logo

Genes within 1Mb (chr12:103065022:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 8.94e-01 0.00977 0.0732 0.064 B L1
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 5.21e-01 0.0818 0.127 0.064 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 5.75e-01 0.0899 0.16 0.064 B L1
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0233 0.149 0.064 B L1
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0193 0.144 0.064 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 3.19e-01 -0.09 0.0901 0.064 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0607 0.135 0.064 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 6.34e-01 0.0721 0.151 0.064 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 3.61e-01 -0.142 0.155 0.064 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 6.92e-01 0.0559 0.141 0.064 B L1
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0958 0.119 0.064 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 3.43e-01 -0.133 0.141 0.064 CD4T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 1.38e-01 -0.209 0.141 0.064 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 6.60e-01 0.0551 0.125 0.064 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 1.14e-01 -0.214 0.135 0.064 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0277 0.156 0.064 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 3.01e-02 -0.29 0.133 0.064 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 1.19e-01 -0.228 0.146 0.064 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0141 0.143 0.064 CD8T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0775 0.155 0.064 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 1.78e-01 -0.176 0.13 0.064 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 9.88e-04 -0.451 0.135 0.064 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0199 0.167 0.064 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 5.78e-01 0.0889 0.159 0.064 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 1.68e-01 0.239 0.172 0.063 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 8.38e-01 0.0377 0.184 0.063 DC L1
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 7.20e-01 0.0708 0.197 0.063 DC L1
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 8.40e-01 0.0364 0.181 0.063 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 2.24e-01 0.144 0.118 0.063 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 6.38e-01 0.0731 0.155 0.063 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0371 0.181 0.063 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 4.46e-01 0.143 0.187 0.063 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 2.93e-01 0.147 0.14 0.064 Mono L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 7.35e-01 0.0622 0.183 0.064 Mono L1
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 9.74e-01 0.00558 0.169 0.064 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 2.34e-01 -0.144 0.121 0.064 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 8.10e-01 0.0293 0.121 0.064 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 9.51e-01 0.00963 0.156 0.064 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 3.55e-01 0.136 0.147 0.064 NK L1
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 3.77e-01 -0.139 0.158 0.064 NK L1
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 2.01e-01 -0.173 0.135 0.064 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 4.14e-03 -0.426 0.147 0.064 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 5.13e-01 -0.121 0.184 0.064 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 4.08e-01 -0.124 0.149 0.064 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 6.45e-01 0.0256 0.0556 0.064 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 2.33e-01 0.127 0.106 0.064 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 7.19e-01 0.0574 0.159 0.064 Other_T L1
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 8.96e-03 0.421 0.16 0.064 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0453 0.141 0.064 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 6.43e-01 0.0595 0.128 0.064 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00188 0.161 0.064 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 3.92e-02 0.232 0.112 0.064 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 4.02e-01 -0.139 0.165 0.064 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 9.81e-01 0.00308 0.131 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0273 0.0336 0.069 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 1.18e-02 -0.437 0.172 0.069 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00686 0.156 0.069 B_Activated L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 7.95e-01 0.0447 0.172 0.069 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 6.59e-01 0.0818 0.185 0.069 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 2.40e-01 -0.235 0.2 0.069 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 4.06e-01 0.127 0.153 0.069 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 2.44e-01 -0.169 0.144 0.069 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0513 0.168 0.069 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 7.96e-02 0.238 0.135 0.069 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0878 0.073 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 5.75e-02 0.346 0.181 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 1.98e-01 -0.212 0.164 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 2.20e-01 -0.211 0.172 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 5.23e-01 0.118 0.184 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 4.29e-01 -0.131 0.165 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 2.75e-01 0.176 0.161 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 7.30e-01 0.0612 0.177 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0464 0.174 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00907 0.17 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 1.18e-01 -0.105 0.0667 0.062 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 7.19e-01 0.0637 0.177 0.062 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 6.44e-02 0.312 0.168 0.062 B_Memory L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 5.82e-01 0.101 0.182 0.062 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 5.53e-01 -0.109 0.184 0.062 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 9.23e-01 0.0157 0.163 0.062 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 3.13e-01 0.169 0.167 0.062 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0123 0.171 0.062 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0859 0.179 0.062 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 5.16e-01 -0.101 0.155 0.062 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 7.13e-02 -0.168 0.0925 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 5.30e-01 -0.106 0.169 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 7.08e-01 0.0621 0.166 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 6.97e-01 0.0707 0.181 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 9.57e-01 0.00873 0.16 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 7.75e-01 0.0391 0.136 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0982 0.177 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 5.06e-01 0.119 0.178 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0338 0.175 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 5.11e-01 0.11 0.167 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 6.81e-01 0.0335 0.0812 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0148 0.166 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 6.90e-01 0.0696 0.174 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 1.62e-01 -0.257 0.183 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 2.48e-01 0.188 0.163 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 5.37e-01 -0.102 0.165 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0398 0.172 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 8.29e-03 -0.482 0.181 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 2.28e-01 -0.219 0.181 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 2.58e-01 -0.179 0.158 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 6.50e-01 0.0861 0.19 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 2.48e-01 0.194 0.167 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 3.60e-01 -0.174 0.19 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 2.78e-03 -0.589 0.194 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 3.44e-02 -0.356 0.167 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 1.66e-01 -0.239 0.172 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 9.33e-01 0.0157 0.187 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 5.51e-02 -0.262 0.136 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0454 0.146 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 1.76e-01 -0.206 0.152 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 5.47e-01 0.0797 0.132 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 2.63e-01 -0.151 0.134 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 2.90e-01 -0.172 0.162 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 1.39e-02 -0.361 0.146 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 2.97e-01 0.151 0.145 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 3.28e-02 -0.362 0.169 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 1.80e-01 -0.243 0.18 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 9.74e-01 0.00487 0.147 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 1.48e-01 -0.21 0.144 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 5.17e-01 0.109 0.168 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 1.84e-02 -0.391 0.164 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 2.28e-02 0.395 0.172 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 5.07e-01 0.122 0.183 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 4.32e-01 -0.147 0.187 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 1.72e-01 0.241 0.176 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 3.94e-01 -0.149 0.175 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 2.05e-01 0.231 0.182 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 2.40e-01 0.208 0.176 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 5.07e-02 -0.297 0.151 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 2.74e-01 -0.172 0.157 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 2.72e-01 -0.195 0.177 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0379 0.166 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 4.40e-03 -0.412 0.143 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 8.09e-02 0.299 0.17 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0898 0.158 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0533 0.165 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 8.07e-01 0.0401 0.164 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0768 0.18 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0376 0.15 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 9.80e-03 -0.366 0.14 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 4.77e-01 -0.121 0.17 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 1.29e-01 0.251 0.165 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 2.34e-01 -0.215 0.18 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 2.21e-01 -0.204 0.166 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 4.98e-01 0.126 0.185 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 7.52e-01 0.0581 0.184 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 1.38e-01 -0.259 0.174 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 7.43e-01 0.0565 0.172 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 2.72e-01 0.209 0.19 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0895 0.173 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 3.41e-01 -0.158 0.166 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 4.19e-01 0.146 0.181 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 4.67e-01 0.135 0.185 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 7.49e-02 -0.306 0.171 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0638 0.173 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 3.60e-01 -0.162 0.177 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 3.37e-02 0.133 0.062 0.065 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 8.71e-04 0.578 0.171 0.065 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 6.29e-01 0.0847 0.175 0.065 MAIT L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 3.58e-01 0.165 0.179 0.065 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0632 0.188 0.065 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 6.61e-01 0.0804 0.183 0.065 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0573 0.164 0.065 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 5.54e-02 0.328 0.17 0.065 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0253 0.184 0.065 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 5.86e-01 0.0827 0.152 0.065 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 2.73e-01 0.234 0.213 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 2.17e-01 -0.249 0.201 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 5.90e-01 -0.112 0.208 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 6.57e-02 -0.377 0.204 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 6.42e-01 0.0952 0.204 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 2.96e-01 0.227 0.217 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00889 0.163 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 8.37e-01 0.0362 0.175 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 4.57e-01 -0.11 0.148 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 1.19e-02 -0.372 0.147 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 5.76e-01 -0.106 0.19 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 8.52e-01 0.0319 0.171 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 2.05e-02 0.421 0.18 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0124 0.2 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 2.28e-01 0.242 0.2 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 1.58e-01 -0.279 0.196 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 4.15e-01 0.154 0.188 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 1.96e-01 -0.236 0.182 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 3.95e-01 0.157 0.184 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00792 0.2 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 6.84e-01 0.0724 0.177 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 1.73e-02 -0.418 0.174 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 2.81e-01 -0.219 0.202 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 5.72e-01 -0.104 0.184 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0716 0.115 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 2.36e-01 0.184 0.154 0.081 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0705 0.181 0.081 PB L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 7.47e-01 0.05 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 5.19e-02 -0.355 0.181 0.081 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 1.00e-01 -0.139 0.0836 0.081 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 7.45e-01 0.0483 0.148 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 9.98e-01 0.000406 0.152 0.081 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0993 0.184 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 3.79e-01 -0.124 0.14 0.081 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 1.86e-01 0.0836 0.063 0.065 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 2.84e-01 0.137 0.127 0.065 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 2.26e-01 0.192 0.158 0.065 Pro_T L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 8.91e-02 0.292 0.171 0.065 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 2.68e-01 -0.187 0.169 0.065 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 4.03e-01 0.0989 0.118 0.065 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 4.80e-01 -0.115 0.162 0.065 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 3.64e-02 0.243 0.116 0.065 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 1.39e-01 -0.246 0.166 0.065 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 2.46e-01 0.148 0.127 0.065 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 3.98e-01 -0.15 0.176 0.064 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 2.56e-01 0.19 0.167 0.064 Treg L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0396 0.192 0.064 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 2.27e-01 0.227 0.187 0.064 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 2.09e-01 -0.218 0.173 0.064 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 5.75e-01 0.0838 0.149 0.064 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 9.19e-01 0.019 0.188 0.064 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 3.45e-01 -0.173 0.182 0.061 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0921 0.222 0.061 cDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 5.08e-01 0.129 0.194 0.061 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0613 0.214 0.061 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 3.98e-01 0.16 0.189 0.061 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 2.88e-01 0.15 0.141 0.061 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 2.75e-01 0.197 0.18 0.061 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 6.12e-01 -0.1 0.197 0.061 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 5.32e-01 0.0987 0.158 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 2.89e-02 0.372 0.169 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 3.98e-02 -0.357 0.172 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 3.12e-01 -0.138 0.136 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 3.52e-01 0.123 0.131 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 5.89e-01 0.0854 0.158 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 5.67e-02 0.327 0.17 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 1.19e-01 -0.273 0.174 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 3.20e-01 0.182 0.182 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 7.69e-01 -0.046 0.156 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 5.00e-01 0.0927 0.137 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0609 0.173 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 1.04e-01 -0.283 0.173 0.064 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0446 0.171 0.064 intMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0883 0.181 0.064 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 5.84e-02 -0.334 0.175 0.064 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 1.74e-01 -0.214 0.157 0.064 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 3.89e-01 0.139 0.162 0.064 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 3.01e-01 0.193 0.186 0.059 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0198 0.19 0.059 ncMono L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 5.30e-01 -0.12 0.19 0.059 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0467 0.187 0.059 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 5.50e-01 0.0992 0.166 0.059 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 6.34e-01 0.0892 0.187 0.059 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 2.85e-01 0.253 0.236 0.054 pDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0572 0.2 0.054 pDC L2
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 1.06e-01 0.366 0.225 0.054 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 1.86e-01 0.266 0.2 0.054 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0357 0.157 0.054 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 6.16e-01 -0.103 0.205 0.054 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 7.39e-01 0.0681 0.204 0.054 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 5.59e-01 0.115 0.195 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 7.04e-02 -0.151 0.0833 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 3.66e-01 0.152 0.168 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 9.49e-01 0.0105 0.164 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0945 0.176 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0658 0.171 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 2.53e-01 -0.175 0.153 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 3.05e-02 0.282 0.13 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0351 0.175 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0762 0.178 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 3.81e-01 0.152 0.173 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 583278 sc-eQTL 1.11e-01 -0.157 0.0981 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0697 0.161 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 7.31e-01 0.0573 0.166 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0095 0.18 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 5.97e-01 0.0811 0.153 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0214 0.14 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -430988 sc-eQTL 3.68e-01 -0.155 0.171 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0949 0.184 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 4.07e-01 -0.148 0.178 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 867437 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00428 0.168 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 8.11e-02 0.253 0.144 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 7.70e-01 0.0512 0.175 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 3.31e-01 -0.174 0.179 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 4.13e-01 -0.102 0.124 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 4.26e-01 0.0972 0.122 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 9.11e-01 0.0173 0.155 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0723 0.167 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -776212 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0248 0.176 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 9.76e-01 0.00521 0.173 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 2.42e-01 -0.192 0.164 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 5.80e-01 0.0907 0.164 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 4.80e-01 0.119 0.169 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 944902 sc-eQTL 3.01e-01 0.161 0.155 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111727 HCFC2 -999509 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0342 0.163 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -900800 sc-eQTL 3.69e-01 -0.127 0.141 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -865085 sc-eQTL 3.54e-03 -0.431 0.146 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 944837 sc-eQTL 4.72e-01 -0.136 0.189 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -900686 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0456 0.157 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000017427 IGF1 583278 eQTL 0.00813 -0.104 0.0393 0.00273 0.0 0.0687
ENSG00000139372 TDG -900800 eQTL 0.0279 -0.0733 0.0333 0.0 0.0 0.0687

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111696 \N -776212 2.8e-07 1.36e-07 5.72e-08 1.97e-07 9.82e-08 8.45e-08 1.73e-07 5.62e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.67e-07 1.11e-07 1.71e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.51e-07 6.92e-08 4.95e-08 1.27e-07 1.31e-07 1.58e-07 3.22e-08 1.68e-07 1.23e-07 1.12e-07 1.04e-07 1.26e-07 1.03e-07 1.08e-07 3.99e-08 3.21e-08 8.7e-08 3.81e-08 3.22e-08 5.74e-08 8.89e-08 6.67e-08 3.6e-08 5.65e-08 1.46e-07 5.12e-08 1.11e-08 2.82e-08 1.8e-08 9.29e-08 1.95e-09 4.82e-08