logo

Genes within 1Mb (chr12:103188207:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 5.63e-01 0.0275 0.0475 0.194 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 4.28e-02 -0.21 0.103 0.194 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 7.73e-01 0.0281 0.097 0.194 B L1
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 1.79e-01 0.126 0.0932 0.194 B L1
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 4.30e-01 0.0739 0.0933 0.194 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 1.18e-01 0.0915 0.0583 0.194 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 8.63e-01 0.0152 0.0876 0.194 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 8.89e-01 0.0141 0.101 0.194 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0662 0.0914 0.194 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0608 0.0885 0.194 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0195 0.089 0.194 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 1.08e-01 -0.123 0.0761 0.194 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 4.76e-01 0.0562 0.0787 0.194 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0515 0.0851 0.194 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 7.54e-01 0.0307 0.0982 0.194 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 7.32e-01 -0.029 0.0846 0.194 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 6.63e-01 0.0402 0.0919 0.194 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 8.64e-01 -0.017 0.0993 0.194 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0288 0.0932 0.194 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 2.91e-02 0.182 0.083 0.194 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00537 0.0889 0.194 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 1.53e-01 -0.153 0.107 0.194 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 5.50e-01 0.0612 0.102 0.194 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 6.20e-01 0.0553 0.111 0.191 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 2.66e-01 -0.133 0.119 0.191 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 1.20e-01 -0.166 0.106 0.191 DC L1
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 9.82e-01 0.00241 0.11 0.191 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0521 0.0718 0.191 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0259 0.0942 0.191 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 6.16e-01 -0.057 0.113 0.191 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 3.24e-01 0.115 0.117 0.194 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 4.44e-01 0.0825 0.107 0.194 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0608 0.101 0.194 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 9.43e-01 0.00551 0.0773 0.194 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0279 0.0773 0.194 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0648 0.0992 0.194 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 6.97e-01 0.0399 0.102 0.193 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 8.74e-01 -0.015 0.0943 0.193 NK L1
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 3.78e-02 0.182 0.0869 0.193 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 7.31e-01 0.0334 0.0971 0.193 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 2.49e-01 0.112 0.0967 0.193 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0206 0.0367 0.194 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 2.83e-01 -0.113 0.105 0.194 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 2.15e-01 0.133 0.107 0.194 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 7.77e-01 0.0276 0.0973 0.194 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 7.42e-01 0.0308 0.0934 0.194 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0166 0.0847 0.194 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 5.54e-01 0.063 0.106 0.194 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 7.42e-01 0.0361 0.109 0.194 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0489 0.0867 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 2.53e-01 0.0262 0.0229 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 3.10e-01 0.108 0.106 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00814 0.117 0.196 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0725 0.126 0.196 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0532 0.126 0.196 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 1.72e-01 0.186 0.136 0.196 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 8.59e-01 0.0185 0.104 0.196 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 3.86e-01 0.0993 0.114 0.196 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0117 0.0929 0.196 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 1.68e-01 0.0663 0.0479 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 1.02e-01 -0.177 0.108 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0352 0.113 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 7.46e-01 0.0391 0.12 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 7.88e-01 0.0327 0.121 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 8.49e-01 0.0207 0.108 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0538 0.106 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 8.05e-01 0.0283 0.115 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 1.43e-01 -0.163 0.111 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0235 0.0439 0.196 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 2.62e-01 -0.124 0.111 0.196 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0298 0.12 0.196 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 7.55e-01 0.0368 0.118 0.196 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 3.46e-01 -0.114 0.12 0.196 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 1.35e-01 0.159 0.106 0.196 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 8.44e-01 0.0216 0.11 0.196 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 9.90e-02 0.193 0.117 0.196 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0706 0.102 0.196 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0727 0.0603 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 2.16e-02 -0.246 0.106 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 5.64e-01 0.0681 0.118 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00763 0.112 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 1.23e-01 0.16 0.103 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 4.42e-01 0.0681 0.0885 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0906 0.115 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 1.33e-01 -0.17 0.113 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0544 0.108 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 3.98e-01 0.0452 0.0534 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0434 0.115 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0931 0.121 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 3.99e-02 0.241 0.116 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 3.05e-01 -0.11 0.107 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 1.78e-01 0.147 0.109 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 5.38e-01 0.0699 0.113 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 5.43e-02 0.229 0.118 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00787 0.105 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 4.11e-02 -0.209 0.102 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 7.37e-01 0.0392 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 2.86e-01 -0.124 0.116 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 5.76e-02 0.231 0.121 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 4.87e-01 0.072 0.103 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0409 0.106 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 4.62e-01 0.0843 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 8.37e-01 -0.019 0.0926 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0119 0.0965 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 1.46e-01 -0.12 0.0824 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 4.57e-01 0.0623 0.0837 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0465 0.0854 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 5.07e-01 0.0683 0.103 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 2.97e-01 0.0976 0.0933 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0619 0.108 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 7.76e-01 0.0328 0.115 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0222 0.104 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 1.66e-01 0.13 0.0934 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 3.08e-01 0.0943 0.0922 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00491 0.107 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0673 0.106 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 5.77e-01 -0.064 0.115 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 7.46e-01 0.0379 0.117 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0486 0.111 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 8.59e-01 0.0197 0.111 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 6.02e-02 -0.206 0.109 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 6.14e-01 0.0578 0.114 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 3.70e-02 -0.23 0.11 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 3.45e-01 0.0978 0.103 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0481 0.117 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 2.23e-01 -0.134 0.11 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 3.08e-02 0.235 0.108 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 7.19e-01 0.0346 0.0961 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 3.54e-01 -0.105 0.113 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 8.56e-01 0.0189 0.104 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 5.77e-01 0.059 0.106 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0147 0.116 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 7.20e-01 0.0385 0.107 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 4.48e-01 0.0732 0.0962 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0539 0.0916 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 2.59e-01 -0.124 0.109 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 8.26e-01 0.0235 0.106 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 5.48e-01 0.0633 0.105 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 6.05e-01 0.0608 0.117 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0156 0.118 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 7.84e-01 0.0319 0.116 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 9.25e-01 0.0104 0.111 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 5.45e-01 -0.066 0.109 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 9.30e-01 0.0106 0.12 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 3.58e-01 0.0995 0.108 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 1.43e-02 -0.286 0.116 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00443 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0276 0.12 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 4.18e-01 0.0908 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 7.83e-01 0.031 0.113 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 6.41e-01 0.0538 0.115 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 7.43e-02 -0.0709 0.0395 0.195 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 8.37e-02 -0.192 0.11 0.195 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 9.13e-01 0.0124 0.114 0.195 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 3.73e-01 0.0986 0.111 0.195 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 3.59e-01 0.11 0.12 0.195 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 9.17e-01 0.0122 0.116 0.195 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 3.11e-01 0.106 0.104 0.195 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 2.20e-02 0.267 0.116 0.195 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0118 0.0966 0.195 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 8.25e-01 0.0251 0.113 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 1.42e-01 -0.168 0.114 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 6.80e-01 0.0482 0.116 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 3.39e-01 -0.11 0.115 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 6.70e-01 0.052 0.122 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 8.80e-01 0.0172 0.114 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 4.67e-01 0.0739 0.101 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 4.31e-02 0.194 0.0954 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0111 0.0965 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 8.74e-01 0.0176 0.111 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0251 0.12 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0188 0.122 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 5.14e-01 0.0784 0.12 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 3.97e-01 0.0999 0.118 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 7.41e-01 0.0361 0.109 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 7.67e-01 0.0345 0.116 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0997 0.101 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 3.28e-01 0.101 0.103 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 9.44e-02 0.171 0.102 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 1.39e-01 0.158 0.106 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 7.38e-02 0.162 0.0897 0.193 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 8.89e-01 -0.02 0.143 0.193 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0581 0.122 0.193 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 1.84e-01 0.189 0.141 0.193 PB L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0483 0.145 0.193 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 4.47e-01 0.0509 0.0667 0.193 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0061 0.117 0.193 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0922 0.146 0.193 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 1.04e-01 0.18 0.11 0.193 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 1.82e-01 0.052 0.0389 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 7.93e-01 0.0257 0.0979 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 5.32e-01 0.0664 0.106 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0984 0.11 0.196 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 4.09e-01 0.0862 0.104 0.196 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 9.79e-01 0.00191 0.0729 0.196 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0176 0.1 0.196 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 2.32e-01 -0.123 0.103 0.196 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 3.39e-01 0.0754 0.0786 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 9.89e-01 0.00141 0.106 0.194 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 1.90e-01 -0.159 0.121 0.194 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0572 0.108 0.194 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 7.44e-01 -0.039 0.12 0.194 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 9.58e-01 0.00577 0.111 0.194 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 1.17e-01 0.148 0.0943 0.194 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0314 0.119 0.194 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 7.34e-01 -0.043 0.126 0.188 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0104 0.11 0.188 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 2.43e-01 -0.138 0.118 0.188 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00744 0.121 0.188 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0273 0.108 0.188 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 4.87e-01 0.0557 0.0801 0.188 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 3.47e-01 -0.105 0.112 0.188 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 4.11e-01 0.0902 0.11 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 4.30e-01 0.0884 0.112 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0251 0.114 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0111 0.0875 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 6.71e-01 0.036 0.0846 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 3.19e-01 -0.101 0.101 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 5.91e-01 0.0597 0.111 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0885 0.116 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0106 0.108 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 7.54e-01 0.0311 0.0991 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0731 0.0871 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 6.98e-01 0.0428 0.11 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 5.17e-01 0.0813 0.125 0.206 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 9.46e-01 0.0088 0.13 0.206 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 6.35e-01 -0.059 0.124 0.206 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 4.47e-01 0.0953 0.125 0.206 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 3.36e-01 -0.127 0.132 0.206 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 2.07e-01 -0.156 0.123 0.206 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0609 0.126 0.206 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0221 0.113 0.206 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0256 0.109 0.193 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 7.62e-01 -0.035 0.115 0.193 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 3.51e-01 -0.113 0.12 0.193 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 8.79e-01 0.0172 0.113 0.193 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 2.57e-01 0.114 0.1 0.193 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 4.71e-01 0.0744 0.103 0.193 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 5.32e-01 0.0705 0.112 0.192 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 9.87e-01 0.00188 0.113 0.192 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0463 0.114 0.192 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 8.34e-01 0.0232 0.11 0.192 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 1.22e-01 0.151 0.0974 0.192 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0363 0.111 0.192 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 4.74e-01 0.0786 0.11 0.189 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 1.67e-01 -0.171 0.124 0.189 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0413 0.13 0.189 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 7.49e-01 0.0355 0.11 0.189 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0893 0.086 0.189 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 5.23e-01 0.0718 0.112 0.189 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0994 0.107 0.189 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 3.29e-01 0.054 0.0552 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 9.70e-02 -0.179 0.108 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0712 0.116 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 9.30e-01 0.00942 0.107 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0463 0.113 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 1.36e-01 0.15 0.1 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 9.70e-01 0.00328 0.0864 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 2.44e-01 0.136 0.117 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 2.50e-01 -0.132 0.114 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 706463 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0429 0.0642 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 9.33e-02 -0.182 0.108 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 7.39e-01 0.039 0.117 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 3.25e-01 0.105 0.107 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 2.77e-01 0.108 0.0994 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 2.08e-01 0.115 0.0908 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -307803 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00965 0.112 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 9.96e-01 0.000611 0.116 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 990622 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0219 0.109 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 3.60e-01 0.102 0.112 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 7.45e-01 0.0373 0.115 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0438 0.106 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 6.07e-01 0.0409 0.0794 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0044 0.0779 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0266 0.0991 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -653027 sc-eQTL 7.95e-01 0.0298 0.114 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 9.11e-01 0.0125 0.112 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 1.67e-01 -0.152 0.109 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 8.03e-01 0.0266 0.106 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 1.55e-01 0.151 0.106 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 8.41e-01 0.0219 0.109 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -876324 sc-eQTL 7.15e-01 0.0387 0.106 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -950034 sc-eQTL 7.77e-01 0.0265 0.0934 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -777615 sc-eQTL 3.24e-02 0.196 0.0911 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -741900 sc-eQTL 6.28e-01 0.047 0.0969 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -777501 sc-eQTL 4.26e-01 0.0811 0.102 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136011 STAB2 -399066 pQTL 0.0228 -0.0622 0.0273 0.0 0.0 0.21
ENSG00000139372 TDG -777615 eQTL 0.0339 0.0466 0.0219 0.0 0.0 0.211

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina