logo

Genes within 1Mb (chr12:103165337:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 8.33e-01 0.0157 0.0744 0.073 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0637 0.163 0.073 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0502 0.152 0.073 B L1
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 3.96e-01 0.125 0.146 0.073 B L1
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 7.98e-01 0.0375 0.146 0.073 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0294 0.0919 0.073 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 2.72e-02 0.302 0.136 0.073 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 3.32e-01 -0.153 0.158 0.073 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 1.59e-01 0.202 0.143 0.073 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 7.04e-02 -0.25 0.137 0.073 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 1.27e-01 0.212 0.138 0.073 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 2.07e-01 0.151 0.119 0.073 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0375 0.123 0.073 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 8.47e-01 0.0256 0.133 0.073 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0612 0.153 0.073 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 3.72e-01 -0.118 0.132 0.073 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 3.53e-01 -0.132 0.142 0.073 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 1.59e-01 0.217 0.153 0.073 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 5.25e-01 0.092 0.144 0.073 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 1.44e-01 0.19 0.129 0.073 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 6.01e-01 0.0722 0.138 0.073 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 6.17e-01 0.0833 0.166 0.073 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 4.93e-01 -0.109 0.158 0.073 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 6.25e-02 -0.321 0.171 0.074 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 1.85e-01 0.245 0.184 0.074 DC L1
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 6.83e-01 0.0679 0.166 0.074 DC L1
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 9.95e-01 0.000996 0.17 0.074 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 7.72e-01 0.0324 0.111 0.074 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 7.08e-01 0.0546 0.146 0.074 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0275 0.175 0.074 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 4.34e-01 -0.141 0.18 0.073 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 3.50e-02 0.348 0.164 0.073 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 6.62e-01 0.0678 0.155 0.073 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0385 0.119 0.073 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0235 0.119 0.073 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 6.48e-02 0.282 0.152 0.073 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0409 0.157 0.073 NK L1
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0412 0.145 0.073 NK L1
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 5.10e-01 0.0889 0.135 0.073 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 7.50e-01 0.0475 0.149 0.073 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 3.75e-01 -0.132 0.149 0.073 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 3.07e-02 -0.122 0.056 0.073 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 3.94e-01 -0.138 0.162 0.073 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 3.40e-01 0.158 0.165 0.073 Other_T L1
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 5.04e-01 0.1 0.15 0.073 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 7.49e-01 0.046 0.144 0.073 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0246 0.13 0.073 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 9.35e-01 0.0135 0.164 0.073 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 5.71e-02 -0.32 0.167 0.073 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0297 0.134 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0229 0.037 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0589 0.172 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 5.88e-01 0.102 0.189 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 3.04e-01 0.21 0.203 0.061 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 6.25e-01 0.0998 0.204 0.061 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 6.33e-01 -0.105 0.22 0.061 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 8.65e-01 0.0286 0.168 0.061 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 3.09e-01 0.188 0.184 0.061 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 4.45e-01 0.114 0.149 0.061 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00977 0.0755 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 9.43e-01 0.0122 0.17 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 1.93e-01 0.231 0.177 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 2.35e-01 -0.224 0.188 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 4.14e-01 0.156 0.19 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 3.32e-01 -0.165 0.17 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 2.58e-01 0.188 0.166 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0593 0.18 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 7.60e-01 0.0535 0.175 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 5.39e-02 0.13 0.0669 0.071 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 3.34e-01 -0.164 0.17 0.071 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 5.90e-01 -0.099 0.183 0.071 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 1.92e-01 -0.236 0.18 0.071 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0352 0.185 0.071 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 1.93e-01 -0.213 0.163 0.071 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 2.64e-01 -0.189 0.168 0.071 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 1.99e-01 0.231 0.179 0.071 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 1.23e-01 0.241 0.155 0.071 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0272 0.0938 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 7.08e-01 0.0626 0.167 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 3.76e-01 -0.162 0.182 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 9.78e-01 0.00482 0.174 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 7.42e-01 0.0531 0.161 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 3.47e-01 -0.129 0.137 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 3.16e-02 0.381 0.176 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 7.26e-01 0.0616 0.176 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 1.46e-01 0.244 0.167 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 1.71e-01 0.114 0.0825 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0611 0.178 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0688 0.188 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 9.44e-02 0.304 0.181 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 7.90e-01 0.0443 0.166 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 2.53e-01 -0.193 0.168 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 1.38e-01 0.26 0.175 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 1.25e-01 -0.284 0.184 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 3.91e-01 0.139 0.162 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 7.48e-01 0.0532 0.165 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0451 0.188 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 5.57e-01 0.11 0.187 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 2.07e-01 -0.248 0.196 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 1.52e-01 -0.239 0.166 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 5.94e-01 0.091 0.17 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 3.48e-01 0.173 0.184 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 2.26e-02 -0.327 0.142 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 1.05e-01 0.242 0.149 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 7.35e-01 0.0437 0.129 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 8.32e-01 0.0276 0.13 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0426 0.133 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 3.41e-01 -0.152 0.159 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 5.41e-01 -0.089 0.145 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 2.90e-01 0.176 0.166 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 4.19e-01 -0.143 0.177 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 5.44e-01 0.0967 0.159 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 1.13e-01 -0.228 0.143 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 5.95e-01 0.0756 0.142 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 5.40e-01 0.101 0.165 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 2.65e-01 -0.182 0.163 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0696 0.179 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 9.02e-01 0.0226 0.182 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0677 0.174 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 6.66e-01 0.0743 0.172 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 6.58e-01 0.0758 0.171 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 9.69e-01 0.00693 0.178 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 8.31e-01 0.0369 0.172 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 3.02e-01 -0.166 0.16 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 5.28e-03 0.501 0.178 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 3.06e-01 0.175 0.17 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 2.79e-01 0.184 0.169 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0949 0.149 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 9.86e-01 0.00314 0.175 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 1.07e-01 -0.26 0.161 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00311 0.166 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 3.26e-01 0.179 0.182 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0144 0.168 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 2.36e-01 0.179 0.151 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 4.22e-01 -0.116 0.144 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 8.61e-01 0.0303 0.172 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 1.08e-01 -0.268 0.166 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 3.75e-01 -0.153 0.172 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 7.53e-01 0.0604 0.191 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 4.57e-01 -0.144 0.192 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 5.06e-01 0.126 0.19 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 5.45e-01 0.11 0.181 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 1.36e-01 0.264 0.177 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 4.20e-03 0.557 0.192 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 5.08e-01 0.113 0.171 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 8.79e-01 0.0284 0.186 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 3.45e-01 0.167 0.177 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 2.70e-01 0.21 0.189 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0806 0.177 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 5.64e-01 -0.103 0.178 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 8.48e-01 0.035 0.182 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 6.97e-01 -0.024 0.0616 0.069 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 4.26e-01 -0.137 0.172 0.069 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 7.29e-01 0.0611 0.176 0.069 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 6.02e-01 0.0895 0.171 0.069 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 4.92e-01 -0.127 0.185 0.069 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 3.12e-01 -0.182 0.18 0.069 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0163 0.161 0.069 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 7.44e-02 -0.323 0.18 0.069 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 3.79e-01 0.131 0.149 0.069 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 2.32e-01 -0.216 0.18 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0144 0.183 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0659 0.186 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 5.37e-01 -0.114 0.184 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0637 0.195 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0934 0.174 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 9.01e-01 0.0194 0.155 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 8.07e-01 0.036 0.147 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 7.49e-01 0.0473 0.147 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 1.13e-01 -0.268 0.168 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 4.52e-01 -0.137 0.182 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 3.27e-01 -0.181 0.184 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 3.19e-01 0.182 0.182 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 7.84e-01 0.0491 0.179 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 4.22e-01 -0.133 0.165 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 5.97e-01 0.0947 0.179 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0841 0.155 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 9.36e-01 0.0128 0.158 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 7.41e-01 0.0522 0.157 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 7.69e-01 0.0483 0.164 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 9.90e-01 0.00152 0.124 0.081 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 2.47e-01 0.225 0.193 0.081 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 9.79e-01 0.00446 0.166 0.081 PB L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 8.24e-01 0.0432 0.194 0.081 PB L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 1.02e-01 0.322 0.195 0.081 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 3.09e-01 0.0926 0.0905 0.081 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 7.63e-02 -0.281 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0433 0.198 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0315 0.151 0.081 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0759 0.063 0.07 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 9.09e-01 0.0181 0.159 0.07 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 1.42e-01 0.253 0.171 0.07 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 8.93e-01 0.024 0.178 0.07 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 8.54e-02 -0.29 0.168 0.07 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 5.96e-01 0.0626 0.118 0.07 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 9.92e-01 0.00156 0.162 0.07 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 3.91e-02 -0.343 0.165 0.07 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0775 0.128 0.07 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 3.05e-02 -0.359 0.165 0.073 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 8.91e-03 0.496 0.188 0.073 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 4.15e-01 0.138 0.169 0.073 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0749 0.187 0.073 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 4.75e-01 -0.124 0.173 0.073 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 9.08e-01 0.0172 0.149 0.073 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 4.71e-01 0.135 0.187 0.073 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 1.46e-01 -0.286 0.196 0.071 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 4.47e-01 0.131 0.172 0.071 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 5.84e-01 -0.101 0.185 0.071 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 5.39e-01 0.117 0.19 0.071 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 4.36e-01 -0.131 0.168 0.071 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0452 0.125 0.071 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 2.83e-01 -0.188 0.175 0.071 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0401 0.17 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 6.73e-02 0.316 0.172 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0541 0.176 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 7.95e-01 0.0352 0.135 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 9.82e-01 0.00301 0.131 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 6.22e-01 0.0775 0.157 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0173 0.175 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 3.17e-01 0.183 0.182 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0201 0.17 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 3.83e-01 -0.136 0.156 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 4.60e-01 0.102 0.137 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 1.08e-01 0.278 0.172 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 3.08e-01 -0.232 0.227 0.055 gdT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 8.72e-01 0.0381 0.236 0.055 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 1.08e-01 -0.361 0.223 0.055 gdT L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 3.21e-01 0.226 0.227 0.055 gdT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 7.03e-01 0.0915 0.24 0.055 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 7.93e-01 0.059 0.225 0.055 gdT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 3.88e-01 0.198 0.228 0.055 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 3.01e-01 -0.213 0.205 0.055 gdT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0675 0.167 0.071 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 2.04e-02 0.408 0.175 0.071 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0808 0.185 0.071 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 2.66e-01 0.192 0.172 0.071 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 2.77e-01 -0.168 0.154 0.071 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 3.23e-01 0.156 0.158 0.071 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 1.38e-01 -0.258 0.173 0.072 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 4.22e-02 0.353 0.172 0.072 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0185 0.176 0.072 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 5.15e-01 -0.111 0.17 0.072 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0361 0.151 0.072 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 7.72e-01 0.0498 0.171 0.072 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 3.52e-01 -0.165 0.176 0.073 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 3.39e-01 0.192 0.2 0.073 pDC L2
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 8.99e-01 0.0266 0.209 0.073 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 3.19e-01 -0.177 0.177 0.073 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 7.33e-01 0.0475 0.139 0.073 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0201 0.181 0.073 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 3.43e-01 0.164 0.172 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 5.87e-01 0.0464 0.0852 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 4.26e-01 -0.133 0.167 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 6.32e-01 0.086 0.179 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 2.01e-01 -0.21 0.164 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 7.55e-01 0.0543 0.174 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 2.68e-01 -0.172 0.155 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 8.48e-01 0.0255 0.133 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 2.76e-01 0.197 0.18 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 6.25e-01 0.0862 0.176 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 683593 sc-eQTL 7.81e-01 0.0278 0.0997 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 8.01e-01 0.0424 0.168 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 1.65e-01 -0.252 0.181 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 2.36e-01 0.196 0.165 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00618 0.155 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 3.69e-01 -0.127 0.141 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -330673 sc-eQTL 3.21e-02 0.37 0.172 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 5.55e-01 -0.106 0.18 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 967752 sc-eQTL 2.53e-01 0.193 0.169 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 5.57e-01 -0.103 0.174 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 7.95e-02 0.313 0.177 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00477 0.166 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0438 0.124 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 7.23e-01 0.0431 0.122 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 8.79e-02 0.263 0.154 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -675897 sc-eQTL 3.81e-01 -0.153 0.174 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 1.05e-02 0.434 0.168 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0382 0.167 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 8.42e-01 0.0325 0.162 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 2.91e-01 -0.171 0.161 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 4.38e-01 0.13 0.167 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -899194 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0126 0.162 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB -972904 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0546 0.143 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -800485 sc-eQTL 5.14e-01 0.0922 0.141 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -764770 sc-eQTL 6.88e-01 0.0598 0.148 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -800371 sc-eQTL 3.53e-01 -0.145 0.156 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136011 STAB2 -421936 eQTL 0.00454 0.157 0.0553 0.0 0.0 0.0584

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina