logo

Genes within 1Mb (chr12:103170110:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0313 0.0446 0.199 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00759 0.0979 0.199 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.55e-01 0.0843 0.0911 0.199 B L1
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0435 0.088 0.199 B L1
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 1.23e-01 -0.135 0.0874 0.199 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 7.37e-01 0.0186 0.0551 0.199 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 6.54e-01 0.037 0.0823 0.199 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.62e-01 0.106 0.0946 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 5.30e-01 0.0541 0.086 0.199 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 9.76e-01 0.00251 0.0848 0.199 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 1.47e-01 -0.123 0.0848 0.199 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 1.36e-01 0.109 0.0728 0.199 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 4.49e-02 -0.151 0.0747 0.199 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 2.94e-01 0.0855 0.0813 0.199 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 3.67e-01 0.0849 0.0938 0.199 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 8.01e-01 0.0205 0.081 0.199 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 6.90e-01 0.0341 0.0855 0.199 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0802 0.0922 0.199 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0719 0.0866 0.199 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0882 0.0778 0.199 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 9.82e-01 0.00184 0.0827 0.199 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 1.90e-01 0.131 0.0995 0.199 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 7.08e-01 0.0358 0.0952 0.199 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 9.56e-01 0.00566 0.103 0.207 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0939 0.11 0.207 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0103 0.0985 0.207 DC L1
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 6.46e-01 0.0463 0.101 0.207 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 1.46e-01 0.0959 0.0658 0.207 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 6.29e-01 0.0419 0.0866 0.207 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 8.96e-01 0.0136 0.104 0.207 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0323 0.109 0.199 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0974 0.1 0.199 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0142 0.0939 0.199 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0375 0.072 0.199 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0435 0.0721 0.199 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 5.49e-01 0.0556 0.0926 0.199 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 8.42e-02 -0.165 0.0951 0.2 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 1.21e-01 -0.137 0.0878 0.2 NK L1
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 5.10e-02 -0.16 0.0814 0.2 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 6.28e-01 -0.044 0.0908 0.2 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 9.57e-02 0.151 0.0902 0.2 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00164 0.0336 0.199 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00718 0.0963 0.199 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0412 0.0982 0.199 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0666 0.0889 0.199 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 8.82e-01 0.0127 0.0855 0.199 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0725 0.0773 0.199 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0231 0.0973 0.199 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 1.70e-02 0.238 0.0988 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 3.91e-01 0.0682 0.0793 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 7.90e-01 0.00569 0.0214 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 8.02e-01 0.0249 0.0994 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0773 0.109 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 5.13e-01 0.0772 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 3.85e-01 -0.102 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0915 0.127 0.202 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0611 0.097 0.202 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 5.36e-02 -0.205 0.105 0.202 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0973 0.0862 0.202 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 8.70e-01 -0.00745 0.0455 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 7.13e-01 0.0377 0.102 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0246 0.107 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 8.48e-02 0.196 0.113 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0577 0.115 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 9.72e-02 0.17 0.102 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0529 0.1 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 5.95e-01 0.0577 0.108 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0485 0.105 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 6.64e-01 0.0178 0.0409 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 4.95e-01 0.0705 0.103 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0631 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0602 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 3.93e-01 0.0959 0.112 0.2 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 9.84e-01 0.00195 0.0991 0.2 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0136 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.00e-01 -0.14 0.109 0.2 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 7.82e-01 0.0262 0.0948 0.2 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 4.22e-01 0.0453 0.0563 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 5.09e-01 0.0662 0.1 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 1.17e-01 0.172 0.109 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 2.07e-01 -0.132 0.104 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 2.16e-01 -0.12 0.0964 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 4.05e-01 0.0687 0.0824 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 7.69e-01 0.0315 0.107 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 8.52e-01 0.0197 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0316 0.101 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0245 0.0498 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 8.67e-01 0.0179 0.107 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 5.81e-01 0.0623 0.113 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0642 0.109 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 2.49e-01 -0.115 0.0998 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 7.49e-01 0.0325 0.102 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 5.04e-01 0.0706 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.09e-01 0.14 0.111 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 1.24e-01 0.149 0.0968 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0592 0.0949 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 2.83e-01 0.116 0.108 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 5.63e-01 0.0621 0.107 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 6.39e-01 0.053 0.113 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 9.94e-01 0.000733 0.0958 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 6.71e-01 0.0416 0.0979 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.07e-01 -0.134 0.106 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0074 0.0872 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0765 0.0907 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 9.01e-02 0.132 0.0774 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 6.52e-02 -0.145 0.0783 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 2.34e-01 0.0957 0.0802 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 5.89e-01 0.0523 0.0966 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0349 0.088 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 4.91e-01 0.0693 0.1 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.44e-02 -0.225 0.106 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00716 0.096 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 2.11e-03 -0.265 0.085 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0597 0.0855 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 6.26e-01 0.0485 0.0993 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 5.34e-02 0.189 0.0974 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 1.45e-01 -0.155 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 9.59e-01 0.00554 0.109 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 1.70e-01 0.142 0.103 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00979 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 1.52e-01 0.146 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 8.25e-01 0.0234 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 6.25e-01 0.0502 0.103 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0209 0.0954 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 7.25e-01 0.0379 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 7.94e-01 0.0265 0.101 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 1.11e-01 -0.161 0.1 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0879 0.0884 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 4.64e-01 0.0763 0.104 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.36e-02 0.217 0.095 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0672 0.0989 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.57e-01 -0.1 0.108 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 7.70e-03 -0.266 0.0988 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0379 0.0902 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00229 0.0859 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 5.36e-01 0.0636 0.103 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0958 0.0995 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 8.27e-01 0.0216 0.0989 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 6.89e-01 0.0442 0.11 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 7.54e-01 0.0348 0.111 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0438 0.109 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 7.21e-01 0.0371 0.104 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 4.61e-01 0.0754 0.102 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 8.12e-01 -0.027 0.113 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 8.11e-01 0.0244 0.102 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 2.66e-01 0.123 0.11 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0509 0.106 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 2.13e-01 -0.141 0.113 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 7.28e-01 0.0367 0.106 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0137 0.106 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 8.49e-02 0.187 0.108 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 2.18e-01 0.0452 0.0366 0.201 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 3.15e-01 0.103 0.102 0.201 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 7.51e-01 0.0334 0.105 0.201 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 1.41e-01 -0.15 0.102 0.201 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 9.48e-01 0.00714 0.11 0.201 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 2.69e-01 -0.118 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0281 0.0961 0.201 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0174 0.108 0.201 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 9.54e-01 0.00516 0.089 0.201 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 6.32e-01 0.0497 0.104 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 3.54e-01 0.0974 0.105 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 2.83e-01 -0.114 0.106 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 2.84e-01 0.113 0.105 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0828 0.112 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 2.05e-01 -0.135 0.106 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 1.25e-01 -0.146 0.0945 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 4.62e-02 -0.179 0.0893 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0784 0.0901 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.29e-02 0.235 0.102 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0677 0.112 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0665 0.114 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 1.11e-01 -0.179 0.112 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 2.97e-02 -0.239 0.109 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 6.18e-01 0.051 0.102 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0946 0.108 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 2.31e-01 -0.113 0.0936 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0859 0.0957 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0681 0.0952 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 7.53e-01 0.0314 0.0996 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 1.56e-01 0.124 0.0865 0.178 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 3.06e-01 -0.14 0.136 0.178 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 6.34e-01 -0.056 0.117 0.178 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 4.12e-01 -0.112 0.136 0.178 PB L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 2.76e-02 -0.305 0.137 0.178 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 1.05e-01 0.104 0.0635 0.178 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 8.71e-01 0.0182 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 6.54e-02 0.257 0.138 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 4.75e-01 0.0762 0.106 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 2.04e-01 -0.047 0.0369 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 1.07e-01 -0.15 0.0923 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0129 0.101 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 2.95e-01 -0.109 0.104 0.2 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 5.79e-01 0.0549 0.0988 0.2 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0256 0.0692 0.2 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00511 0.095 0.2 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.23e-05 0.406 0.0935 0.2 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0536 0.0747 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 2.80e-01 0.106 0.0975 0.199 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0354 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 7.37e-01 0.0335 0.0995 0.199 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0312 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0906 0.102 0.199 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 1.42e-01 -0.128 0.0868 0.199 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 6.50e-02 -0.202 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 5.15e-01 0.0756 0.116 0.215 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0923 0.101 0.215 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 7.01e-01 0.0417 0.109 0.215 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 2.00e-01 0.143 0.111 0.215 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0416 0.0989 0.215 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0521 0.0736 0.215 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 1.76e-01 0.139 0.102 0.215 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0204 0.102 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0559 0.104 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 8.96e-01 0.0139 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0991 0.0811 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 7.24e-02 -0.141 0.0782 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.56e-01 0.107 0.0942 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 9.15e-01 0.011 0.103 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0526 0.108 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0439 0.1 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 7.51e-01 0.0293 0.0922 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0734 0.081 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0403 0.102 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0675 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 2.72e-01 0.14 0.127 0.209 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 4.92e-01 -0.084 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 4.04e-01 -0.103 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0312 0.13 0.209 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0394 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.20e-01 0.152 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 7.83e-02 0.196 0.11 0.209 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 9.06e-01 -0.012 0.101 0.2 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0127 0.107 0.2 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 8.78e-02 0.19 0.111 0.2 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0721 0.104 0.2 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0968 0.093 0.2 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 1.55e-01 -0.136 0.0951 0.2 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 8.16e-01 -0.024 0.103 0.204 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 1.76e-01 -0.14 0.103 0.204 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 8.03e-01 0.026 0.104 0.204 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 2.73e-01 0.111 0.101 0.204 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0702 0.0897 0.204 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 4.44e-01 0.0778 0.101 0.204 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0764 0.102 0.215 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 2.47e-01 -0.133 0.115 0.215 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 4.06e-01 -0.1 0.12 0.215 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 9.57e-01 0.00552 0.102 0.215 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 2.14e-02 0.183 0.0786 0.215 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 5.08e-01 0.0691 0.104 0.215 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0274 0.0995 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 9.99e-01 -5.22e-05 0.0526 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 9.54e-01 0.0059 0.103 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0418 0.111 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 8.45e-02 0.174 0.101 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 8.82e-01 -0.016 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 4.79e-01 0.0679 0.0958 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0809 0.0819 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.17e-01 -0.137 0.111 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0207 0.109 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 688366 sc-eQTL 6.71e-01 0.0252 0.0592 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 8.67e-01 0.0168 0.0999 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 1.19e-01 0.168 0.107 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 2.05e-01 -0.125 0.0981 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 1.70e-01 -0.126 0.0915 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 5.25e-01 0.0534 0.0839 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -325900 sc-eQTL 4.84e-01 0.0722 0.103 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 2.34e-01 0.127 0.107 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 972525 sc-eQTL 2.67e-01 0.111 0.1 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 9.91e-01 0.00118 0.105 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0537 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0419 0.0992 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0634 0.0741 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0972 0.0725 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 6.21e-01 0.0458 0.0926 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -671124 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.49e-01 -0.096 0.102 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 4.71e-01 0.0726 0.101 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 9.15e-01 0.0104 0.0974 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0806 0.0971 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00556 0.1 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -894421 sc-eQTL 3.34e-02 -0.21 0.0983 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -968131 sc-eQTL 8.48e-02 -0.151 0.087 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -795712 sc-eQTL 7.40e-02 -0.154 0.0857 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0759 0.0907 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -795598 sc-eQTL 5.90e-02 0.18 0.0946 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139372 TDG -795712 eQTL 0.0356 -0.0449 0.0213 0.0 0.0 0.195
ENSG00000166598 HSP90B1 -759997 eQTL 0.0144 0.0469 0.0191 0.0 0.0 0.195

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina