logo

Genes within 1Mb (chr12:103018099:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0147 0.0693 0.071 B L1
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 8.59e-01 0.0214 0.121 0.071 B L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 5.84e-01 0.0832 0.152 0.071 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 2.13e-01 0.103 0.0826 0.071 B L1
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0321 0.136 0.071 B L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0648 0.0854 0.071 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0227 0.128 0.071 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 7.55e-01 0.0448 0.143 0.071 B L1
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0817 0.147 0.071 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 9.24e-01 0.0128 0.134 0.071 B L1
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 2.34e-01 -0.134 0.112 0.071 CD4T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0203 0.133 0.071 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00908 0.0798 0.071 CD4T L1
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 8.65e-01 0.0201 0.118 0.071 CD4T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 4.03e-01 -0.107 0.127 0.071 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 4.87e-01 -0.102 0.147 0.071 CD4T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 4.98e-02 -0.248 0.126 0.071 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 2.20e-01 -0.168 0.137 0.071 CD8T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0331 0.134 0.071 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 1.94e-01 -0.125 0.0963 0.071 CD8T L1
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 7.23e-02 -0.22 0.122 0.071 CD8T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 1.42e-02 -0.317 0.128 0.071 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0426 0.157 0.071 CD8T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 5.83e-01 0.0822 0.15 0.071 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 4.06e-01 0.139 0.167 0.07 DC L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000536 0.177 0.07 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 3.67e-01 -0.144 0.16 0.07 DC L1
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00902 0.174 0.07 DC L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 6.15e-02 0.213 0.113 0.07 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 9.02e-01 0.0184 0.149 0.07 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 2.63e-01 0.195 0.174 0.07 DC L1
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 4.52e-01 0.135 0.18 0.07 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 3.69e-01 0.119 0.132 0.071 Mono L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 7.25e-01 0.0611 0.174 0.071 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 9.67e-01 0.00521 0.127 0.071 Mono L1
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0887 0.115 0.071 Mono L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 9.16e-01 0.0122 0.115 0.071 Mono L1
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0307 0.148 0.071 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 2.58e-01 0.156 0.138 0.071 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 3.62e-02 0.217 0.103 0.071 NK L1
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 2.76e-01 -0.139 0.127 0.071 NK L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 1.23e-02 -0.35 0.139 0.071 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 3.24e-01 -0.171 0.173 0.071 NK L1
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 4.74e-01 -0.101 0.141 0.071 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0105 0.0522 0.071 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 2.87e-01 0.106 0.0993 0.071 Other_T L1
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 8.33e-01 0.0316 0.15 0.071 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 4.46e-01 0.0809 0.106 0.071 Other_T L1
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 4.26e-01 -0.106 0.133 0.071 Other_T L1
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 3.83e-01 0.105 0.12 0.071 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0332 0.151 0.071 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 6.46e-02 0.195 0.105 0.071 Other_T L1
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 3.23e-01 -0.154 0.155 0.071 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 9.57e-01 0.00661 0.123 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0289 0.0313 0.077 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 2.21e-02 -0.371 0.161 0.077 B_Activated L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 6.82e-01 0.0599 0.146 0.077 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0806 0.163 0.077 B_Activated L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 9.86e-01 0.00293 0.173 0.077 B_Activated L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 4.18e-01 -0.151 0.187 0.077 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 5.84e-01 0.0782 0.143 0.077 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0879 0.135 0.077 B_Activated L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0384 0.157 0.077 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 2.01e-01 0.162 0.126 0.077 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0632 0.0695 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 2.44e-02 0.389 0.171 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0864 0.157 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 2.15e-01 0.176 0.142 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 8.31e-01 0.0376 0.175 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0835 0.157 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 2.40e-01 0.18 0.153 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 8.65e-01 0.0286 0.168 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0301 0.166 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 7.94e-01 0.0422 0.161 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0338 0.0635 0.069 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 9.46e-01 0.0114 0.168 0.069 B_Memory L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 3.42e-01 0.152 0.16 0.069 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 5.12e-01 0.0962 0.146 0.069 B_Memory L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 2.62e-01 -0.195 0.174 0.069 B_Memory L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0821 0.154 0.069 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 6.48e-01 0.0726 0.159 0.069 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0117 0.162 0.069 B_Memory L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0432 0.17 0.069 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 2.64e-01 -0.164 0.147 0.069 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0451 0.0879 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0742 0.159 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 8.27e-01 0.0341 0.156 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 7.24e-01 0.0415 0.117 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 7.16e-01 0.055 0.151 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 6.29e-01 0.0622 0.129 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0673 0.167 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 3.56e-01 0.155 0.168 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0391 0.165 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 7.63e-01 0.0476 0.157 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 3.46e-01 0.0719 0.0762 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 9.76e-01 0.00477 0.157 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 5.52e-01 0.0974 0.164 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 8.13e-01 0.0341 0.144 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 7.25e-01 0.0541 0.153 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0997 0.156 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 6.98e-01 0.0628 0.162 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 4.87e-02 -0.34 0.171 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 2.32e-01 -0.204 0.17 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 4.23e-01 -0.12 0.149 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 3.39e-01 0.17 0.178 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 2.10e-01 0.197 0.156 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00834 0.174 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 2.04e-02 -0.43 0.184 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 6.17e-02 -0.295 0.157 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 6.21e-02 -0.301 0.161 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 3.53e-01 0.163 0.175 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 7.63e-02 -0.228 0.128 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 6.30e-01 0.0664 0.138 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0655 0.0945 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 8.14e-01 0.0294 0.124 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 6.26e-01 -0.062 0.127 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 1.54e-01 -0.217 0.152 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 4.05e-02 -0.284 0.138 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 4.10e-01 0.113 0.137 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 2.93e-02 -0.351 0.16 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 2.95e-01 0.0988 0.0942 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0131 0.14 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 2.78e-01 -0.15 0.138 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 6.41e-01 0.0748 0.16 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 3.76e-02 -0.328 0.157 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 3.29e-02 0.346 0.161 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 1.87e-01 0.225 0.17 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 6.30e-01 0.0667 0.138 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 2.17e-01 0.203 0.164 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00438 0.164 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 1.67e-01 0.235 0.17 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 1.65e-01 0.229 0.164 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 1.10e-01 -0.234 0.145 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 3.54e-01 -0.14 0.15 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 2.18e-02 -0.312 0.135 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0959 0.159 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 3.24e-02 -0.298 0.138 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 1.36e-02 0.403 0.162 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0882 0.152 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 8.50e-01 0.0294 0.155 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 4.57e-01 0.115 0.154 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 4.91e-02 -0.207 0.104 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0428 0.141 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 4.87e-02 -0.264 0.133 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 4.30e-01 -0.127 0.16 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 3.08e-01 0.159 0.155 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 2.14e-01 -0.211 0.169 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 6.06e-02 -0.293 0.155 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0162 0.151 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 9.96e-01 0.000876 0.173 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0916 0.165 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 4.69e-01 0.117 0.162 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 1.62e-01 0.25 0.178 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0376 0.165 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0555 0.158 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 7.08e-01 0.0563 0.15 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0685 0.176 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 5.82e-02 -0.31 0.163 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0294 0.165 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 3.43e-01 -0.16 0.168 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 1.75e-02 0.139 0.0581 0.069 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 2.26e-04 0.601 0.16 0.069 MAIT L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 3.66e-01 0.149 0.164 0.069 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 7.31e-01 0.0499 0.145 0.069 MAIT L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 3.98e-01 -0.15 0.177 0.069 MAIT L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 2.52e-01 0.197 0.171 0.069 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0888 0.154 0.069 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 9.72e-02 0.267 0.16 0.069 MAIT L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 2.89e-01 -0.184 0.173 0.069 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 8.00e-01 0.0363 0.143 0.069 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 6.45e-01 0.0907 0.196 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 2.80e-01 -0.183 0.169 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0878 0.191 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 1.16e-01 -0.297 0.188 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 5.63e-01 -0.109 0.188 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 8.62e-01 0.0348 0.2 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 9.28e-01 0.0138 0.153 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 3.66e-01 0.117 0.13 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0824 0.139 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 2.16e-02 -0.318 0.137 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0538 0.177 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 4.41e-01 0.123 0.159 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 7.49e-03 0.448 0.166 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 1.65e-01 0.24 0.172 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 1.31e-01 0.281 0.185 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 4.61e-01 -0.135 0.182 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0184 0.175 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 3.32e-01 -0.164 0.168 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 1.04e-01 0.274 0.168 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 4.00e-03 0.379 0.13 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 6.05e-01 0.0845 0.163 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 2.66e-02 -0.358 0.16 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 3.02e-01 -0.193 0.186 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0518 0.17 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0238 0.103 0.096 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 1.54e-01 0.197 0.137 0.096 PB L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 5.18e-01 -0.104 0.161 0.096 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 3.31e-01 0.122 0.125 0.096 PB L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 1.30e-01 -0.247 0.162 0.096 PB L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0897 0.0749 0.096 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 6.44e-01 -0.061 0.132 0.096 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 9.27e-01 0.0124 0.135 0.096 PB L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 7.99e-01 0.042 0.164 0.096 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0928 0.125 0.096 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 9.90e-01 0.000733 0.0597 0.072 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 1.58e-01 0.17 0.12 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 3.88e-01 0.129 0.149 0.072 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0109 0.139 0.072 Pro_T L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 3.25e-01 -0.157 0.159 0.072 Pro_T L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 1.78e-01 0.15 0.111 0.072 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 1.65e-01 -0.212 0.152 0.072 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 3.35e-02 0.233 0.109 0.072 Pro_T L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 7.70e-02 -0.277 0.156 0.072 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 4.89e-01 0.0833 0.12 0.072 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 7.99e-02 -0.29 0.165 0.071 Treg L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 5.83e-01 0.0861 0.157 0.071 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 5.06e-01 0.0919 0.138 0.071 Treg L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 4.22e-01 0.142 0.176 0.071 Treg L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 2.82e-01 -0.175 0.163 0.071 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 4.71e-01 -0.101 0.14 0.071 Treg L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 9.60e-01 0.00888 0.176 0.071 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 2.62e-01 -0.191 0.17 0.066 cDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 5.09e-01 -0.137 0.207 0.066 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 2.61e-01 -0.213 0.188 0.066 cDC L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 8.61e-01 0.0351 0.2 0.066 cDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 2.85e-01 0.189 0.176 0.066 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 5.01e-01 0.0888 0.132 0.066 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 2.56e-01 0.191 0.167 0.066 cDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 9.24e-01 0.0177 0.184 0.066 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 3.80e-01 0.131 0.149 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 5.42e-02 0.31 0.16 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 3.39e-01 0.124 0.129 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0874 0.128 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 3.30e-01 0.121 0.124 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0294 0.149 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 1.51e-01 0.234 0.162 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 1.18e-01 -0.259 0.165 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 4.99e-01 0.105 0.154 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 9.89e-01 -0.002 0.148 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 7.07e-01 0.0489 0.13 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 9.65e-01 0.00723 0.164 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 1.02e-01 -0.273 0.166 0.071 intMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000566 0.164 0.071 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 1.76e-02 -0.396 0.166 0.071 intMono L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 3.44e-02 -0.356 0.167 0.071 intMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 5.96e-02 -0.284 0.15 0.071 intMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 1.81e-01 0.207 0.154 0.071 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 5.96e-01 0.0945 0.178 0.066 ncMono L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 7.96e-01 0.0471 0.182 0.066 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 2.99e-01 -0.165 0.159 0.066 ncMono L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0125 0.178 0.066 ncMono L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 9.55e-02 0.263 0.157 0.066 ncMono L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 8.37e-01 0.0368 0.179 0.066 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 2.24e-02 0.509 0.221 0.056 pDC L2
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 6.97e-01 0.074 0.19 0.056 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 4.28e-01 -0.15 0.188 0.056 pDC L2
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 6.38e-01 0.0899 0.191 0.056 pDC L2
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0162 0.149 0.056 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0822 0.194 0.056 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 5.47e-01 0.117 0.194 0.056 pDC L2
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 2.58e-01 0.21 0.185 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0564 0.0797 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 3.31e-01 0.156 0.16 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 7.60e-01 0.0477 0.156 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 5.29e-01 0.0726 0.115 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 4.37e-01 -0.127 0.162 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0986 0.145 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 9.46e-02 0.208 0.124 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0729 0.166 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 7.14e-01 0.0621 0.169 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 4.21e-01 0.133 0.165 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 536355 sc-eQTL 8.92e-01 0.0127 0.0932 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0821 0.152 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 7.33e-01 0.0537 0.157 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 7.03e-01 0.043 0.113 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 8.86e-01 0.0208 0.144 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00134 0.132 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -477911 sc-eQTL 6.13e-01 -0.082 0.162 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0145 0.174 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 3.82e-01 -0.147 0.168 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 820514 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0242 0.158 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 7.46e-02 0.244 0.136 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 8.76e-01 0.0258 0.165 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 4.08e-01 0.104 0.126 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 5.57e-01 -0.069 0.117 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 5.65e-01 0.0664 0.115 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00371 0.146 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 3.09e-01 -0.16 0.157 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111696 NT5DC3 -823135 sc-eQTL 9.78e-01 0.0045 0.166 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 8.87e-03 -0.359 0.136 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 3.55e-01 -0.143 0.154 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 3.79e-01 0.136 0.154 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 7.55e-01 0.0497 0.159 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 897979 sc-eQTL 1.69e-01 0.2 0.145 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 955950 sc-eQTL 7.25e-04 0.375 0.109 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139372 TDG -947723 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0947 0.133 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166598 HSP90B1 -912008 sc-eQTL 1.16e-02 -0.352 0.138 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 897914 sc-eQTL 4.26e-01 -0.141 0.177 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000204954 C12orf73 -947609 sc-eQTL 9.65e-01 0.00637 0.147 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000017427 IGF1 536355 eQTL 0.00548 -0.113 0.0406 0.00406 0.0 0.0638
ENSG00000139372 TDG -947723 eQTL 0.0396 -0.0708 0.0344 0.0 0.0 0.0638

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111696 \N -823135 2.91e-07 1.35e-07 5.91e-08 1.89e-07 1.03e-07 8.21e-08 1.81e-07 5.56e-08 1.54e-07 7.6e-08 1.67e-07 1.19e-07 1.79e-07 7.95e-08 5.82e-08 7.89e-08 4.18e-08 1.56e-07 7.12e-08 4.95e-08 1.22e-07 1.39e-07 1.58e-07 2.68e-08 1.68e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.03e-07 1.08e-07 3.99e-08 3.59e-08 9.76e-08 3.4e-08 3.07e-08 5.74e-08 8.37e-08 6.58e-08 3.67e-08 5.33e-08 1.46e-07 5.27e-08 1.86e-08 3.41e-08 1.8e-08 8.74e-08 1.95e-09 4.81e-08