logo

Genes within 1Mb (chr12:103192554:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 7.98e-01 -0.013 0.0509 0.147 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00684 0.112 0.147 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 4.99e-01 0.0703 0.104 0.147 B L1
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 7.03e-02 -0.181 0.0995 0.147 B L1
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 9.24e-01 0.00961 0.1 0.147 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 2.95e-02 -0.136 0.0621 0.147 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00508 0.0938 0.147 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0513 0.108 0.147 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 2.54e-02 -0.218 0.0969 0.147 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 3.66e-01 0.0855 0.0943 0.147 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 4.57e-01 0.0706 0.0948 0.147 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0481 0.0815 0.147 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 6.92e-01 0.0333 0.084 0.147 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 6.15e-01 0.0457 0.0908 0.147 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 6.29e-01 0.0506 0.105 0.147 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 4.79e-01 0.0639 0.0901 0.147 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0175 0.0966 0.147 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 1.06e-01 0.168 0.104 0.147 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 5.89e-01 0.053 0.0979 0.147 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 1.46e-01 -0.128 0.0877 0.147 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 3.34e-01 0.0903 0.0932 0.147 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 2.18e-01 -0.139 0.113 0.147 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0419 0.108 0.147 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0572 0.118 0.146 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0484 0.127 0.146 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 3.81e-01 0.0996 0.114 0.146 DC L1
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 8.40e-01 0.0235 0.116 0.146 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 8.07e-01 0.0187 0.0763 0.146 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0477 0.0999 0.146 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 1.38e-01 0.178 0.12 0.146 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 1.13e-01 -0.195 0.123 0.147 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 9.98e-01 0.000229 0.113 0.147 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000565 0.106 0.147 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 9.81e-01 0.00193 0.0815 0.147 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 1.44e-01 0.119 0.0811 0.147 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 1.72e-03 -0.325 0.102 0.147 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 6.80e-01 0.0445 0.108 0.148 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 1.93e-01 0.129 0.099 0.148 NK L1
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0285 0.0925 0.148 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 6.64e-01 0.0444 0.102 0.148 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 3.81e-01 0.0895 0.102 0.148 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0206 0.0394 0.147 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 8.27e-01 0.0248 0.113 0.147 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 7.03e-01 -0.044 0.115 0.147 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 7.57e-01 0.0324 0.104 0.147 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0562 0.1 0.147 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0679 0.0907 0.147 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 1.77e-01 0.154 0.114 0.147 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0333 0.117 0.147 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 3.41e-01 0.0886 0.0929 0.147 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 3.67e-01 0.0212 0.0235 0.156 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 3.74e-01 0.0971 0.109 0.156 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 8.61e-02 0.206 0.119 0.156 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 6.07e-02 -0.242 0.128 0.156 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0941 0.129 0.156 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0803 0.14 0.156 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 8.15e-01 0.025 0.107 0.156 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0325 0.117 0.156 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 7.93e-01 -0.025 0.0951 0.156 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 6.57e-01 0.0225 0.0506 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 1.12e-01 -0.181 0.113 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 5.17e-01 0.0772 0.119 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0614 0.127 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 3.30e-01 -0.124 0.127 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0157 0.114 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 1.64e-01 0.155 0.111 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0787 0.12 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 5.31e-02 -0.226 0.116 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0175 0.047 0.149 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 2.03e-01 -0.151 0.118 0.149 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 3.50e-01 0.119 0.127 0.149 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 2.75e-01 0.138 0.126 0.149 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 8.39e-02 -0.222 0.128 0.149 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0264 0.114 0.149 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 4.24e-01 0.0939 0.117 0.149 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 2.49e-01 -0.144 0.125 0.149 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 1.22e-01 -0.168 0.108 0.149 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0586 0.0642 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 3.81e-01 0.1 0.114 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0059 0.125 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 4.22e-01 0.0958 0.119 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0557 0.11 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 2.13e-02 -0.216 0.093 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 8.77e-01 0.0189 0.122 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0257 0.121 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 9.83e-01 0.00246 0.115 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0253 0.0567 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000659 0.122 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 1.60e-01 0.18 0.128 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 4.82e-03 -0.348 0.122 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 6.71e-01 0.0485 0.114 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 8.21e-02 -0.201 0.115 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 9.29e-01 0.0106 0.12 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 6.26e-01 0.0618 0.127 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 1.02e-01 -0.181 0.11 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 6.86e-02 0.198 0.108 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 3.53e-01 0.115 0.123 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 8.53e-01 0.0228 0.123 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 1.06e-01 -0.209 0.128 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 4.75e-01 0.0784 0.11 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0214 0.112 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 2.89e-01 0.129 0.121 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 6.45e-02 0.182 0.0979 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0758 0.103 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 4.28e-01 0.0699 0.0881 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 7.23e-01 0.0317 0.0893 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 4.34e-01 0.0713 0.0909 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 4.60e-01 0.081 0.109 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 3.32e-01 0.0967 0.0995 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 1.08e-01 -0.183 0.113 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 1.51e-03 0.381 0.119 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0315 0.109 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 8.72e-01 0.016 0.0987 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 6.29e-01 0.047 0.0972 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 5.63e-01 0.0653 0.113 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0849 0.111 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 9.98e-01 0.000354 0.122 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 1.48e-01 0.181 0.124 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0564 0.119 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0797 0.118 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 9.18e-01 0.0121 0.117 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 5.23e-01 -0.078 0.122 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 7.69e-01 0.0346 0.118 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 8.86e-01 0.0156 0.109 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 5.62e-01 0.0712 0.123 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 5.75e-01 0.0649 0.116 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0307 0.115 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 1.35e-01 0.151 0.101 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 2.57e-01 -0.135 0.118 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 2.72e-01 -0.12 0.109 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 6.91e-01 0.0438 0.11 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 2.06e-01 0.153 0.12 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 6.26e-02 0.208 0.111 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 7.30e-03 -0.268 0.0988 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 9.55e-01 0.0054 0.0956 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0127 0.114 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 8.16e-01 0.0258 0.111 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 3.19e-01 0.111 0.112 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 8.28e-01 -0.027 0.125 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 2.99e-01 -0.13 0.125 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 5.01e-02 -0.241 0.122 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 3.52e-01 0.11 0.117 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 3.30e-02 -0.245 0.114 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0325 0.128 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 1.13e-01 -0.183 0.115 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 1.57e-01 0.178 0.125 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 5.89e-02 -0.226 0.119 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 9.02e-01 0.0158 0.129 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 3.01e-01 0.124 0.12 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0447 0.12 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0574 0.123 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 5.73e-02 -0.0803 0.042 0.147 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 3.95e-01 0.101 0.118 0.147 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0876 0.121 0.147 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 4.13e-01 0.0965 0.118 0.147 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 1.69e-01 -0.175 0.127 0.147 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 3.21e-01 0.123 0.123 0.147 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 4.52e-01 0.0834 0.111 0.147 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 1.68e-01 0.172 0.124 0.147 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0825 0.103 0.147 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 4.68e-01 0.091 0.125 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 8.82e-01 0.0189 0.127 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 4.69e-01 0.0934 0.129 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 6.20e-01 0.0633 0.127 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 1.22e-01 0.209 0.134 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 6.94e-01 0.0471 0.12 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 8.52e-02 0.184 0.106 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 8.84e-01 0.0149 0.101 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 5.49e-01 0.061 0.101 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0389 0.116 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 1.09e-01 0.214 0.133 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 8.31e-01 0.0289 0.136 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 1.31e-01 -0.202 0.133 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 5.91e-01 0.0707 0.131 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 3.18e-01 0.121 0.121 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0411 0.123 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 6.25e-01 0.0523 0.107 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 7.48e-02 -0.194 0.108 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 2.90e-01 -0.115 0.108 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 4.59e-01 0.0841 0.113 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 1.12e-01 -0.13 0.0813 0.159 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 4.14e-01 0.105 0.129 0.159 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 8.56e-01 0.0201 0.11 0.159 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0695 0.128 0.159 PB L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 7.57e-01 0.0407 0.131 0.159 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 5.35e-01 0.0376 0.0603 0.159 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0431 0.106 0.159 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 1.45e-01 -0.192 0.131 0.159 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 9.60e-02 -0.167 0.0992 0.159 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0327 0.0426 0.148 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 3.19e-01 -0.107 0.107 0.148 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0295 0.116 0.148 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 7.10e-02 0.216 0.119 0.148 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 5.58e-01 0.0668 0.114 0.148 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0777 0.0795 0.148 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 6.16e-01 0.0549 0.109 0.148 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0126 0.112 0.148 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0388 0.0861 0.148 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 5.20e-02 -0.215 0.11 0.147 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 2.59e-01 -0.144 0.127 0.147 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0346 0.113 0.147 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0158 0.125 0.147 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 6.77e-01 0.0482 0.116 0.147 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 6.06e-01 0.0512 0.0991 0.147 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 3.50e-01 -0.117 0.125 0.147 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 5.70e-01 0.0753 0.132 0.151 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0449 0.116 0.151 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 5.84e-01 -0.068 0.124 0.151 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 6.18e-01 0.0635 0.127 0.151 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 6.35e-02 0.209 0.112 0.151 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00715 0.0841 0.151 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 2.81e-01 0.127 0.117 0.151 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 2.17e-02 -0.268 0.116 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 8.26e-01 0.0263 0.119 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0538 0.122 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 5.68e-01 0.0533 0.0933 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 8.85e-02 0.154 0.0897 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 7.47e-02 -0.193 0.108 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 3.29e-01 -0.116 0.119 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 7.22e-01 0.0443 0.124 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 1.77e-02 0.272 0.114 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 7.39e-01 0.0354 0.106 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 4.01e-02 0.191 0.0925 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 4.36e-02 -0.237 0.117 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 2.56e-01 0.165 0.145 0.136 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 7.05e-01 0.0569 0.15 0.136 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 2.02e-01 0.183 0.143 0.136 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0179 0.145 0.136 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 5.74e-01 0.086 0.153 0.136 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 5.30e-02 0.276 0.141 0.136 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 8.81e-03 -0.378 0.142 0.136 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0898 0.131 0.136 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 3.74e-01 -0.103 0.116 0.147 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 7.44e-02 -0.218 0.122 0.147 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00592 0.128 0.147 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 1.43e-01 -0.175 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 9.85e-02 0.176 0.106 0.147 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0836 0.109 0.147 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0313 0.124 0.145 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 4.67e-01 0.0903 0.124 0.145 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 3.18e-01 0.125 0.125 0.145 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 8.78e-02 -0.207 0.121 0.145 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 6.80e-01 0.0446 0.108 0.145 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 2.38e-01 -0.144 0.122 0.145 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 1.45e-01 -0.183 0.125 0.138 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 2.30e-01 0.171 0.142 0.138 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 3.06e-02 0.319 0.146 0.138 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 4.92e-01 -0.087 0.126 0.138 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 7.33e-01 0.0337 0.0988 0.138 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 6.42e-01 -0.06 0.129 0.138 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 2.14e-01 0.153 0.122 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 6.90e-01 0.0235 0.0589 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 2.23e-01 -0.14 0.115 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 1.07e-01 0.2 0.123 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0826 0.113 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 3.00e-01 -0.125 0.12 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 6.83e-01 -0.044 0.107 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 3.05e-01 0.0944 0.0918 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 2.48e-01 -0.144 0.125 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 1.20e-01 -0.189 0.121 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 710810 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0388 0.0683 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 4.28e-01 0.0915 0.115 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 6.76e-01 0.0521 0.124 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 2.35e-01 -0.135 0.113 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 9.86e-01 0.00183 0.106 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 7.95e-03 -0.255 0.0953 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -303456 sc-eQTL 7.65e-01 0.0357 0.119 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 9.09e-01 0.0142 0.123 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 994969 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0757 0.116 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 4.53e-02 -0.24 0.119 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 9.40e-01 0.00927 0.123 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 7.43e-01 0.0375 0.114 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 4.55e-01 0.0639 0.0853 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 3.99e-02 0.171 0.0829 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 1.99e-03 -0.326 0.104 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -648680 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0688 0.122 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0628 0.119 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 5.24e-01 0.0746 0.117 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 1.76e-01 -0.153 0.113 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 4.50e-01 0.0854 0.113 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 2.17e-01 -0.144 0.116 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -871977 sc-eQTL 6.24e-01 0.055 0.112 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -945687 sc-eQTL 3.20e-01 0.0983 0.0986 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -773268 sc-eQTL 2.87e-01 -0.104 0.0972 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -737553 sc-eQTL 7.40e-01 0.0341 0.103 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -773154 sc-eQTL 6.08e-01 0.0552 0.108 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000017427 IGF1 710810 eQTL 0.0361 0.0622 0.0297 0.00126 0.0 0.138
ENSG00000136011 STAB2 -394719 eQTL 0.0554 -0.0727 0.0379 0.00239 0.0 0.138

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 IGF1 710810 3.1e-07 1.59e-07 6.99e-08 2.24e-07 1.07e-07 8.89e-08 2.24e-07 6.12e-08 1.71e-07 1.03e-07 1.76e-07 1.31e-07 2.29e-07 8.07e-08 6.12e-08 9.6e-08 5.57e-08 2.04e-07 7.11e-08 6.03e-08 1.23e-07 1.76e-07 1.69e-07 4.07e-08 2.17e-07 1.56e-07 1.31e-07 1.26e-07 1.37e-07 1.38e-07 1.22e-07 4.29e-08 4.23e-08 9.08e-08 3.36e-08 3.43e-08 5.26e-08 7.92e-08 6.33e-08 6.92e-08 4.36e-08 1.59e-07 3.18e-08 7.28e-09 4.99e-08 6.68e-09 7.13e-08 0.0 4.54e-08
ENSG00000216285 \N -838225 2.77e-07 1.36e-07 6.41e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.45e-08 1.73e-07 5.75e-08 1.47e-07 6.75e-08 1.73e-07 1.11e-07 1.69e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.97e-08 4.18e-08 1.56e-07 7.09e-08 5.04e-08 1.27e-07 1.31e-07 1.58e-07 2.68e-08 1.68e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.07e-07 1.07e-07 3.84e-08 3.68e-08 8.7e-08 3.63e-08 2.68e-08 5.35e-08 9.17e-08 6.67e-08 4.24e-08 5.33e-08 1.46e-07 4.7e-08 1.1e-08 3.36e-08 1.65e-08 8.74e-08 1.98e-09 4.98e-08