logo

Genes within 1Mb (chr12:103183679:CTT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00663 0.0497 0.173 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 6.88e-01 0.0438 0.109 0.173 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 1.81e-01 0.136 0.101 0.173 B L1
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0815 0.0978 0.173 B L1
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 3.05e-01 -0.1 0.0976 0.173 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0207 0.0614 0.173 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 2.20e-01 0.112 0.0913 0.173 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 1.51e-01 0.151 0.105 0.173 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00876 0.0958 0.173 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 7.69e-01 0.0276 0.0937 0.173 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0444 0.0941 0.173 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 2.08e-01 0.102 0.0806 0.173 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 1.11e-01 -0.133 0.0828 0.173 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 1.50e-01 0.13 0.0897 0.173 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 1.06e-01 0.168 0.103 0.173 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0167 0.0895 0.173 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 6.95e-01 0.0372 0.0948 0.173 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0274 0.102 0.173 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 6.40e-01 -0.045 0.0962 0.173 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 1.22e-01 -0.134 0.0861 0.173 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 5.93e-01 0.049 0.0917 0.173 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 9.94e-02 0.182 0.11 0.173 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 4.86e-01 0.0737 0.105 0.173 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0428 0.113 0.18 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 3.04e-01 -0.125 0.121 0.18 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 9.85e-01 0.00204 0.109 0.18 DC L1
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00329 0.111 0.18 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 1.61e-01 0.102 0.0725 0.18 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 4.86e-01 0.0666 0.0953 0.18 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0352 0.115 0.18 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 9.28e-01 0.0107 0.119 0.173 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0965 0.11 0.173 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0785 0.102 0.173 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 7.42e-01 -0.026 0.0788 0.173 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0107 0.0788 0.173 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 6.11e-01 0.0515 0.101 0.173 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 4.58e-02 -0.211 0.105 0.174 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 1.23e-01 -0.151 0.0972 0.174 NK L1
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 4.28e-02 -0.184 0.0901 0.174 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0541 0.101 0.174 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 2.76e-01 0.11 0.1 0.174 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 6.70e-01 0.0157 0.0369 0.173 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0151 0.106 0.173 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 8.48e-01 0.0207 0.108 0.173 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0551 0.0976 0.173 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 8.22e-01 0.0212 0.0938 0.173 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0992 0.0847 0.173 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 6.02e-01 0.0557 0.107 0.173 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 7.61e-02 0.194 0.109 0.173 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 4.19e-01 0.0705 0.087 0.173 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 9.24e-01 0.00227 0.0237 0.179 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 8.98e-01 0.0141 0.11 0.179 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0284 0.121 0.179 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 3.69e-01 0.117 0.13 0.179 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 1.42e-01 -0.191 0.129 0.179 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0611 0.141 0.179 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0622 0.107 0.179 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 3.06e-01 -0.121 0.118 0.179 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0756 0.0955 0.179 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 7.76e-01 0.0146 0.0514 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 6.65e-01 0.0502 0.116 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 9.15e-01 0.0129 0.121 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 3.17e-01 0.129 0.128 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0507 0.129 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 3.48e-02 0.243 0.115 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 7.68e-01 0.0334 0.113 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 2.74e-01 0.134 0.122 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 1.93e-01 -0.155 0.119 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 6.85e-01 0.0185 0.0456 0.175 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 3.06e-01 0.118 0.115 0.175 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00442 0.124 0.175 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 9.37e-01 0.00972 0.122 0.175 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 3.20e-01 0.124 0.125 0.175 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 8.67e-01 0.0185 0.11 0.175 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0691 0.114 0.175 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 2.14e-01 -0.151 0.121 0.175 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 9.38e-01 0.0082 0.106 0.175 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 1.41e-01 0.091 0.0615 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 1.65e-01 0.152 0.109 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 1.87e-02 0.282 0.119 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 1.50e-01 -0.165 0.114 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0814 0.106 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 4.18e-01 0.0734 0.0904 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 8.52e-01 0.0219 0.117 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 5.99e-01 0.061 0.116 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 9.34e-01 0.00917 0.111 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0112 0.0557 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 4.52e-01 0.0899 0.119 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 4.62e-01 0.0928 0.126 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 3.72e-01 -0.109 0.122 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0848 0.112 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 6.41e-01 0.0531 0.114 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 2.86e-01 0.126 0.118 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 1.38e-01 0.184 0.124 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 1.85e-01 0.144 0.108 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 2.99e-01 -0.108 0.104 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 1.27e-01 0.179 0.117 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 4.02e-01 0.0983 0.117 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 9.28e-01 0.0111 0.123 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0115 0.105 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 4.73e-01 0.0769 0.107 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0782 0.116 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 9.50e-01 0.00608 0.0967 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 8.71e-01 0.0164 0.101 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 2.65e-01 0.0963 0.0862 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 1.08e-01 -0.141 0.087 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 2.76e-01 0.0972 0.089 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 2.37e-01 0.127 0.107 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 5.26e-01 -0.062 0.0976 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 6.63e-01 0.0486 0.111 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 3.10e-02 -0.254 0.117 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 8.44e-01 0.021 0.106 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 2.28e-02 -0.218 0.0952 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 8.60e-01 0.0168 0.0949 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 4.48e-01 0.0837 0.11 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 1.40e-01 0.16 0.108 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 2.03e-01 -0.15 0.117 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 7.89e-01 0.0321 0.12 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 2.29e-02 0.259 0.113 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0207 0.113 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 1.79e-01 0.151 0.112 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 5.13e-01 0.0766 0.117 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 3.60e-01 0.104 0.113 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0343 0.105 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 6.37e-01 0.0558 0.118 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 9.69e-01 0.00428 0.111 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 2.27e-01 -0.134 0.11 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0749 0.0972 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 9.71e-01 0.00422 0.114 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 2.56e-02 0.234 0.104 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 3.21e-01 -0.109 0.11 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0811 0.121 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 6.04e-02 -0.209 0.111 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0441 0.1 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 9.37e-01 0.00751 0.0955 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 2.97e-01 0.119 0.114 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0718 0.111 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 3.93e-01 0.0917 0.107 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 8.88e-01 0.0168 0.12 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 7.26e-01 0.0422 0.12 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 3.45e-01 -0.112 0.118 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 4.31e-01 0.089 0.113 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 1.77e-01 0.15 0.11 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 5.61e-01 0.0713 0.123 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 5.78e-01 0.0631 0.113 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 3.24e-01 0.121 0.123 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0255 0.117 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 1.88e-01 -0.166 0.125 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 9.43e-01 0.00842 0.117 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0265 0.118 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 2.54e-01 0.138 0.12 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 8.31e-02 0.0694 0.0398 0.175 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 6.76e-01 0.0469 0.112 0.175 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 5.74e-01 0.0646 0.115 0.175 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 2.53e-01 -0.127 0.111 0.175 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 6.28e-01 0.0586 0.121 0.175 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 1.24e-01 -0.18 0.116 0.175 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 7.13e-01 0.0387 0.105 0.175 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0375 0.118 0.175 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0202 0.0973 0.175 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 8.57e-01 0.0205 0.114 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 5.41e-01 0.0706 0.115 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 1.77e-01 -0.158 0.117 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 2.70e-01 0.128 0.115 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 3.07e-01 -0.125 0.122 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 1.47e-01 -0.172 0.118 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 2.17e-01 -0.131 0.106 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 6.29e-02 -0.186 0.0997 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0815 0.101 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 3.29e-02 0.245 0.114 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0802 0.121 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0593 0.123 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 3.16e-01 -0.122 0.122 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 4.65e-02 -0.237 0.118 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0631 0.111 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 1.84e-01 -0.157 0.118 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 2.31e-01 -0.123 0.102 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 2.76e-01 -0.114 0.105 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 4.10e-01 -0.086 0.104 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 6.37e-01 0.0516 0.109 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 2.66e-01 0.112 0.1 0.144 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 3.80e-01 -0.139 0.158 0.144 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0715 0.136 0.144 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0878 0.158 0.144 PB L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 1.13e-02 -0.404 0.157 0.144 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 1.17e-01 0.116 0.0735 0.144 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 6.03e-01 0.0677 0.13 0.144 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 4.19e-01 0.131 0.162 0.144 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 5.10e-01 0.0814 0.123 0.144 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0297 0.0407 0.174 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 2.94e-01 -0.107 0.102 0.174 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00897 0.111 0.174 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0943 0.115 0.174 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 5.76e-01 0.0609 0.109 0.174 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0149 0.0761 0.174 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 4.47e-01 0.0794 0.104 0.174 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 1.43e-03 0.339 0.105 0.174 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0207 0.0822 0.174 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 2.33e-01 0.129 0.108 0.173 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 8.21e-01 -0.028 0.124 0.173 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0272 0.11 0.173 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 3.07e-01 -0.124 0.121 0.173 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0153 0.112 0.173 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 2.87e-01 -0.103 0.0962 0.173 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 1.43e-02 -0.295 0.12 0.173 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 7.24e-01 0.0456 0.129 0.185 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 2.21e-01 -0.138 0.112 0.185 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 8.04e-01 -0.03 0.121 0.185 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 7.32e-01 0.0426 0.124 0.185 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0689 0.11 0.185 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00596 0.082 0.185 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 1.09e-01 0.183 0.114 0.185 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 5.79e-01 0.062 0.112 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0568 0.114 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0915 0.116 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 1.54e-01 -0.127 0.0886 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 1.01e-01 -0.141 0.0856 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 2.44e-01 0.12 0.103 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0168 0.113 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 9.95e-01 0.000721 0.118 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00444 0.109 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 5.24e-01 0.0641 0.1 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0486 0.0884 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0608 0.112 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0582 0.132 0.191 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 1.78e-01 0.183 0.135 0.191 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0944 0.13 0.191 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0799 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 2.91e-01 -0.146 0.138 0.191 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0432 0.13 0.191 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 9.00e-02 0.224 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 8.63e-02 0.203 0.118 0.191 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00356 0.111 0.173 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0371 0.118 0.173 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 1.04e-01 0.2 0.122 0.173 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0311 0.115 0.173 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0311 0.103 0.173 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 1.86e-01 -0.139 0.105 0.173 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0179 0.113 0.176 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 1.13e-01 -0.179 0.112 0.176 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0285 0.114 0.176 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 2.20e-01 0.136 0.11 0.176 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0872 0.0982 0.176 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 5.16e-01 0.0723 0.111 0.176 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 3.27e-01 -0.112 0.114 0.181 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 2.99e-01 -0.134 0.129 0.181 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 9.23e-01 0.0131 0.135 0.181 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 6.73e-01 0.0485 0.115 0.181 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 5.72e-02 0.17 0.0886 0.181 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 5.04e-01 0.0781 0.117 0.181 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0792 0.111 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 7.01e-01 0.0226 0.0588 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 8.48e-01 0.022 0.115 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 9.12e-01 0.0136 0.124 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 7.89e-02 0.199 0.113 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0136 0.12 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 2.67e-01 0.119 0.107 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0378 0.0919 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0832 0.125 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0963 0.122 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 701935 sc-eQTL 2.57e-01 0.0741 0.0652 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 3.60e-01 0.101 0.11 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 2.08e-02 0.274 0.117 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 1.05e-01 -0.175 0.108 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0629 0.101 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 5.37e-01 0.0572 0.0925 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -312331 sc-eQTL 3.53e-01 0.106 0.113 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 2.12e-01 0.147 0.118 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 986094 sc-eQTL 4.80e-01 0.0783 0.111 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 6.48e-01 0.0524 0.115 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0316 0.117 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 3.46e-01 -0.103 0.108 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0633 0.0812 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0743 0.0796 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 7.34e-01 0.0345 0.101 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -657555 sc-eQTL 9.38e-01 0.00892 0.114 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 2.63e-01 -0.125 0.112 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 7.37e-01 0.037 0.11 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 6.77e-01 0.0444 0.106 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0473 0.106 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00122 0.11 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -880852 sc-eQTL 2.68e-02 -0.243 0.109 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -954562 sc-eQTL 1.06e-01 -0.157 0.0967 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -782143 sc-eQTL 9.83e-02 -0.158 0.0953 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0909 0.101 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -782029 sc-eQTL 1.42e-01 0.155 0.105 0.175 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139372 TDG -782143 eQTL 0.0274 -0.0501 0.0227 0.0 0.0 0.172
ENSG00000166598 HSP90B1 -746428 eQTL 0.0362 0.0427 0.0203 0.0 0.0 0.172

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina