0.191 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0432 0.13 0.191 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 9.00e-02 0.224 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 9.90e-01 0.00137 0.111 0.176 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0288 0.117 0.176 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 1.23e-01 0.188 0.121 0.176 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 9.19e-01 0.0116 0.114 0.176 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 7.47e-01 -0.033 0.102 0.176 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.53e-01 -0.12 0.104 0.176 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 9.82e-01 0.00256 0.112 0.179 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 1.34e-01 -0.169 0.112 0.179 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0473 0.114 0.179 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 2.54e-01 0.126 0.11 0.179 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 2.93e-01 -0.103 0.0976 0.179 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 6.19e-01 0.0551 0.111 0.179 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 2.97e-01 -0.117 0.112 0.184 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 2.45e-01 -0.148 0.127 0.184 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 7.38e-01 0.0447 0.133 0.184 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 9.03e-01 0.0139 0.113 0.184 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 5.28e-02 0.171 0.0875 0.184 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 4.92e-01 0.0794 0.115 0.184 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0671 0.11 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 7.98e-01 0.0149 0.0582 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 7.64e-01 0.0342 0.114 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 8.82e-01 0.0182 0.123 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 7.88e-02 0.197 0.111 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00922 0.119 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 3.61e-01 0.0971 0.106 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0342 0.0909 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0944 0.123 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 729599 sc-eQTL 3.52e-01 0.0605 0.0649 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 2.99e-01 0.114 0.109 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 2.43e-02 0.265 0.117 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 1.07e-01 -0.174 0.107 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0605 0.101 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 7.94e-01 0.0241 0.0922 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -284667 sc-eQTL 3.59e-01 0.104 0.113 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 2.90e-01 0.124 0.117 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 5.97e-01 0.0602 0.114 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0425 0.116 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 3.54e-01 -0.1 0.108 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0486 0.0807 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0776 0.079 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 7.83e-01 0.0277 0.101 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -629891 sc-eQTL 8.64e-01 0.0194 0.114 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 2.97e-01 -0.116 0.111 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 8.56e-01 0.0199 0.109 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 5.64e-01 0.0612 0.106 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0586 0.106 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00254 0.109 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -853188 sc-eQTL 2.02e-02 -0.255 0.109 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -926898 sc-eQTL 1.98e-01 -0.125 0.0968 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -754479 sc-eQTL 1.06e-01 -0.155 0.0953 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0915 0.101 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -754365 sc-eQTL 1.11e-01 0.169 0.105 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139372 TDG -754479 eQTL 0.0199 -0.0525 0.0225 0.0 0.0 0.177
ENSG00000166598 HSP90B1 -718764 eQTL 0.0429 0.041 0.0202 0.0 0.0 0.177

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000214198 \N -718868 4.37e-07 1.78e-07 7.72e-08 2.31e-07 1.08e-07 1.13e-07 3.11e-07 7.98e-08 2.56e-07 1.46e-07 2.38e-07 1.91e-07 2.94e-07 8.54e-08 6.93e-08 1.17e-07 8.53e-08 2.66e-07 8.93e-08 7.83e-08 1.39e-07 2.24e-07 2.04e-07 3.27e-08 2.86e-07 2.33e-07 1.48e-07 1.42e-07 1.54e-07 1.58e-07 1.35e-07 4.85e-08 3.8e-08 1.15e-07 5.5e-08 5.23e-08 5.62e-08 5.92e-08 4.75e-08 6.43e-08 5.1e-08 1.55e-07 3.18e-08 1.24e-08 3.4e-08 9.44e-09 9.1e-08 0.0 4.61e-08